Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5B1QRQ7

Protein Details
Accession A0A5B1QRQ7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-40DVQSSHKKARTEKKEGVKDKGKGBasic
316-345REVKPAPTAKESKKKLKRKEKEGQAPDADABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-41KKARTEKKEGVKDKGKGK
320-358PAPTAKESKKKLKRKEKEGQAPDADAGEVVPKKSKKKKA
Subcellular Location(s) mito 13, mito_nucl 10.999, cyto_mito 10.499, cyto_nucl 8.166, nucl 7.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MAPHSSKRKTAPVPMDVDVQSSHKKARTEKKEGVKDKGKGKSHENASGEFRAVKASVVLAIPPVFASKPRDGAEEMLDSMVMFRYLPALRGVVLAHSKLEFLTHAGRINGDSPYVICNVGFEAMIWSPEVGMKLSGKINLCSPDHISLLVHRTFNVSIPRHHIPTDEWEFEYGPAENDPEFSSEAVAAPDPEPETDVAEAKLEEGVEAAEKTEENDEGVDRGGRWIHKVTGARLGGEEGRLEFTVVGLTIANQMLSLLGSIQVDPFSPAHVPQSTQPQRTSKSEAASQSALDVAESDEEDALELSSDDDVAERQVREVKPAPTAKESKKKLKRKEKEGQAPDADAGEVVPKKSKKKKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.61
3 0.51
4 0.46
5 0.38
6 0.34
7 0.32
8 0.29
9 0.32
10 0.31
11 0.36
12 0.44
13 0.53
14 0.59
15 0.63
16 0.7
17 0.75
18 0.81
19 0.82
20 0.83
21 0.81
22 0.78
23 0.77
24 0.77
25 0.74
26 0.68
27 0.68
28 0.67
29 0.64
30 0.66
31 0.59
32 0.54
33 0.52
34 0.49
35 0.44
36 0.35
37 0.29
38 0.23
39 0.21
40 0.17
41 0.12
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.09
50 0.1
51 0.09
52 0.12
53 0.18
54 0.19
55 0.24
56 0.25
57 0.28
58 0.28
59 0.3
60 0.3
61 0.25
62 0.23
63 0.17
64 0.16
65 0.13
66 0.12
67 0.1
68 0.07
69 0.05
70 0.04
71 0.09
72 0.09
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.12
77 0.13
78 0.13
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.11
86 0.11
87 0.08
88 0.09
89 0.12
90 0.13
91 0.15
92 0.15
93 0.15
94 0.16
95 0.17
96 0.15
97 0.12
98 0.1
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.08
104 0.07
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.08
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.09
121 0.11
122 0.14
123 0.14
124 0.14
125 0.16
126 0.19
127 0.2
128 0.19
129 0.21
130 0.19
131 0.19
132 0.18
133 0.16
134 0.14
135 0.18
136 0.18
137 0.16
138 0.14
139 0.15
140 0.15
141 0.18
142 0.23
143 0.21
144 0.2
145 0.26
146 0.28
147 0.28
148 0.28
149 0.26
150 0.2
151 0.25
152 0.29
153 0.25
154 0.22
155 0.22
156 0.22
157 0.21
158 0.21
159 0.13
160 0.08
161 0.07
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.07
209 0.09
210 0.09
211 0.11
212 0.13
213 0.14
214 0.18
215 0.21
216 0.21
217 0.27
218 0.27
219 0.25
220 0.23
221 0.23
222 0.19
223 0.17
224 0.16
225 0.08
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.03
245 0.04
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.14
257 0.14
258 0.16
259 0.16
260 0.28
261 0.34
262 0.37
263 0.42
264 0.44
265 0.47
266 0.51
267 0.56
268 0.49
269 0.46
270 0.47
271 0.45
272 0.43
273 0.39
274 0.34
275 0.27
276 0.24
277 0.19
278 0.13
279 0.11
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.07
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.08
298 0.12
299 0.12
300 0.14
301 0.22
302 0.22
303 0.28
304 0.34
305 0.33
306 0.38
307 0.44
308 0.46
309 0.47
310 0.55
311 0.58
312 0.63
313 0.69
314 0.71
315 0.76
316 0.82
317 0.85
318 0.88
319 0.89
320 0.89
321 0.92
322 0.92
323 0.92
324 0.9
325 0.88
326 0.8
327 0.72
328 0.62
329 0.52
330 0.41
331 0.29
332 0.22
333 0.19
334 0.17
335 0.17
336 0.24
337 0.28
338 0.38