Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VXF2

Protein Details
Accession H1VXF2    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-37SPLVNGHKSDKKSKKDKKEKKRLREEDAEAGEBasic
74-128TTNGEPSPEKKKKKDKKHRKSVGDAAEDASDAERKEKKDKKKKRKSQHKEAEDDVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-44KSDKKSKKDKKEKKRLREEDAEAGEERKHKRT
82-99EKKKKKDKKHRKSVGDAA
102-121ASDAERKEKKDKKKKRKSQH
143-152KKEKKTKKTK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 11.333, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MAATDSPLVNGHKSDKKSKKDKKEKKRLREEDAEAGEERKHKRTKSIGVAQDDDDDDESPVASQDLSLAALTNTTNGEPSPEKKKKKDKKHRKSVGDAAEDASDAERKEKKDKKKKRKSQHKEAEDDVEGSFADAAATPASEKKEKKTKKTKAATPDPVAENDDNGDAMDVDSPAKTKSTSRVHQPPDAPSKPSFPFFTQTVSLYLPLYPVGWDTPCTAAASQHLEPLVNRYVPELKGVLLAFRNVAVSEQPGRRHAATNDSEHCDLVSVDEYAVGFGYVTVDVDLFLPRRGAWMEGSINLENEGHIGVVCWGKFNARFGTGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.52
3 0.61
4 0.7
5 0.78
6 0.82
7 0.86
8 0.92
9 0.93
10 0.95
11 0.95
12 0.95
13 0.96
14 0.94
15 0.91
16 0.9
17 0.84
18 0.82
19 0.74
20 0.66
21 0.56
22 0.48
23 0.42
24 0.38
25 0.36
26 0.36
27 0.39
28 0.38
29 0.46
30 0.54
31 0.6
32 0.64
33 0.7
34 0.68
35 0.67
36 0.68
37 0.6
38 0.54
39 0.45
40 0.36
41 0.27
42 0.2
43 0.15
44 0.12
45 0.11
46 0.08
47 0.08
48 0.07
49 0.06
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.05
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.11
65 0.13
66 0.17
67 0.27
68 0.36
69 0.44
70 0.53
71 0.64
72 0.71
73 0.79
74 0.87
75 0.88
76 0.9
77 0.93
78 0.94
79 0.91
80 0.89
81 0.87
82 0.83
83 0.76
84 0.65
85 0.55
86 0.44
87 0.36
88 0.28
89 0.2
90 0.13
91 0.09
92 0.13
93 0.15
94 0.18
95 0.28
96 0.36
97 0.47
98 0.56
99 0.67
100 0.74
101 0.82
102 0.9
103 0.91
104 0.95
105 0.94
106 0.95
107 0.94
108 0.91
109 0.84
110 0.76
111 0.7
112 0.59
113 0.49
114 0.38
115 0.27
116 0.18
117 0.13
118 0.1
119 0.05
120 0.04
121 0.03
122 0.04
123 0.03
124 0.03
125 0.04
126 0.06
127 0.09
128 0.14
129 0.15
130 0.2
131 0.31
132 0.37
133 0.47
134 0.56
135 0.64
136 0.69
137 0.77
138 0.77
139 0.76
140 0.8
141 0.76
142 0.68
143 0.63
144 0.53
145 0.46
146 0.42
147 0.32
148 0.22
149 0.16
150 0.13
151 0.09
152 0.08
153 0.07
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.16
166 0.23
167 0.26
168 0.34
169 0.43
170 0.47
171 0.51
172 0.53
173 0.51
174 0.52
175 0.51
176 0.46
177 0.38
178 0.39
179 0.35
180 0.35
181 0.32
182 0.24
183 0.26
184 0.24
185 0.25
186 0.22
187 0.21
188 0.21
189 0.19
190 0.17
191 0.14
192 0.13
193 0.11
194 0.09
195 0.08
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.09
202 0.11
203 0.11
204 0.12
205 0.12
206 0.11
207 0.13
208 0.17
209 0.16
210 0.17
211 0.16
212 0.16
213 0.15
214 0.19
215 0.2
216 0.15
217 0.15
218 0.16
219 0.2
220 0.19
221 0.21
222 0.17
223 0.14
224 0.17
225 0.17
226 0.16
227 0.13
228 0.13
229 0.12
230 0.11
231 0.12
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.1
236 0.16
237 0.2
238 0.22
239 0.24
240 0.28
241 0.29
242 0.33
243 0.31
244 0.34
245 0.34
246 0.38
247 0.41
248 0.42
249 0.42
250 0.37
251 0.35
252 0.27
253 0.23
254 0.18
255 0.14
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.07
263 0.05
264 0.04
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.07
272 0.1
273 0.09
274 0.1
275 0.11
276 0.11
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.14
281 0.19
282 0.2
283 0.22
284 0.27
285 0.25
286 0.24
287 0.23
288 0.22
289 0.16
290 0.15
291 0.12
292 0.08
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.12
297 0.12
298 0.13
299 0.14
300 0.18
301 0.21
302 0.26
303 0.27