FuNGI

A0A5B1QRY2

Protein Details

Accession

A0A5B1QRY2

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
74-98	VTWKVFYPGKLRKKLNKENVHSRAY	Hydrophilic
380-399	AGVAKPKRERRDKDAEKGDE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
12-24	AKSRLKEKRMAHL
232-264	ASKKEEAKKKAAAKHSEPPATLGKKAAKRAAKA
383-425	AKPKRERRDKDAEKGDEGAGGAGGGKGKEREARRREEKAAKAG
466-485	DGGRGRGRGRGRGRGAGRGG

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MPAPEGVNKSPAKSRLKEKRMAHLRPGGGASSGGGGGGGGTTERLKTIVRRLPANLPEEIFWQSVQKWVTDDAVTWKVFYPGKLRKKLNKENVHSRAYIAFRTEEQLADFSREYDGHIFRDKAGNESQAIVEFAPYQKVPLEKKKVDNRNNTIDKGRKSDEDFISFLQTLEASSTKTHDTEQLMEHLIASTQSPAMPTSTPLLEALKAEKSAQKDKEAIQRNHAHYKEMAAASKKEEAKKKAAAKHSEPPATLGKKAAKRAAKAAAVAAAQGQPGASQPKASASNANAAAKAAANQAGPKGGRSSRHPSVQIQDPQLLQRQGAPAGDSAQPSPVTTKPTAGVPGPQQEGGSGGGGGGGGRRARPVLGLGSRQFEAALSGAGVAKPKRERRDKDAEKGDEGAGGAGGGKGKEREARRREEKAAKAGMLPAPAILQREAQPHAPRILAKPPAAEGDAGPVHAGPPVHDGGRGRGRGRGRGRGAGRGG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.63
3	0.7
4	0.76
5	0.74
6	0.77
7	0.79
8	0.79
9	0.77
10	0.74
11	0.67
12	0.62
13	0.58
14	0.48
15	0.38
16	0.31
17	0.23
18	0.16
19	0.14
20	0.1
21	0.07
22	0.06
23	0.05
24	0.05
25	0.04
26	0.03
27	0.05
28	0.06
29	0.06
30	0.07
31	0.09
32	0.11
33	0.16
34	0.26
35	0.31
36	0.34
37	0.38
38	0.42
39	0.49
40	0.53
41	0.52
42	0.45
43	0.4
44	0.36
45	0.35
46	0.34
47	0.26
48	0.2
49	0.19
50	0.17
51	0.21
52	0.21
53	0.19
54	0.18
55	0.18
56	0.21
57	0.18
58	0.19
59	0.2
60	0.25
61	0.24
62	0.23
63	0.22
64	0.25
65	0.26
66	0.27
67	0.3
68	0.35
69	0.45
70	0.53
71	0.61
72	0.66
73	0.75
74	0.84
75	0.85
76	0.85
77	0.84
78	0.86
79	0.84
80	0.79
81	0.69
82	0.6
83	0.55
84	0.46
85	0.4
86	0.31
87	0.25
88	0.22
89	0.24
90	0.23
91	0.18
92	0.17
93	0.17
94	0.16
95	0.18
96	0.17
97	0.14
98	0.15
99	0.15
100	0.16
101	0.19
102	0.2
103	0.19
104	0.24
105	0.24
106	0.24
107	0.3
108	0.28
109	0.26
110	0.27
111	0.26
112	0.23
113	0.23
114	0.22
115	0.17
116	0.17
117	0.13
118	0.11
119	0.1
120	0.1
121	0.11
122	0.1
123	0.1
124	0.12
125	0.17
126	0.23
127	0.31
128	0.4
129	0.43
130	0.52
131	0.61
132	0.7
133	0.74
134	0.78
135	0.75
136	0.76
137	0.75
138	0.69
139	0.67
140	0.63
141	0.57
142	0.53
143	0.49
144	0.42
145	0.41
146	0.47
147	0.43
148	0.39
149	0.37
150	0.32
151	0.33
152	0.29
153	0.25
154	0.16
155	0.13
156	0.09
157	0.1
158	0.1
159	0.07
160	0.08
161	0.09
162	0.1
163	0.11
164	0.12
165	0.14
166	0.16
167	0.17
168	0.18
169	0.19
170	0.19
171	0.18
172	0.17
173	0.13
174	0.11
175	0.09
176	0.08
177	0.06
178	0.05
179	0.05
180	0.06
181	0.06
182	0.07
183	0.07
184	0.08
185	0.1
186	0.09
187	0.1
188	0.1
189	0.1
190	0.09
191	0.1
192	0.11
193	0.1
194	0.1
195	0.11
196	0.13
197	0.16
198	0.23
199	0.25
200	0.26
201	0.27
202	0.31
203	0.39
204	0.46
205	0.43
206	0.43
207	0.49
208	0.5
209	0.56
210	0.52
211	0.45
212	0.35
213	0.36
214	0.33
215	0.26
216	0.24
217	0.18
218	0.19
219	0.19
220	0.24
221	0.25
222	0.26
223	0.31
224	0.33
225	0.36
226	0.42
227	0.47
228	0.48
229	0.52
230	0.53
231	0.51
232	0.55
233	0.56
234	0.52
235	0.45
236	0.42
237	0.41
238	0.36
239	0.32
240	0.28
241	0.28
242	0.29
243	0.33
244	0.36
245	0.33
246	0.33
247	0.37
248	0.38
249	0.33
250	0.3
251	0.27
252	0.22
253	0.18
254	0.17
255	0.13
256	0.09
257	0.07
258	0.07
259	0.06
260	0.04
261	0.06
262	0.08
263	0.07
264	0.07
265	0.08
266	0.11
267	0.14
268	0.14
269	0.16
270	0.15
271	0.21
272	0.23
273	0.24
274	0.2
275	0.18
276	0.18
277	0.14
278	0.14
279	0.1
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.09
284	0.11
285	0.11
286	0.11
287	0.14
288	0.15
289	0.18
290	0.24
291	0.31
292	0.34
293	0.39
294	0.41
295	0.4
296	0.42
297	0.47
298	0.47
299	0.41
300	0.38
301	0.34
302	0.34
303	0.36
304	0.32
305	0.23
306	0.2
307	0.19
308	0.18
309	0.17
310	0.16
311	0.11
312	0.13
313	0.15
314	0.14
315	0.13
316	0.14
317	0.14
318	0.13
319	0.16
320	0.15
321	0.18
322	0.18
323	0.19
324	0.18
325	0.19
326	0.21
327	0.19
328	0.21
329	0.19
330	0.24
331	0.24
332	0.24
333	0.22
334	0.19
335	0.2
336	0.17
337	0.14
338	0.08
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.06
343	0.05
344	0.06
345	0.07
346	0.07
347	0.08
348	0.09
349	0.09
350	0.1
351	0.12
352	0.16
353	0.19
354	0.24
355	0.25
356	0.27
357	0.27
358	0.26
359	0.24
360	0.18
361	0.16
362	0.11
363	0.09
364	0.06
365	0.06
366	0.07
367	0.08
368	0.11
369	0.11
370	0.17
371	0.25
372	0.33
373	0.42
374	0.52
375	0.59
376	0.63
377	0.75
378	0.77
379	0.79
380	0.81
381	0.75
382	0.67
383	0.63
384	0.54
385	0.44
386	0.35
387	0.25
388	0.15
389	0.1
390	0.08
391	0.06
392	0.07
393	0.06
394	0.08
395	0.09
396	0.12
397	0.19
398	0.26
399	0.36
400	0.42
401	0.52
402	0.59
403	0.66
404	0.73
405	0.75
406	0.75
407	0.73
408	0.71
409	0.62
410	0.54
411	0.51
412	0.45
413	0.36
414	0.29
415	0.21
416	0.17
417	0.18
418	0.18
419	0.15
420	0.15
421	0.18
422	0.22
423	0.25
424	0.3
425	0.34
426	0.35
427	0.37
428	0.37
429	0.36
430	0.36
431	0.42
432	0.41
433	0.38
434	0.36
435	0.35
436	0.36
437	0.34
438	0.31
439	0.22
440	0.23
441	0.21
442	0.19
443	0.18
444	0.14
445	0.13
446	0.15
447	0.15
448	0.09
449	0.13
450	0.16
451	0.16
452	0.19
453	0.21
454	0.27
455	0.35
456	0.39
457	0.36
458	0.4
459	0.45
460	0.52
461	0.58
462	0.6
463	0.57
464	0.61
465	0.63

A0A5B1QRY2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer