Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5B1QAK0

Protein Details
Accession A0A5B1QAK0    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-132SDLPVRSRSRSPRPRPRNGRGGRRSBasic
216-235RSSRSRSRSLSRSRSRSRSAHydrophilic
238-267SSYSRYSRSRSRSRSYSRGRRSNSRDDIRDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
113-233RSRSRSPRPRPRNGRGGRRSISRSPSRSRSPRFARRDSGRFGDSYRRPYGRRQPVRDTYRPHSPSRSRSPVRRGGLGPRRRSPSYERGGYGRRGRSRSPSYSVRSSRSRSRSLSRSRSRSR
248-251SRSR
254-257SRGR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSMKDRSPSPQTPPRDEDVDMDNGVPDKPTAKVVVVTNLTRNVVEAHLHTIFGFYGKILKIDIPVYAKSGQNRGKAAVEYFDPESAHKAATHMDGGQLDGAVLKVELSDLPVRSRSRSPRPRPRNGRGGRRSISRSPSRSRSPRFARRDSGRFGDSYRRPYGRRQPVRDTYRPHSPSRSRSPVRRGGLGPRRRSPSYERGGYGRRGRSRSPSYSVRSSRSRSRSLSRSRSRSRSASYSSYSRYSRSRSRSRSYSRGRRSNSRDDIRDSRSRSPPPAAAAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.58
3 0.54
4 0.48
5 0.43
6 0.4
7 0.32
8 0.27
9 0.23
10 0.2
11 0.19
12 0.16
13 0.12
14 0.1
15 0.11
16 0.13
17 0.14
18 0.14
19 0.18
20 0.19
21 0.26
22 0.28
23 0.29
24 0.3
25 0.31
26 0.31
27 0.26
28 0.25
29 0.2
30 0.17
31 0.17
32 0.15
33 0.17
34 0.17
35 0.17
36 0.16
37 0.15
38 0.14
39 0.13
40 0.11
41 0.06
42 0.1
43 0.1
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.13
48 0.13
49 0.16
50 0.15
51 0.15
52 0.18
53 0.2
54 0.22
55 0.22
56 0.3
57 0.34
58 0.35
59 0.36
60 0.36
61 0.35
62 0.34
63 0.32
64 0.26
65 0.2
66 0.19
67 0.18
68 0.17
69 0.15
70 0.14
71 0.17
72 0.15
73 0.15
74 0.12
75 0.12
76 0.12
77 0.13
78 0.13
79 0.1
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.1
84 0.08
85 0.07
86 0.06
87 0.05
88 0.04
89 0.04
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.06
95 0.08
96 0.09
97 0.1
98 0.15
99 0.16
100 0.19
101 0.25
102 0.3
103 0.39
104 0.49
105 0.59
106 0.65
107 0.74
108 0.82
109 0.86
110 0.85
111 0.85
112 0.82
113 0.82
114 0.77
115 0.76
116 0.68
117 0.64
118 0.62
119 0.56
120 0.56
121 0.52
122 0.51
123 0.49
124 0.52
125 0.55
126 0.58
127 0.57
128 0.59
129 0.61
130 0.66
131 0.68
132 0.67
133 0.66
134 0.65
135 0.65
136 0.59
137 0.54
138 0.45
139 0.38
140 0.35
141 0.36
142 0.33
143 0.34
144 0.35
145 0.35
146 0.35
147 0.42
148 0.51
149 0.53
150 0.59
151 0.59
152 0.63
153 0.7
154 0.76
155 0.75
156 0.71
157 0.65
158 0.66
159 0.63
160 0.57
161 0.56
162 0.54
163 0.56
164 0.59
165 0.64
166 0.59
167 0.63
168 0.68
169 0.69
170 0.65
171 0.62
172 0.54
173 0.55
174 0.59
175 0.6
176 0.59
177 0.56
178 0.6
179 0.56
180 0.59
181 0.56
182 0.55
183 0.55
184 0.53
185 0.47
186 0.46
187 0.49
188 0.52
189 0.52
190 0.51
191 0.5
192 0.49
193 0.51
194 0.55
195 0.59
196 0.57
197 0.56
198 0.56
199 0.55
200 0.6
201 0.62
202 0.59
203 0.58
204 0.58
205 0.61
206 0.6
207 0.61
208 0.57
209 0.6
210 0.64
211 0.67
212 0.73
213 0.73
214 0.77
215 0.79
216 0.81
217 0.8
218 0.77
219 0.72
220 0.69
221 0.65
222 0.6
223 0.56
224 0.54
225 0.51
226 0.51
227 0.46
228 0.43
229 0.43
230 0.44
231 0.48
232 0.53
233 0.59
234 0.62
235 0.69
236 0.75
237 0.78
238 0.82
239 0.84
240 0.85
241 0.85
242 0.86
243 0.85
244 0.85
245 0.84
246 0.85
247 0.84
248 0.82
249 0.77
250 0.75
251 0.76
252 0.73
253 0.73
254 0.68
255 0.67
256 0.66
257 0.67
258 0.65
259 0.63
260 0.6
261 0.56