FuNGI

A0A5B1QHZ9

Protein Details

Accession

A0A5B1QHZ9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
135-155	AAAGTKRKRRWDEPGDKTEEK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
140-144	KRKRR

Subcellular Location(s)

cyto 14.5, cyto_nucl 13.5, nucl 9.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSAPGSPRLVDSFTAPKDVLKEFEELAEEENVDPFAETASKRQIAQRQSDYHNRRFSRTANESIDAFQAGEDGKEVEGGYKDAMRLQMLEKEEQRVKRAIEEKERRDREEHKEKMDLDKTPPAAEIEEAAKELAAAAGTKRKRRWDEPGDKTEEKKSDTGEWSKEALEQSAPKKRRSRWDATPADVGETPKKSRWDMTPAAGSADVAMTPIIMNAPGFMQEDKHNRYLTDEELNAVLPSQGYAIVTPPPGYAPMMAPRQLMATPITEVGGFQIQESSDAAAAAAAAGLAPELPTEIPGVGNLAFFKAEDAQYFAKILKEEDETELSVEEMKERKIMRLLLKIKNGTPPVRKTALRQITDKARDFGAGPLFDKILPLLMERTLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLSKAAGLAHMISTMRPDIDHADEYVRNTTARAFSVVASALGIPSLLPFLKAVCRSKKSWQARHTGIRIVQQIAIMMGCAVLPHLRNLVDCIAHGLSDEQQKVRTMTALGLAALAEAAAPYGIESFDNVLKPLWLGIRLHRGKGLAAFLKAIGFIIPLMDPEYASYYTKEVTVILIREFQTSDEEMKKIVLKVVKQCAATEGVTPQYIKQDILPDFFKAFWVRRMALDRRNYRQVVETTVELAQKAGASEIIGRIVNELKDEAEPYRKMVMETITKVVASLGASDIDERLEVRLVDGIIYSFQEQTTEDQVMLDGFGTVVNALGIRVKPYLMQIVSTILWRLNNKSAKVRQQAADLTTRLAVVIKQCGEDQLLSKLGLVLFEQLGEEYPDTLGSIIAAEGAIANVVGMTQMNPPVKDLLPRMTPILRNRHEKVQEASINLIGRIADRGAEFVPAREWMRICFELLDLLKAHKKGIRRAAVNSFGYIAKSLGPQDVLSVLLTNLRVQERQSRVCSTVAIAIVAETCGPFTCIPAILNEYRTAELNVRTGCLKALSFVFEYVGPQSAYYVDSVVTMLEDALTDRDLVHRQTASTIVKHLALGVAGLGCEDSMLHLMNLVWPNCFETSPHVIGAVMDAVEAMRVTLGPGVLLSYVLQGLFHPARKVREVYWRVYNALYLGAEDALVPFYPDLSELSEGQNVYDRHPLQVFI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.3
3	0.28
4	0.3
5	0.32
6	0.3
7	0.24
8	0.25
9	0.22
10	0.23
11	0.24
12	0.21
13	0.21
14	0.19
15	0.18
16	0.15
17	0.16
18	0.14
19	0.12
20	0.11
21	0.09
22	0.09
23	0.11
24	0.12
25	0.16
26	0.24
27	0.26
28	0.28
29	0.35
30	0.42
31	0.46
32	0.54
33	0.58
34	0.57
35	0.62
36	0.71
37	0.73
38	0.74
39	0.76
40	0.7
41	0.67
42	0.65
43	0.62
44	0.62
45	0.6
46	0.6
47	0.55
48	0.55
49	0.51
50	0.47
51	0.44
52	0.34
53	0.27
54	0.18
55	0.14
56	0.11
57	0.1
58	0.09
59	0.09
60	0.08
61	0.09
62	0.09
63	0.1
64	0.11
65	0.12
66	0.13
67	0.14
68	0.14
69	0.16
70	0.18
71	0.16
72	0.17
73	0.18
74	0.23
75	0.24
76	0.3
77	0.29
78	0.35
79	0.41
80	0.43
81	0.45
82	0.45
83	0.43
84	0.45
85	0.51
86	0.52
87	0.56
88	0.63
89	0.68
90	0.74
91	0.78
92	0.73
93	0.72
94	0.71
95	0.7
96	0.71
97	0.68
98	0.63
99	0.65
100	0.62
101	0.66
102	0.63
103	0.57
104	0.52
105	0.52
106	0.48
107	0.42
108	0.41
109	0.33
110	0.28
111	0.24
112	0.21
113	0.16
114	0.15
115	0.15
116	0.13
117	0.11
118	0.1
119	0.1
120	0.08
121	0.06
122	0.06
123	0.08
124	0.16
125	0.22
126	0.3
127	0.35
128	0.45
129	0.53
130	0.59
131	0.67
132	0.7
133	0.76
134	0.78
135	0.82
136	0.81
137	0.76
138	0.72
139	0.69
140	0.63
141	0.56
142	0.48
143	0.42
144	0.4
145	0.44
146	0.47
147	0.43
148	0.41
149	0.39
150	0.38
151	0.38
152	0.31
153	0.26
154	0.23
155	0.26
156	0.3
157	0.39
158	0.42
159	0.47
160	0.54
161	0.6
162	0.67
163	0.7
164	0.71
165	0.72
166	0.78
167	0.77
168	0.73
169	0.72
170	0.61
171	0.56
172	0.49
173	0.42
174	0.37
175	0.35
176	0.34
177	0.32
178	0.36
179	0.35
180	0.37
181	0.4
182	0.42
183	0.42
184	0.44
185	0.44
186	0.41
187	0.4
188	0.36
189	0.3
190	0.22
191	0.17
192	0.12
193	0.07
194	0.06
195	0.05
196	0.04
197	0.05
198	0.05
199	0.04
200	0.04
201	0.05
202	0.05
203	0.07
204	0.08
205	0.08
206	0.1
207	0.17
208	0.25
209	0.3
210	0.34
211	0.34
212	0.32
213	0.36
214	0.37
215	0.34
216	0.31
217	0.26
218	0.23
219	0.22
220	0.22
221	0.18
222	0.16
223	0.12
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.05
229	0.06
230	0.07
231	0.09
232	0.1
233	0.1
234	0.1
235	0.1
236	0.11
237	0.11
238	0.11
239	0.11
240	0.17
241	0.2
242	0.21
243	0.21
244	0.2
245	0.21
246	0.2
247	0.19
248	0.14
249	0.12
250	0.12
251	0.12
252	0.12
253	0.1
254	0.1
255	0.1
256	0.11
257	0.09
258	0.08
259	0.1
260	0.09
261	0.1
262	0.11
263	0.1
264	0.08
265	0.08
266	0.07
267	0.06
268	0.06
269	0.04
270	0.04
271	0.03
272	0.02
273	0.02
274	0.02
275	0.02
276	0.02
277	0.02
278	0.03
279	0.03
280	0.04
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.07
286	0.07
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.07
292	0.08
293	0.09
294	0.09
295	0.09
296	0.13
297	0.13
298	0.14
299	0.15
300	0.14
301	0.14
302	0.14
303	0.14
304	0.13
305	0.15
306	0.16
307	0.18
308	0.19
309	0.17
310	0.17
311	0.16
312	0.14
313	0.13
314	0.11
315	0.12
316	0.11
317	0.12
318	0.16
319	0.16
320	0.19
321	0.21
322	0.26
323	0.28
324	0.36
325	0.43
326	0.45
327	0.51
328	0.52
329	0.49
330	0.51
331	0.51
332	0.48
333	0.47
334	0.45
335	0.45
336	0.47
337	0.47
338	0.44
339	0.5
340	0.52
341	0.48
342	0.46
343	0.46
344	0.5
345	0.56
346	0.53
347	0.44
348	0.36
349	0.33
350	0.31
351	0.29
352	0.24
353	0.18
354	0.17
355	0.17
356	0.17
357	0.16
358	0.15
359	0.11
360	0.09
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.08
365	0.09
366	0.1
367	0.12
368	0.12
369	0.14
370	0.13
371	0.13
372	0.16
373	0.16
374	0.17
375	0.14
376	0.15
377	0.14
378	0.18
379	0.2
380	0.18
381	0.19
382	0.19
383	0.19
384	0.19
385	0.19
386	0.14
387	0.14
388	0.15
389	0.15
390	0.16
391	0.18
392	0.17
393	0.18
394	0.2
395	0.2
396	0.18
397	0.16
398	0.14
399	0.14
400	0.15
401	0.14
402	0.13
403	0.1
404	0.09
405	0.09
406	0.09
407	0.06
408	0.05
409	0.04
410	0.05
411	0.05
412	0.06
413	0.06
414	0.05
415	0.06
416	0.06
417	0.08
418	0.1
419	0.12
420	0.12
421	0.14
422	0.15
423	0.16
424	0.15
425	0.13
426	0.11
427	0.08
428	0.08
429	0.06
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.07
437	0.07
438	0.06
439	0.06
440	0.07
441	0.08
442	0.11
443	0.12
444	0.11
445	0.14
446	0.15
447	0.16
448	0.17
449	0.15
450	0.12
451	0.12
452	0.13
453	0.12
454	0.12
455	0.12
456	0.11
457	0.11
458	0.12
459	0.12
460	0.1
461	0.08
462	0.08
463	0.06
464	0.05
465	0.04
466	0.03
467	0.03
468	0.04
469	0.04
470	0.04
471	0.04
472	0.05
473	0.09
474	0.14
475	0.19
476	0.25
477	0.29
478	0.32
479	0.39
480	0.48
481	0.54
482	0.59
483	0.6
484	0.61
485	0.64
486	0.68
487	0.63
488	0.57
489	0.5
490	0.45
491	0.41
492	0.34
493	0.29
494	0.21
495	0.19
496	0.15
497	0.13
498	0.07
499	0.05
500	0.04
501	0.03
502	0.03
503	0.03
504	0.04
505	0.04
506	0.05
507	0.07
508	0.07
509	0.07
510	0.09
511	0.1
512	0.09
513	0.09
514	0.11
515	0.09
516	0.09
517	0.09
518	0.08
519	0.09
520	0.13
521	0.14
522	0.12
523	0.13
524	0.15
525	0.15
526	0.15
527	0.13
528	0.09
529	0.09
530	0.1
531	0.09
532	0.08
533	0.07
534	0.07
535	0.06
536	0.05
537	0.04
538	0.02
539	0.02
540	0.02
541	0.02
542	0.02
543	0.02
544	0.02
545	0.02
546	0.03
547	0.03
548	0.04
549	0.06
550	0.06
551	0.07
552	0.07
553	0.06
554	0.07
555	0.07
556	0.06
557	0.07
558	0.07
559	0.1
560	0.2
561	0.21
562	0.22
563	0.22
564	0.22
565	0.2
566	0.21
567	0.22
568	0.13
569	0.13
570	0.12
571	0.11
572	0.11
573	0.1
574	0.09
575	0.06
576	0.04
577	0.03
578	0.04
579	0.03
580	0.04
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.08
586	0.08
587	0.09
588	0.1
589	0.09
590	0.09
591	0.1
592	0.09
593	0.07
594	0.07
595	0.08
596	0.09
597	0.09
598	0.12
599	0.12
600	0.12
601	0.13
602	0.12
603	0.12
604	0.12
605	0.15
606	0.13
607	0.13
608	0.12
609	0.13
610	0.14
611	0.12
612	0.14
613	0.14
614	0.16
615	0.22
616	0.27
617	0.3
618	0.29
619	0.29
620	0.27
621	0.27
622	0.24
623	0.19
624	0.14
625	0.12
626	0.12
627	0.12
628	0.11
629	0.12
630	0.12
631	0.11
632	0.11
633	0.16
634	0.16
635	0.19
636	0.2
637	0.18
638	0.18
639	0.18
640	0.18
641	0.14
642	0.15
643	0.16
644	0.18
645	0.18
646	0.2
647	0.27
648	0.3
649	0.35
650	0.42
651	0.45
652	0.47
653	0.53
654	0.51
655	0.45
656	0.45
657	0.39
658	0.35
659	0.3
660	0.25
661	0.2
662	0.21
663	0.2
664	0.15
665	0.14
666	0.1
667	0.08
668	0.08
669	0.06
670	0.04
671	0.04
672	0.05
673	0.05
674	0.07
675	0.07
676	0.06
677	0.07
678	0.09
679	0.09
680	0.09
681	0.09
682	0.08
683	0.08
684	0.1
685	0.1
686	0.14
687	0.14
688	0.16
689	0.18
690	0.18
691	0.18
692	0.18
693	0.2
694	0.19
695	0.21
696	0.21
697	0.18
698	0.17
699	0.17
700	0.15
701	0.13
702	0.08
703	0.07
704	0.06
705	0.06
706	0.06
707	0.06
708	0.06
709	0.06
710	0.06
711	0.05
712	0.05
713	0.06
714	0.06
715	0.06
716	0.07
717	0.07
718	0.07
719	0.07
720	0.06
721	0.06
722	0.07
723	0.07
724	0.06
725	0.06
726	0.07
727	0.07
728	0.1
729	0.12
730	0.12
731	0.11
732	0.1
733	0.11
734	0.1
735	0.09
736	0.07
737	0.04
738	0.03
739	0.03
740	0.03
741	0.03
742	0.03
743	0.03
744	0.03
745	0.03
746	0.05
747	0.06
748	0.07
749	0.08
750	0.08
751	0.09
752	0.1
753	0.15
754	0.13
755	0.13
756	0.12
757	0.14
758	0.14
759	0.14
760	0.13
761	0.1
762	0.13
763	0.13
764	0.16
765	0.22
766	0.27
767	0.29
768	0.37
769	0.43
770	0.49
771	0.54
772	0.56
773	0.49
774	0.49
775	0.49
776	0.43
777	0.42
778	0.33
779	0.27
780	0.23
781	0.21
782	0.16
783	0.14
784	0.12
785	0.09
786	0.13
787	0.13
788	0.14
789	0.14
790	0.15
791	0.16
792	0.15
793	0.15
794	0.13
795	0.14
796	0.13
797	0.13
798	0.13
799	0.12
800	0.12
801	0.1
802	0.09
803	0.07
804	0.07
805	0.07
806	0.06
807	0.07
808	0.07
809	0.07
810	0.06
811	0.06
812	0.06
813	0.06
814	0.06
815	0.06
816	0.04
817	0.04
818	0.04
819	0.04
820	0.03
821	0.03
822	0.03
823	0.03
824	0.03
825	0.02
826	0.02
827	0.02
828	0.02
829	0.02
830	0.03
831	0.04
832	0.05
833	0.11
834	0.13
835	0.13
836	0.15
837	0.17
838	0.18
839	0.21
840	0.22
841	0.23
842	0.23
843	0.24
844	0.27
845	0.28
846	0.33
847	0.36
848	0.44
849	0.44
850	0.5
851	0.52
852	0.58
853	0.58
854	0.57
855	0.53
856	0.52
857	0.49
858	0.43
859	0.41
860	0.35
861	0.32
862	0.27
863	0.24
864	0.15
865	0.12
866	0.12
867	0.1
868	0.08
869	0.08
870	0.1
871	0.09
872	0.13
873	0.12
874	0.12
875	0.13
876	0.15
877	0.16
878	0.18
879	0.18
880	0.16
881	0.22
882	0.22
883	0.22
884	0.19
885	0.18
886	0.2
887	0.2
888	0.21
889	0.15
890	0.18
891	0.21
892	0.21
893	0.24
894	0.21
895	0.26
896	0.32
897	0.42
898	0.47
899	0.46
900	0.51
901	0.56
902	0.61
903	0.56
904	0.49
905	0.41
906	0.33
907	0.3
908	0.25
909	0.18
910	0.12
911	0.12
912	0.13
913	0.12
914	0.13
915	0.12
916	0.12
917	0.12
918	0.12
919	0.1
920	0.09
921	0.08
922	0.09
923	0.1
924	0.1
925	0.13
926	0.14
927	0.15
928	0.17
929	0.26
930	0.31
931	0.37
932	0.41
933	0.41
934	0.41
935	0.41
936	0.4
937	0.32
938	0.29
939	0.23
940	0.19
941	0.14
942	0.12
943	0.12
944	0.11
945	0.1
946	0.05
947	0.05
948	0.05
949	0.07
950	0.07
951	0.08
952	0.1
953	0.11
954	0.11
955	0.13
956	0.18
957	0.19
958	0.2
959	0.21
960	0.22
961	0.22
962	0.23
963	0.22
964	0.21
965	0.21
966	0.24
967	0.22
968	0.22
969	0.22
970	0.21
971	0.2
972	0.18
973	0.16
974	0.13
975	0.14
976	0.16
977	0.16
978	0.16
979	0.16
980	0.14
981	0.16
982	0.15
983	0.16
984	0.13
985	0.11
986	0.12
987	0.11
988	0.12
989	0.11
990	0.1
991	0.07
992	0.08
993	0.08
994	0.07
995	0.07
996	0.06
997	0.05
998	0.05
999	0.05
1000	0.05
1001	0.06
1002	0.07
1003	0.07
1004	0.07
1005	0.11
1006	0.14
1007	0.16
1008	0.2
1009	0.2
1010	0.2
1011	0.21
1012	0.28
1013	0.28
1014	0.26
1015	0.27
1016	0.25
1017	0.25
1018	0.24
1019	0.23
1020	0.17
1021	0.13
1022	0.11
1023	0.09
1024	0.07
1025	0.06
1026	0.06
1027	0.05
1028	0.04
1029	0.04
1030	0.04
1031	0.04
1032	0.06
1033	0.07
1034	0.07
1035	0.08
1036	0.08
1037	0.14
1038	0.2
1039	0.19
1040	0.18
1041	0.18
1042	0.21
1043	0.22
1044	0.22
1045	0.18
1046	0.19
1047	0.26
1048	0.27
1049	0.26
1050	0.24
1051	0.22
1052	0.22
1053	0.22
1054	0.17
1055	0.09
1056	0.07
1057	0.07
1058	0.06
1059	0.07
1060	0.06
1061	0.05
1062	0.04
1063	0.04
1064	0.05
1065	0.06
1066	0.06
1067	0.06
1068	0.06
1069	0.07
1070	0.07
1071	0.07
1072	0.07
1073	0.07
1074	0.08
1075	0.07
1076	0.08
1077	0.07
1078	0.14
1079	0.18
1080	0.21
1081	0.25
1082	0.29
1083	0.35
1084	0.4
1085	0.43
1086	0.4
1087	0.47
1088	0.49
1089	0.5
1090	0.55
1091	0.53
1092	0.5
1093	0.48
1094	0.44
1095	0.34
1096	0.31
1097	0.25
1098	0.16
1099	0.14
1100	0.12
1101	0.11
1102	0.1
1103	0.1
1104	0.08
1105	0.08
1106	0.08
1107	0.07
1108	0.07
1109	0.08
1110	0.08
1111	0.09
1112	0.11
1113	0.14
1114	0.14
1115	0.17
1116	0.2
1117	0.2
1118	0.2
1119	0.26
1120	0.23
1121	0.24
1122	0.31
1123	0.29
1124	0.3

A0A5B1QHZ9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer