FuNGI

Q8SQJ0

Protein Details

Accession

Q8SQJ0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
52-71	YSIFYRRNCKNEPRLQPPSF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR033133 PUM-HD IPR033712 Pumilio_RNA-bd IPR001313 Pumilio_RNA-bd_rpt
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
KEGG	ecu:ECU11_1730 -
Pfam	View protein in Pfam PF00806 PUF
PROSITE	View protein in PROSITE PS50302 PUM PS50303 PUM_HD
CDD	cd07920 Pumilio

Amino Acid Sequences

MKREEIDDSSDCRIRYADFRDSGNRPISAPPVDKFFIEDEVELGDIQTDLNYSIFYRRNCKNEPRLQPPSFFIRGQSGYWTSQYDDLIAKAFSNTGFLDIKTIGELSSGSESSRSLAERIDEDYPESEKSSEYKGTSRATTPIGNMNVLDTETFSAMLNLKGAKGVECTQGGGNRRSSSAIGDIGGIPMDSRFLRELLEIHEEQGGKGCKGVPGGPSMKDICVSISKDQEGSRCIQRKMDSISRAEISWFFNNIVDAAPELSANLFGNYVIQKIIPLLTEEERARLIAKLAKQINLLSVHPYGCRVIQKLVDVSSDVDFILEEVRDNLLELIEDQNGNHVIQKCIEKCKDRNIILQQFSENSLFLATHKYGCRVIQRMLEFCREDEIKNIVEVLISNIKTLVDDQYGNYVIQHILAVGKEDEKNLVIEKIIEKSYELSRCKFSSNVVEQCVKLSNNGQRERFLAKFLEPVGSKPGMYSMCVDMYGNYVVQRLYDSSGENIRREMKSALRPFVRDLKKSPFARHILFKINT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.32
3	0.35
4	0.37
5	0.37
6	0.41
7	0.48
8	0.5
9	0.54
10	0.51
11	0.45
12	0.38
13	0.38
14	0.39
15	0.38
16	0.39
17	0.34
18	0.35
19	0.35
20	0.34
21	0.33
22	0.29
23	0.27
24	0.24
25	0.22
26	0.16
27	0.16
28	0.17
29	0.14
30	0.12
31	0.08
32	0.07
33	0.06
34	0.06
35	0.06
36	0.06
37	0.06
38	0.07
39	0.07
40	0.14
41	0.2
42	0.23
43	0.31
44	0.37
45	0.44
46	0.52
47	0.61
48	0.65
49	0.69
50	0.76
51	0.78
52	0.81
53	0.77
54	0.72
55	0.66
56	0.63
57	0.58
58	0.48
59	0.41
60	0.37
61	0.36
62	0.33
63	0.34
64	0.3
65	0.28
66	0.29
67	0.29
68	0.24
69	0.24
70	0.24
71	0.2
72	0.18
73	0.16
74	0.16
75	0.15
76	0.13
77	0.11
78	0.12
79	0.09
80	0.11
81	0.1
82	0.12
83	0.13
84	0.13
85	0.15
86	0.14
87	0.15
88	0.13
89	0.13
90	0.09
91	0.08
92	0.08
93	0.08
94	0.1
95	0.1
96	0.1
97	0.1
98	0.11
99	0.11
100	0.13
101	0.13
102	0.1
103	0.11
104	0.13
105	0.14
106	0.17
107	0.18
108	0.16
109	0.17
110	0.18
111	0.18
112	0.18
113	0.18
114	0.15
115	0.14
116	0.15
117	0.18
118	0.2
119	0.2
120	0.22
121	0.26
122	0.29
123	0.3
124	0.3
125	0.29
126	0.28
127	0.27
128	0.26
129	0.27
130	0.26
131	0.24
132	0.22
133	0.2
134	0.17
135	0.15
136	0.14
137	0.08
138	0.07
139	0.07
140	0.08
141	0.07
142	0.08
143	0.08
144	0.08
145	0.09
146	0.09
147	0.08
148	0.09
149	0.1
150	0.09
151	0.11
152	0.13
153	0.15
154	0.15
155	0.16
156	0.17
157	0.21
158	0.24
159	0.25
160	0.26
161	0.24
162	0.24
163	0.24
164	0.23
165	0.21
166	0.19
167	0.16
168	0.13
169	0.12
170	0.12
171	0.1
172	0.1
173	0.08
174	0.05
175	0.05
176	0.06
177	0.05
178	0.06
179	0.07
180	0.08
181	0.08
182	0.09
183	0.1
184	0.12
185	0.17
186	0.16
187	0.16
188	0.18
189	0.18
190	0.17
191	0.21
192	0.19
193	0.14
194	0.15
195	0.15
196	0.13
197	0.14
198	0.16
199	0.12
200	0.16
201	0.18
202	0.19
203	0.21
204	0.2
205	0.19
206	0.18
207	0.17
208	0.13
209	0.14
210	0.16
211	0.16
212	0.17
213	0.17
214	0.19
215	0.2
216	0.2
217	0.18
218	0.19
219	0.24
220	0.28
221	0.28
222	0.3
223	0.31
224	0.33
225	0.37
226	0.41
227	0.36
228	0.32
229	0.34
230	0.3
231	0.29
232	0.25
233	0.21
234	0.18
235	0.16
236	0.15
237	0.13
238	0.12
239	0.12
240	0.12
241	0.1
242	0.07
243	0.06
244	0.05
245	0.05
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.05
250	0.04
251	0.05
252	0.04
253	0.04
254	0.05
255	0.06
256	0.06
257	0.05
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.06
262	0.05
263	0.06
264	0.07
265	0.08
266	0.12
267	0.12
268	0.13
269	0.12
270	0.12
271	0.12
272	0.1
273	0.11
274	0.11
275	0.13
276	0.19
277	0.2
278	0.22
279	0.22
280	0.22
281	0.24
282	0.22
283	0.21
284	0.16
285	0.16
286	0.15
287	0.14
288	0.15
289	0.13
290	0.13
291	0.15
292	0.13
293	0.14
294	0.15
295	0.17
296	0.17
297	0.17
298	0.16
299	0.14
300	0.14
301	0.12
302	0.11
303	0.09
304	0.07
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.06
314	0.06
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.06
319	0.07
320	0.07
321	0.07
322	0.09
323	0.1
324	0.1
325	0.13
326	0.14
327	0.14
328	0.16
329	0.22
330	0.23
331	0.3
332	0.35
333	0.38
334	0.4
335	0.49
336	0.55
337	0.52
338	0.57
339	0.58
340	0.61
341	0.57
342	0.55
343	0.46
344	0.38
345	0.38
346	0.31
347	0.21
348	0.13
349	0.11
350	0.09
351	0.09
352	0.12
353	0.11
354	0.15
355	0.15
356	0.18
357	0.19
358	0.22
359	0.28
360	0.27
361	0.3
362	0.32
363	0.34
364	0.36
365	0.37
366	0.4
367	0.35
368	0.31
369	0.33
370	0.28
371	0.25
372	0.24
373	0.25
374	0.2
375	0.19
376	0.19
377	0.13
378	0.12
379	0.12
380	0.12
381	0.15
382	0.14
383	0.14
384	0.14
385	0.14
386	0.14
387	0.15
388	0.14
389	0.11
390	0.11
391	0.12
392	0.16
393	0.17
394	0.16
395	0.15
396	0.14
397	0.12
398	0.11
399	0.11
400	0.07
401	0.07
402	0.07
403	0.09
404	0.08
405	0.12
406	0.12
407	0.13
408	0.14
409	0.14
410	0.15
411	0.14
412	0.14
413	0.11
414	0.13
415	0.14
416	0.16
417	0.17
418	0.16
419	0.15
420	0.17
421	0.24
422	0.29
423	0.31
424	0.31
425	0.35
426	0.37
427	0.39
428	0.37
429	0.34
430	0.36
431	0.41
432	0.43
433	0.42
434	0.44
435	0.41
436	0.42
437	0.43
438	0.33
439	0.28
440	0.29
441	0.31
442	0.38
443	0.45
444	0.45
445	0.43
446	0.46
447	0.49
448	0.43
449	0.4
450	0.33
451	0.27
452	0.29
453	0.28
454	0.31
455	0.26
456	0.26
457	0.29
458	0.27
459	0.26
460	0.22
461	0.26
462	0.2
463	0.21
464	0.22
465	0.19
466	0.18
467	0.19
468	0.19
469	0.14
470	0.16
471	0.16
472	0.15
473	0.12
474	0.13
475	0.12
476	0.12
477	0.14
478	0.12
479	0.14
480	0.15
481	0.16
482	0.19
483	0.27
484	0.31
485	0.3
486	0.33
487	0.36
488	0.35
489	0.37
490	0.38
491	0.37
492	0.43
493	0.5
494	0.54
495	0.53
496	0.54
497	0.56
498	0.63
499	0.63
500	0.58
501	0.57
502	0.57
503	0.62
504	0.65
505	0.67
506	0.66
507	0.64
508	0.65
509	0.68
510	0.64

Q8SQJ0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer