Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5B1QDR4

Protein Details
Accession A0A5B1QDR4    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-72EKETKRIQDRIAKVRNKRELNHydrophilic
87-113TDDTLKWIKKAKKREKELAKKRQAEIDHydrophilic
266-292QKGDVGFKKPKTKKKRPSRRVAVDSDIBasic
663-689PQPLSKGKTEKTKGKKKEQNKSAAQTLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-108IKKAKKREKELAKKR
273-285KKPKTKKKRPSRR
331-341TRRAKIKSKKL
590-616SHKFHGKGSGKMKTEKRLKKIAEEKKK
669-679GKTEKTKGKKK
774-774R
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 11.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MSMEESISLEETNKIRISLGLKPLTDDSSPADDKDKQAEQNYANQREREAKEKETKRIQDRIAKVRNKRELNASLKGSTLGDADADTDDTLKWIKKAKKREKELAKKRQAEIDSMDKVFQDEYTEKDLEGIKVSHDFDELEDGEARILTLKDSRILDNEEDELQNVEMAEQERTKERNDLKIKNRGYTGYDDDEFVDGREGMKRAVLSKYDEFLEGPKETGFRLGASAPSTSKAARQELEQAAAAVNKSLLSIDYAKNIETQDYLQKGDVGFKKPKTKKKRPSRRVAVDSDIAPVDEVPMEVDEKPIVPRVRDLDANFVDDDELQAALARTRRAKIKSKKLSPEEVARKIAEERARTEQPNGIEVINVDDDERDGESSGLVFDDTSEFVRAITYDPVAVKKEAPSSTPAPEKQEPAGVKDEPMEVVEELEAGEVNVKEEEDEEAMLNAIENAIKATEAEEKASTTNNDIGTSSEQTFSTGMASTLNILRQQGILATPTSDQTDRERVQLQRDLWLAEQRRRVAEREMERLKSRGSNKDQAQREYENRLREQQEARANLEAFKNYKPDVNIVYYDEFGRSLTPKEAWKALSHKFHGKGSGKMKTEKRLKKIAEEKKKEAMASGDTPLSMSRAFQMRQEKTGQAHFVLSVGNRGAVPQAAEFLDPQPLSKGKTEKTKGKKKEQNKSAAQTLDNGFITLPAPQISHNAGTSASPAPNSETNSPAPRPGFSRITSTVVSEAPSGTGTPVSGDRTKVAFGFGTKRKAGEEPNGTPPSKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.23
4 0.26
5 0.28
6 0.36
7 0.37
8 0.36
9 0.38
10 0.4
11 0.4
12 0.36
13 0.3
14 0.26
15 0.28
16 0.29
17 0.27
18 0.3
19 0.3
20 0.32
21 0.38
22 0.39
23 0.37
24 0.4
25 0.45
26 0.43
27 0.5
28 0.57
29 0.59
30 0.59
31 0.54
32 0.54
33 0.56
34 0.57
35 0.56
36 0.52
37 0.51
38 0.56
39 0.63
40 0.69
41 0.69
42 0.75
43 0.74
44 0.78
45 0.77
46 0.76
47 0.77
48 0.78
49 0.78
50 0.77
51 0.79
52 0.8
53 0.83
54 0.79
55 0.74
56 0.72
57 0.71
58 0.69
59 0.68
60 0.62
61 0.53
62 0.47
63 0.45
64 0.36
65 0.27
66 0.21
67 0.14
68 0.1
69 0.09
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.12
78 0.13
79 0.15
80 0.23
81 0.32
82 0.39
83 0.51
84 0.61
85 0.68
86 0.76
87 0.84
88 0.86
89 0.89
90 0.92
91 0.92
92 0.92
93 0.89
94 0.82
95 0.8
96 0.7
97 0.63
98 0.57
99 0.54
100 0.48
101 0.41
102 0.39
103 0.31
104 0.3
105 0.26
106 0.21
107 0.18
108 0.14
109 0.17
110 0.22
111 0.22
112 0.21
113 0.24
114 0.25
115 0.21
116 0.23
117 0.2
118 0.16
119 0.19
120 0.21
121 0.18
122 0.17
123 0.16
124 0.14
125 0.18
126 0.17
127 0.15
128 0.15
129 0.14
130 0.14
131 0.13
132 0.13
133 0.1
134 0.09
135 0.08
136 0.11
137 0.12
138 0.17
139 0.19
140 0.2
141 0.21
142 0.25
143 0.25
144 0.24
145 0.25
146 0.22
147 0.2
148 0.19
149 0.17
150 0.13
151 0.13
152 0.1
153 0.08
154 0.09
155 0.1
156 0.11
157 0.11
158 0.13
159 0.17
160 0.19
161 0.21
162 0.27
163 0.3
164 0.38
165 0.46
166 0.54
167 0.57
168 0.65
169 0.66
170 0.62
171 0.6
172 0.52
173 0.47
174 0.43
175 0.4
176 0.35
177 0.33
178 0.29
179 0.28
180 0.26
181 0.23
182 0.18
183 0.14
184 0.09
185 0.09
186 0.12
187 0.12
188 0.11
189 0.13
190 0.13
191 0.14
192 0.18
193 0.19
194 0.21
195 0.23
196 0.24
197 0.24
198 0.24
199 0.21
200 0.2
201 0.21
202 0.16
203 0.15
204 0.14
205 0.13
206 0.13
207 0.15
208 0.14
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.12
213 0.13
214 0.14
215 0.12
216 0.13
217 0.14
218 0.13
219 0.16
220 0.19
221 0.21
222 0.2
223 0.21
224 0.27
225 0.27
226 0.29
227 0.25
228 0.21
229 0.18
230 0.18
231 0.17
232 0.09
233 0.08
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.07
239 0.1
240 0.11
241 0.14
242 0.15
243 0.15
244 0.17
245 0.17
246 0.15
247 0.13
248 0.14
249 0.16
250 0.17
251 0.18
252 0.16
253 0.17
254 0.16
255 0.23
256 0.25
257 0.26
258 0.3
259 0.34
260 0.45
261 0.52
262 0.62
263 0.66
264 0.72
265 0.78
266 0.83
267 0.9
268 0.89
269 0.93
270 0.93
271 0.92
272 0.88
273 0.82
274 0.75
275 0.66
276 0.56
277 0.46
278 0.35
279 0.25
280 0.18
281 0.13
282 0.09
283 0.06
284 0.05
285 0.04
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.06
291 0.07
292 0.08
293 0.13
294 0.14
295 0.13
296 0.16
297 0.18
298 0.2
299 0.23
300 0.23
301 0.25
302 0.25
303 0.26
304 0.23
305 0.2
306 0.18
307 0.14
308 0.14
309 0.07
310 0.06
311 0.04
312 0.05
313 0.05
314 0.06
315 0.08
316 0.1
317 0.12
318 0.14
319 0.2
320 0.25
321 0.36
322 0.44
323 0.53
324 0.61
325 0.68
326 0.75
327 0.74
328 0.74
329 0.67
330 0.67
331 0.64
332 0.58
333 0.52
334 0.43
335 0.39
336 0.33
337 0.35
338 0.29
339 0.23
340 0.22
341 0.26
342 0.29
343 0.29
344 0.3
345 0.28
346 0.25
347 0.24
348 0.22
349 0.15
350 0.12
351 0.11
352 0.12
353 0.09
354 0.08
355 0.07
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.05
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.03
369 0.03
370 0.04
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.07
380 0.06
381 0.07
382 0.08
383 0.09
384 0.11
385 0.11
386 0.1
387 0.11
388 0.16
389 0.15
390 0.16
391 0.18
392 0.19
393 0.22
394 0.26
395 0.26
396 0.28
397 0.29
398 0.3
399 0.26
400 0.29
401 0.26
402 0.24
403 0.27
404 0.21
405 0.19
406 0.18
407 0.18
408 0.13
409 0.13
410 0.11
411 0.07
412 0.07
413 0.06
414 0.05
415 0.05
416 0.04
417 0.04
418 0.03
419 0.04
420 0.04
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.06
427 0.05
428 0.06
429 0.05
430 0.05
431 0.06
432 0.05
433 0.05
434 0.04
435 0.04
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.05
443 0.1
444 0.1
445 0.11
446 0.12
447 0.12
448 0.13
449 0.15
450 0.14
451 0.11
452 0.14
453 0.13
454 0.13
455 0.13
456 0.14
457 0.15
458 0.17
459 0.16
460 0.14
461 0.13
462 0.13
463 0.13
464 0.12
465 0.1
466 0.08
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.08
472 0.09
473 0.09
474 0.09
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.08
479 0.08
480 0.08
481 0.07
482 0.08
483 0.08
484 0.09
485 0.11
486 0.11
487 0.12
488 0.14
489 0.22
490 0.22
491 0.25
492 0.29
493 0.29
494 0.34
495 0.39
496 0.35
497 0.32
498 0.32
499 0.3
500 0.27
501 0.31
502 0.3
503 0.3
504 0.35
505 0.32
506 0.35
507 0.36
508 0.37
509 0.35
510 0.39
511 0.39
512 0.43
513 0.46
514 0.45
515 0.45
516 0.44
517 0.41
518 0.4
519 0.4
520 0.41
521 0.43
522 0.48
523 0.52
524 0.6
525 0.63
526 0.6
527 0.6
528 0.56
529 0.52
530 0.53
531 0.51
532 0.48
533 0.45
534 0.48
535 0.45
536 0.45
537 0.44
538 0.42
539 0.45
540 0.42
541 0.42
542 0.39
543 0.37
544 0.34
545 0.33
546 0.29
547 0.24
548 0.23
549 0.24
550 0.21
551 0.24
552 0.22
553 0.23
554 0.24
555 0.24
556 0.24
557 0.24
558 0.24
559 0.22
560 0.21
561 0.18
562 0.15
563 0.12
564 0.13
565 0.11
566 0.12
567 0.14
568 0.16
569 0.18
570 0.21
571 0.25
572 0.24
573 0.28
574 0.32
575 0.37
576 0.42
577 0.43
578 0.48
579 0.48
580 0.48
581 0.53
582 0.5
583 0.51
584 0.5
585 0.54
586 0.51
587 0.56
588 0.59
589 0.6
590 0.67
591 0.67
592 0.66
593 0.68
594 0.66
595 0.68
596 0.73
597 0.74
598 0.75
599 0.75
600 0.74
601 0.72
602 0.72
603 0.61
604 0.53
605 0.45
606 0.38
607 0.33
608 0.3
609 0.22
610 0.2
611 0.2
612 0.18
613 0.17
614 0.12
615 0.1
616 0.11
617 0.16
618 0.17
619 0.23
620 0.33
621 0.34
622 0.38
623 0.41
624 0.41
625 0.39
626 0.44
627 0.41
628 0.32
629 0.3
630 0.26
631 0.22
632 0.2
633 0.17
634 0.15
635 0.13
636 0.12
637 0.11
638 0.12
639 0.12
640 0.11
641 0.12
642 0.09
643 0.11
644 0.1
645 0.11
646 0.12
647 0.12
648 0.17
649 0.16
650 0.16
651 0.18
652 0.2
653 0.22
654 0.27
655 0.32
656 0.32
657 0.43
658 0.5
659 0.56
660 0.65
661 0.73
662 0.77
663 0.81
664 0.86
665 0.86
666 0.89
667 0.88
668 0.88
669 0.86
670 0.83
671 0.79
672 0.73
673 0.64
674 0.58
675 0.51
676 0.45
677 0.36
678 0.3
679 0.22
680 0.19
681 0.19
682 0.14
683 0.13
684 0.09
685 0.1
686 0.1
687 0.14
688 0.17
689 0.19
690 0.18
691 0.17
692 0.17
693 0.17
694 0.19
695 0.19
696 0.17
697 0.15
698 0.16
699 0.19
700 0.23
701 0.27
702 0.27
703 0.27
704 0.32
705 0.38
706 0.38
707 0.4
708 0.38
709 0.36
710 0.37
711 0.4
712 0.4
713 0.36
714 0.42
715 0.39
716 0.42
717 0.4
718 0.38
719 0.33
720 0.28
721 0.28
722 0.21
723 0.18
724 0.14
725 0.14
726 0.13
727 0.11
728 0.11
729 0.09
730 0.11
731 0.13
732 0.18
733 0.2
734 0.21
735 0.23
736 0.25
737 0.27
738 0.25
739 0.24
740 0.21
741 0.22
742 0.3
743 0.34
744 0.39
745 0.39
746 0.4
747 0.41
748 0.44
749 0.46
750 0.47
751 0.49
752 0.47
753 0.55
754 0.6
755 0.58