FuNGI

H1VMT8

Protein Details

Accession

H1VMT8

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-23	PPKTAGEKRKRGRPPNAPKIGDA	Basic
42-86	AVVVSTPAKRGRPKKNKESQPPPLAEEPKTKRRGRPRREEVVEEV	Hydrophilic
143-163	SVNSAAKKKRGRPTKVIEEPT	Hydrophilic
167-189	TELEPTPKKKRGRPSLNKGLVAE	Hydrophilic
196-216	EEESAPKKRGRKPKEKIAEVE	Basic
283-303	EESKAAKKKHRRPAARTEPEA	Basic
318-343	GEPATEKPTKKRRKRSSQTEEKPSKS	Basic
366-409	APEEQPSKSRKSKKRPSGDEDAADSAPAKKRRRRTSDEIRQQQQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-17	GEKRKRGRPPNA
49-79	AKRGRPKKNKESQPPPLAEEPKTKRRGRPRR
149-155	KKKRGRP
174-180	KKKRGRP
201-211	PKKRGRKPKEK
230-240	PKKRGRKPKGK
261-399	PEKKRGRKPKAAAEEGEKPSAEEESKAAKKKHRRPAARTEPEAPEARRRKDRQPSPAGEPATEKPTKKRRKRSSQTEEKPSKSPPETQRRRPGRPRISDGASSPHAPEEQPSKSRKSKKRPSGDEDAADSAPAKKRRRR
425-434	RRPAPKHRHI

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017956 AT_hook_DNA-bd_motif IPR025212 CAD_CENP-Q
Gene Ontology	GO:0000775 C:chromosome, centromeric region GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF13094 CENP-Q

Amino Acid Sequences

PPKTAGEKRKRGRPPNAPKIGDASQESSRIVEAESNELAEEAVVVSTPAKRGRPKKNKESQPPPLAEEPKTKRRGRPRREEVVEEVIEEEPELVQSKSKSIEAVKSAVGVKDFSQPAEKPTVTKTGRKAAQEASVARGDDEASVNSAAKKKRGRPTKVIEEPTEDATELEPTPKKKRGRPSLNKGLVAEESIEAAEEESAPKKRGRKPKEKIAEVEEYAAEEEVEAEMAPKKRGRKPKGKAVEVEEPTPEEEAQAEAEPAPEKKRGRKPKAAAEEGEKPSAEEESKAAKKKHRRPAARTEPEAPEARRRKDRQPSPAGEPATEKPTKKRRKRSSQTEEKPSKSPPETQRRRPGRPRISDGASSPHAPEEQPSKSRKSKKRPSGDEDAADSAPAKKRRRRTSDEIRQQQQQQQLLLQSSMDPPAARRPAPKHRHIAPRVRQIPRSIIEEKWTPLAPPTLAHVSSLLRLAERPVLQRLAANEKRRDQAASAIRLVTNRLSRKLSRGLPFPPAAAPSTGSGVGARKAADADGGRAEELNFERVIEGVAALERQLDPLLHAVELLKVEKERDERSLEADYDSLRTLEANARSEARNFKDNLRKTHVLVPEPKVAGAADSSRHGSVGEEHDFKFVPDENVTGTLFRDLEGNELRELAGQVSSHMESMRNNLQQIDGVLPQIVRSRAALQDVLFKHLDQPSYENVLLG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.9
2	0.9
3	0.92
4	0.84
5	0.75
6	0.72
7	0.64
8	0.58
9	0.5
10	0.44
11	0.37
12	0.37
13	0.35
14	0.29
15	0.26
16	0.21
17	0.18
18	0.17
19	0.15
20	0.18
21	0.18
22	0.17
23	0.17
24	0.16
25	0.15
26	0.11
27	0.1
28	0.05
29	0.05
30	0.04
31	0.05
32	0.06
33	0.08
34	0.13
35	0.17
36	0.23
37	0.33
38	0.43
39	0.54
40	0.64
41	0.73
42	0.8
43	0.86
44	0.91
45	0.92
46	0.93
47	0.92
48	0.91
49	0.84
50	0.78
51	0.76
52	0.7
53	0.63
54	0.63
55	0.6
56	0.61
57	0.66
58	0.67
59	0.67
60	0.74
61	0.81
62	0.81
63	0.85
64	0.84
65	0.86
66	0.86
67	0.82
68	0.77
69	0.74
70	0.63
71	0.52
72	0.44
73	0.34
74	0.27
75	0.21
76	0.16
77	0.07
78	0.08
79	0.09
80	0.08
81	0.11
82	0.12
83	0.14
84	0.17
85	0.17
86	0.2
87	0.21
88	0.27
89	0.27
90	0.29
91	0.27
92	0.27
93	0.28
94	0.26
95	0.24
96	0.19
97	0.17
98	0.22
99	0.23
100	0.21
101	0.25
102	0.24
103	0.27
104	0.33
105	0.32
106	0.26
107	0.29
108	0.37
109	0.35
110	0.41
111	0.43
112	0.45
113	0.5
114	0.51
115	0.51
116	0.45
117	0.48
118	0.47
119	0.42
120	0.37
121	0.34
122	0.32
123	0.28
124	0.25
125	0.19
126	0.15
127	0.15
128	0.11
129	0.1
130	0.11
131	0.12
132	0.14
133	0.2
134	0.21
135	0.27
136	0.34
137	0.41
138	0.5
139	0.6
140	0.66
141	0.7
142	0.77
143	0.8
144	0.82
145	0.79
146	0.71
147	0.67
148	0.61
149	0.54
150	0.45
151	0.34
152	0.25
153	0.19
154	0.19
155	0.14
156	0.16
157	0.17
158	0.21
159	0.28
160	0.36
161	0.42
162	0.47
163	0.58
164	0.64
165	0.72
166	0.78
167	0.81
168	0.85
169	0.85
170	0.8
171	0.7
172	0.61
173	0.5
174	0.4
175	0.3
176	0.19
177	0.13
178	0.1
179	0.09
180	0.07
181	0.06
182	0.06
183	0.05
184	0.06
185	0.09
186	0.12
187	0.14
188	0.18
189	0.26
190	0.34
191	0.45
192	0.53
193	0.61
194	0.68
195	0.76
196	0.83
197	0.81
198	0.77
199	0.72
200	0.68
201	0.57
202	0.5
203	0.39
204	0.29
205	0.24
206	0.19
207	0.13
208	0.07
209	0.06
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.09
215	0.1
216	0.13
217	0.16
218	0.23
219	0.31
220	0.42
221	0.51
222	0.58
223	0.64
224	0.72
225	0.79
226	0.77
227	0.74
228	0.7
229	0.7
230	0.61
231	0.55
232	0.45
233	0.35
234	0.3
235	0.27
236	0.2
237	0.11
238	0.09
239	0.08
240	0.08
241	0.07
242	0.07
243	0.06
244	0.07
245	0.08
246	0.09
247	0.11
248	0.16
249	0.19
250	0.28
251	0.38
252	0.49
253	0.56
254	0.65
255	0.69
256	0.73
257	0.8
258	0.75
259	0.67
260	0.6
261	0.61
262	0.53
263	0.48
264	0.38
265	0.28
266	0.24
267	0.23
268	0.18
269	0.1
270	0.09
271	0.15
272	0.2
273	0.26
274	0.29
275	0.35
276	0.45
277	0.55
278	0.63
279	0.66
280	0.7
281	0.72
282	0.8
283	0.84
284	0.81
285	0.75
286	0.7
287	0.62
288	0.57
289	0.53
290	0.43
291	0.42
292	0.41
293	0.43
294	0.47
295	0.48
296	0.54
297	0.61
298	0.67
299	0.67
300	0.69
301	0.68
302	0.65
303	0.67
304	0.59
305	0.49
306	0.44
307	0.36
308	0.33
309	0.32
310	0.26
311	0.29
312	0.38
313	0.48
314	0.55
315	0.65
316	0.69
317	0.78
318	0.87
319	0.9
320	0.91
321	0.91
322	0.9
323	0.9
324	0.85
325	0.77
326	0.69
327	0.6
328	0.55
329	0.46
330	0.46
331	0.44
332	0.49
333	0.54
334	0.6
335	0.69
336	0.71
337	0.77
338	0.78
339	0.8
340	0.78
341	0.76
342	0.74
343	0.69
344	0.64
345	0.57
346	0.49
347	0.42
348	0.34
349	0.28
350	0.22
351	0.18
352	0.15
353	0.13
354	0.14
355	0.14
356	0.16
357	0.21
358	0.24
359	0.29
360	0.37
361	0.47
362	0.55
363	0.61
364	0.68
365	0.73
366	0.8
367	0.82
368	0.81
369	0.8
370	0.74
371	0.65
372	0.56
373	0.49
374	0.38
375	0.3
376	0.23
377	0.17
378	0.19
379	0.25
380	0.29
381	0.33
382	0.43
383	0.53
384	0.61
385	0.67
386	0.71
387	0.75
388	0.79
389	0.84
390	0.83
391	0.77
392	0.73
393	0.68
394	0.64
395	0.58
396	0.49
397	0.39
398	0.32
399	0.3
400	0.26
401	0.22
402	0.17
403	0.13
404	0.11
405	0.11
406	0.1
407	0.08
408	0.08
409	0.15
410	0.18
411	0.19
412	0.23
413	0.29
414	0.4
415	0.48
416	0.54
417	0.54
418	0.59
419	0.68
420	0.7
421	0.74
422	0.72
423	0.75
424	0.77
425	0.73
426	0.68
427	0.6
428	0.59
429	0.51
430	0.48
431	0.4
432	0.32
433	0.32
434	0.31
435	0.29
436	0.26
437	0.24
438	0.18
439	0.17
440	0.18
441	0.14
442	0.12
443	0.15
444	0.16
445	0.16
446	0.16
447	0.15
448	0.14
449	0.15
450	0.16
451	0.13
452	0.09
453	0.09
454	0.11
455	0.14
456	0.15
457	0.16
458	0.18
459	0.19
460	0.19
461	0.2
462	0.22
463	0.27
464	0.32
465	0.37
466	0.39
467	0.43
468	0.45
469	0.44
470	0.43
471	0.34
472	0.36
473	0.36
474	0.34
475	0.31
476	0.3
477	0.3
478	0.29
479	0.29
480	0.25
481	0.25
482	0.24
483	0.27
484	0.31
485	0.32
486	0.37
487	0.43
488	0.46
489	0.44
490	0.45
491	0.44
492	0.45
493	0.44
494	0.4
495	0.34
496	0.28
497	0.24
498	0.2
499	0.18
500	0.13
501	0.14
502	0.13
503	0.12
504	0.12
505	0.12
506	0.12
507	0.12
508	0.12
509	0.1
510	0.1
511	0.1
512	0.13
513	0.12
514	0.12
515	0.13
516	0.13
517	0.13
518	0.13
519	0.13
520	0.13
521	0.14
522	0.14
523	0.12
524	0.12
525	0.12
526	0.11
527	0.12
528	0.08
529	0.07
530	0.05
531	0.05
532	0.05
533	0.05
534	0.07
535	0.06
536	0.07
537	0.07
538	0.07
539	0.07
540	0.1
541	0.11
542	0.1
543	0.1
544	0.1
545	0.11
546	0.12
547	0.12
548	0.11
549	0.11
550	0.12
551	0.17
552	0.21
553	0.22
554	0.25
555	0.29
556	0.28
557	0.31
558	0.34
559	0.3
560	0.27
561	0.25
562	0.21
563	0.18
564	0.18
565	0.14
566	0.1
567	0.1
568	0.11
569	0.16
570	0.19
571	0.21
572	0.22
573	0.25
574	0.26
575	0.3
576	0.35
577	0.33
578	0.35
579	0.35
580	0.42
581	0.49
582	0.55
583	0.59
584	0.6
585	0.59
586	0.56
587	0.62
588	0.59
589	0.56
590	0.57
591	0.54
592	0.52
593	0.5
594	0.46
595	0.39
596	0.33
597	0.26
598	0.21
599	0.18
600	0.13
601	0.14
602	0.17
603	0.16
604	0.17
605	0.16
606	0.15
607	0.18
608	0.22
609	0.26
610	0.27
611	0.27
612	0.29
613	0.29
614	0.28
615	0.27
616	0.23
617	0.21
618	0.18
619	0.19
620	0.18
621	0.21
622	0.21
623	0.19
624	0.17
625	0.16
626	0.15
627	0.14
628	0.15
629	0.12
630	0.18
631	0.22
632	0.23
633	0.2
634	0.21
635	0.21
636	0.2
637	0.2
638	0.15
639	0.12
640	0.1
641	0.11
642	0.14
643	0.15
644	0.14
645	0.14
646	0.15
647	0.15
648	0.21
649	0.29
650	0.28
651	0.29
652	0.29
653	0.29
654	0.29
655	0.29
656	0.26
657	0.19
658	0.16
659	0.17
660	0.16
661	0.16
662	0.2
663	0.19
664	0.17
665	0.18
666	0.21
667	0.23
668	0.26
669	0.27
670	0.23
671	0.31
672	0.31
673	0.34
674	0.31
675	0.28
676	0.31
677	0.32
678	0.34
679	0.27
680	0.3
681	0.3
682	0.37

H1VMT8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer