Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VBV1

Protein Details
Accession H1VBV1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
364-396EALLPSKESKSKSQKKKRKKASETEPRARPEKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
370-396KESKSKSQKKKRKKASETEPRARPEKK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026832  Asteroid  
IPR039436  Asteroid_dom  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
KEGG chig:CH63R_04955  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12813  XPG_I_2  
Amino Acid Sequences MLLSAAIYFDGFLPASKSEVRLERILKVSSSLKVYRSGFPNGCPARQIASTRISLPPLFPTDAPIRDQPLIPPPPFLVAAVVDKLCQTSKYATVVRLVPGEADAYCAEDVFRNGGTILTSDSDLTIHDLKLGAVTFFRDLHIASTEEGDQLMGPKFSPSDIARRLQLPQDQGMRRFGYELSKSSRPKFAQVLENCKGDLLDPDEFRRFCIPYETLETTDWSDVPVLGGIDNPTLDARLSEVVLQCLILAYALEEDKQDACLGSIKQVFSVAKDSNLVPWDVVHLTAQVQATLYSLRILAQVLDLMYEIKAEKPVQGSKQLRELLATLPPLADYPSVSGTIALMASLKDSDVLAKVATALDLPEEALLPSKESKSKSQKKKRKKASETEPRARPEKKVSSNPFDILETE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.14
3 0.15
4 0.17
5 0.21
6 0.27
7 0.31
8 0.36
9 0.38
10 0.41
11 0.44
12 0.44
13 0.38
14 0.37
15 0.36
16 0.33
17 0.37
18 0.34
19 0.31
20 0.37
21 0.39
22 0.41
23 0.42
24 0.47
25 0.43
26 0.42
27 0.5
28 0.46
29 0.44
30 0.39
31 0.36
32 0.32
33 0.34
34 0.35
35 0.29
36 0.3
37 0.31
38 0.33
39 0.33
40 0.33
41 0.29
42 0.27
43 0.27
44 0.27
45 0.27
46 0.24
47 0.27
48 0.29
49 0.31
50 0.33
51 0.31
52 0.31
53 0.3
54 0.31
55 0.29
56 0.32
57 0.37
58 0.34
59 0.33
60 0.29
61 0.3
62 0.29
63 0.27
64 0.19
65 0.14
66 0.15
67 0.16
68 0.15
69 0.13
70 0.13
71 0.14
72 0.13
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.16
77 0.22
78 0.24
79 0.24
80 0.27
81 0.29
82 0.28
83 0.26
84 0.23
85 0.17
86 0.15
87 0.15
88 0.11
89 0.11
90 0.09
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.1
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.07
111 0.1
112 0.1
113 0.09
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.11
118 0.11
119 0.08
120 0.07
121 0.08
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.1
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.11
132 0.11
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.07
137 0.08
138 0.09
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.12
145 0.11
146 0.18
147 0.22
148 0.24
149 0.25
150 0.26
151 0.28
152 0.28
153 0.3
154 0.24
155 0.25
156 0.31
157 0.32
158 0.32
159 0.35
160 0.31
161 0.28
162 0.26
163 0.23
164 0.21
165 0.2
166 0.22
167 0.23
168 0.29
169 0.32
170 0.33
171 0.4
172 0.35
173 0.37
174 0.37
175 0.36
176 0.38
177 0.39
178 0.45
179 0.41
180 0.41
181 0.37
182 0.33
183 0.29
184 0.2
185 0.18
186 0.12
187 0.12
188 0.12
189 0.15
190 0.19
191 0.19
192 0.2
193 0.2
194 0.17
195 0.15
196 0.19
197 0.17
198 0.16
199 0.22
200 0.22
201 0.21
202 0.21
203 0.22
204 0.18
205 0.18
206 0.16
207 0.1
208 0.09
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.04
235 0.03
236 0.03
237 0.04
238 0.04
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.1
248 0.1
249 0.14
250 0.16
251 0.16
252 0.16
253 0.19
254 0.19
255 0.16
256 0.21
257 0.17
258 0.15
259 0.17
260 0.17
261 0.17
262 0.18
263 0.16
264 0.11
265 0.11
266 0.13
267 0.11
268 0.12
269 0.09
270 0.08
271 0.09
272 0.12
273 0.12
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.1
297 0.1
298 0.13
299 0.17
300 0.22
301 0.25
302 0.35
303 0.39
304 0.38
305 0.46
306 0.46
307 0.42
308 0.38
309 0.36
310 0.28
311 0.27
312 0.25
313 0.17
314 0.14
315 0.14
316 0.13
317 0.13
318 0.11
319 0.08
320 0.1
321 0.11
322 0.12
323 0.11
324 0.11
325 0.1
326 0.1
327 0.09
328 0.07
329 0.06
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.08
337 0.08
338 0.09
339 0.08
340 0.08
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.06
350 0.07
351 0.07
352 0.1
353 0.1
354 0.12
355 0.15
356 0.19
357 0.24
358 0.27
359 0.38
360 0.45
361 0.56
362 0.65
363 0.73
364 0.8
365 0.86
366 0.94
367 0.95
368 0.95
369 0.95
370 0.95
371 0.94
372 0.95
373 0.94
374 0.93
375 0.9
376 0.84
377 0.82
378 0.75
379 0.7
380 0.69
381 0.68
382 0.68
383 0.71
384 0.74
385 0.74
386 0.77
387 0.72
388 0.65