Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5B1R4C4

Protein Details
Accession A0A5B1R4C4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
138-166NTKYPDYVYRRRPNNSRRKRRSDATLNPPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
149-158RPNNSRRKRR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSRFDMAVAQHGPDSPENAVFVPTVPDERHAHERDGSLSSSEDSLGYPHYAQSSKTESDTAEDTQLTAQTLNNDGTPKRPMNAFMIFARRRRPQVSAENQMMRTGEISKILSKEWNSMDASDKQFYLNQAKRLKETFNTKYPDYVYRRRPNNSRRKRRSDATLNPPHNPSPSGDTGDDVSGFQDYEYPTAGDGDEAAYSSQREFAASRSGHHPGALGYDGSAGLPHPHGTAASYSYPISDLPTNHFSPSRVSQISPLHHRSPSDVSSSLSSLTSQSTLSDSSEHSHPYGSRLSLQDNHLPPASAYSSDSMGDYGFWNGADGLGRGSRGRSSSSSAWPLIPPLNAGGARDRALGPGPPGMKHDMYSPPPHRPWSTATSHTSSSASSTSPQLSAQSSHRYHPISSSFFASEDPAVDNYRPSVSATPNPGHADAFSSSVRLHEHASYGSRGAGAIKYDHVSFLSQTTSRIGGSPYPHSSQDDLRPPLHHSRSSTLPHPPALHAPDLPPQAPHGSLLSSMNASDPHTLPPMSYWDRIKLEER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.19
3 0.19
4 0.19
5 0.19
6 0.19
7 0.16
8 0.15
9 0.15
10 0.15
11 0.17
12 0.16
13 0.21
14 0.23
15 0.28
16 0.37
17 0.37
18 0.39
19 0.39
20 0.4
21 0.39
22 0.39
23 0.35
24 0.27
25 0.24
26 0.22
27 0.19
28 0.17
29 0.14
30 0.11
31 0.11
32 0.12
33 0.13
34 0.12
35 0.13
36 0.17
37 0.17
38 0.18
39 0.23
40 0.27
41 0.27
42 0.28
43 0.28
44 0.24
45 0.27
46 0.29
47 0.25
48 0.22
49 0.2
50 0.19
51 0.18
52 0.19
53 0.16
54 0.14
55 0.13
56 0.13
57 0.15
58 0.16
59 0.16
60 0.19
61 0.18
62 0.21
63 0.27
64 0.27
65 0.26
66 0.27
67 0.28
68 0.31
69 0.34
70 0.33
71 0.3
72 0.39
73 0.41
74 0.43
75 0.48
76 0.48
77 0.5
78 0.5
79 0.51
80 0.49
81 0.55
82 0.6
83 0.61
84 0.62
85 0.62
86 0.59
87 0.56
88 0.48
89 0.38
90 0.3
91 0.24
92 0.17
93 0.14
94 0.16
95 0.17
96 0.18
97 0.19
98 0.22
99 0.22
100 0.26
101 0.25
102 0.27
103 0.25
104 0.25
105 0.29
106 0.3
107 0.33
108 0.29
109 0.27
110 0.25
111 0.26
112 0.28
113 0.34
114 0.32
115 0.37
116 0.42
117 0.44
118 0.46
119 0.47
120 0.47
121 0.43
122 0.48
123 0.46
124 0.48
125 0.5
126 0.47
127 0.47
128 0.47
129 0.5
130 0.48
131 0.5
132 0.52
133 0.57
134 0.64
135 0.67
136 0.74
137 0.76
138 0.8
139 0.83
140 0.84
141 0.85
142 0.87
143 0.88
144 0.84
145 0.83
146 0.82
147 0.81
148 0.8
149 0.8
150 0.73
151 0.69
152 0.66
153 0.57
154 0.48
155 0.39
156 0.3
157 0.26
158 0.25
159 0.26
160 0.23
161 0.22
162 0.22
163 0.21
164 0.19
165 0.13
166 0.11
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.1
192 0.17
193 0.17
194 0.19
195 0.21
196 0.24
197 0.23
198 0.23
199 0.22
200 0.14
201 0.16
202 0.14
203 0.1
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.07
218 0.09
219 0.09
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.14
229 0.18
230 0.19
231 0.2
232 0.21
233 0.19
234 0.21
235 0.23
236 0.23
237 0.2
238 0.19
239 0.23
240 0.27
241 0.31
242 0.33
243 0.35
244 0.33
245 0.33
246 0.33
247 0.31
248 0.3
249 0.28
250 0.24
251 0.2
252 0.18
253 0.18
254 0.18
255 0.16
256 0.12
257 0.11
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.1
269 0.11
270 0.12
271 0.11
272 0.12
273 0.12
274 0.13
275 0.15
276 0.13
277 0.15
278 0.15
279 0.17
280 0.2
281 0.22
282 0.26
283 0.25
284 0.27
285 0.24
286 0.23
287 0.2
288 0.19
289 0.17
290 0.11
291 0.1
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.09
314 0.1
315 0.12
316 0.13
317 0.18
318 0.21
319 0.25
320 0.28
321 0.27
322 0.27
323 0.25
324 0.25
325 0.22
326 0.18
327 0.14
328 0.11
329 0.13
330 0.12
331 0.13
332 0.13
333 0.13
334 0.14
335 0.14
336 0.14
337 0.12
338 0.13
339 0.13
340 0.12
341 0.15
342 0.15
343 0.14
344 0.16
345 0.19
346 0.19
347 0.18
348 0.21
349 0.22
350 0.25
351 0.34
352 0.35
353 0.39
354 0.41
355 0.45
356 0.43
357 0.4
358 0.41
359 0.39
360 0.4
361 0.39
362 0.4
363 0.39
364 0.39
365 0.37
366 0.33
367 0.27
368 0.23
369 0.18
370 0.14
371 0.13
372 0.14
373 0.14
374 0.14
375 0.14
376 0.14
377 0.15
378 0.17
379 0.2
380 0.26
381 0.27
382 0.28
383 0.33
384 0.33
385 0.32
386 0.34
387 0.36
388 0.31
389 0.31
390 0.32
391 0.27
392 0.26
393 0.26
394 0.23
395 0.17
396 0.14
397 0.14
398 0.12
399 0.14
400 0.14
401 0.14
402 0.14
403 0.14
404 0.14
405 0.14
406 0.16
407 0.18
408 0.24
409 0.29
410 0.29
411 0.32
412 0.34
413 0.33
414 0.29
415 0.25
416 0.23
417 0.18
418 0.2
419 0.16
420 0.15
421 0.14
422 0.15
423 0.16
424 0.14
425 0.16
426 0.14
427 0.16
428 0.17
429 0.2
430 0.2
431 0.19
432 0.18
433 0.16
434 0.15
435 0.15
436 0.14
437 0.12
438 0.12
439 0.14
440 0.15
441 0.15
442 0.16
443 0.15
444 0.15
445 0.14
446 0.14
447 0.16
448 0.15
449 0.16
450 0.17
451 0.18
452 0.17
453 0.17
454 0.18
455 0.18
456 0.21
457 0.27
458 0.29
459 0.31
460 0.33
461 0.35
462 0.36
463 0.37
464 0.42
465 0.44
466 0.44
467 0.43
468 0.43
469 0.46
470 0.53
471 0.53
472 0.5
473 0.45
474 0.46
475 0.5
476 0.54
477 0.53
478 0.52
479 0.5
480 0.5
481 0.48
482 0.46
483 0.46
484 0.45
485 0.43
486 0.35
487 0.34
488 0.37
489 0.38
490 0.36
491 0.29
492 0.28
493 0.28
494 0.27
495 0.26
496 0.2
497 0.16
498 0.18
499 0.19
500 0.18
501 0.16
502 0.15
503 0.15
504 0.15
505 0.16
506 0.19
507 0.18
508 0.19
509 0.22
510 0.22
511 0.21
512 0.22
513 0.29
514 0.29
515 0.34
516 0.34
517 0.38
518 0.42