FuNGI

A0A5B1QY89

Protein Details

Accession

A0A5B1QY89

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
273-363	SESEDDKRKSKSKKRKSAKESSSKSKSKKRKRSKESDDESDASDRGSKKSKSKGKKRKRDDSDEEESASEAEAKKKRKKRKVDKSDASGSE	Basic
367-398	DSDSDARSKKKSKAKKKSKSRRSKSSDESSSD	Hydrophilic
408-444	GSDSDTSRRKRSKSKSSSRSKSKSKSSKLRARSSSPD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
279-308	KRKSKSKKRKSAKESSSKSKSKKRKRSKES
315-331	SDRGSKKSKSKGKKRKR
344-355	EAKKKRKKRKVD
373-390	RSKKKSKAKKKSKSRRSK
415-439	RRKRSKSKSSSRSKSKSKSSKLRAR

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MAARKLNPLETKLHQAALQAGKPITQKEVDAIVPDAAARISAINFLLGAGMLKLLKDGNKLLYRAVQKGEMDIKKGLTGEENMVLGHIQAAANQGIWTKHLKAKTELHQTVIDRCLKSLVQKQLIKAVKGVDKNRTRKIYMMAHLEPSVELTGGPWYTDSELDTEFIKLLCSACLRFIKDRSFPKQKNSDDAPASSLPLYSISDAPAYPTAQQITGFLSKSKITETQLTEEHVEMLLNVLILDGDVEKIPAFAAAMWDSNAIADDVSGSESGSESEDDKRKSKSKKRKSAKESSSKSKSKKRKRSKESDDESDASDRGSKKSKSKGKKRKRDDSDEEESASEAEAKKKRKKRKVDKSDASGSESASDSDSDARSKKKSKAKKKSKSRRSKSSDESSSDSDSDSGSESGSDSDTSRRKRSKSKSSSRSKSKSKSSKLRARSSSPDATMGNDSFTGSAWVYRAIRQERVALGWSEAPCGRCPVFDFCKDGGPVNAKECEYYGEWLTRGVVEQE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.38
2	0.35
3	0.39
4	0.39
5	0.37
6	0.32
7	0.3
8	0.32
9	0.34
10	0.34
11	0.3
12	0.26
13	0.24
14	0.22
15	0.26
16	0.23
17	0.23
18	0.22
19	0.18
20	0.17
21	0.16
22	0.14
23	0.1
24	0.09
25	0.07
26	0.07
27	0.07
28	0.08
29	0.09
30	0.08
31	0.08
32	0.08
33	0.08
34	0.07
35	0.07
36	0.05
37	0.06
38	0.06
39	0.06
40	0.07
41	0.09
42	0.11
43	0.14
44	0.17
45	0.24
46	0.28
47	0.29
48	0.3
49	0.36
50	0.38
51	0.39
52	0.39
53	0.35
54	0.31
55	0.35
56	0.42
57	0.37
58	0.36
59	0.35
60	0.33
61	0.3
62	0.3
63	0.25
64	0.19
65	0.19
66	0.18
67	0.18
68	0.17
69	0.15
70	0.15
71	0.14
72	0.11
73	0.09
74	0.08
75	0.06
76	0.06
77	0.09
78	0.09
79	0.09
80	0.1
81	0.11
82	0.1
83	0.13
84	0.16
85	0.17
86	0.22
87	0.26
88	0.29
89	0.33
90	0.41
91	0.48
92	0.55
93	0.52
94	0.51
95	0.51
96	0.49
97	0.48
98	0.46
99	0.43
100	0.33
101	0.32
102	0.31
103	0.27
104	0.32
105	0.35
106	0.38
107	0.41
108	0.43
109	0.44
110	0.5
111	0.53
112	0.48
113	0.42
114	0.38
115	0.35
116	0.39
117	0.43
118	0.43
119	0.49
120	0.56
121	0.62
122	0.62
123	0.58
124	0.54
125	0.57
126	0.55
127	0.51
128	0.51
129	0.45
130	0.42
131	0.4
132	0.37
133	0.3
134	0.23
135	0.18
136	0.1
137	0.08
138	0.06
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.07
143	0.07
144	0.08
145	0.09
146	0.09
147	0.09
148	0.09
149	0.1
150	0.1
151	0.1
152	0.09
153	0.09
154	0.08
155	0.07
156	0.07
157	0.08
158	0.09
159	0.09
160	0.14
161	0.17
162	0.2
163	0.23
164	0.28
165	0.32
166	0.38
167	0.45
168	0.49
169	0.56
170	0.56
171	0.61
172	0.66
173	0.62
174	0.63
175	0.6
176	0.58
177	0.49
178	0.47
179	0.42
180	0.33
181	0.31
182	0.24
183	0.19
184	0.12
185	0.11
186	0.11
187	0.08
188	0.08
189	0.08
190	0.09
191	0.09
192	0.1
193	0.1
194	0.1
195	0.1
196	0.11
197	0.11
198	0.1
199	0.11
200	0.1
201	0.12
202	0.13
203	0.13
204	0.12
205	0.13
206	0.13
207	0.14
208	0.15
209	0.15
210	0.14
211	0.2
212	0.21
213	0.23
214	0.23
215	0.24
216	0.23
217	0.21
218	0.19
219	0.13
220	0.11
221	0.07
222	0.07
223	0.05
224	0.04
225	0.04
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.04
236	0.04
237	0.03
238	0.03
239	0.03
240	0.04
241	0.05
242	0.05
243	0.05
244	0.06
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.04
249	0.04
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.05
260	0.05
261	0.06
262	0.11
263	0.16
264	0.18
265	0.21
266	0.25
267	0.31
268	0.41
269	0.5
270	0.57
271	0.63
272	0.72
273	0.8
274	0.86
275	0.88
276	0.89
277	0.89
278	0.88
279	0.84
280	0.83
281	0.81
282	0.78
283	0.76
284	0.75
285	0.76
286	0.77
287	0.81
288	0.83
289	0.84
290	0.88
291	0.92
292	0.92
293	0.92
294	0.88
295	0.84
296	0.78
297	0.68
298	0.59
299	0.5
300	0.39
301	0.28
302	0.25
303	0.19
304	0.17
305	0.22
306	0.24
307	0.29
308	0.39
309	0.49
310	0.55
311	0.66
312	0.74
313	0.79
314	0.86
315	0.9
316	0.91
317	0.91
318	0.9
319	0.87
320	0.84
321	0.81
322	0.72
323	0.63
324	0.52
325	0.43
326	0.32
327	0.24
328	0.18
329	0.11
330	0.16
331	0.21
332	0.29
333	0.38
334	0.47
335	0.58
336	0.66
337	0.76
338	0.8
339	0.86
340	0.9
341	0.92
342	0.92
343	0.88
344	0.87
345	0.78
346	0.71
347	0.6
348	0.49
349	0.39
350	0.31
351	0.23
352	0.15
353	0.13
354	0.09
355	0.11
356	0.12
357	0.13
358	0.16
359	0.19
360	0.25
361	0.31
362	0.39
363	0.47
364	0.56
365	0.65
366	0.73
367	0.81
368	0.85
369	0.91
370	0.94
371	0.95
372	0.96
373	0.94
374	0.94
375	0.91
376	0.89
377	0.87
378	0.85
379	0.81
380	0.74
381	0.69
382	0.61
383	0.56
384	0.47
385	0.39
386	0.29
387	0.21
388	0.18
389	0.15
390	0.12
391	0.09
392	0.08
393	0.08
394	0.09
395	0.09
396	0.1
397	0.09
398	0.16
399	0.23
400	0.29
401	0.38
402	0.44
403	0.5
404	0.59
405	0.69
406	0.73
407	0.77
408	0.82
409	0.83
410	0.88
411	0.92
412	0.92
413	0.92
414	0.91
415	0.88
416	0.88
417	0.88
418	0.88
419	0.88
420	0.88
421	0.88
422	0.87
423	0.89
424	0.85
425	0.81
426	0.78
427	0.75
428	0.71
429	0.63
430	0.58
431	0.48
432	0.44
433	0.41
434	0.34
435	0.27
436	0.21
437	0.19
438	0.15
439	0.15
440	0.14
441	0.1
442	0.11
443	0.1
444	0.15
445	0.16
446	0.2
447	0.28
448	0.3
449	0.34
450	0.35
451	0.39
452	0.36
453	0.37
454	0.37
455	0.29
456	0.27
457	0.28
458	0.26
459	0.25
460	0.26
461	0.25
462	0.24
463	0.28
464	0.26
465	0.22
466	0.26
467	0.31
468	0.35
469	0.37
470	0.42
471	0.38
472	0.44
473	0.43
474	0.42
475	0.39
476	0.39
477	0.38
478	0.36
479	0.4
480	0.33
481	0.33
482	0.32
483	0.3
484	0.26
485	0.27
486	0.26
487	0.25
488	0.24
489	0.24
490	0.25
491	0.21

A0A5B1QY89

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer