Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5B1QEM6

Protein Details
Accession A0A5B1QEM6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MASVRQPKPSRKGPPNDSGPNRRPAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.333, mito 5.5, cyto_mito 4.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
Amino Acid Sequences MASVRQPKPSRKGPPNDSGPNRRPAWGSMGRSSPAFSPSPNSARLPNGPPPANSSAAPAFPPLANPAAPRQDAPQDKVLQALTGLTRYEGVVASTAGEGDTAGVSLRDVKEISSPGAPLKDQFFIASTNIDTWASGPADAKAPNGDSFKTDTDISHKPQQRRERELTAWADSPLPASLSPLSPPLGTRNLAHTDDITFGAGASQTTSWDQFDANERLFGVKTAFDEDQYTTKLDRTAKDFKEREKRAQVIANEILGATTNNPHIAEERSMNNTDDNGTNEEDKYGAVVRGTNAYVPPGARKQPAGGAKAPEIPKVAVNAPDGTAVSQPETGSSSSKAPSPAPTSATNANASKPPADALPAFRDFVTHEKQRLTQKRIAIVKNERDKRMAEFVQFSQSFKLNKPIPDDLVTILAKDEEKQRQIREKSSQDAASAQARAIALAGAAATAAPSASSKNIAAAQAKAAKAAIPPSASAGNALGLSGPGLGKGGESKGAAPSTNGGTGKRISMFIQPIPAFKGRPSAPQKPTVNTSGQALQAGKGANGGAPVLTPTTANKLNVNASSFKPNPKAVAFTPVSVGPVSLRLSPSIASASPKPKGEVCIYDIISPPTPNPFFGNRVLKKQPVHVKDDFNPFKYNKVAEATAVSAIWPYQGKRYMQMFPPVSLQPQQQSPHMAPPGPPPMPPPSYEEDSAAQAAAATRGYVYAYPPYGYPGQPMMPGMAPPPPGAYMPGPYMQHMPYPPSMPPPNAMYASPQMAQMPPYMQPPPGQYPPPPNGGGPRPSMPPTPIPAHAHPYYHQSPQLQHAVPYPMMMPPPGPGGPPHGYEGAPPPVQMGGVGHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.84
3 0.86
4 0.85
5 0.85
6 0.81
7 0.8
8 0.73
9 0.66
10 0.59
11 0.52
12 0.51
13 0.49
14 0.49
15 0.46
16 0.48
17 0.46
18 0.44
19 0.43
20 0.36
21 0.32
22 0.27
23 0.22
24 0.23
25 0.29
26 0.33
27 0.36
28 0.36
29 0.35
30 0.4
31 0.45
32 0.46
33 0.46
34 0.5
35 0.5
36 0.48
37 0.51
38 0.5
39 0.47
40 0.41
41 0.37
42 0.31
43 0.3
44 0.29
45 0.24
46 0.21
47 0.19
48 0.2
49 0.18
50 0.18
51 0.18
52 0.19
53 0.24
54 0.29
55 0.3
56 0.3
57 0.3
58 0.37
59 0.42
60 0.44
61 0.45
62 0.42
63 0.41
64 0.43
65 0.39
66 0.3
67 0.25
68 0.23
69 0.16
70 0.14
71 0.14
72 0.12
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.11
77 0.1
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.04
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.1
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.13
97 0.17
98 0.19
99 0.21
100 0.18
101 0.19
102 0.19
103 0.22
104 0.22
105 0.2
106 0.21
107 0.2
108 0.19
109 0.19
110 0.17
111 0.16
112 0.17
113 0.16
114 0.14
115 0.13
116 0.14
117 0.13
118 0.12
119 0.11
120 0.14
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.12
125 0.16
126 0.16
127 0.17
128 0.15
129 0.17
130 0.2
131 0.21
132 0.21
133 0.19
134 0.23
135 0.23
136 0.24
137 0.22
138 0.19
139 0.23
140 0.28
141 0.32
142 0.37
143 0.43
144 0.47
145 0.56
146 0.65
147 0.68
148 0.71
149 0.73
150 0.7
151 0.66
152 0.68
153 0.63
154 0.56
155 0.48
156 0.4
157 0.34
158 0.26
159 0.25
160 0.17
161 0.14
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.12
167 0.13
168 0.14
169 0.13
170 0.14
171 0.17
172 0.19
173 0.2
174 0.2
175 0.23
176 0.27
177 0.28
178 0.28
179 0.24
180 0.22
181 0.22
182 0.21
183 0.16
184 0.11
185 0.09
186 0.09
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.07
192 0.08
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.11
198 0.18
199 0.2
200 0.19
201 0.19
202 0.19
203 0.19
204 0.19
205 0.19
206 0.13
207 0.1
208 0.1
209 0.14
210 0.14
211 0.13
212 0.15
213 0.16
214 0.18
215 0.18
216 0.19
217 0.15
218 0.16
219 0.2
220 0.22
221 0.23
222 0.27
223 0.35
224 0.38
225 0.48
226 0.5
227 0.54
228 0.62
229 0.64
230 0.66
231 0.65
232 0.64
233 0.58
234 0.61
235 0.53
236 0.48
237 0.45
238 0.36
239 0.27
240 0.24
241 0.19
242 0.13
243 0.13
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.11
251 0.13
252 0.14
253 0.15
254 0.17
255 0.2
256 0.22
257 0.22
258 0.21
259 0.19
260 0.19
261 0.17
262 0.17
263 0.15
264 0.15
265 0.16
266 0.15
267 0.15
268 0.13
269 0.11
270 0.1
271 0.09
272 0.08
273 0.07
274 0.08
275 0.09
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.1
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.14
284 0.16
285 0.19
286 0.19
287 0.2
288 0.2
289 0.25
290 0.3
291 0.3
292 0.29
293 0.28
294 0.28
295 0.34
296 0.33
297 0.28
298 0.25
299 0.22
300 0.2
301 0.19
302 0.19
303 0.16
304 0.16
305 0.15
306 0.14
307 0.14
308 0.13
309 0.12
310 0.11
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.14
323 0.15
324 0.15
325 0.18
326 0.21
327 0.21
328 0.22
329 0.23
330 0.24
331 0.25
332 0.26
333 0.26
334 0.22
335 0.21
336 0.2
337 0.19
338 0.17
339 0.15
340 0.13
341 0.1
342 0.11
343 0.11
344 0.12
345 0.16
346 0.16
347 0.17
348 0.16
349 0.16
350 0.16
351 0.19
352 0.22
353 0.21
354 0.22
355 0.23
356 0.28
357 0.37
358 0.45
359 0.46
360 0.45
361 0.45
362 0.5
363 0.55
364 0.52
365 0.5
366 0.49
367 0.51
368 0.56
369 0.58
370 0.53
371 0.48
372 0.47
373 0.42
374 0.41
375 0.34
376 0.27
377 0.25
378 0.24
379 0.29
380 0.28
381 0.26
382 0.21
383 0.22
384 0.22
385 0.2
386 0.27
387 0.23
388 0.25
389 0.29
390 0.29
391 0.28
392 0.29
393 0.29
394 0.22
395 0.22
396 0.19
397 0.14
398 0.13
399 0.11
400 0.09
401 0.09
402 0.14
403 0.14
404 0.19
405 0.22
406 0.25
407 0.34
408 0.37
409 0.41
410 0.43
411 0.42
412 0.42
413 0.42
414 0.39
415 0.31
416 0.29
417 0.26
418 0.2
419 0.17
420 0.14
421 0.12
422 0.11
423 0.1
424 0.09
425 0.07
426 0.05
427 0.04
428 0.04
429 0.02
430 0.02
431 0.02
432 0.02
433 0.02
434 0.02
435 0.02
436 0.02
437 0.03
438 0.04
439 0.05
440 0.05
441 0.07
442 0.08
443 0.1
444 0.11
445 0.11
446 0.13
447 0.16
448 0.16
449 0.15
450 0.14
451 0.13
452 0.12
453 0.14
454 0.12
455 0.09
456 0.09
457 0.1
458 0.11
459 0.1
460 0.1
461 0.08
462 0.07
463 0.07
464 0.06
465 0.05
466 0.04
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.05
475 0.05
476 0.06
477 0.07
478 0.07
479 0.09
480 0.1
481 0.1
482 0.09
483 0.11
484 0.1
485 0.14
486 0.14
487 0.12
488 0.13
489 0.14
490 0.15
491 0.14
492 0.14
493 0.12
494 0.16
495 0.18
496 0.17
497 0.23
498 0.22
499 0.22
500 0.24
501 0.24
502 0.2
503 0.18
504 0.24
505 0.19
506 0.28
507 0.35
508 0.41
509 0.43
510 0.51
511 0.54
512 0.5
513 0.53
514 0.47
515 0.42
516 0.33
517 0.31
518 0.25
519 0.22
520 0.21
521 0.18
522 0.15
523 0.15
524 0.14
525 0.12
526 0.1
527 0.09
528 0.08
529 0.08
530 0.07
531 0.05
532 0.04
533 0.05
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.06
538 0.1
539 0.13
540 0.14
541 0.15
542 0.17
543 0.19
544 0.21
545 0.22
546 0.21
547 0.2
548 0.27
549 0.27
550 0.3
551 0.32
552 0.31
553 0.32
554 0.3
555 0.33
556 0.26
557 0.32
558 0.28
559 0.24
560 0.25
561 0.22
562 0.22
563 0.17
564 0.17
565 0.09
566 0.11
567 0.12
568 0.12
569 0.12
570 0.12
571 0.12
572 0.13
573 0.13
574 0.12
575 0.12
576 0.13
577 0.17
578 0.22
579 0.25
580 0.26
581 0.26
582 0.26
583 0.29
584 0.3
585 0.28
586 0.27
587 0.29
588 0.29
589 0.3
590 0.29
591 0.28
592 0.26
593 0.23
594 0.2
595 0.21
596 0.2
597 0.2
598 0.22
599 0.23
600 0.25
601 0.32
602 0.41
603 0.38
604 0.44
605 0.48
606 0.5
607 0.49
608 0.54
609 0.56
610 0.51
611 0.55
612 0.52
613 0.54
614 0.54
615 0.63
616 0.59
617 0.53
618 0.53
619 0.47
620 0.46
621 0.43
622 0.38
623 0.3
624 0.29
625 0.27
626 0.22
627 0.23
628 0.21
629 0.18
630 0.16
631 0.13
632 0.09
633 0.09
634 0.1
635 0.1
636 0.1
637 0.15
638 0.21
639 0.22
640 0.28
641 0.32
642 0.35
643 0.38
644 0.46
645 0.42
646 0.38
647 0.41
648 0.36
649 0.34
650 0.33
651 0.31
652 0.25
653 0.29
654 0.3
655 0.29
656 0.33
657 0.32
658 0.36
659 0.36
660 0.34
661 0.3
662 0.34
663 0.4
664 0.36
665 0.34
666 0.31
667 0.35
668 0.35
669 0.35
670 0.34
671 0.32
672 0.35
673 0.36
674 0.35
675 0.3
676 0.3
677 0.28
678 0.23
679 0.16
680 0.12
681 0.12
682 0.1
683 0.08
684 0.06
685 0.06
686 0.06
687 0.07
688 0.07
689 0.09
690 0.12
691 0.14
692 0.14
693 0.14
694 0.18
695 0.2
696 0.2
697 0.21
698 0.2
699 0.2
700 0.2
701 0.21
702 0.19
703 0.17
704 0.17
705 0.15
706 0.16
707 0.16
708 0.15
709 0.16
710 0.15
711 0.15
712 0.17
713 0.17
714 0.16
715 0.18
716 0.22
717 0.22
718 0.22
719 0.25
720 0.23
721 0.26
722 0.25
723 0.26
724 0.25
725 0.27
726 0.26
727 0.31
728 0.35
729 0.32
730 0.34
731 0.33
732 0.35
733 0.34
734 0.33
735 0.29
736 0.29
737 0.3
738 0.28
739 0.25
740 0.22
741 0.21
742 0.22
743 0.19
744 0.18
745 0.16
746 0.2
747 0.21
748 0.2
749 0.23
750 0.28
751 0.33
752 0.37
753 0.39
754 0.4
755 0.47
756 0.49
757 0.52
758 0.47
759 0.42
760 0.44
761 0.46
762 0.46
763 0.42
764 0.41
765 0.4
766 0.42
767 0.43
768 0.4
769 0.39
770 0.4
771 0.4
772 0.43
773 0.45
774 0.45
775 0.49
776 0.48
777 0.46
778 0.41
779 0.45
780 0.43
781 0.41
782 0.43
783 0.39
784 0.4
785 0.43
786 0.51
787 0.43
788 0.41
789 0.41
790 0.41
791 0.37
792 0.34
793 0.29
794 0.23
795 0.23
796 0.22
797 0.17
798 0.13
799 0.18
800 0.18
801 0.18
802 0.17
803 0.23
804 0.26
805 0.28
806 0.3
807 0.27
808 0.26
809 0.28
810 0.33
811 0.32
812 0.29
813 0.27
814 0.24
815 0.23
816 0.22
817 0.21