Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1UWS2

Protein Details
Accession H1UWS2    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-30MEDQVHKPHRKAKDKKNKQHTGEKNPKAFABasic
172-197DLFRKPQALKDAKKRLKRRLWSELYQHydrophilic
796-819FVQVRIKKHRWHKKILKTNDPLIFHydrophilic
1082-1141STIRNDKVAKRAAKKEEKRAEYRKKVAESEEKKEAREKKESKEFWRKNGRKRQAPDEGAGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-27KPHRKAKDKKNKQHTGEKNPK
181-190KDAKKRLKRR
523-528KKLHGK
1088-1149KVAKRAAKKEEKRAEYRKKVAESEEKKEAREKKESKEFWRKNGRKRQAPDEGAGGGGQKRRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012948  AARP2CN  
IPR039761  Bms1/Tsr1  
IPR037875  Bms1_N  
IPR007034  BMS1_TSR1_C  
IPR030387  G_Bms1/Tsr1_dom  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0034511  F:U3 snoRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:2000232  P:regulation of rRNA processing  
KEGG chig:CH63R_07726  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08142  AARP2CN  
PF04950  RIBIOP_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51714  G_BMS1  
CDD cd01882  BMS1  
Amino Acid Sequences MEDQVHKPHRKAKDKKNKQHTGEKNPKAFAFSNPGKLARSAARSSDIKERRFHVPQVDRLPDEPPPRLVTIVGPPGVGKTTLLKSLIRRYAKETLSDPQGPITVVTSKKQRLTFVECPNELEAMVDMAKIADIVLLMIDGNYGFEMETMEFLNVLAATGMPGNVFGILTHLDLFRKPQALKDAKKRLKRRLWSELYQGAHLFFLSGVMNGRYPDREVHNLSRFLSVMKNPRPLIWRNSHPYAIIDSYRDITHPTKIEEDSKCDRSVVLSGYLRGTNFASQGQRIHVPGLGDFTVANLEVLPDPCPTPAMEQAIAKVTGKTTRRRLDEKEKKLHAPMSDRSGLKIDGDAIWITREKGFTFDKDGEEGEMGEGEELIVGLQGERKLLGQTEEGVQLFKGGEQVKQIAEDDDTGRKTHRQARFADRDDDSEVEVDDEGFISGEDEGESDVEEEFNEGKLGKMFRKAAEKDADEEDIAFADSDSDLGSLSGVEDDDENDVDTDNEDFDSDEEAAAMKWKENMAERAKKLHGKRRSYHTPDLARFIYDDSLTAEEALQKWRGEDQDEEDIEADEEDDFFQKSKQDKEDKVEDRSIPQYDYEDLAAKWSQAANVEALRKRFTTAGQRDDDGEDGEDEDEFDGIDDEDEDDQGDGVFEDLETGEQHGGEDSVEHEPTEEEIFEQEREKNAKRKEELKLRFEEEDREGFMNDKANARREGGDQEFGEDDWYEAQKAVIQKQLDINKAEFETLDERQRAAVEGYRAGKYAKIVLEGVPAEFVTKFNPRNPIILGGLSPTEDRFGFVQVRIKKHRWHKKILKTNDPLIFSLGWRRFQTLPIYSISDSRTRNRMLKYTPEHMHCFGTIYGPLIAPNTGFVCFQSFSSANPGFRIAATGTVLSVDESTEIVKKLKLTGTADKIHKNTAFIKGMFNTSLEIAKFEGASIKTVSGVRGQIKRALSKPEGHFRATFEDKILYSDIVFLRAWYPIKPHRFYNPVTNLVGWQAMRLTGEVRRAEGIETPLQKNSQYRKIERETRHFNPLRVPRALAAELPFKSQIVQARKQKKDTYMQKRAVVLSKEEKTARNLLQQLSTIRNDKVAKRAAKKEEKRAEYRKKVAESEEKKEAREKKESKEFWRKNGRKRQAPDEGAGGGGQKRRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.92
3 0.94
4 0.94
5 0.91
6 0.92
7 0.91
8 0.9
9 0.9
10 0.89
11 0.85
12 0.79
13 0.72
14 0.67
15 0.58
16 0.52
17 0.51
18 0.46
19 0.48
20 0.47
21 0.49
22 0.44
23 0.43
24 0.43
25 0.39
26 0.4
27 0.35
28 0.34
29 0.39
30 0.39
31 0.42
32 0.48
33 0.49
34 0.48
35 0.5
36 0.51
37 0.53
38 0.56
39 0.57
40 0.57
41 0.58
42 0.62
43 0.66
44 0.68
45 0.62
46 0.58
47 0.56
48 0.52
49 0.49
50 0.44
51 0.38
52 0.36
53 0.35
54 0.35
55 0.32
56 0.28
57 0.3
58 0.32
59 0.29
60 0.25
61 0.24
62 0.24
63 0.25
64 0.22
65 0.16
66 0.15
67 0.17
68 0.21
69 0.23
70 0.25
71 0.3
72 0.39
73 0.47
74 0.47
75 0.47
76 0.5
77 0.56
78 0.55
79 0.54
80 0.48
81 0.45
82 0.47
83 0.48
84 0.42
85 0.35
86 0.34
87 0.29
88 0.26
89 0.23
90 0.21
91 0.21
92 0.25
93 0.32
94 0.36
95 0.42
96 0.45
97 0.47
98 0.48
99 0.55
100 0.59
101 0.61
102 0.64
103 0.58
104 0.58
105 0.54
106 0.48
107 0.38
108 0.3
109 0.2
110 0.13
111 0.12
112 0.09
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.03
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.08
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.07
155 0.08
156 0.09
157 0.1
158 0.11
159 0.12
160 0.16
161 0.18
162 0.23
163 0.23
164 0.27
165 0.36
166 0.45
167 0.52
168 0.59
169 0.66
170 0.69
171 0.79
172 0.83
173 0.84
174 0.85
175 0.86
176 0.85
177 0.84
178 0.84
179 0.79
180 0.78
181 0.73
182 0.65
183 0.57
184 0.48
185 0.38
186 0.3
187 0.24
188 0.17
189 0.1
190 0.09
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.1
196 0.11
197 0.13
198 0.13
199 0.14
200 0.18
201 0.21
202 0.27
203 0.32
204 0.4
205 0.45
206 0.46
207 0.46
208 0.44
209 0.39
210 0.34
211 0.32
212 0.29
213 0.32
214 0.36
215 0.42
216 0.41
217 0.44
218 0.48
219 0.49
220 0.52
221 0.5
222 0.53
223 0.53
224 0.57
225 0.54
226 0.49
227 0.46
228 0.41
229 0.36
230 0.29
231 0.23
232 0.2
233 0.2
234 0.2
235 0.18
236 0.19
237 0.17
238 0.21
239 0.22
240 0.23
241 0.25
242 0.27
243 0.34
244 0.33
245 0.38
246 0.4
247 0.41
248 0.39
249 0.36
250 0.33
251 0.27
252 0.28
253 0.23
254 0.22
255 0.2
256 0.2
257 0.22
258 0.24
259 0.22
260 0.2
261 0.19
262 0.15
263 0.14
264 0.17
265 0.17
266 0.18
267 0.19
268 0.21
269 0.22
270 0.21
271 0.21
272 0.19
273 0.17
274 0.16
275 0.17
276 0.14
277 0.12
278 0.11
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.05
284 0.06
285 0.07
286 0.08
287 0.09
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.1
293 0.12
294 0.15
295 0.17
296 0.18
297 0.18
298 0.19
299 0.21
300 0.21
301 0.19
302 0.16
303 0.13
304 0.19
305 0.23
306 0.29
307 0.36
308 0.43
309 0.49
310 0.54
311 0.61
312 0.66
313 0.72
314 0.74
315 0.75
316 0.72
317 0.69
318 0.67
319 0.63
320 0.56
321 0.52
322 0.46
323 0.43
324 0.43
325 0.4
326 0.37
327 0.36
328 0.31
329 0.25
330 0.22
331 0.16
332 0.11
333 0.12
334 0.11
335 0.09
336 0.1
337 0.1
338 0.11
339 0.11
340 0.12
341 0.11
342 0.15
343 0.17
344 0.17
345 0.22
346 0.23
347 0.23
348 0.23
349 0.23
350 0.2
351 0.18
352 0.16
353 0.1
354 0.08
355 0.07
356 0.06
357 0.05
358 0.04
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.05
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.08
371 0.08
372 0.1
373 0.09
374 0.1
375 0.11
376 0.13
377 0.13
378 0.13
379 0.12
380 0.11
381 0.1
382 0.09
383 0.12
384 0.1
385 0.11
386 0.12
387 0.14
388 0.14
389 0.15
390 0.15
391 0.11
392 0.11
393 0.12
394 0.12
395 0.14
396 0.15
397 0.15
398 0.16
399 0.17
400 0.22
401 0.29
402 0.33
403 0.35
404 0.4
405 0.5
406 0.57
407 0.59
408 0.59
409 0.51
410 0.47
411 0.44
412 0.38
413 0.29
414 0.2
415 0.16
416 0.11
417 0.1
418 0.08
419 0.06
420 0.05
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.05
441 0.06
442 0.08
443 0.11
444 0.11
445 0.16
446 0.18
447 0.21
448 0.29
449 0.3
450 0.34
451 0.37
452 0.36
453 0.34
454 0.34
455 0.32
456 0.23
457 0.22
458 0.16
459 0.11
460 0.1
461 0.07
462 0.05
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.03
469 0.03
470 0.04
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.04
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.05
486 0.05
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.05
491 0.06
492 0.06
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.08
498 0.07
499 0.06
500 0.07
501 0.08
502 0.09
503 0.12
504 0.19
505 0.24
506 0.31
507 0.32
508 0.35
509 0.38
510 0.43
511 0.47
512 0.5
513 0.51
514 0.52
515 0.56
516 0.61
517 0.68
518 0.69
519 0.69
520 0.68
521 0.66
522 0.59
523 0.58
524 0.5
525 0.4
526 0.32
527 0.26
528 0.2
529 0.12
530 0.11
531 0.08
532 0.08
533 0.08
534 0.08
535 0.07
536 0.07
537 0.08
538 0.09
539 0.1
540 0.09
541 0.1
542 0.12
543 0.13
544 0.13
545 0.14
546 0.15
547 0.19
548 0.19
549 0.19
550 0.17
551 0.16
552 0.15
553 0.13
554 0.1
555 0.04
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.05
561 0.05
562 0.09
563 0.12
564 0.16
565 0.22
566 0.28
567 0.31
568 0.36
569 0.45
570 0.45
571 0.46
572 0.47
573 0.4
574 0.36
575 0.36
576 0.32
577 0.23
578 0.2
579 0.17
580 0.14
581 0.14
582 0.12
583 0.11
584 0.09
585 0.11
586 0.11
587 0.09
588 0.09
589 0.08
590 0.08
591 0.08
592 0.09
593 0.08
594 0.1
595 0.14
596 0.16
597 0.17
598 0.18
599 0.17
600 0.18
601 0.17
602 0.18
603 0.24
604 0.28
605 0.33
606 0.33
607 0.33
608 0.33
609 0.33
610 0.3
611 0.2
612 0.15
613 0.09
614 0.08
615 0.07
616 0.06
617 0.05
618 0.05
619 0.04
620 0.04
621 0.03
622 0.03
623 0.03
624 0.03
625 0.03
626 0.04
627 0.04
628 0.04
629 0.05
630 0.04
631 0.04
632 0.04
633 0.04
634 0.03
635 0.03
636 0.03
637 0.03
638 0.03
639 0.03
640 0.03
641 0.04
642 0.04
643 0.04
644 0.04
645 0.05
646 0.04
647 0.05
648 0.04
649 0.04
650 0.05
651 0.07
652 0.07
653 0.07
654 0.07
655 0.07
656 0.08
657 0.09
658 0.07
659 0.05
660 0.06
661 0.08
662 0.08
663 0.1
664 0.1
665 0.13
666 0.18
667 0.22
668 0.29
669 0.34
670 0.41
671 0.43
672 0.49
673 0.54
674 0.59
675 0.63
676 0.61
677 0.6
678 0.55
679 0.54
680 0.48
681 0.43
682 0.35
683 0.29
684 0.25
685 0.21
686 0.19
687 0.17
688 0.17
689 0.17
690 0.16
691 0.2
692 0.2
693 0.23
694 0.24
695 0.25
696 0.25
697 0.23
698 0.27
699 0.24
700 0.26
701 0.22
702 0.22
703 0.21
704 0.19
705 0.18
706 0.12
707 0.1
708 0.08
709 0.08
710 0.07
711 0.07
712 0.07
713 0.09
714 0.11
715 0.13
716 0.16
717 0.16
718 0.17
719 0.23
720 0.28
721 0.29
722 0.28
723 0.26
724 0.24
725 0.24
726 0.23
727 0.17
728 0.15
729 0.15
730 0.15
731 0.2
732 0.18
733 0.18
734 0.19
735 0.19
736 0.18
737 0.15
738 0.16
739 0.12
740 0.16
741 0.18
742 0.18
743 0.19
744 0.18
745 0.18
746 0.15
747 0.18
748 0.15
749 0.14
750 0.14
751 0.14
752 0.17
753 0.16
754 0.15
755 0.11
756 0.1
757 0.1
758 0.09
759 0.09
760 0.09
761 0.14
762 0.17
763 0.2
764 0.28
765 0.28
766 0.3
767 0.31
768 0.31
769 0.27
770 0.25
771 0.21
772 0.15
773 0.14
774 0.12
775 0.12
776 0.08
777 0.09
778 0.08
779 0.09
780 0.09
781 0.11
782 0.13
783 0.14
784 0.22
785 0.25
786 0.33
787 0.39
788 0.43
789 0.48
790 0.57
791 0.66
792 0.66
793 0.71
794 0.74
795 0.78
796 0.84
797 0.85
798 0.85
799 0.8
800 0.8
801 0.74
802 0.66
803 0.56
804 0.47
805 0.39
806 0.29
807 0.32
808 0.28
809 0.27
810 0.25
811 0.28
812 0.27
813 0.3
814 0.35
815 0.3
816 0.29
817 0.26
818 0.29
819 0.26
820 0.28
821 0.27
822 0.27
823 0.27
824 0.29
825 0.32
826 0.33
827 0.39
828 0.4
829 0.44
830 0.42
831 0.49
832 0.51
833 0.53
834 0.55
835 0.54
836 0.55
837 0.5
838 0.48
839 0.38
840 0.34
841 0.26
842 0.22
843 0.17
844 0.14
845 0.13
846 0.12
847 0.12
848 0.1
849 0.1
850 0.08
851 0.09
852 0.09
853 0.09
854 0.09
855 0.09
856 0.11
857 0.11
858 0.12
859 0.16
860 0.15
861 0.15
862 0.23
863 0.26
864 0.23
865 0.23
866 0.25
867 0.2
868 0.2
869 0.21
870 0.13
871 0.12
872 0.12
873 0.11
874 0.1
875 0.1
876 0.1
877 0.08
878 0.08
879 0.06
880 0.05
881 0.06
882 0.07
883 0.08
884 0.1
885 0.1
886 0.12
887 0.13
888 0.16
889 0.18
890 0.22
891 0.26
892 0.33
893 0.38
894 0.44
895 0.48
896 0.5
897 0.49
898 0.5
899 0.46
900 0.41
901 0.39
902 0.39
903 0.4
904 0.34
905 0.37
906 0.32
907 0.34
908 0.31
909 0.27
910 0.21
911 0.17
912 0.19
913 0.15
914 0.14
915 0.12
916 0.12
917 0.12
918 0.11
919 0.14
920 0.12
921 0.14
922 0.14
923 0.14
924 0.15
925 0.16
926 0.17
927 0.16
928 0.2
929 0.24
930 0.28
931 0.3
932 0.34
933 0.37
934 0.42
935 0.42
936 0.45
937 0.42
938 0.46
939 0.51
940 0.55
941 0.55
942 0.52
943 0.5
944 0.44
945 0.49
946 0.45
947 0.39
948 0.31
949 0.3
950 0.27
951 0.28
952 0.27
953 0.19
954 0.15
955 0.19
956 0.17
957 0.17
958 0.16
959 0.15
960 0.14
961 0.18
962 0.19
963 0.15
964 0.22
965 0.28
966 0.37
967 0.4
968 0.43
969 0.48
970 0.52
971 0.54
972 0.58
973 0.57
974 0.53
975 0.52
976 0.48
977 0.4
978 0.36
979 0.35
980 0.24
981 0.18
982 0.13
983 0.12
984 0.12
985 0.12
986 0.13
987 0.13
988 0.2
989 0.2
990 0.21
991 0.22
992 0.22
993 0.23
994 0.24
995 0.25
996 0.25
997 0.29
998 0.3
999 0.31
1000 0.32
1001 0.34
1002 0.38
1003 0.42
1004 0.45
1005 0.48
1006 0.52
1007 0.58
1008 0.66
1009 0.73
1010 0.74
1011 0.76
1012 0.76
1013 0.72
1014 0.77
1015 0.72
1016 0.65
1017 0.65
1018 0.66
1019 0.63
1020 0.56
1021 0.53
1022 0.44
1023 0.46
1024 0.45
1025 0.37
1026 0.32
1027 0.32
1028 0.3
1029 0.31
1030 0.29
1031 0.24
1032 0.24
1033 0.24
1034 0.29
1035 0.3
1036 0.39
1037 0.46
1038 0.56
1039 0.63
1040 0.7
1041 0.73
1042 0.72
1043 0.75
1044 0.77
1045 0.78
1046 0.78
1047 0.78
1048 0.76
1049 0.73
1050 0.7
1051 0.67
1052 0.59
1053 0.55
1054 0.54
1055 0.5
1056 0.51
1057 0.5
1058 0.48
1059 0.45
1060 0.5
1061 0.47
1062 0.46
1063 0.48
1064 0.44
1065 0.44
1066 0.45
1067 0.44
1068 0.42
1069 0.43
1070 0.38
1071 0.34
1072 0.38
1073 0.4
1074 0.4
1075 0.45
1076 0.48
1077 0.53
1078 0.58
1079 0.66
1080 0.7
1081 0.76
1082 0.81
1083 0.83
1084 0.85
1085 0.84
1086 0.86
1087 0.87
1088 0.88
1089 0.87
1090 0.87
1091 0.85
1092 0.8
1093 0.76
1094 0.75
1095 0.75
1096 0.71
1097 0.68
1098 0.69
1099 0.63
1100 0.59
1101 0.63
1102 0.63
1103 0.6
1104 0.63
1105 0.62
1106 0.62
1107 0.71
1108 0.76
1109 0.78
1110 0.81
1111 0.81
1112 0.8
1113 0.85
1114 0.84
1115 0.84
1116 0.88
1117 0.88
1118 0.87
1119 0.87
1120 0.87
1121 0.86
1122 0.82
1123 0.74
1124 0.67
1125 0.57
1126 0.47
1127 0.4
1128 0.33
1129 0.26