FuNGI

A0A5M9JHB3

Protein Details

Accession

A0A5M9JHB3

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-29	MGSAKNTPREEKKKAKSSSKSSSKPTTKT	Hydrophilic
70-91	SNPAVKSPPKSKSKPNGKLAES	Hydrophilic
336-389	AATPAKKSKSDKSKKTQKDSEEGADRSSKKKHKESGDKKKKHKKTDNLDPETTT	Basic
449-480	GPGVTTKNEARREKKAQKEAKRRRLESRTDNF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
10-20	EEKKKAKSSSK
340-379	AKKSKSDKSKKTQKDSEEGADRSSKKKHKESGDKKKKHKK
458-472	ARREKKAQKEAKRRR

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MGSAKNTPREEKKKAKSSSKSSSKPTTKTQVAKSPQTFKSTEFIAESDNEKDEPIETNSSSDSDNDSLPSNPAVKSPPKSKSKPNGKLAESSDSSEAESGEESESGSSSGEEEEEESDAESESNTNGNKSAIPPPSKKDARTVSLKVAPFKPPPGFEKNSSKNSSKASQLFNKSNLEGKEIWYITAPASVPIASVKEISLQDAKLGKAVFSQDGNDYGFVHDPLDDMTYTKILLPSNSKDGYSIEKKPVNQIYHMQQVVNLSKTNSSQATVPAKRPVRQQPKGLKARYQPIGFASAPGIIGSDDESDSEERAPKFQKIAMSEDENSDVEMEDAPPAATPAKKSKSDKSKKTQKDSEEGADRSSKKKHKESGDKKKKHKKTDNLDPETTTNTRASQLCIPPPNKTLNSSSNSDTTLSNSQPTKFNSTMKSLFSDPESAKKKATEVVSTEGPGVTTKNEARREKKAQKEAKRRRLESRTDNF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.85
2	0.87
3	0.86
4	0.87
5	0.88
6	0.88
7	0.85
8	0.83
9	0.84
10	0.82
11	0.78
12	0.77
13	0.76
14	0.74
15	0.74
16	0.74
17	0.73
18	0.72
19	0.76
20	0.75
21	0.74
22	0.7
23	0.68
24	0.61
25	0.54
26	0.5
27	0.42
28	0.37
29	0.3
30	0.26
31	0.23
32	0.23
33	0.23
34	0.22
35	0.22
36	0.19
37	0.18
38	0.18
39	0.16
40	0.17
41	0.18
42	0.2
43	0.19
44	0.2
45	0.21
46	0.22
47	0.21
48	0.19
49	0.19
50	0.16
51	0.17
52	0.16
53	0.17
54	0.17
55	0.18
56	0.19
57	0.17
58	0.16
59	0.18
60	0.22
61	0.27
62	0.33
63	0.4
64	0.47
65	0.54
66	0.59
67	0.67
68	0.73
69	0.77
70	0.8
71	0.82
72	0.82
73	0.75
74	0.76
75	0.69
76	0.66
77	0.56
78	0.49
79	0.41
80	0.32
81	0.3
82	0.23
83	0.2
84	0.13
85	0.11
86	0.1
87	0.09
88	0.08
89	0.08
90	0.08
91	0.08
92	0.07
93	0.07
94	0.06
95	0.06
96	0.06
97	0.06
98	0.06
99	0.07
100	0.07
101	0.08
102	0.08
103	0.07
104	0.08
105	0.08
106	0.07
107	0.07
108	0.06
109	0.06
110	0.09
111	0.09
112	0.09
113	0.1
114	0.11
115	0.12
116	0.15
117	0.21
118	0.25
119	0.31
120	0.34
121	0.38
122	0.47
123	0.5
124	0.48
125	0.5
126	0.49
127	0.48
128	0.52
129	0.5
130	0.47
131	0.49
132	0.5
133	0.46
134	0.43
135	0.43
136	0.38
137	0.4
138	0.37
139	0.34
140	0.37
141	0.4
142	0.41
143	0.42
144	0.5
145	0.52
146	0.57
147	0.59
148	0.55
149	0.51
150	0.51
151	0.49
152	0.45
153	0.43
154	0.41
155	0.43
156	0.48
157	0.48
158	0.48
159	0.47
160	0.42
161	0.41
162	0.36
163	0.32
164	0.26
165	0.24
166	0.26
167	0.24
168	0.23
169	0.18
170	0.18
171	0.14
172	0.16
173	0.14
174	0.08
175	0.09
176	0.08
177	0.08
178	0.08
179	0.08
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.1
184	0.1
185	0.12
186	0.13
187	0.12
188	0.15
189	0.17
190	0.17
191	0.15
192	0.15
193	0.13
194	0.12
195	0.14
196	0.12
197	0.11
198	0.12
199	0.1
200	0.12
201	0.12
202	0.11
203	0.1
204	0.1
205	0.1
206	0.09
207	0.08
208	0.07
209	0.06
210	0.06
211	0.07
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.09
221	0.12
222	0.14
223	0.18
224	0.19
225	0.18
226	0.17
227	0.18
228	0.22
229	0.23
230	0.24
231	0.25
232	0.27
233	0.28
234	0.33
235	0.38
236	0.34
237	0.31
238	0.32
239	0.31
240	0.34
241	0.34
242	0.28
243	0.23
244	0.25
245	0.24
246	0.22
247	0.18
248	0.13
249	0.14
250	0.14
251	0.16
252	0.13
253	0.12
254	0.11
255	0.16
256	0.24
257	0.25
258	0.27
259	0.32
260	0.35
261	0.37
262	0.44
263	0.49
264	0.51
265	0.54
266	0.61
267	0.63
268	0.7
269	0.76
270	0.71
271	0.67
272	0.61
273	0.63
274	0.6
275	0.51
276	0.42
277	0.34
278	0.37
279	0.3
280	0.26
281	0.19
282	0.13
283	0.13
284	0.12
285	0.11
286	0.05
287	0.05
288	0.06
289	0.06
290	0.05
291	0.06
292	0.07
293	0.08
294	0.08
295	0.09
296	0.13
297	0.12
298	0.16
299	0.19
300	0.19
301	0.2
302	0.22
303	0.25
304	0.23
305	0.27
306	0.27
307	0.29
308	0.28
309	0.28
310	0.27
311	0.23
312	0.2
313	0.16
314	0.13
315	0.09
316	0.08
317	0.08
318	0.06
319	0.06
320	0.06
321	0.05
322	0.06
323	0.08
324	0.08
325	0.11
326	0.2
327	0.25
328	0.32
329	0.37
330	0.46
331	0.56
332	0.65
333	0.72
334	0.74
335	0.8
336	0.82
337	0.87
338	0.86
339	0.8
340	0.77
341	0.71
342	0.68
343	0.64
344	0.55
345	0.48
346	0.47
347	0.44
348	0.4
349	0.45
350	0.44
351	0.45
352	0.53
353	0.59
354	0.63
355	0.72
356	0.79
357	0.82
358	0.87
359	0.88
360	0.9
361	0.93
362	0.92
363	0.92
364	0.91
365	0.9
366	0.89
367	0.91
368	0.91
369	0.88
370	0.81
371	0.72
372	0.63
373	0.58
374	0.49
375	0.4
376	0.3
377	0.24
378	0.25
379	0.24
380	0.26
381	0.28
382	0.32
383	0.36
384	0.43
385	0.44
386	0.44
387	0.47
388	0.51
389	0.45
390	0.44
391	0.43
392	0.42
393	0.45
394	0.44
395	0.44
396	0.38
397	0.38
398	0.35
399	0.29
400	0.26
401	0.27
402	0.25
403	0.27
404	0.28
405	0.29
406	0.33
407	0.37
408	0.4
409	0.38
410	0.43
411	0.41
412	0.46
413	0.48
414	0.44
415	0.44
416	0.38
417	0.36
418	0.33
419	0.36
420	0.3
421	0.36
422	0.4
423	0.38
424	0.39
425	0.38
426	0.38
427	0.37
428	0.4
429	0.36
430	0.34
431	0.38
432	0.38
433	0.37
434	0.36
435	0.3
436	0.26
437	0.2
438	0.18
439	0.13
440	0.17
441	0.22
442	0.29
443	0.38
444	0.47
445	0.53
446	0.62
447	0.71
448	0.75
449	0.8
450	0.82
451	0.84
452	0.86
453	0.91
454	0.92
455	0.92
456	0.93
457	0.88
458	0.88
459	0.88
460	0.87

A0A5M9JHB3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer