Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VGC9

Protein Details
Accession H1VGC9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-47ITTKYSIKPVKPRKSKTPTEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-157GGGGGKKKKKGKK
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 9, cyto_nucl 8.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039914  SRP9-like  
IPR039432  SRP9_dom  
Gene Ontology GO:0048500  C:signal recognition particle  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
KEGG chig:CH63R_02546  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05486  SRP9-21  
Amino Acid Sequences MPTYKTSQEWLEQSSLLLQARPATTRITTKYSIKPVKPRKSKTPTEDATTTEDAPMTDAKPPRGSLVLKTFDPVSGVTLKYRTTKAAEVSRLITCLGTLSRTMSTSKAPVEVKDEPMADSAGAPVAGEDTPVGASAGAPTPAGAGGGGGKKKKKGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.2
4 0.17
5 0.14
6 0.16
7 0.17
8 0.18
9 0.18
10 0.17
11 0.2
12 0.25
13 0.28
14 0.3
15 0.32
16 0.36
17 0.42
18 0.5
19 0.55
20 0.56
21 0.63
22 0.68
23 0.75
24 0.79
25 0.79
26 0.8
27 0.8
28 0.84
29 0.8
30 0.79
31 0.72
32 0.68
33 0.62
34 0.53
35 0.5
36 0.43
37 0.36
38 0.26
39 0.23
40 0.16
41 0.16
42 0.14
43 0.1
44 0.12
45 0.14
46 0.16
47 0.18
48 0.18
49 0.19
50 0.21
51 0.21
52 0.2
53 0.25
54 0.26
55 0.24
56 0.24
57 0.23
58 0.2
59 0.2
60 0.16
61 0.1
62 0.09
63 0.1
64 0.09
65 0.1
66 0.12
67 0.13
68 0.14
69 0.14
70 0.15
71 0.16
72 0.2
73 0.25
74 0.25
75 0.24
76 0.26
77 0.25
78 0.23
79 0.21
80 0.16
81 0.1
82 0.1
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.1
89 0.11
90 0.11
91 0.13
92 0.14
93 0.15
94 0.18
95 0.18
96 0.18
97 0.23
98 0.25
99 0.26
100 0.27
101 0.26
102 0.22
103 0.22
104 0.21
105 0.15
106 0.13
107 0.1
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.04
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.05
121 0.05
122 0.06
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.06
131 0.05
132 0.08
133 0.14
134 0.19
135 0.25
136 0.29
137 0.37