Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M9J5A0

Protein Details
Accession A0A5M9J5A0    Localization Confidence Low Confidence Score 6.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-27LHSLRLRLRLRRRKLLGLICHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 20, nucl 3.5, cyto_nucl 3, cyto 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR045113  Rpb7-like  
IPR005576  Rpb7-like_N  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03876  SHS2_Rpb7-N  
CDD cd04329  RNAP_II_Rpb7_N  
Amino Acid Sequences MRRNHPLLHSLRLRLRLRRRKLLGLICLFKQVRFGVNINWKACGLTVNLGISGTNFLPLSGRAAHRQTFAHSLLRLPGTCQSVTSLQFLSFSDHNTKIDSAHSNIKVRPLDGLCDPKEFRYLYGDCLGRQYYQNPSCFQLLDNFTFPAVLYVLCKEGRLAYYDLKDTLDCEKKHWLFNFTILPFYQFRYLFRYPPITMFFLYNLERQVTLHPSYFGRNMHELVTGKLLKDVEGTCTGLYYIITIMDTFNISEGRILPGSGLAEFTVGYRAVVWRPFKGETVRTRNM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.7
3 0.71
4 0.75
5 0.78
6 0.79
7 0.78
8 0.81
9 0.79
10 0.77
11 0.75
12 0.7
13 0.6
14 0.63
15 0.55
16 0.46
17 0.42
18 0.34
19 0.29
20 0.28
21 0.29
22 0.29
23 0.38
24 0.45
25 0.42
26 0.41
27 0.38
28 0.34
29 0.33
30 0.26
31 0.18
32 0.14
33 0.16
34 0.15
35 0.15
36 0.14
37 0.14
38 0.12
39 0.13
40 0.1
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.1
46 0.12
47 0.14
48 0.16
49 0.19
50 0.23
51 0.25
52 0.27
53 0.28
54 0.28
55 0.3
56 0.3
57 0.29
58 0.26
59 0.25
60 0.25
61 0.27
62 0.24
63 0.2
64 0.22
65 0.21
66 0.2
67 0.2
68 0.19
69 0.2
70 0.22
71 0.22
72 0.18
73 0.15
74 0.16
75 0.16
76 0.17
77 0.14
78 0.16
79 0.19
80 0.2
81 0.2
82 0.21
83 0.21
84 0.17
85 0.2
86 0.2
87 0.18
88 0.24
89 0.27
90 0.28
91 0.29
92 0.34
93 0.31
94 0.29
95 0.3
96 0.23
97 0.22
98 0.22
99 0.28
100 0.23
101 0.26
102 0.27
103 0.23
104 0.26
105 0.24
106 0.21
107 0.21
108 0.21
109 0.19
110 0.24
111 0.23
112 0.2
113 0.22
114 0.22
115 0.17
116 0.18
117 0.17
118 0.21
119 0.25
120 0.27
121 0.26
122 0.27
123 0.27
124 0.26
125 0.24
126 0.21
127 0.19
128 0.19
129 0.18
130 0.16
131 0.15
132 0.15
133 0.14
134 0.1
135 0.07
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.09
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.15
149 0.16
150 0.16
151 0.16
152 0.15
153 0.13
154 0.18
155 0.23
156 0.21
157 0.23
158 0.32
159 0.33
160 0.38
161 0.39
162 0.36
163 0.29
164 0.33
165 0.37
166 0.28
167 0.28
168 0.23
169 0.24
170 0.21
171 0.22
172 0.23
173 0.17
174 0.18
175 0.24
176 0.26
177 0.25
178 0.28
179 0.32
180 0.27
181 0.3
182 0.33
183 0.27
184 0.26
185 0.25
186 0.22
187 0.2
188 0.21
189 0.19
190 0.17
191 0.16
192 0.15
193 0.15
194 0.17
195 0.18
196 0.19
197 0.18
198 0.19
199 0.19
200 0.22
201 0.25
202 0.24
203 0.23
204 0.24
205 0.24
206 0.23
207 0.26
208 0.24
209 0.22
210 0.27
211 0.23
212 0.21
213 0.23
214 0.22
215 0.17
216 0.2
217 0.19
218 0.16
219 0.18
220 0.19
221 0.16
222 0.16
223 0.16
224 0.13
225 0.12
226 0.09
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.1
240 0.13
241 0.13
242 0.12
243 0.11
244 0.13
245 0.14
246 0.12
247 0.12
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.11
257 0.15
258 0.21
259 0.25
260 0.26
261 0.3
262 0.32
263 0.36
264 0.4
265 0.45
266 0.49