FuNGI

H1VKJ8

Protein Details

Accession

H1VKJ8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-34	GQPCTYLRGPLPRKRRKATDPPEHRPSTA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
17-22	PRKRRK

Subcellular Location(s)

nucl 9, mito 8.5, cyto_mito 8, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025742 CSTF2_hinge IPR026896 CSTF_C IPR038192 CSTF_C_sf IPR007219 Transcription_factor_dom_fun
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription GO:0031124 P:mRNA 3'-end processing
Pfam	View protein in Pfam PF14327 CSTF2_hinge PF14304 CSTF_C PF04082 Fungal_trans
CDD	cd12148 fungal_TF_MHR

Amino Acid Sequences

MCSFHGQPCTYLRGPLPRKRRKATDPPEHRPSTATNGSVSAPAGPPPAPVPLDPQEEITHPSPELLEALSPSLAGSEHAITFNQPSLLDGTLGLHLKTHSEYVGNTNYREPSLLDLHRPHDPAIRSVRRLDESTVFLIHRDRETSSEPQRIADLDAIEKVVHPLGSTLVNLYFRIVHPSFPVLHKKVFLEKYARSYHEFSPPLLAAVYLLALDWSLYDRTLATSSWQPDQAALEALALRTMSDDMKRPKISTLQAGLLIQQRFRNNTWTFTAQLTALAQGLGLHVDCSDWAIPDWEKGLRRRLAWALFMQDKWGALVHGRPSHIRLDEDWDVRPCCIEDFPENAADEEHDPEGSAEVVVGRELFLRHIELSLILSDVLGTFYTAKATRRGGTLDQIGTVGVAELAKPIVMMLRECTLPPLPAGKELPPNVTATDAISRTLNTLPPSQLLDILTQMKALASSDPARATELLQQAPQLAYAVFQALLLMGLAAPIGYPLQPPAPGFPPVPVPGANNTPPVSGTPYAPPPQQVSYGAPPPPAAGALGQDPDALMRQVMELPMETINMLPEAERQQILALRASFGGQRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.56
3	0.64
4	0.66
5	0.75
6	0.8
7	0.85
8	0.85
9	0.87
10	0.88
11	0.89
12	0.89
13	0.88
14	0.89
15	0.82
16	0.73
17	0.64
18	0.58
19	0.55
20	0.5
21	0.42
22	0.33
23	0.32
24	0.32
25	0.3
26	0.27
27	0.2
28	0.15
29	0.15
30	0.17
31	0.15
32	0.15
33	0.15
34	0.2
35	0.18
36	0.18
37	0.24
38	0.27
39	0.32
40	0.32
41	0.33
42	0.3
43	0.3
44	0.35
45	0.31
46	0.27
47	0.21
48	0.21
49	0.19
50	0.18
51	0.17
52	0.12
53	0.11
54	0.09
55	0.1
56	0.1
57	0.09
58	0.08
59	0.08
60	0.07
61	0.07
62	0.08
63	0.09
64	0.1
65	0.11
66	0.11
67	0.12
68	0.14
69	0.15
70	0.14
71	0.12
72	0.12
73	0.13
74	0.14
75	0.13
76	0.11
77	0.11
78	0.14
79	0.15
80	0.13
81	0.12
82	0.12
83	0.13
84	0.15
85	0.14
86	0.12
87	0.12
88	0.13
89	0.18
90	0.26
91	0.27
92	0.27
93	0.29
94	0.3
95	0.29
96	0.29
97	0.24
98	0.19
99	0.24
100	0.25
101	0.28
102	0.3
103	0.32
104	0.36
105	0.37
106	0.34
107	0.34
108	0.33
109	0.33
110	0.4
111	0.44
112	0.42
113	0.44
114	0.48
115	0.45
116	0.45
117	0.43
118	0.36
119	0.33
120	0.32
121	0.3
122	0.25
123	0.22
124	0.23
125	0.22
126	0.2
127	0.18
128	0.17
129	0.19
130	0.24
131	0.31
132	0.35
133	0.39
134	0.37
135	0.36
136	0.36
137	0.33
138	0.3
139	0.25
140	0.19
141	0.13
142	0.13
143	0.13
144	0.12
145	0.12
146	0.11
147	0.09
148	0.08
149	0.07
150	0.07
151	0.08
152	0.09
153	0.09
154	0.09
155	0.1
156	0.11
157	0.11
158	0.11
159	0.11
160	0.11
161	0.18
162	0.18
163	0.16
164	0.17
165	0.19
166	0.21
167	0.24
168	0.32
169	0.27
170	0.29
171	0.3
172	0.3
173	0.36
174	0.36
175	0.36
176	0.34
177	0.34
178	0.39
179	0.42
180	0.43
181	0.39
182	0.4
183	0.39
184	0.41
185	0.4
186	0.34
187	0.32
188	0.3
189	0.26
190	0.22
191	0.19
192	0.1
193	0.09
194	0.08
195	0.04
196	0.04
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.04
202	0.04
203	0.05
204	0.05
205	0.05
206	0.07
207	0.08
208	0.08
209	0.09
210	0.13
211	0.15
212	0.17
213	0.18
214	0.17
215	0.16
216	0.17
217	0.16
218	0.12
219	0.1
220	0.09
221	0.08
222	0.07
223	0.07
224	0.06
225	0.05
226	0.05
227	0.06
228	0.06
229	0.07
230	0.13
231	0.17
232	0.24
233	0.26
234	0.26
235	0.27
236	0.31
237	0.32
238	0.31
239	0.29
240	0.24
241	0.24
242	0.23
243	0.24
244	0.24
245	0.22
246	0.19
247	0.19
248	0.2
249	0.22
250	0.23
251	0.29
252	0.25
253	0.27
254	0.29
255	0.28
256	0.27
257	0.25
258	0.25
259	0.16
260	0.16
261	0.13
262	0.1
263	0.08
264	0.06
265	0.05
266	0.04
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.05
278	0.06
279	0.07
280	0.07
281	0.08
282	0.1
283	0.13
284	0.16
285	0.23
286	0.24
287	0.25
288	0.27
289	0.3
290	0.29
291	0.28
292	0.26
293	0.23
294	0.22
295	0.22
296	0.2
297	0.16
298	0.14
299	0.12
300	0.11
301	0.07
302	0.06
303	0.09
304	0.11
305	0.14
306	0.15
307	0.15
308	0.17
309	0.2
310	0.21
311	0.2
312	0.16
313	0.2
314	0.24
315	0.25
316	0.25
317	0.24
318	0.23
319	0.22
320	0.22
321	0.16
322	0.12
323	0.11
324	0.11
325	0.11
326	0.14
327	0.15
328	0.17
329	0.17
330	0.16
331	0.15
332	0.14
333	0.12
334	0.11
335	0.1
336	0.08
337	0.08
338	0.07
339	0.08
340	0.07
341	0.06
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.05
349	0.05
350	0.06
351	0.06
352	0.08
353	0.08
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.08
358	0.07
359	0.07
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.05
369	0.07
370	0.09
371	0.11
372	0.14
373	0.17
374	0.18
375	0.19
376	0.22
377	0.22
378	0.24
379	0.27
380	0.23
381	0.21
382	0.19
383	0.17
384	0.14
385	0.12
386	0.08
387	0.04
388	0.04
389	0.03
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.05
396	0.06
397	0.06
398	0.08
399	0.1
400	0.1
401	0.11
402	0.14
403	0.13
404	0.13
405	0.13
406	0.17
407	0.16
408	0.19
409	0.21
410	0.21
411	0.27
412	0.28
413	0.3
414	0.26
415	0.27
416	0.23
417	0.22
418	0.19
419	0.14
420	0.17
421	0.14
422	0.14
423	0.14
424	0.13
425	0.14
426	0.16
427	0.17
428	0.15
429	0.18
430	0.18
431	0.2
432	0.22
433	0.2
434	0.2
435	0.19
436	0.17
437	0.17
438	0.18
439	0.16
440	0.14
441	0.13
442	0.11
443	0.1
444	0.1
445	0.08
446	0.09
447	0.12
448	0.14
449	0.15
450	0.16
451	0.17
452	0.17
453	0.18
454	0.21
455	0.24
456	0.23
457	0.22
458	0.22
459	0.22
460	0.21
461	0.2
462	0.14
463	0.09
464	0.08
465	0.08
466	0.08
467	0.07
468	0.07
469	0.06
470	0.05
471	0.06
472	0.05
473	0.04
474	0.03
475	0.03
476	0.03
477	0.03
478	0.03
479	0.03
480	0.04
481	0.04
482	0.05
483	0.07
484	0.09
485	0.11
486	0.12
487	0.15
488	0.18
489	0.21
490	0.21
491	0.21
492	0.24
493	0.25
494	0.26
495	0.23
496	0.22
497	0.23
498	0.29
499	0.3
500	0.29
501	0.28
502	0.26
503	0.26
504	0.25
505	0.27
506	0.22
507	0.22
508	0.23
509	0.29
510	0.32
511	0.33
512	0.34
513	0.32
514	0.34
515	0.35
516	0.32
517	0.31
518	0.34
519	0.38
520	0.37
521	0.34
522	0.32
523	0.3
524	0.27
525	0.22
526	0.17
527	0.11
528	0.11
529	0.13
530	0.14
531	0.13
532	0.12
533	0.12
534	0.12
535	0.13
536	0.11
537	0.09
538	0.08
539	0.09
540	0.11
541	0.12
542	0.12
543	0.11
544	0.12
545	0.12
546	0.12
547	0.12
548	0.1
549	0.1
550	0.1
551	0.09
552	0.08
553	0.12
554	0.15
555	0.19
556	0.19
557	0.18
558	0.2
559	0.24
560	0.26
561	0.27
562	0.24
563	0.22
564	0.22
565	0.23

H1VKJ8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer