Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5B1QGC4

Protein Details
Accession A0A5B1QGC4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
248-277DAEWEKRTEEKKKKKNKKFEQSLKELRKRTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
254-286RTEEKKKKKNKKFEQSLKELRKRTREGVWQKRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042171  Acyl-CoA_hotdog  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR029069  HotDog_dom_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF13622  4HBT_3  
PF05181  XPA_C  
CDD cd21077  DBD_Rad14  
cd03444  Thioesterase_II_repeat1  
cd03445  Thioesterase_II_repeat2  
Amino Acid Sequences MSEAGPSTRPVTPPPRNNYNADTQLTPEQVKRVEINRLKAKARQREREASASSSSIPNGNNKRPLAVVSAASTSPTGPTRQEPKLKRDSRLGKYFEYDLSKMVNSKGGFLVEDKKEAEEDLKTKARERERQKAMQNLDPPIYLDPRQNPKCIECGSVDIDQTYRKIFRCLVCNRCKNEKPEKYSLLTKTECKEDYLLTDSAELRDEELLPHLLKANPHKSTFANMMLFCRYQVEAFAWQKWGSPEALDAEWEKRTEEKKKKKNKKFEQSLKELRKRTREGVWQKRKDAEHKHVFSQPSHQEGGVAKQVCHECGFTIETMADSADPDQAEHRHISTSLEVEQLDDNLYRSRELWLPFRARGVFGGQVISQAIVSATKCVQPQYALHCYFLLSASSAVPILYYVDKLREGRSYTTIAVKAVQRGRTIFMMISSFHIPEPLQLSHQWAMPNVPSPEDCPNEEDIIRSAADDGRDDATRKSFPIVVKRIGNHIGENGTPVFMFWMRPRDKADYDMPFQKAILGYISDTHFLPVAANTLRISRFGGGVKPFGMIVSEPTHDFDCNDWILYMTVSSVASSGRGFVTGRMYSRSGTLIAITNQEGVVRADIRDAGSTEGPKSKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.67
3 0.68
4 0.71
5 0.69
6 0.67
7 0.64
8 0.57
9 0.5
10 0.44
11 0.44
12 0.43
13 0.4
14 0.33
15 0.32
16 0.31
17 0.33
18 0.34
19 0.34
20 0.41
21 0.45
22 0.52
23 0.57
24 0.61
25 0.61
26 0.63
27 0.68
28 0.69
29 0.73
30 0.73
31 0.73
32 0.76
33 0.78
34 0.79
35 0.73
36 0.66
37 0.58
38 0.5
39 0.43
40 0.35
41 0.3
42 0.26
43 0.24
44 0.29
45 0.35
46 0.41
47 0.47
48 0.46
49 0.47
50 0.44
51 0.44
52 0.4
53 0.34
54 0.28
55 0.22
56 0.24
57 0.22
58 0.21
59 0.2
60 0.15
61 0.15
62 0.15
63 0.15
64 0.16
65 0.23
66 0.3
67 0.38
68 0.48
69 0.51
70 0.58
71 0.67
72 0.71
73 0.69
74 0.72
75 0.73
76 0.73
77 0.75
78 0.71
79 0.63
80 0.6
81 0.57
82 0.52
83 0.48
84 0.39
85 0.31
86 0.3
87 0.28
88 0.26
89 0.24
90 0.25
91 0.19
92 0.21
93 0.21
94 0.19
95 0.18
96 0.19
97 0.26
98 0.22
99 0.25
100 0.23
101 0.23
102 0.22
103 0.22
104 0.22
105 0.19
106 0.19
107 0.23
108 0.28
109 0.28
110 0.34
111 0.41
112 0.47
113 0.52
114 0.59
115 0.62
116 0.65
117 0.72
118 0.73
119 0.74
120 0.7
121 0.68
122 0.64
123 0.57
124 0.5
125 0.42
126 0.37
127 0.31
128 0.29
129 0.24
130 0.24
131 0.28
132 0.37
133 0.4
134 0.43
135 0.43
136 0.41
137 0.46
138 0.43
139 0.38
140 0.28
141 0.29
142 0.29
143 0.28
144 0.26
145 0.21
146 0.2
147 0.19
148 0.18
149 0.17
150 0.17
151 0.16
152 0.19
153 0.24
154 0.27
155 0.35
156 0.42
157 0.5
158 0.56
159 0.63
160 0.66
161 0.71
162 0.73
163 0.72
164 0.74
165 0.73
166 0.71
167 0.72
168 0.7
169 0.64
170 0.66
171 0.62
172 0.58
173 0.51
174 0.48
175 0.42
176 0.43
177 0.39
178 0.33
179 0.31
180 0.24
181 0.24
182 0.24
183 0.22
184 0.17
185 0.18
186 0.17
187 0.16
188 0.16
189 0.13
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.08
194 0.1
195 0.11
196 0.1
197 0.11
198 0.12
199 0.13
200 0.15
201 0.23
202 0.29
203 0.3
204 0.31
205 0.33
206 0.32
207 0.34
208 0.34
209 0.31
210 0.26
211 0.23
212 0.24
213 0.24
214 0.23
215 0.19
216 0.18
217 0.14
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.16
222 0.18
223 0.19
224 0.2
225 0.19
226 0.21
227 0.21
228 0.2
229 0.13
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.12
237 0.13
238 0.13
239 0.12
240 0.14
241 0.19
242 0.29
243 0.38
244 0.47
245 0.56
246 0.67
247 0.78
248 0.84
249 0.9
250 0.91
251 0.91
252 0.92
253 0.92
254 0.89
255 0.87
256 0.87
257 0.86
258 0.83
259 0.78
260 0.72
261 0.7
262 0.65
263 0.59
264 0.56
265 0.56
266 0.59
267 0.64
268 0.69
269 0.67
270 0.66
271 0.68
272 0.65
273 0.63
274 0.6
275 0.59
276 0.58
277 0.55
278 0.55
279 0.54
280 0.53
281 0.45
282 0.44
283 0.37
284 0.3
285 0.29
286 0.25
287 0.22
288 0.21
289 0.23
290 0.2
291 0.18
292 0.15
293 0.18
294 0.18
295 0.17
296 0.18
297 0.15
298 0.1
299 0.11
300 0.12
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.05
308 0.04
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.08
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.1
322 0.11
323 0.1
324 0.11
325 0.1
326 0.11
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.11
337 0.14
338 0.16
339 0.2
340 0.24
341 0.27
342 0.27
343 0.3
344 0.28
345 0.25
346 0.24
347 0.21
348 0.17
349 0.13
350 0.14
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.07
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.07
362 0.09
363 0.1
364 0.11
365 0.12
366 0.12
367 0.15
368 0.2
369 0.28
370 0.26
371 0.26
372 0.26
373 0.25
374 0.24
375 0.22
376 0.16
377 0.08
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.07
389 0.09
390 0.11
391 0.13
392 0.14
393 0.17
394 0.19
395 0.21
396 0.23
397 0.24
398 0.23
399 0.27
400 0.26
401 0.22
402 0.23
403 0.22
404 0.25
405 0.27
406 0.29
407 0.26
408 0.27
409 0.29
410 0.26
411 0.26
412 0.19
413 0.16
414 0.14
415 0.13
416 0.14
417 0.14
418 0.13
419 0.12
420 0.13
421 0.12
422 0.12
423 0.16
424 0.14
425 0.15
426 0.15
427 0.2
428 0.2
429 0.23
430 0.21
431 0.18
432 0.19
433 0.18
434 0.23
435 0.19
436 0.19
437 0.17
438 0.19
439 0.25
440 0.26
441 0.26
442 0.23
443 0.25
444 0.26
445 0.25
446 0.23
447 0.18
448 0.17
449 0.16
450 0.13
451 0.12
452 0.11
453 0.12
454 0.12
455 0.12
456 0.13
457 0.14
458 0.16
459 0.16
460 0.19
461 0.19
462 0.19
463 0.2
464 0.22
465 0.24
466 0.33
467 0.37
468 0.39
469 0.42
470 0.43
471 0.46
472 0.47
473 0.44
474 0.35
475 0.32
476 0.28
477 0.23
478 0.24
479 0.19
480 0.14
481 0.13
482 0.12
483 0.11
484 0.1
485 0.12
486 0.13
487 0.23
488 0.25
489 0.29
490 0.34
491 0.38
492 0.39
493 0.42
494 0.46
495 0.42
496 0.45
497 0.49
498 0.46
499 0.4
500 0.38
501 0.35
502 0.28
503 0.23
504 0.19
505 0.13
506 0.12
507 0.14
508 0.16
509 0.15
510 0.14
511 0.14
512 0.13
513 0.12
514 0.12
515 0.09
516 0.12
517 0.12
518 0.13
519 0.13
520 0.17
521 0.17
522 0.18
523 0.19
524 0.16
525 0.18
526 0.19
527 0.24
528 0.23
529 0.25
530 0.24
531 0.22
532 0.21
533 0.18
534 0.17
535 0.12
536 0.13
537 0.14
538 0.15
539 0.15
540 0.18
541 0.19
542 0.18
543 0.19
544 0.17
545 0.19
546 0.18
547 0.18
548 0.16
549 0.15
550 0.15
551 0.14
552 0.13
553 0.08
554 0.09
555 0.08
556 0.08
557 0.07
558 0.07
559 0.08
560 0.08
561 0.09
562 0.08
563 0.1
564 0.1
565 0.12
566 0.19
567 0.21
568 0.23
569 0.26
570 0.27
571 0.26
572 0.28
573 0.27
574 0.22
575 0.19
576 0.19
577 0.19
578 0.19
579 0.21
580 0.21
581 0.2
582 0.19
583 0.18
584 0.18
585 0.15
586 0.17
587 0.15
588 0.14
589 0.15
590 0.17
591 0.18
592 0.18
593 0.18
594 0.18
595 0.21
596 0.23
597 0.25