FuNGI

A0A5B1RD60

Protein Details

Accession

A0A5B1RD60

Localization Confidence

Low

Confidence Score

5.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-24	LKPVKTLTTKERKKSRFGNAFH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 16.5, cyto_mito 10.5, cyto 3.5, nucl 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012592 PROCN IPR027652 PRP8 IPR019581 Prp8_U5-snRNA-bd IPR042516 Prp8_U5-snRNA-bd_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR019582 RRM_spliceosomal_PrP8
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0030623 F:U5 snRNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF08083 PROCN PF10598 RRM_4 PF10597 U5_2-snRNA_bdg

Amino Acid Sequences

MNLKPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREILRLTKLVVDAHVQYRLGNVDAFQLADALQYIFAHIGALTGMYRYKYKLMRQVRMTKDLKHLIYYRFNTGPVGKGPGVGFWAPGWRVWLFFMRGIVPLLERWLGNLLARQFEGRNSKGIAKTVTKQRVESHYDLELRAAVMHDILDMMPESIKQNKAKTILQHLSEAWRCWKANIPWKVPGMPTAIENIISRYIKSKANWWTFVAHYNRERIRRGATVDKAVIKKNLGRLTRLYLKAEQEHQHGYLKDGPYISAEEAVAIYTATVHWLESRKFAPIPFPPLSYKHDTQLLVLALEKLKEAYSVKGRLSERELALIEQAYDNPHECLSRIKRCLLTQQAFKELGVKFFDTYDKLIPCYDIEPVEKITDAYLDQFLFFEVDKRGLFPAWIKPADTEPPPLLVYKWCQGINNLTDIWETSEGECNVMMETVLSNVYEEIDLTLLNRLLRLILDHNLADYITAKNNTVLTYKDMAHTNAYGLIRGLQFSAFVFQYYGLVLNILILGLHRASEMAGPPQMPNNFLQYRDSATETCHPIRLYSRYVDRLHILFRFTADEARDLIQRYLSANPDPTNNNIIGYYNKRCWPQECRMRLIKHDVNLGRAVFWNVKQSLPRSLTTIEWEDTFVSVYSRDNPQLLFSMCSFEVRILPTEDPDDGQRRGLHKHFCASPMKQFNNRIHQVLTSSGSTTFSKIVNKWNTALIGLMTYYREAVIHTNELLDALVKAENKIQTRVKIGLNSKMPSCFPPVVFYMPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDLQWSKQTDVGVIHFRAGMIHEEDQLIPNLYRYLQPWEAEFLDSARVWSE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.74
2	0.79
3	0.82
4	0.82
5	0.81
6	0.76
7	0.77
8	0.76
9	0.77
10	0.7
11	0.64
12	0.53
13	0.44
14	0.44
15	0.37
16	0.32
17	0.3
18	0.29
19	0.27
20	0.3
21	0.31
22	0.28
23	0.25
24	0.24
25	0.24
26	0.25
27	0.28
28	0.24
29	0.22
30	0.23
31	0.23
32	0.21
33	0.17
34	0.14
35	0.15
36	0.15
37	0.15
38	0.13
39	0.11
40	0.1
41	0.1
42	0.1
43	0.07
44	0.07
45	0.06
46	0.07
47	0.07
48	0.07
49	0.07
50	0.06
51	0.06
52	0.05
53	0.06
54	0.05
55	0.06
56	0.08
57	0.1
58	0.12
59	0.14
60	0.21
61	0.27
62	0.34
63	0.43
64	0.51
65	0.58
66	0.66
67	0.74
68	0.74
69	0.78
70	0.74
71	0.7
72	0.69
73	0.68
74	0.6
75	0.56
76	0.55
77	0.51
78	0.57
79	0.55
80	0.52
81	0.45
82	0.45
83	0.42
84	0.38
85	0.36
86	0.28
87	0.32
88	0.25
89	0.27
90	0.26
91	0.24
92	0.25
93	0.21
94	0.2
95	0.14
96	0.19
97	0.16
98	0.17
99	0.19
100	0.16
101	0.17
102	0.18
103	0.22
104	0.2
105	0.21
106	0.22
107	0.2
108	0.21
109	0.21
110	0.19
111	0.15
112	0.13
113	0.14
114	0.14
115	0.13
116	0.13
117	0.14
118	0.14
119	0.14
120	0.17
121	0.17
122	0.17
123	0.18
124	0.19
125	0.17
126	0.23
127	0.29
128	0.27
129	0.29
130	0.29
131	0.35
132	0.35
133	0.38
134	0.37
135	0.34
136	0.41
137	0.47
138	0.54
139	0.5
140	0.5
141	0.52
142	0.55
143	0.58
144	0.53
145	0.46
146	0.43
147	0.43
148	0.4
149	0.35
150	0.28
151	0.21
152	0.18
153	0.15
154	0.09
155	0.07
156	0.07
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.06
161	0.05
162	0.06
163	0.06
164	0.07
165	0.09
166	0.14
167	0.2
168	0.23
169	0.26
170	0.31
171	0.35
172	0.38
173	0.41
174	0.46
175	0.46
176	0.44
177	0.43
178	0.39
179	0.42
180	0.41
181	0.38
182	0.33
183	0.32
184	0.31
185	0.3
186	0.37
187	0.37
188	0.44
189	0.51
190	0.51
191	0.52
192	0.54
193	0.55
194	0.47
195	0.42
196	0.36
197	0.28
198	0.23
199	0.2
200	0.18
201	0.17
202	0.16
203	0.15
204	0.17
205	0.17
206	0.17
207	0.17
208	0.2
209	0.23
210	0.24
211	0.29
212	0.34
213	0.4
214	0.43
215	0.41
216	0.42
217	0.38
218	0.45
219	0.42
220	0.39
221	0.35
222	0.4
223	0.44
224	0.45
225	0.47
226	0.42
227	0.43
228	0.4
229	0.43
230	0.43
231	0.41
232	0.41
233	0.41
234	0.44
235	0.42
236	0.41
237	0.38
238	0.32
239	0.32
240	0.34
241	0.38
242	0.34
243	0.34
244	0.34
245	0.38
246	0.44
247	0.44
248	0.4
249	0.37
250	0.39
251	0.39
252	0.43
253	0.39
254	0.34
255	0.34
256	0.32
257	0.33
258	0.29
259	0.29
260	0.28
261	0.26
262	0.25
263	0.22
264	0.21
265	0.18
266	0.19
267	0.16
268	0.12
269	0.11
270	0.09
271	0.08
272	0.08
273	0.07
274	0.05
275	0.04
276	0.03
277	0.03
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.07
282	0.11
283	0.12
284	0.15
285	0.16
286	0.18
287	0.19
288	0.19
289	0.22
290	0.22
291	0.29
292	0.27
293	0.29
294	0.28
295	0.31
296	0.36
297	0.37
298	0.35
299	0.3
300	0.33
301	0.31
302	0.29
303	0.29
304	0.24
305	0.17
306	0.16
307	0.15
308	0.11
309	0.11
310	0.1
311	0.07
312	0.07
313	0.08
314	0.09
315	0.11
316	0.17
317	0.2
318	0.2
319	0.27
320	0.27
321	0.28
322	0.31
323	0.32
324	0.27
325	0.26
326	0.26
327	0.2
328	0.2
329	0.17
330	0.13
331	0.09
332	0.09
333	0.07
334	0.08
335	0.08
336	0.08
337	0.08
338	0.08
339	0.08
340	0.16
341	0.22
342	0.29
343	0.31
344	0.33
345	0.36
346	0.37
347	0.44
348	0.45
349	0.43
350	0.41
351	0.41
352	0.42
353	0.39
354	0.38
355	0.36
356	0.28
357	0.25
358	0.21
359	0.2
360	0.15
361	0.16
362	0.17
363	0.13
364	0.14
365	0.15
366	0.14
367	0.14
368	0.14
369	0.14
370	0.13
371	0.13
372	0.12
373	0.1
374	0.1
375	0.11
376	0.11
377	0.11
378	0.11
379	0.1
380	0.09
381	0.08
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.08
392	0.07
393	0.09
394	0.08
395	0.09
396	0.1
397	0.09
398	0.1
399	0.1
400	0.14
401	0.17
402	0.18
403	0.17
404	0.17
405	0.19
406	0.22
407	0.21
408	0.18
409	0.13
410	0.15
411	0.15
412	0.14
413	0.13
414	0.12
415	0.13
416	0.13
417	0.16
418	0.15
419	0.15
420	0.16
421	0.2
422	0.19
423	0.19
424	0.16
425	0.13
426	0.13
427	0.12
428	0.13
429	0.09
430	0.09
431	0.08
432	0.12
433	0.11
434	0.12
435	0.11
436	0.1
437	0.09
438	0.09
439	0.08
440	0.03
441	0.03
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.05
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.07
462	0.08
463	0.09
464	0.1
465	0.1
466	0.1
467	0.1
468	0.1
469	0.09
470	0.08
471	0.07
472	0.08
473	0.09
474	0.09
475	0.1
476	0.11
477	0.12
478	0.12
479	0.12
480	0.13
481	0.15
482	0.15
483	0.17
484	0.18
485	0.18
486	0.18
487	0.17
488	0.14
489	0.15
490	0.15
491	0.12
492	0.11
493	0.13
494	0.11
495	0.11
496	0.11
497	0.07
498	0.07
499	0.07
500	0.09
501	0.07
502	0.07
503	0.07
504	0.07
505	0.07
506	0.07
507	0.07
508	0.05
509	0.05
510	0.05
511	0.05
512	0.04
513	0.04
514	0.03
515	0.03
516	0.04
517	0.03
518	0.04
519	0.03
520	0.04
521	0.04
522	0.06
523	0.07
524	0.08
525	0.09
526	0.09
527	0.1
528	0.15
529	0.15
530	0.15
531	0.15
532	0.21
533	0.21
534	0.21
535	0.23
536	0.19
537	0.22
538	0.22
539	0.23
540	0.17
541	0.18
542	0.22
543	0.26
544	0.26
545	0.26
546	0.24
547	0.23
548	0.27
549	0.28
550	0.26
551	0.25
552	0.29
553	0.33
554	0.34
555	0.35
556	0.33
557	0.31
558	0.31
559	0.28
560	0.24
561	0.18
562	0.17
563	0.18
564	0.16
565	0.17
566	0.15
567	0.15
568	0.15
569	0.16
570	0.17
571	0.17
572	0.17
573	0.14
574	0.14
575	0.14
576	0.16
577	0.17
578	0.17
579	0.18
580	0.19
581	0.22
582	0.23
583	0.24
584	0.24
585	0.21
586	0.2
587	0.17
588	0.18
589	0.19
590	0.23
591	0.25
592	0.27
593	0.31
594	0.33
595	0.36
596	0.39
597	0.43
598	0.47
599	0.52
600	0.53
601	0.56
602	0.61
603	0.61
604	0.6
605	0.62
606	0.56
607	0.48
608	0.51
609	0.46
610	0.4
611	0.41
612	0.36
613	0.28
614	0.25
615	0.25
616	0.19
617	0.19
618	0.23
619	0.21
620	0.23
621	0.25
622	0.27
623	0.33
624	0.33
625	0.33
626	0.29
627	0.3
628	0.29
629	0.3
630	0.31
631	0.24
632	0.21
633	0.21
634	0.18
635	0.17
636	0.16
637	0.12
638	0.09
639	0.08
640	0.09
641	0.12
642	0.15
643	0.17
644	0.17
645	0.17
646	0.18
647	0.21
648	0.21
649	0.2
650	0.17
651	0.19
652	0.18
653	0.19
654	0.17
655	0.14
656	0.16
657	0.15
658	0.17
659	0.16
660	0.17
661	0.17
662	0.19
663	0.18
664	0.17
665	0.2
666	0.23
667	0.21
668	0.24
669	0.26
670	0.27
671	0.33
672	0.38
673	0.41
674	0.39
675	0.45
676	0.44
677	0.46
678	0.5
679	0.47
680	0.51
681	0.53
682	0.56
683	0.57
684	0.62
685	0.65
686	0.67
687	0.68
688	0.6
689	0.52
690	0.47
691	0.41
692	0.37
693	0.32
694	0.22
695	0.2
696	0.18
697	0.19
698	0.19
699	0.19
700	0.18
701	0.17
702	0.21
703	0.23
704	0.32
705	0.36
706	0.38
707	0.38
708	0.39
709	0.37
710	0.32
711	0.31
712	0.21
713	0.15
714	0.12
715	0.12
716	0.09
717	0.09
718	0.09
719	0.08
720	0.08
721	0.08
722	0.12
723	0.14
724	0.16
725	0.16
726	0.16
727	0.16
728	0.16
729	0.15
730	0.12
731	0.08
732	0.07
733	0.1
734	0.1
735	0.11
736	0.15
737	0.2
738	0.23
739	0.3
740	0.34
741	0.35
742	0.39
743	0.43
744	0.42
745	0.45
746	0.47
747	0.49
748	0.5
749	0.49
750	0.47
751	0.45
752	0.43
753	0.38
754	0.4
755	0.35
756	0.3
757	0.3
758	0.31
759	0.35
760	0.36
761	0.34
762	0.35
763	0.32
764	0.31
765	0.28
766	0.25
767	0.19
768	0.16
769	0.15
770	0.08
771	0.08
772	0.07
773	0.06
774	0.06
775	0.05
776	0.05
777	0.05
778	0.05
779	0.05
780	0.07
781	0.07
782	0.08
783	0.13
784	0.15
785	0.17
786	0.24
787	0.26
788	0.26
789	0.29
790	0.28
791	0.27
792	0.28
793	0.3
794	0.3
795	0.28
796	0.27
797	0.25
798	0.24
799	0.22
800	0.21
801	0.2
802	0.18
803	0.19
804	0.19
805	0.2
806	0.21
807	0.22
808	0.23
809	0.22
810	0.17
811	0.17
812	0.17
813	0.17
814	0.18
815	0.19
816	0.25
817	0.27
818	0.27
819	0.28
820	0.31
821	0.32
822	0.31
823	0.29
824	0.22
825	0.22
826	0.21

A0A5B1RD60

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer