Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VW40

Protein Details
Accession H1VW40    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-26MSARGGSRPPPRGRPNKVTKPSPGGLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-30GSRPPPRGRPNKVTKPSPGGLKRDA
Subcellular Location(s) mito 13.5, cyto_mito 10.166, cyto_nucl 7.333, nucl 7, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022190  DUF3716  
KEGG chig:CH63R_02371  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12511  DUF3716  
Amino Acid Sequences MSARGGSRPPPRGRPNKVTKPSPGGLKRDAHGRQSRHSSVATDQLEQLAHDAEAEAEHEDDDEITAPPPPGSSSHHHQQQHHQQQHHQQQHHHHPNPFDLATAGILANGPPGSVPGTDSDIHPDLHNLPAQFAMEAPMGTHGTGTLSRTAEDLASESGYGQLVIDSALAKRLANNEGQRPAVQRRQDQTLNLKRRSNVEALLAHVSGQEAHSPCKSCHKGYGPWNGCVVVNGQMCGSCANCWFNASGSRCSFHENNLPQHMPAIQIQPVPQVSANTSFAGTAPMAPGMAPVGSSFGQPGADPTVAQFVKDVLDRAMVEARSDNPHVRFQLRIETAARQLALASAEYAEFLAQQGGHDPSQHPDAEGSAPEAAMGEGDNGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.86
3 0.87
4 0.89
5 0.86
6 0.83
7 0.81
8 0.76
9 0.76
10 0.72
11 0.68
12 0.66
13 0.63
14 0.57
15 0.58
16 0.58
17 0.57
18 0.58
19 0.56
20 0.57
21 0.62
22 0.63
23 0.57
24 0.54
25 0.47
26 0.42
27 0.46
28 0.4
29 0.33
30 0.3
31 0.28
32 0.27
33 0.24
34 0.22
35 0.14
36 0.11
37 0.09
38 0.09
39 0.07
40 0.07
41 0.08
42 0.07
43 0.06
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.09
53 0.1
54 0.09
55 0.1
56 0.1
57 0.12
58 0.16
59 0.22
60 0.27
61 0.35
62 0.43
63 0.48
64 0.51
65 0.59
66 0.65
67 0.7
68 0.7
69 0.65
70 0.64
71 0.69
72 0.76
73 0.75
74 0.68
75 0.63
76 0.65
77 0.73
78 0.77
79 0.73
80 0.67
81 0.6
82 0.59
83 0.58
84 0.49
85 0.38
86 0.27
87 0.21
88 0.17
89 0.15
90 0.11
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.06
96 0.05
97 0.04
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.08
103 0.11
104 0.12
105 0.12
106 0.17
107 0.17
108 0.17
109 0.17
110 0.17
111 0.15
112 0.16
113 0.18
114 0.14
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.08
122 0.08
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.06
129 0.07
130 0.08
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.12
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.07
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.1
159 0.11
160 0.15
161 0.19
162 0.21
163 0.23
164 0.24
165 0.24
166 0.25
167 0.28
168 0.29
169 0.3
170 0.32
171 0.32
172 0.37
173 0.38
174 0.37
175 0.42
176 0.47
177 0.51
178 0.5
179 0.5
180 0.46
181 0.47
182 0.48
183 0.39
184 0.31
185 0.26
186 0.22
187 0.22
188 0.22
189 0.18
190 0.15
191 0.13
192 0.11
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.08
197 0.1
198 0.12
199 0.14
200 0.15
201 0.25
202 0.27
203 0.25
204 0.31
205 0.34
206 0.39
207 0.45
208 0.56
209 0.49
210 0.47
211 0.47
212 0.41
213 0.36
214 0.29
215 0.23
216 0.18
217 0.16
218 0.14
219 0.13
220 0.12
221 0.13
222 0.13
223 0.12
224 0.06
225 0.08
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.11
231 0.17
232 0.2
233 0.24
234 0.24
235 0.25
236 0.25
237 0.3
238 0.3
239 0.26
240 0.32
241 0.32
242 0.35
243 0.4
244 0.4
245 0.35
246 0.35
247 0.32
248 0.24
249 0.22
250 0.19
251 0.15
252 0.16
253 0.16
254 0.19
255 0.18
256 0.18
257 0.16
258 0.14
259 0.14
260 0.17
261 0.18
262 0.15
263 0.15
264 0.14
265 0.13
266 0.14
267 0.13
268 0.09
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.04
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.09
284 0.08
285 0.1
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.19
291 0.19
292 0.19
293 0.17
294 0.14
295 0.16
296 0.17
297 0.18
298 0.1
299 0.13
300 0.13
301 0.15
302 0.19
303 0.17
304 0.17
305 0.18
306 0.2
307 0.22
308 0.25
309 0.28
310 0.26
311 0.32
312 0.35
313 0.35
314 0.35
315 0.32
316 0.39
317 0.36
318 0.36
319 0.33
320 0.33
321 0.34
322 0.35
323 0.33
324 0.23
325 0.21
326 0.18
327 0.17
328 0.14
329 0.11
330 0.09
331 0.08
332 0.09
333 0.09
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.11
341 0.14
342 0.15
343 0.17
344 0.18
345 0.2
346 0.25
347 0.25
348 0.22
349 0.19
350 0.21
351 0.21
352 0.21
353 0.2
354 0.16
355 0.15
356 0.14
357 0.13
358 0.11
359 0.09
360 0.08