Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5B1Q9I4

Protein Details
Accession A0A5B1Q9I4    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-134VAKPADQKDQEKKEKKARRRPGRRGAKAVPGEBasic
151-178AAGDAEKPKKKKKKAAKKPKRQEGAEGDBasic
187-210EGDAAKQPRKKRAPRPPRPAGEEPBasic
244-266VVSARIVRRRWGRPRKSKGYGFVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
113-129EKKEKKARRRPGRRGAK
156-173EKPKKKKKKAAKKPKRQE
190-205AAKQPRKKRAPRPPRP
251-261RRRWGRPRKSK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 8, pero 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025239  DUF4187  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR039249  GPATCH11  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13821  DUF4187  
PF01585  G-patch  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDAPAAPVTENGAPPATQEQPVEETPGFKVFAGNLAYSTTDEGLKAFFAPVESDIISAQVIMRGTRSAGYGFVALTSAEAAQKAVEALDKKELDGRPIIVEVAKPADQKDQEKKEKKARRRPGRRGAKAVPGEVTDAEANGDAEKADDAAAGDAEKPKKKKKKAAKKPKRQEGAEGDASAGDAPAEGDAAKQPRKKRAPRPPRPAGEEPVGEPSKTVLFVANLGFNIDDAGLSALFTDANIKVVSARIVRRRWGRPRKSKGYGFVDVGDEEEQKKAIEALQGKDVGGRPIAVKIAVNTQVEEEEKAEAEATATDAPAQKEATPEATREVEAREEGLSKSLFERAAEEEAAGSSSGNKALAMMMKMGFKPGQSLGKVEDAPTASPPDSGQGTPVPETSSAPATSASPPPTGAVKPHRLEPLPINEWAGRKGIGLGKRSASPTELEHLAKVAKVGEAETQESYRDRTRREFEQRRAEGRLVPAQMTCVTLDEKAGISYNVLWLNPDKPDSYPAGLLEALAERWTLVPDARVDPKISVQERLRSQMEADALQPLADLDDDAPPKVKHVQESMFSPEQLEKAVQFLSLPPQDKLQAVLDYLRSQYHYCFWCGTEYSNAAELQELCPGPEEDAHD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.18
3 0.22
4 0.22
5 0.21
6 0.21
7 0.23
8 0.26
9 0.27
10 0.31
11 0.26
12 0.25
13 0.24
14 0.27
15 0.24
16 0.2
17 0.2
18 0.15
19 0.2
20 0.21
21 0.19
22 0.17
23 0.17
24 0.18
25 0.17
26 0.18
27 0.14
28 0.12
29 0.12
30 0.12
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.09
35 0.09
36 0.09
37 0.1
38 0.11
39 0.13
40 0.13
41 0.13
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.1
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.11
53 0.12
54 0.13
55 0.11
56 0.11
57 0.12
58 0.12
59 0.11
60 0.1
61 0.1
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.1
74 0.11
75 0.14
76 0.21
77 0.22
78 0.22
79 0.29
80 0.29
81 0.28
82 0.29
83 0.28
84 0.22
85 0.23
86 0.23
87 0.17
88 0.17
89 0.15
90 0.16
91 0.17
92 0.17
93 0.18
94 0.24
95 0.28
96 0.35
97 0.43
98 0.49
99 0.58
100 0.65
101 0.72
102 0.76
103 0.82
104 0.85
105 0.86
106 0.87
107 0.88
108 0.9
109 0.93
110 0.93
111 0.94
112 0.92
113 0.9
114 0.84
115 0.83
116 0.75
117 0.66
118 0.56
119 0.46
120 0.39
121 0.3
122 0.26
123 0.17
124 0.13
125 0.12
126 0.1
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.12
142 0.17
143 0.23
144 0.29
145 0.39
146 0.49
147 0.58
148 0.67
149 0.73
150 0.8
151 0.85
152 0.91
153 0.92
154 0.93
155 0.95
156 0.95
157 0.93
158 0.84
159 0.81
160 0.77
161 0.73
162 0.65
163 0.54
164 0.43
165 0.34
166 0.32
167 0.23
168 0.15
169 0.07
170 0.04
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.04
176 0.07
177 0.13
178 0.18
179 0.23
180 0.29
181 0.39
182 0.49
183 0.59
184 0.66
185 0.73
186 0.78
187 0.85
188 0.9
189 0.9
190 0.86
191 0.85
192 0.79
193 0.72
194 0.65
195 0.55
196 0.46
197 0.44
198 0.38
199 0.29
200 0.24
201 0.2
202 0.17
203 0.16
204 0.15
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.06
226 0.05
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.1
233 0.12
234 0.17
235 0.23
236 0.25
237 0.32
238 0.39
239 0.48
240 0.56
241 0.64
242 0.7
243 0.73
244 0.81
245 0.84
246 0.85
247 0.8
248 0.78
249 0.74
250 0.66
251 0.56
252 0.47
253 0.39
254 0.31
255 0.27
256 0.2
257 0.13
258 0.11
259 0.1
260 0.09
261 0.08
262 0.08
263 0.07
264 0.07
265 0.1
266 0.13
267 0.14
268 0.17
269 0.17
270 0.17
271 0.19
272 0.18
273 0.15
274 0.12
275 0.11
276 0.08
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.07
281 0.07
282 0.1
283 0.14
284 0.14
285 0.13
286 0.13
287 0.14
288 0.14
289 0.14
290 0.11
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.04
298 0.05
299 0.05
300 0.04
301 0.06
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.1
309 0.13
310 0.12
311 0.12
312 0.14
313 0.14
314 0.14
315 0.14
316 0.14
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.08
321 0.09
322 0.08
323 0.1
324 0.09
325 0.09
326 0.09
327 0.11
328 0.11
329 0.09
330 0.11
331 0.11
332 0.13
333 0.12
334 0.12
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.07
339 0.05
340 0.04
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.04
346 0.05
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.1
352 0.1
353 0.11
354 0.11
355 0.09
356 0.11
357 0.12
358 0.16
359 0.15
360 0.16
361 0.17
362 0.2
363 0.2
364 0.19
365 0.19
366 0.15
367 0.15
368 0.15
369 0.15
370 0.12
371 0.12
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.11
376 0.12
377 0.12
378 0.13
379 0.13
380 0.14
381 0.13
382 0.12
383 0.13
384 0.13
385 0.13
386 0.12
387 0.11
388 0.11
389 0.12
390 0.14
391 0.16
392 0.17
393 0.15
394 0.15
395 0.16
396 0.18
397 0.17
398 0.2
399 0.24
400 0.3
401 0.3
402 0.35
403 0.39
404 0.37
405 0.39
406 0.39
407 0.39
408 0.34
409 0.33
410 0.31
411 0.29
412 0.29
413 0.28
414 0.24
415 0.16
416 0.14
417 0.16
418 0.18
419 0.21
420 0.23
421 0.24
422 0.24
423 0.27
424 0.28
425 0.26
426 0.23
427 0.19
428 0.18
429 0.2
430 0.21
431 0.19
432 0.17
433 0.18
434 0.17
435 0.15
436 0.14
437 0.11
438 0.09
439 0.08
440 0.09
441 0.11
442 0.12
443 0.14
444 0.15
445 0.14
446 0.15
447 0.16
448 0.18
449 0.22
450 0.25
451 0.27
452 0.33
453 0.38
454 0.46
455 0.56
456 0.63
457 0.65
458 0.72
459 0.74
460 0.71
461 0.71
462 0.63
463 0.55
464 0.5
465 0.47
466 0.37
467 0.32
468 0.27
469 0.25
470 0.23
471 0.21
472 0.17
473 0.12
474 0.12
475 0.11
476 0.11
477 0.11
478 0.1
479 0.1
480 0.1
481 0.09
482 0.09
483 0.09
484 0.12
485 0.13
486 0.12
487 0.13
488 0.14
489 0.16
490 0.17
491 0.19
492 0.16
493 0.16
494 0.2
495 0.22
496 0.22
497 0.21
498 0.2
499 0.2
500 0.19
501 0.17
502 0.15
503 0.12
504 0.1
505 0.09
506 0.08
507 0.06
508 0.07
509 0.08
510 0.08
511 0.08
512 0.1
513 0.13
514 0.18
515 0.22
516 0.24
517 0.24
518 0.25
519 0.28
520 0.34
521 0.33
522 0.36
523 0.36
524 0.42
525 0.44
526 0.49
527 0.47
528 0.39
529 0.38
530 0.35
531 0.32
532 0.25
533 0.22
534 0.19
535 0.17
536 0.16
537 0.15
538 0.11
539 0.09
540 0.08
541 0.07
542 0.06
543 0.12
544 0.13
545 0.14
546 0.18
547 0.17
548 0.2
549 0.26
550 0.28
551 0.27
552 0.33
553 0.37
554 0.37
555 0.41
556 0.47
557 0.42
558 0.4
559 0.37
560 0.32
561 0.28
562 0.26
563 0.23
564 0.16
565 0.15
566 0.15
567 0.14
568 0.12
569 0.13
570 0.19
571 0.24
572 0.27
573 0.25
574 0.28
575 0.3
576 0.3
577 0.32
578 0.27
579 0.23
580 0.22
581 0.24
582 0.24
583 0.24
584 0.25
585 0.24
586 0.22
587 0.22
588 0.23
589 0.27
590 0.27
591 0.28
592 0.29
593 0.28
594 0.3
595 0.31
596 0.31
597 0.3
598 0.29
599 0.29
600 0.3
601 0.29
602 0.24
603 0.25
604 0.23
605 0.18
606 0.22
607 0.19
608 0.17
609 0.2
610 0.2
611 0.19