Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5B1R713

Protein Details
Accession A0A5B1R713    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-111AASSRMEKRKEKQPEKRKKRNKPPRYFGISABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-105RMEKRKEKQPEKRKKRNKPPR
Subcellular Location(s) mito 19, cyto_mito 13.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015965  tRNA_lig_PDEase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003972  F:RNA ligase (ATP) activity  
GO:0006388  P:tRNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08302  tRNA_lig_CPD  
Amino Acid Sequences MLRRCRVPLITINLVSIIPAGRTLARFIESRSHIFSFLDGKIPGSCADTPARLPKLRRLSSTSISIAALASTMARPGTGNAASSRMEKRKEKQPEKRKKRNKPPRYFGISAEINLAHTLSSVLKEDHGGMAVSEMVRETWQQLKKKNRIARQPHVTLVHSKSLTGEHDLWDRCSALDALDIPPVFKFRLGHIVANGRVMAATVDEIEVYTEHEDGEAGRNFLEVLPVEIRDRLHITVGTQESSISAVEAKALVQEWRKGKKEGIVEVAIEKLWNVWL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.3
3 0.23
4 0.15
5 0.08
6 0.08
7 0.09
8 0.1
9 0.11
10 0.13
11 0.14
12 0.16
13 0.17
14 0.19
15 0.26
16 0.28
17 0.31
18 0.34
19 0.33
20 0.32
21 0.31
22 0.31
23 0.26
24 0.24
25 0.25
26 0.19
27 0.19
28 0.19
29 0.2
30 0.19
31 0.18
32 0.17
33 0.16
34 0.18
35 0.19
36 0.21
37 0.28
38 0.33
39 0.34
40 0.36
41 0.43
42 0.5
43 0.53
44 0.55
45 0.54
46 0.54
47 0.54
48 0.56
49 0.48
50 0.39
51 0.34
52 0.3
53 0.23
54 0.16
55 0.12
56 0.07
57 0.06
58 0.04
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.1
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.14
69 0.15
70 0.18
71 0.24
72 0.25
73 0.31
74 0.36
75 0.4
76 0.48
77 0.58
78 0.66
79 0.7
80 0.76
81 0.81
82 0.87
83 0.92
84 0.93
85 0.93
86 0.94
87 0.95
88 0.95
89 0.94
90 0.92
91 0.9
92 0.88
93 0.79
94 0.69
95 0.64
96 0.54
97 0.43
98 0.36
99 0.26
100 0.18
101 0.16
102 0.14
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.06
126 0.12
127 0.18
128 0.22
129 0.3
130 0.4
131 0.47
132 0.55
133 0.61
134 0.61
135 0.66
136 0.71
137 0.73
138 0.71
139 0.66
140 0.62
141 0.57
142 0.51
143 0.46
144 0.4
145 0.35
146 0.27
147 0.25
148 0.21
149 0.2
150 0.2
151 0.19
152 0.17
153 0.13
154 0.19
155 0.19
156 0.2
157 0.19
158 0.18
159 0.14
160 0.15
161 0.14
162 0.08
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.11
167 0.11
168 0.1
169 0.1
170 0.12
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.19
176 0.21
177 0.22
178 0.24
179 0.29
180 0.28
181 0.28
182 0.26
183 0.17
184 0.15
185 0.14
186 0.1
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.05
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.13
203 0.13
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.14
210 0.08
211 0.1
212 0.11
213 0.12
214 0.14
215 0.15
216 0.16
217 0.16
218 0.19
219 0.17
220 0.18
221 0.17
222 0.17
223 0.23
224 0.24
225 0.22
226 0.19
227 0.18
228 0.16
229 0.17
230 0.16
231 0.09
232 0.08
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.09
239 0.12
240 0.16
241 0.23
242 0.3
243 0.39
244 0.43
245 0.45
246 0.48
247 0.5
248 0.53
249 0.52
250 0.51
251 0.44
252 0.41
253 0.4
254 0.37
255 0.31
256 0.23
257 0.17