Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5B1R4N1

Protein Details
Accession A0A5B1R4N1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-30DEERARRVKRSQLKDLNVNHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF02854  MIF4G  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MEANQTNTKNDEERARRVKRSQLKDLNVNHLGEEPSKAADSSFKRHTALIKRIRQSIGVDNHDQILKDVDSLTLEKYIDEIAGAVPEGIARCKLEKDVWSAAEVISSLHRRFPKVFTPALLSSLSAALAPSPRAALAALAPEQREKEEAARVSRQRPVLRVCAELALVGVIRDAPGRSGGEWIMKALRDLLSNDPSLSSIPLLTTFLKSYARPFLGLTPPASAKQVSAAAEPGSLSSETTANTAANGSSEATIPEDEELVEKDIRDRFRKMCEGYFDSVAKKLVIEHKRLQEQDRRNHEAYIRSGEIFEDRQQAYEKMTKSYEKLLASCQTLSELLYLPLPTLPTSTQATNSIQIGTNSGSLSLDDGEDNAIATSGGKWEDDEERRFFEEIQDLREVVPRSILGVDETTSDQPNPEEDAENARKKEEEEVRKLEEELAGLEVNGKEQAVNGAQVNGASLEQSDAEQSADEDEDDGAATPTQETSPPTTPNMAPQGPSQLLTALLARLPDCTNRSLIDQAAIDFAFLNSKAARKRLVKYLGQVPKNRTDLLPHYSRLVAILNKYMPDIGSDLVAHLDEEFRYLQRKKNVVKELSEVRLKNITFLSNLTKFKVVPPHLILHMFKVCLDDFSGTNVDNIALLLEGCGRFLLRNEETKQRFGTMLELMKRKQSMQHFDQRQQLMLENAYYQANPPERAPRQEKERSPIELFVRHLIYDVLAKKTIDKVLKLLRKLDWDDPAIYRILHKIFTKPHKLRFSNVSLLAMLTYDLQRYHPDFTIGVVDQVLEDVRRGLEQNVYSTNQRRVATIKYLGELYIYRLVGSGLIFDTLWSLVTFGHPEGHPLPMYPCPVDMPDDFFRVRLVCVLIDTCGMCFDRGSQKKKLDNFLTFFQYYVLCKEPIPMDVEFMLTDTLEAVRPKMGMFKTLEEAATAVDEMFATAYQTAGLLNGDDSGEDSGDEGERPEEEDEDEEYDGAETEDVEDDRGPSPEPSVVVMSAQENLGPSEEADAEFAKELAKLVTDSSAESRKVDRRTAQTLWESAVLPPAARRKRVEEDEEETSDTEEGPGVMNFTMLTKRGNKQQMRQLAIPAESALAIQTRTAQMQDKVEQQHLKRLVLNYEQREEAEELKGLTANHYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.63
3 0.67
4 0.71
5 0.77
6 0.77
7 0.79
8 0.8
9 0.79
10 0.79
11 0.8
12 0.8
13 0.78
14 0.73
15 0.64
16 0.54
17 0.47
18 0.41
19 0.33
20 0.3
21 0.21
22 0.18
23 0.19
24 0.18
25 0.15
26 0.21
27 0.25
28 0.3
29 0.36
30 0.37
31 0.38
32 0.41
33 0.49
34 0.51
35 0.56
36 0.59
37 0.62
38 0.64
39 0.69
40 0.68
41 0.63
42 0.58
43 0.57
44 0.55
45 0.52
46 0.49
47 0.44
48 0.45
49 0.43
50 0.39
51 0.3
52 0.26
53 0.2
54 0.18
55 0.17
56 0.14
57 0.15
58 0.16
59 0.17
60 0.15
61 0.15
62 0.14
63 0.14
64 0.14
65 0.12
66 0.1
67 0.1
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.06
73 0.07
74 0.08
75 0.09
76 0.1
77 0.11
78 0.13
79 0.16
80 0.19
81 0.23
82 0.26
83 0.31
84 0.36
85 0.35
86 0.34
87 0.33
88 0.3
89 0.26
90 0.22
91 0.16
92 0.15
93 0.2
94 0.19
95 0.25
96 0.28
97 0.32
98 0.35
99 0.4
100 0.42
101 0.43
102 0.45
103 0.41
104 0.45
105 0.42
106 0.41
107 0.36
108 0.28
109 0.22
110 0.2
111 0.18
112 0.11
113 0.09
114 0.08
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.12
125 0.14
126 0.16
127 0.17
128 0.19
129 0.2
130 0.2
131 0.21
132 0.19
133 0.2
134 0.25
135 0.29
136 0.32
137 0.4
138 0.44
139 0.47
140 0.51
141 0.55
142 0.51
143 0.53
144 0.53
145 0.53
146 0.5
147 0.48
148 0.43
149 0.38
150 0.33
151 0.27
152 0.21
153 0.13
154 0.11
155 0.08
156 0.07
157 0.05
158 0.05
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.14
166 0.15
167 0.17
168 0.18
169 0.19
170 0.19
171 0.18
172 0.18
173 0.18
174 0.18
175 0.16
176 0.18
177 0.22
178 0.23
179 0.23
180 0.23
181 0.21
182 0.2
183 0.19
184 0.17
185 0.12
186 0.09
187 0.08
188 0.09
189 0.11
190 0.12
191 0.13
192 0.13
193 0.15
194 0.17
195 0.17
196 0.2
197 0.26
198 0.26
199 0.25
200 0.25
201 0.28
202 0.32
203 0.34
204 0.31
205 0.27
206 0.27
207 0.27
208 0.28
209 0.22
210 0.16
211 0.17
212 0.19
213 0.17
214 0.16
215 0.17
216 0.15
217 0.15
218 0.15
219 0.12
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.07
244 0.08
245 0.09
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.14
250 0.19
251 0.25
252 0.28
253 0.32
254 0.33
255 0.39
256 0.47
257 0.46
258 0.46
259 0.47
260 0.48
261 0.47
262 0.47
263 0.42
264 0.36
265 0.34
266 0.3
267 0.23
268 0.18
269 0.18
270 0.24
271 0.28
272 0.33
273 0.38
274 0.44
275 0.51
276 0.53
277 0.56
278 0.56
279 0.59
280 0.63
281 0.65
282 0.65
283 0.6
284 0.6
285 0.57
286 0.53
287 0.48
288 0.44
289 0.37
290 0.29
291 0.28
292 0.26
293 0.25
294 0.21
295 0.21
296 0.21
297 0.19
298 0.2
299 0.22
300 0.23
301 0.24
302 0.28
303 0.26
304 0.23
305 0.26
306 0.27
307 0.27
308 0.32
309 0.33
310 0.29
311 0.29
312 0.3
313 0.3
314 0.3
315 0.28
316 0.23
317 0.19
318 0.17
319 0.16
320 0.13
321 0.1
322 0.09
323 0.1
324 0.1
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.11
332 0.13
333 0.14
334 0.15
335 0.18
336 0.19
337 0.19
338 0.2
339 0.18
340 0.17
341 0.16
342 0.16
343 0.14
344 0.13
345 0.11
346 0.11
347 0.09
348 0.08
349 0.09
350 0.07
351 0.07
352 0.05
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.05
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.08
367 0.14
368 0.19
369 0.23
370 0.24
371 0.26
372 0.28
373 0.28
374 0.27
375 0.23
376 0.25
377 0.22
378 0.23
379 0.22
380 0.2
381 0.2
382 0.25
383 0.23
384 0.16
385 0.16
386 0.13
387 0.13
388 0.13
389 0.12
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.1
395 0.1
396 0.11
397 0.11
398 0.1
399 0.1
400 0.11
401 0.12
402 0.12
403 0.11
404 0.11
405 0.19
406 0.25
407 0.3
408 0.29
409 0.27
410 0.26
411 0.26
412 0.33
413 0.34
414 0.36
415 0.38
416 0.42
417 0.45
418 0.45
419 0.45
420 0.38
421 0.29
422 0.21
423 0.15
424 0.11
425 0.08
426 0.07
427 0.08
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.06
432 0.05
433 0.05
434 0.07
435 0.06
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.08
442 0.06
443 0.06
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.05
450 0.04
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.04
460 0.05
461 0.05
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.05
468 0.06
469 0.07
470 0.11
471 0.14
472 0.16
473 0.17
474 0.19
475 0.19
476 0.22
477 0.26
478 0.22
479 0.2
480 0.19
481 0.23
482 0.2
483 0.21
484 0.17
485 0.12
486 0.12
487 0.11
488 0.11
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.07
494 0.08
495 0.1
496 0.11
497 0.12
498 0.13
499 0.13
500 0.14
501 0.14
502 0.14
503 0.13
504 0.11
505 0.1
506 0.11
507 0.1
508 0.08
509 0.07
510 0.06
511 0.06
512 0.05
513 0.06
514 0.06
515 0.09
516 0.11
517 0.13
518 0.19
519 0.23
520 0.26
521 0.33
522 0.38
523 0.37
524 0.39
525 0.47
526 0.48
527 0.49
528 0.51
529 0.46
530 0.47
531 0.47
532 0.44
533 0.34
534 0.31
535 0.29
536 0.3
537 0.29
538 0.23
539 0.23
540 0.22
541 0.22
542 0.19
543 0.16
544 0.12
545 0.1
546 0.12
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.11
551 0.09
552 0.08
553 0.08
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.06
558 0.06
559 0.06
560 0.05
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.05
565 0.06
566 0.06
567 0.12
568 0.14
569 0.19
570 0.25
571 0.32
572 0.35
573 0.43
574 0.51
575 0.48
576 0.48
577 0.48
578 0.46
579 0.43
580 0.44
581 0.35
582 0.29
583 0.3
584 0.28
585 0.26
586 0.22
587 0.19
588 0.14
589 0.16
590 0.19
591 0.2
592 0.21
593 0.2
594 0.2
595 0.2
596 0.22
597 0.28
598 0.25
599 0.24
600 0.26
601 0.27
602 0.27
603 0.29
604 0.27
605 0.22
606 0.21
607 0.17
608 0.14
609 0.14
610 0.13
611 0.11
612 0.11
613 0.1
614 0.08
615 0.1
616 0.11
617 0.1
618 0.1
619 0.09
620 0.08
621 0.07
622 0.07
623 0.04
624 0.03
625 0.03
626 0.03
627 0.04
628 0.04
629 0.04
630 0.04
631 0.04
632 0.05
633 0.06
634 0.12
635 0.13
636 0.19
637 0.22
638 0.31
639 0.33
640 0.35
641 0.35
642 0.3
643 0.29
644 0.23
645 0.23
646 0.18
647 0.2
648 0.22
649 0.24
650 0.24
651 0.26
652 0.26
653 0.24
654 0.27
655 0.29
656 0.32
657 0.36
658 0.45
659 0.47
660 0.51
661 0.58
662 0.53
663 0.47
664 0.4
665 0.35
666 0.26
667 0.22
668 0.17
669 0.1
670 0.11
671 0.1
672 0.09
673 0.08
674 0.12
675 0.13
676 0.14
677 0.15
678 0.23
679 0.24
680 0.32
681 0.37
682 0.37
683 0.43
684 0.51
685 0.53
686 0.5
687 0.52
688 0.5
689 0.46
690 0.47
691 0.41
692 0.36
693 0.34
694 0.31
695 0.28
696 0.22
697 0.21
698 0.16
699 0.14
700 0.15
701 0.16
702 0.14
703 0.15
704 0.15
705 0.16
706 0.19
707 0.24
708 0.21
709 0.2
710 0.23
711 0.3
712 0.36
713 0.36
714 0.37
715 0.34
716 0.37
717 0.4
718 0.39
719 0.34
720 0.31
721 0.31
722 0.28
723 0.27
724 0.23
725 0.19
726 0.16
727 0.15
728 0.14
729 0.16
730 0.16
731 0.2
732 0.27
733 0.35
734 0.45
735 0.47
736 0.55
737 0.62
738 0.63
739 0.62
740 0.61
741 0.58
742 0.54
743 0.5
744 0.42
745 0.32
746 0.3
747 0.25
748 0.19
749 0.13
750 0.07
751 0.07
752 0.07
753 0.07
754 0.08
755 0.11
756 0.13
757 0.16
758 0.16
759 0.17
760 0.16
761 0.16
762 0.19
763 0.16
764 0.14
765 0.11
766 0.1
767 0.09
768 0.09
769 0.09
770 0.05
771 0.05
772 0.05
773 0.05
774 0.06
775 0.07
776 0.08
777 0.12
778 0.13
779 0.15
780 0.18
781 0.2
782 0.23
783 0.27
784 0.31
785 0.33
786 0.32
787 0.31
788 0.31
789 0.33
790 0.34
791 0.35
792 0.31
793 0.26
794 0.26
795 0.25
796 0.23
797 0.19
798 0.17
799 0.16
800 0.15
801 0.14
802 0.14
803 0.14
804 0.13
805 0.13
806 0.1
807 0.06
808 0.06
809 0.06
810 0.06
811 0.07
812 0.06
813 0.07
814 0.06
815 0.06
816 0.05
817 0.06
818 0.08
819 0.08
820 0.11
821 0.1
822 0.14
823 0.15
824 0.17
825 0.16
826 0.16
827 0.18
828 0.18
829 0.2
830 0.17
831 0.17
832 0.16
833 0.17
834 0.19
835 0.17
836 0.21
837 0.21
838 0.24
839 0.23
840 0.22
841 0.22
842 0.2
843 0.19
844 0.15
845 0.13
846 0.1
847 0.11
848 0.11
849 0.11
850 0.11
851 0.11
852 0.09
853 0.1
854 0.1
855 0.09
856 0.09
857 0.12
858 0.22
859 0.3
860 0.35
861 0.41
862 0.48
863 0.55
864 0.61
865 0.66
866 0.62
867 0.61
868 0.6
869 0.56
870 0.55
871 0.48
872 0.42
873 0.34
874 0.29
875 0.23
876 0.22
877 0.21
878 0.16
879 0.15
880 0.18
881 0.18
882 0.19
883 0.21
884 0.18
885 0.17
886 0.16
887 0.17
888 0.14
889 0.13
890 0.11
891 0.08
892 0.07
893 0.06
894 0.06
895 0.08
896 0.09
897 0.09
898 0.1
899 0.1
900 0.11
901 0.17
902 0.17
903 0.2
904 0.22
905 0.24
906 0.26
907 0.27
908 0.27
909 0.2
910 0.2
911 0.15
912 0.13
913 0.1
914 0.07
915 0.06
916 0.05
917 0.05
918 0.05
919 0.05
920 0.05
921 0.05
922 0.05
923 0.05
924 0.05
925 0.05
926 0.05
927 0.05
928 0.05
929 0.05
930 0.06
931 0.06
932 0.05
933 0.06
934 0.07
935 0.06
936 0.06
937 0.06
938 0.07
939 0.07
940 0.08
941 0.07
942 0.07
943 0.08
944 0.1
945 0.1
946 0.1
947 0.11
948 0.13
949 0.13
950 0.15
951 0.15
952 0.13
953 0.12
954 0.11
955 0.1
956 0.09
957 0.07
958 0.05
959 0.06
960 0.08
961 0.08
962 0.09
963 0.09
964 0.11
965 0.12
966 0.13
967 0.13
968 0.12
969 0.14
970 0.15
971 0.15
972 0.15
973 0.16
974 0.15
975 0.14
976 0.15
977 0.14
978 0.13
979 0.12
980 0.11
981 0.1
982 0.1
983 0.11
984 0.1
985 0.09
986 0.1
987 0.11
988 0.11
989 0.11
990 0.11
991 0.11
992 0.11
993 0.11
994 0.09
995 0.09
996 0.09
997 0.08
998 0.09
999 0.08
1000 0.09
1001 0.12
1002 0.12
1003 0.13
1004 0.17
1005 0.22
1006 0.22
1007 0.24
1008 0.29
1009 0.34
1010 0.39
1011 0.44
1012 0.47
1013 0.48
1014 0.55
1015 0.56
1016 0.56
1017 0.54
1018 0.51
1019 0.46
1020 0.41
1021 0.34
1022 0.27
1023 0.3
1024 0.23
1025 0.18
1026 0.21
1027 0.29
1028 0.33
1029 0.38
1030 0.41
1031 0.44
1032 0.53
1033 0.61
1034 0.63
1035 0.6
1036 0.6
1037 0.61
1038 0.59
1039 0.53
1040 0.44
1041 0.37
1042 0.3
1043 0.23
1044 0.18
1045 0.12
1046 0.09
1047 0.09
1048 0.08
1049 0.09
1050 0.08
1051 0.08
1052 0.08
1053 0.1
1054 0.12
1055 0.12
1056 0.17
1057 0.22
1058 0.27
1059 0.36
1060 0.46
1061 0.52
1062 0.58
1063 0.66
1064 0.71
1065 0.71
1066 0.69
1067 0.65
1068 0.59
1069 0.53
1070 0.45
1071 0.36
1072 0.27
1073 0.2
1074 0.18
1075 0.13
1076 0.1
1077 0.09
1078 0.09
1079 0.12
1080 0.13
1081 0.14
1082 0.17
1083 0.22
1084 0.25
1085 0.3
1086 0.35
1087 0.39
1088 0.41
1089 0.48
1090 0.52
1091 0.49
1092 0.55
1093 0.54
1094 0.52
1095 0.5
1096 0.49
1097 0.48
1098 0.5
1099 0.56
1100 0.53
1101 0.52
1102 0.51
1103 0.46
1104 0.47
1105 0.43
1106 0.36
1107 0.3
1108 0.25
1109 0.21
1110 0.21
1111 0.23
1112 0.19