Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E2LW28

Protein Details
Accession E2LW28    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-274VNTLVAKKNKNKKKRLGLTQMGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-267KKNKNKKKR
Subcellular Location(s) cyto 10, cyto_nucl 9.833, nucl 8.5, cyto_pero 6.333, cysk 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031120  HIR1-like  
IPR011494  HIRA-like_C  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG mpr:MPER_11428  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07569  Hira  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences LHKLDRHQGFVKGVCWDPVGEFLATQSDDRTVKIWRTTDWGLEAEVKKPFEDSPGSTFFRRLSWSPDGAHITASNATNNRGFVFIAAVITRGAWTSDISLVGHENTIEVASYNPHIFLRNPSAAVATSNICSVVALGADDRSVSVWQTKSARPLIVAKEVFERQIMDLSWSWDGMTLYAASSDGTIAVFNFEPDELEGIAPHSIQEQYLSKFGFAPPSVPSNWSHAAQSQQQVPSQSQMTGFDGQANGDGERVNTLVAKKNKNKKKRLGLTQMGSVPSSAMAQIPSSSTSSSLPKPKLETSGSFPTPEEQPFDSKPAPGWGSRRDRDFGMDMDVDMDVASSVPIDVITENKGKRKAEEELVSGRQPAYRTLGGDRPRETGPIRVLADSGPSLGMVGAPAINLPIPTTMTRVTAEVEGTDDVFEAINAEGDEDQNEVMFISGKSTKWLDYVPSPVLAARATSTFCAAAMQDGSVNVYSHNGRRLMPTLALGSPCSLIDGNKHCLMVITQSGQLYSWKVHKNSAFFPPISVIPLISSPNYTITSALGRPNGCPIINCSNGSVFSMTRSSYVGELSENVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.31
3 0.26
4 0.22
5 0.23
6 0.22
7 0.17
8 0.16
9 0.15
10 0.18
11 0.18
12 0.17
13 0.14
14 0.17
15 0.18
16 0.19
17 0.2
18 0.21
19 0.26
20 0.32
21 0.33
22 0.3
23 0.36
24 0.38
25 0.39
26 0.37
27 0.33
28 0.28
29 0.34
30 0.33
31 0.3
32 0.33
33 0.3
34 0.27
35 0.28
36 0.27
37 0.24
38 0.27
39 0.27
40 0.28
41 0.33
42 0.37
43 0.36
44 0.38
45 0.34
46 0.32
47 0.33
48 0.29
49 0.3
50 0.33
51 0.36
52 0.35
53 0.4
54 0.42
55 0.37
56 0.37
57 0.29
58 0.25
59 0.25
60 0.25
61 0.23
62 0.2
63 0.22
64 0.23
65 0.23
66 0.22
67 0.19
68 0.18
69 0.14
70 0.14
71 0.12
72 0.11
73 0.11
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.09
83 0.1
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.09
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.11
102 0.13
103 0.14
104 0.19
105 0.25
106 0.25
107 0.25
108 0.25
109 0.25
110 0.24
111 0.23
112 0.2
113 0.14
114 0.12
115 0.11
116 0.11
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.07
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.11
132 0.12
133 0.16
134 0.21
135 0.23
136 0.28
137 0.31
138 0.31
139 0.28
140 0.33
141 0.32
142 0.36
143 0.35
144 0.3
145 0.31
146 0.32
147 0.3
148 0.25
149 0.22
150 0.15
151 0.17
152 0.16
153 0.14
154 0.14
155 0.16
156 0.15
157 0.14
158 0.13
159 0.13
160 0.12
161 0.09
162 0.09
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.08
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.09
193 0.11
194 0.12
195 0.15
196 0.15
197 0.14
198 0.15
199 0.16
200 0.18
201 0.15
202 0.15
203 0.14
204 0.17
205 0.17
206 0.18
207 0.19
208 0.2
209 0.22
210 0.21
211 0.2
212 0.18
213 0.21
214 0.23
215 0.25
216 0.24
217 0.23
218 0.24
219 0.25
220 0.24
221 0.23
222 0.2
223 0.18
224 0.14
225 0.14
226 0.15
227 0.15
228 0.15
229 0.14
230 0.13
231 0.12
232 0.13
233 0.12
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.08
243 0.15
244 0.21
245 0.29
246 0.37
247 0.47
248 0.56
249 0.65
250 0.73
251 0.75
252 0.8
253 0.8
254 0.82
255 0.82
256 0.79
257 0.71
258 0.66
259 0.59
260 0.48
261 0.39
262 0.29
263 0.2
264 0.13
265 0.11
266 0.07
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.09
277 0.12
278 0.15
279 0.21
280 0.21
281 0.22
282 0.25
283 0.26
284 0.29
285 0.28
286 0.27
287 0.27
288 0.32
289 0.31
290 0.29
291 0.27
292 0.24
293 0.24
294 0.23
295 0.19
296 0.14
297 0.16
298 0.17
299 0.21
300 0.2
301 0.18
302 0.18
303 0.19
304 0.19
305 0.18
306 0.21
307 0.25
308 0.33
309 0.35
310 0.38
311 0.36
312 0.35
313 0.35
314 0.33
315 0.25
316 0.2
317 0.18
318 0.15
319 0.14
320 0.13
321 0.1
322 0.08
323 0.07
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.02
328 0.02
329 0.02
330 0.02
331 0.03
332 0.03
333 0.04
334 0.07
335 0.12
336 0.14
337 0.19
338 0.24
339 0.24
340 0.26
341 0.29
342 0.3
343 0.32
344 0.34
345 0.33
346 0.33
347 0.35
348 0.34
349 0.3
350 0.26
351 0.22
352 0.19
353 0.18
354 0.17
355 0.16
356 0.17
357 0.19
358 0.25
359 0.29
360 0.33
361 0.33
362 0.31
363 0.31
364 0.32
365 0.3
366 0.29
367 0.25
368 0.27
369 0.26
370 0.23
371 0.23
372 0.2
373 0.21
374 0.16
375 0.14
376 0.08
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.05
390 0.05
391 0.07
392 0.08
393 0.1
394 0.11
395 0.12
396 0.13
397 0.13
398 0.14
399 0.13
400 0.13
401 0.11
402 0.11
403 0.1
404 0.09
405 0.09
406 0.07
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.05
411 0.05
412 0.06
413 0.05
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.05
421 0.06
422 0.05
423 0.05
424 0.06
425 0.05
426 0.08
427 0.11
428 0.12
429 0.15
430 0.16
431 0.17
432 0.17
433 0.18
434 0.18
435 0.19
436 0.24
437 0.22
438 0.21
439 0.21
440 0.2
441 0.2
442 0.16
443 0.14
444 0.1
445 0.1
446 0.11
447 0.11
448 0.12
449 0.11
450 0.11
451 0.11
452 0.1
453 0.1
454 0.09
455 0.09
456 0.08
457 0.08
458 0.1
459 0.1
460 0.1
461 0.09
462 0.11
463 0.14
464 0.16
465 0.21
466 0.22
467 0.22
468 0.26
469 0.29
470 0.28
471 0.27
472 0.26
473 0.24
474 0.24
475 0.24
476 0.2
477 0.18
478 0.16
479 0.15
480 0.15
481 0.12
482 0.11
483 0.17
484 0.22
485 0.26
486 0.28
487 0.28
488 0.26
489 0.26
490 0.26
491 0.24
492 0.22
493 0.19
494 0.19
495 0.19
496 0.2
497 0.19
498 0.2
499 0.18
500 0.18
501 0.23
502 0.28
503 0.3
504 0.37
505 0.41
506 0.45
507 0.48
508 0.53
509 0.51
510 0.43
511 0.43
512 0.39
513 0.35
514 0.33
515 0.28
516 0.2
517 0.15
518 0.17
519 0.18
520 0.15
521 0.16
522 0.14
523 0.18
524 0.19
525 0.18
526 0.17
527 0.16
528 0.2
529 0.21
530 0.25
531 0.26
532 0.25
533 0.26
534 0.32
535 0.34
536 0.3
537 0.28
538 0.31
539 0.34
540 0.38
541 0.38
542 0.34
543 0.32
544 0.32
545 0.33
546 0.28
547 0.2
548 0.19
549 0.21
550 0.19
551 0.18
552 0.18
553 0.18
554 0.17
555 0.18
556 0.15
557 0.14