Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5B1QFQ4

Protein Details
Accession A0A5B1QFQ4    Localization Confidence Low Confidence Score 6.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
164-186WEAMRCSKTGRIEKRKCAKPDSVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 10cyto_nucl 10, cyto 9, nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039771  Csl4  
IPR019495  EXOSC1_C  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR003029  S1_domain  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000178  C:exosome (RNase complex)  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10447  EXOSC1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50126  S1  
CDD cd05791  S1_CSL4  
Amino Acid Sequences MASQDYLLPGQPFPLPRGPAPRLGAGFYQRDAVPRASLLGIPTHDGPALVISRVRPHPPAPNSVVLGSVTRLSPQQAMLSITVVDGVPLPAGEEFTGVIRVQDVRATEKDKVKIGDCFRGGDVVKGVVISLGDARSYYVTTARNDLGVVFATSEAGATMEPVSWEAMRCSKTGRIEKRKCAKPDSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.3
4 0.39
5 0.4
6 0.43
7 0.45
8 0.45
9 0.4
10 0.39
11 0.39
12 0.34
13 0.34
14 0.28
15 0.28
16 0.23
17 0.24
18 0.25
19 0.23
20 0.19
21 0.17
22 0.18
23 0.15
24 0.16
25 0.14
26 0.14
27 0.13
28 0.14
29 0.14
30 0.14
31 0.13
32 0.12
33 0.11
34 0.11
35 0.11
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.15
40 0.18
41 0.21
42 0.21
43 0.23
44 0.32
45 0.33
46 0.39
47 0.37
48 0.37
49 0.36
50 0.33
51 0.31
52 0.23
53 0.2
54 0.15
55 0.12
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.07
71 0.05
72 0.04
73 0.04
74 0.03
75 0.03
76 0.04
77 0.03
78 0.04
79 0.03
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.07
90 0.08
91 0.1
92 0.12
93 0.16
94 0.2
95 0.24
96 0.26
97 0.28
98 0.29
99 0.27
100 0.31
101 0.31
102 0.33
103 0.3
104 0.29
105 0.26
106 0.28
107 0.26
108 0.21
109 0.18
110 0.12
111 0.11
112 0.1
113 0.09
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.1
126 0.13
127 0.15
128 0.18
129 0.18
130 0.18
131 0.17
132 0.17
133 0.14
134 0.12
135 0.11
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.05
143 0.04
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.07
149 0.08
150 0.09
151 0.1
152 0.12
153 0.17
154 0.19
155 0.19
156 0.23
157 0.27
158 0.36
159 0.45
160 0.53
161 0.59
162 0.67
163 0.77
164 0.84
165 0.87
166 0.85