Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5B1QCC6

Protein Details
Accession A0A5B1QCC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
310-329EGGPKKKKKKADGPGVTAKNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
312-320GPKKKKKKA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045144  TAF4  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
CDD cd08045  TAF4  
Amino Acid Sequences MNMKTESDTTPATSQTPSLPQTQTPQPQATQPQQPQQPQQQQPTTSYATAQWATSQIPIDPALQQHPQHPSTQYYQSYQHYPQASYGHYQPYIPPPPASQPHTPAPTQRATQSTIAATSTTNVAAANNQLDTADVATLNDALGSAGVDLRAEEERLQRSSDQHQTYRPYEDRSRKQPASPNFDARFLGPTMRKIGTRHRVTKVPEDSVNYVALALRARLSDLITGMIAASTHRTSTQFDREPSLYEDGTPMWSVSVRQDIAKQLAALEKGEREEEMRVRRERKELAAAQAAALATHAAGGTGTAGEEDAEGGPKKKKKKADGPGVTAKNMSEDVRKKMSNAVARQAAGLGTSKYAWMNAATSSAATPPPKPKPAGSPAPTTTTPAVGAGTGQSSWARPYVATNKAQTGTSSEDDKKQLVTLRDALFVVEREKGHGGGRGAARGWV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.28
4 0.26
5 0.3
6 0.31
7 0.31
8 0.37
9 0.45
10 0.49
11 0.48
12 0.5
13 0.46
14 0.5
15 0.56
16 0.57
17 0.58
18 0.56
19 0.58
20 0.62
21 0.67
22 0.69
23 0.71
24 0.74
25 0.72
26 0.75
27 0.74
28 0.68
29 0.66
30 0.63
31 0.57
32 0.47
33 0.4
34 0.33
35 0.31
36 0.29
37 0.26
38 0.21
39 0.19
40 0.19
41 0.2
42 0.19
43 0.14
44 0.15
45 0.17
46 0.17
47 0.16
48 0.18
49 0.2
50 0.24
51 0.25
52 0.28
53 0.34
54 0.35
55 0.36
56 0.37
57 0.37
58 0.37
59 0.43
60 0.41
61 0.37
62 0.41
63 0.41
64 0.45
65 0.43
66 0.44
67 0.39
68 0.37
69 0.37
70 0.35
71 0.33
72 0.3
73 0.31
74 0.3
75 0.28
76 0.27
77 0.27
78 0.32
79 0.35
80 0.34
81 0.31
82 0.28
83 0.35
84 0.41
85 0.43
86 0.39
87 0.39
88 0.44
89 0.47
90 0.46
91 0.43
92 0.43
93 0.42
94 0.39
95 0.37
96 0.34
97 0.34
98 0.34
99 0.31
100 0.27
101 0.23
102 0.21
103 0.18
104 0.15
105 0.12
106 0.11
107 0.09
108 0.08
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.05
122 0.05
123 0.06
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.05
137 0.06
138 0.07
139 0.09
140 0.13
141 0.16
142 0.17
143 0.19
144 0.19
145 0.22
146 0.27
147 0.34
148 0.34
149 0.34
150 0.37
151 0.41
152 0.42
153 0.46
154 0.42
155 0.39
156 0.43
157 0.5
158 0.53
159 0.56
160 0.63
161 0.58
162 0.6
163 0.62
164 0.62
165 0.61
166 0.58
167 0.59
168 0.51
169 0.51
170 0.46
171 0.39
172 0.33
173 0.24
174 0.24
175 0.17
176 0.17
177 0.2
178 0.2
179 0.21
180 0.21
181 0.3
182 0.36
183 0.42
184 0.47
185 0.46
186 0.51
187 0.52
188 0.59
189 0.53
190 0.47
191 0.41
192 0.37
193 0.36
194 0.32
195 0.28
196 0.19
197 0.15
198 0.12
199 0.11
200 0.08
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.04
214 0.04
215 0.03
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.07
221 0.1
222 0.14
223 0.22
224 0.25
225 0.25
226 0.29
227 0.29
228 0.3
229 0.3
230 0.28
231 0.2
232 0.17
233 0.16
234 0.13
235 0.13
236 0.11
237 0.09
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.11
243 0.1
244 0.11
245 0.13
246 0.15
247 0.17
248 0.17
249 0.15
250 0.13
251 0.14
252 0.14
253 0.13
254 0.12
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.1
259 0.09
260 0.12
261 0.17
262 0.22
263 0.27
264 0.33
265 0.37
266 0.4
267 0.44
268 0.44
269 0.42
270 0.45
271 0.41
272 0.4
273 0.4
274 0.36
275 0.31
276 0.29
277 0.26
278 0.17
279 0.14
280 0.09
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.04
295 0.04
296 0.07
297 0.08
298 0.1
299 0.17
300 0.22
301 0.3
302 0.36
303 0.45
304 0.52
305 0.62
306 0.7
307 0.75
308 0.78
309 0.78
310 0.81
311 0.75
312 0.66
313 0.56
314 0.46
315 0.36
316 0.29
317 0.23
318 0.22
319 0.24
320 0.28
321 0.34
322 0.34
323 0.33
324 0.38
325 0.43
326 0.43
327 0.42
328 0.44
329 0.41
330 0.41
331 0.4
332 0.35
333 0.28
334 0.2
335 0.18
336 0.12
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.1
345 0.09
346 0.11
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.11
351 0.14
352 0.14
353 0.19
354 0.26
355 0.33
356 0.38
357 0.41
358 0.42
359 0.47
360 0.54
361 0.6
362 0.56
363 0.56
364 0.53
365 0.56
366 0.54
367 0.49
368 0.41
369 0.32
370 0.29
371 0.21
372 0.19
373 0.13
374 0.13
375 0.09
376 0.1
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.1
381 0.12
382 0.13
383 0.13
384 0.12
385 0.19
386 0.26
387 0.32
388 0.37
389 0.38
390 0.42
391 0.43
392 0.43
393 0.37
394 0.33
395 0.32
396 0.3
397 0.33
398 0.31
399 0.35
400 0.37
401 0.38
402 0.34
403 0.32
404 0.35
405 0.33
406 0.35
407 0.37
408 0.36
409 0.37
410 0.36
411 0.34
412 0.3
413 0.28
414 0.24
415 0.22
416 0.2
417 0.21
418 0.23
419 0.24
420 0.24
421 0.27
422 0.26
423 0.29
424 0.31
425 0.3