Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5B1QKF0

Protein Details
Accession A0A5B1QKF0    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MSSRHDYRRRDRTPERDERDRDRDRBasic
35-72RDRYRGGRGRSRSRSPPRRGGDRRPERRDDRRDDRRDYBasic
197-218GTANVKKERTWRQYMNRRGGFNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-127RDRTPERDERDRDRDRDRDRERDRDRDRYRGGRGRSRSRSPPRRGGDRRPERRDDRRDDRRDYGRDRRDDRRRDDRDGRDYDRDDRRDRDRERDRDRDRRDDPKDRERPRQRDGRSDE
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSSRHDYRRRDRTPERDERDRDRDRDRDRERDRDRDRYRGGRGRSRSRSPPRRGGDRRPERRDDRRDDRRDYGRDRRDDRRRDDRDGRDYDRDDRRDRDRERDRDRDRRDDPKDRERPRQRDGRSDERALPRDSEMKRPGGSSGAGPSSTADATPEPGEEVEAMDATNDDDAAMMAMMGLSGFGSTKGKHVEGNQEGTANVKKERTWRQYMNRRGGFNRPLDKIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.85
3 0.84
4 0.83
5 0.82
6 0.82
7 0.8
8 0.75
9 0.73
10 0.74
11 0.71
12 0.75
13 0.73
14 0.74
15 0.73
16 0.78
17 0.77
18 0.78
19 0.78
20 0.78
21 0.76
22 0.75
23 0.75
24 0.72
25 0.74
26 0.72
27 0.72
28 0.7
29 0.73
30 0.74
31 0.75
32 0.75
33 0.76
34 0.79
35 0.82
36 0.81
37 0.82
38 0.79
39 0.82
40 0.82
41 0.82
42 0.82
43 0.82
44 0.85
45 0.82
46 0.84
47 0.81
48 0.84
49 0.83
50 0.81
51 0.8
52 0.81
53 0.81
54 0.78
55 0.77
56 0.75
57 0.73
58 0.71
59 0.71
60 0.68
61 0.69
62 0.68
63 0.71
64 0.72
65 0.74
66 0.74
67 0.75
68 0.72
69 0.72
70 0.76
71 0.73
72 0.72
73 0.7
74 0.66
75 0.61
76 0.57
77 0.56
78 0.55
79 0.52
80 0.48
81 0.46
82 0.48
83 0.52
84 0.52
85 0.55
86 0.57
87 0.62
88 0.66
89 0.72
90 0.73
91 0.74
92 0.77
93 0.75
94 0.7
95 0.7
96 0.7
97 0.69
98 0.68
99 0.68
100 0.73
101 0.69
102 0.75
103 0.75
104 0.75
105 0.71
106 0.74
107 0.66
108 0.65
109 0.67
110 0.66
111 0.61
112 0.57
113 0.57
114 0.54
115 0.55
116 0.46
117 0.4
118 0.32
119 0.35
120 0.34
121 0.35
122 0.32
123 0.31
124 0.31
125 0.3
126 0.29
127 0.23
128 0.22
129 0.15
130 0.15
131 0.13
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.11
136 0.11
137 0.1
138 0.08
139 0.07
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.08
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.04
156 0.04
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.02
166 0.02
167 0.02
168 0.02
169 0.03
170 0.04
171 0.06
172 0.07
173 0.11
174 0.15
175 0.16
176 0.19
177 0.22
178 0.31
179 0.34
180 0.39
181 0.36
182 0.33
183 0.32
184 0.33
185 0.34
186 0.26
187 0.25
188 0.21
189 0.23
190 0.32
191 0.42
192 0.47
193 0.52
194 0.59
195 0.68
196 0.76
197 0.84
198 0.85
199 0.81
200 0.79
201 0.73
202 0.73
203 0.7
204 0.68
205 0.66