Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VRK5

Protein Details
Accession H1VRK5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-258IGTGGKTKRERERKTKQLLDIDQRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
95-120PARGGPRGGYGARVRGGRGGRFPRER
267-288GGPRGGARGGARGGARGGARGG
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 11, nucl 5.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MLLGFKISTNNFPLQNLFELLGNDAEDDTPQAPVKTVEKTTMRSTKRGVEPEAPSRAAAGNTGAPRRNNASGNEAAFRDRGAGSDRNRGKTTDEPARGGPRGGYGARVRGGRGGRFPRERDDRQSKGLASGSEKQAAQSWGATEGDAERKDEQAGEAIAQAEAKDAEAEAAAPVEPEEPEDKHISYTDYLAQLAEKKLALEGNTEVRKANEGTKLKKEWANAKEVARDDEDTFMIGTGGKTKRERERKTKQLLDIDQRYVEPERSHGGPRGGARGGARGGARGGARGGDRGXVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.29
3 0.27
4 0.23
5 0.19
6 0.19
7 0.19
8 0.17
9 0.14
10 0.12
11 0.11
12 0.1
13 0.09
14 0.1
15 0.09
16 0.1
17 0.12
18 0.12
19 0.12
20 0.15
21 0.18
22 0.21
23 0.22
24 0.27
25 0.3
26 0.34
27 0.41
28 0.48
29 0.48
30 0.48
31 0.5
32 0.52
33 0.55
34 0.57
35 0.53
36 0.51
37 0.54
38 0.57
39 0.59
40 0.5
41 0.42
42 0.38
43 0.34
44 0.27
45 0.22
46 0.16
47 0.16
48 0.18
49 0.23
50 0.26
51 0.25
52 0.28
53 0.32
54 0.35
55 0.33
56 0.32
57 0.33
58 0.33
59 0.34
60 0.33
61 0.29
62 0.26
63 0.22
64 0.2
65 0.16
66 0.13
67 0.12
68 0.14
69 0.2
70 0.22
71 0.31
72 0.36
73 0.39
74 0.4
75 0.4
76 0.4
77 0.39
78 0.43
79 0.43
80 0.41
81 0.38
82 0.4
83 0.44
84 0.4
85 0.35
86 0.28
87 0.2
88 0.2
89 0.18
90 0.19
91 0.16
92 0.18
93 0.2
94 0.21
95 0.19
96 0.21
97 0.24
98 0.21
99 0.27
100 0.31
101 0.35
102 0.4
103 0.41
104 0.44
105 0.5
106 0.52
107 0.54
108 0.56
109 0.52
110 0.51
111 0.52
112 0.44
113 0.39
114 0.37
115 0.28
116 0.24
117 0.25
118 0.23
119 0.22
120 0.22
121 0.2
122 0.21
123 0.2
124 0.17
125 0.12
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.07
131 0.07
132 0.11
133 0.11
134 0.12
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.04
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.04
156 0.03
157 0.04
158 0.03
159 0.03
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.07
165 0.08
166 0.11
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.14
171 0.14
172 0.13
173 0.14
174 0.14
175 0.13
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.13
180 0.13
181 0.13
182 0.1
183 0.1
184 0.11
185 0.12
186 0.11
187 0.11
188 0.12
189 0.18
190 0.2
191 0.2
192 0.2
193 0.19
194 0.21
195 0.2
196 0.23
197 0.24
198 0.29
199 0.34
200 0.41
201 0.44
202 0.45
203 0.47
204 0.47
205 0.48
206 0.45
207 0.46
208 0.44
209 0.43
210 0.44
211 0.43
212 0.41
213 0.34
214 0.33
215 0.28
216 0.25
217 0.23
218 0.17
219 0.16
220 0.13
221 0.11
222 0.09
223 0.08
224 0.13
225 0.16
226 0.21
227 0.24
228 0.31
229 0.42
230 0.52
231 0.61
232 0.64
233 0.73
234 0.78
235 0.85
236 0.86
237 0.83
238 0.82
239 0.8
240 0.8
241 0.75
242 0.67
243 0.58
244 0.51
245 0.47
246 0.4
247 0.36
248 0.27
249 0.24
250 0.25
251 0.26
252 0.3
253 0.31
254 0.31
255 0.32
256 0.34
257 0.37
258 0.33
259 0.33
260 0.3
261 0.3
262 0.28
263 0.27
264 0.24
265 0.2
266 0.2
267 0.21
268 0.2
269 0.17
270 0.17
271 0.16
272 0.17
273 0.18