Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VQE4

Protein Details
Accession H1VQE4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
135-167YPSQKLRPGKRQSHPLRWKKKELKKQAEQHEELHydrophilic
380-403VIFSRELRRQKRSINRRGGPQLPDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
140-159LRPGKRQSHPLRWKKKELKK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 10, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
Amino Acid Sequences MAAQPSTSTPTAAGATASSSASTSAPVSNDHDGTPRSVAAKALPVRDRDSFSKLQVERYVTRDWHHSVAMKDAQERFEKDMQQTRDKIDDYNIIKTQRAYFPPSKLYGEGYRGYGNGYTDIDPRMRAPFPAQVIYPSQKLRPGKRQSHPLRWKKKELKKQAEQHEELVPIRIDVDWEKIKLRDTFTWNLHDRIIPAELFAQHLVEDLGVPLDSQHKPVLDQVILQIRDQLNDFYPLVFSEEDALDPELPYSAYKNDEMRVLIKLNVTIGGVTLVDQFEWDINNPLNSPEEFAASMTRDMSLSGEFTTAIAHSIREQCQLFTRSLYSVGHPFDGRPVEDPDLVAAFLPSPLPSVFRPQQQAKEYAPYLYELSDADLERNEVIFSRELRRQKRSINRRGGPQLPDLKERQRTIRTLLVSSVLPGAATNIEESTLYKRVAGAPTTRKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.12
3 0.13
4 0.13
5 0.1
6 0.1
7 0.1
8 0.1
9 0.11
10 0.11
11 0.12
12 0.13
13 0.15
14 0.2
15 0.23
16 0.24
17 0.24
18 0.27
19 0.26
20 0.28
21 0.27
22 0.24
23 0.21
24 0.21
25 0.21
26 0.19
27 0.26
28 0.27
29 0.33
30 0.36
31 0.37
32 0.41
33 0.44
34 0.47
35 0.42
36 0.45
37 0.41
38 0.4
39 0.46
40 0.43
41 0.45
42 0.45
43 0.47
44 0.43
45 0.44
46 0.47
47 0.39
48 0.41
49 0.41
50 0.39
51 0.36
52 0.35
53 0.35
54 0.3
55 0.35
56 0.38
57 0.34
58 0.35
59 0.35
60 0.36
61 0.37
62 0.39
63 0.38
64 0.38
65 0.4
66 0.41
67 0.46
68 0.48
69 0.51
70 0.52
71 0.49
72 0.49
73 0.46
74 0.41
75 0.36
76 0.39
77 0.34
78 0.37
79 0.38
80 0.34
81 0.35
82 0.35
83 0.37
84 0.35
85 0.36
86 0.37
87 0.38
88 0.41
89 0.45
90 0.46
91 0.44
92 0.38
93 0.39
94 0.34
95 0.33
96 0.3
97 0.27
98 0.25
99 0.23
100 0.23
101 0.2
102 0.17
103 0.14
104 0.14
105 0.14
106 0.15
107 0.17
108 0.16
109 0.16
110 0.16
111 0.19
112 0.17
113 0.17
114 0.18
115 0.21
116 0.23
117 0.24
118 0.23
119 0.21
120 0.25
121 0.27
122 0.28
123 0.25
124 0.23
125 0.28
126 0.34
127 0.39
128 0.45
129 0.53
130 0.58
131 0.63
132 0.73
133 0.75
134 0.8
135 0.83
136 0.83
137 0.84
138 0.82
139 0.86
140 0.86
141 0.87
142 0.86
143 0.87
144 0.86
145 0.85
146 0.87
147 0.86
148 0.85
149 0.77
150 0.69
151 0.61
152 0.52
153 0.43
154 0.36
155 0.25
156 0.16
157 0.14
158 0.12
159 0.1
160 0.08
161 0.13
162 0.13
163 0.14
164 0.15
165 0.16
166 0.2
167 0.21
168 0.24
169 0.24
170 0.28
171 0.33
172 0.34
173 0.4
174 0.39
175 0.37
176 0.35
177 0.3
178 0.25
179 0.21
180 0.19
181 0.12
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.03
194 0.04
195 0.03
196 0.03
197 0.04
198 0.08
199 0.08
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.12
204 0.13
205 0.16
206 0.11
207 0.11
208 0.12
209 0.17
210 0.18
211 0.17
212 0.2
213 0.17
214 0.18
215 0.18
216 0.17
217 0.11
218 0.13
219 0.14
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.09
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.08
230 0.09
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.08
240 0.1
241 0.12
242 0.12
243 0.14
244 0.15
245 0.15
246 0.16
247 0.15
248 0.15
249 0.14
250 0.13
251 0.12
252 0.11
253 0.1
254 0.08
255 0.07
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.06
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.12
273 0.11
274 0.13
275 0.1
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.11
281 0.11
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.1
299 0.15
300 0.16
301 0.21
302 0.21
303 0.21
304 0.27
305 0.29
306 0.26
307 0.23
308 0.23
309 0.19
310 0.21
311 0.21
312 0.17
313 0.2
314 0.2
315 0.21
316 0.19
317 0.18
318 0.21
319 0.23
320 0.21
321 0.19
322 0.22
323 0.23
324 0.23
325 0.22
326 0.19
327 0.17
328 0.16
329 0.13
330 0.09
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.1
338 0.11
339 0.19
340 0.23
341 0.29
342 0.36
343 0.4
344 0.48
345 0.5
346 0.54
347 0.48
348 0.51
349 0.47
350 0.4
351 0.35
352 0.29
353 0.25
354 0.2
355 0.18
356 0.11
357 0.13
358 0.14
359 0.14
360 0.13
361 0.13
362 0.13
363 0.13
364 0.13
365 0.11
366 0.09
367 0.11
368 0.13
369 0.16
370 0.21
371 0.27
372 0.36
373 0.44
374 0.51
375 0.55
376 0.62
377 0.7
378 0.75
379 0.79
380 0.81
381 0.79
382 0.81
383 0.83
384 0.8
385 0.73
386 0.71
387 0.7
388 0.63
389 0.63
390 0.59
391 0.59
392 0.6
393 0.6
394 0.6
395 0.58
396 0.57
397 0.57
398 0.58
399 0.53
400 0.47
401 0.44
402 0.38
403 0.31
404 0.29
405 0.24
406 0.17
407 0.13
408 0.11
409 0.11
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.09
414 0.09
415 0.1
416 0.11
417 0.15
418 0.19
419 0.18
420 0.18
421 0.19
422 0.24
423 0.29
424 0.31
425 0.35