Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A5B1QL47

Protein Details
Accession A0A5B1QL47    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-26DSPIIFKRTKAKHTQRARETPAETHydrophilic
38-64SPSSLATKVRNKAKQRAKPKSNLSFGGHydrophilic
450-469ARRDRRSSRIARRSHRKSTEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
48-56NKAKQRAKP
239-251GKKSRKAEAGKRR
447-466PAAARRDRRSSRIARRSHRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012890  GCFC2-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MADSPIIFKRTKAKHTQRARETPAETPVEQPKGEEEPSPSSLATKVRNKAKQRAKPKSNLSFGGEEDGGEEIFQVKKSSLSRKLTLGKHPASPGVLPTNLDQASISPQPSSGPIYDAAYLSELKASTPSARPPLPKDATDVDVSMDVDDMGVVSLDAFGDGEATIPSESSVLAAKQKRERMRTTGGTDEDFISLSVTKREDVYQGPHPESRLMREEDDLGEGDDEFAEFTSAQERIALGKKSRKAEAGKRRDAMKEMIADAEEVDEETEEWEQEQLRRGGMSAIEQLEKAPVKPVYRPAPIPPLTSIPSLDAATARLTTMMTSLTTSHAQHTASMASLSSEHKQLDDRESDMRDMVSTAEEKRSWFAAFREWMESVATFLDEKFPQLEKLEEEHISIIKEKRDMIRQRRHADDEDDLSYFLGSLPVPPHTEPEELDELGRIIPRANPAAARRDRRSSRIARRSHRKSTEEEGFSTDAELPPSDATDYHTALQKLAMRRDDILSDVKAKEFKDPSLGVGKWFGEWRRRFTDSYVGAWGGLGMISAWEFWVRLEIIGWNPLEDPRSLDNFGWYEALYRYSRPSDNLDDGEEPQMGPDGDLVAAMISTCVLPRLSKIVESGGLDPNSSRDVRRVVDLAEEIEISVEKNNPKFQNFLKTVVDTFKESFVESYRLEKQYLDLNQSRFDPEAVPARRRLLTRQRKLLTNILRWRRYTGEQFGIGELVTKLVENCMMPIAESGWDVGGEESLRKVAAAIPAELIPWQLKARLGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.79
3 0.87
4 0.88
5 0.89
6 0.88
7 0.85
8 0.78
9 0.72
10 0.69
11 0.63
12 0.54
13 0.49
14 0.5
15 0.46
16 0.42
17 0.38
18 0.35
19 0.34
20 0.35
21 0.32
22 0.29
23 0.31
24 0.33
25 0.35
26 0.3
27 0.26
28 0.29
29 0.31
30 0.35
31 0.38
32 0.43
33 0.51
34 0.6
35 0.67
36 0.74
37 0.79
38 0.81
39 0.83
40 0.87
41 0.86
42 0.87
43 0.89
44 0.89
45 0.85
46 0.8
47 0.73
48 0.65
49 0.56
50 0.51
51 0.41
52 0.31
53 0.24
54 0.2
55 0.15
56 0.12
57 0.11
58 0.08
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.1
63 0.16
64 0.22
65 0.31
66 0.39
67 0.44
68 0.46
69 0.53
70 0.61
71 0.62
72 0.66
73 0.66
74 0.6
75 0.58
76 0.57
77 0.52
78 0.45
79 0.4
80 0.35
81 0.3
82 0.28
83 0.24
84 0.23
85 0.28
86 0.25
87 0.25
88 0.2
89 0.16
90 0.21
91 0.22
92 0.22
93 0.15
94 0.15
95 0.16
96 0.18
97 0.21
98 0.16
99 0.15
100 0.15
101 0.17
102 0.18
103 0.17
104 0.16
105 0.14
106 0.14
107 0.12
108 0.13
109 0.11
110 0.1
111 0.11
112 0.12
113 0.15
114 0.18
115 0.23
116 0.27
117 0.31
118 0.36
119 0.4
120 0.48
121 0.48
122 0.46
123 0.45
124 0.42
125 0.41
126 0.38
127 0.33
128 0.24
129 0.21
130 0.2
131 0.15
132 0.12
133 0.09
134 0.07
135 0.06
136 0.05
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.07
158 0.08
159 0.15
160 0.19
161 0.25
162 0.32
163 0.4
164 0.47
165 0.53
166 0.57
167 0.56
168 0.61
169 0.61
170 0.59
171 0.58
172 0.52
173 0.46
174 0.42
175 0.36
176 0.28
177 0.22
178 0.17
179 0.12
180 0.11
181 0.1
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.13
186 0.14
187 0.16
188 0.17
189 0.21
190 0.27
191 0.31
192 0.34
193 0.34
194 0.34
195 0.36
196 0.34
197 0.34
198 0.31
199 0.29
200 0.27
201 0.27
202 0.28
203 0.23
204 0.24
205 0.19
206 0.14
207 0.11
208 0.1
209 0.09
210 0.07
211 0.06
212 0.05
213 0.04
214 0.05
215 0.04
216 0.05
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.11
223 0.16
224 0.19
225 0.22
226 0.29
227 0.35
228 0.38
229 0.4
230 0.43
231 0.45
232 0.52
233 0.58
234 0.61
235 0.63
236 0.63
237 0.64
238 0.6
239 0.56
240 0.48
241 0.41
242 0.33
243 0.26
244 0.23
245 0.2
246 0.17
247 0.14
248 0.11
249 0.08
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.07
260 0.09
261 0.13
262 0.13
263 0.14
264 0.14
265 0.14
266 0.14
267 0.13
268 0.13
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.12
274 0.14
275 0.15
276 0.13
277 0.14
278 0.15
279 0.16
280 0.19
281 0.26
282 0.29
283 0.32
284 0.33
285 0.32
286 0.39
287 0.39
288 0.38
289 0.33
290 0.3
291 0.28
292 0.27
293 0.24
294 0.17
295 0.16
296 0.15
297 0.13
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.08
312 0.1
313 0.11
314 0.12
315 0.13
316 0.13
317 0.13
318 0.13
319 0.11
320 0.09
321 0.09
322 0.07
323 0.06
324 0.07
325 0.09
326 0.09
327 0.11
328 0.1
329 0.11
330 0.13
331 0.15
332 0.17
333 0.17
334 0.18
335 0.19
336 0.2
337 0.2
338 0.18
339 0.16
340 0.12
341 0.11
342 0.09
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.1
347 0.11
348 0.11
349 0.12
350 0.13
351 0.12
352 0.12
353 0.12
354 0.15
355 0.16
356 0.17
357 0.18
358 0.17
359 0.17
360 0.16
361 0.15
362 0.11
363 0.09
364 0.08
365 0.05
366 0.05
367 0.08
368 0.07
369 0.08
370 0.09
371 0.09
372 0.1
373 0.11
374 0.12
375 0.1
376 0.12
377 0.15
378 0.13
379 0.13
380 0.13
381 0.12
382 0.12
383 0.14
384 0.14
385 0.13
386 0.13
387 0.15
388 0.17
389 0.25
390 0.34
391 0.41
392 0.49
393 0.56
394 0.59
395 0.62
396 0.63
397 0.57
398 0.51
399 0.43
400 0.36
401 0.29
402 0.25
403 0.2
404 0.16
405 0.14
406 0.11
407 0.08
408 0.06
409 0.04
410 0.05
411 0.06
412 0.08
413 0.1
414 0.1
415 0.12
416 0.14
417 0.15
418 0.14
419 0.17
420 0.18
421 0.17
422 0.17
423 0.14
424 0.12
425 0.12
426 0.12
427 0.07
428 0.06
429 0.07
430 0.09
431 0.1
432 0.11
433 0.13
434 0.15
435 0.25
436 0.3
437 0.35
438 0.37
439 0.44
440 0.47
441 0.49
442 0.55
443 0.55
444 0.6
445 0.63
446 0.68
447 0.68
448 0.76
449 0.8
450 0.81
451 0.8
452 0.72
453 0.68
454 0.66
455 0.65
456 0.57
457 0.49
458 0.43
459 0.35
460 0.32
461 0.28
462 0.22
463 0.13
464 0.12
465 0.11
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.07
470 0.06
471 0.09
472 0.12
473 0.13
474 0.13
475 0.17
476 0.17
477 0.17
478 0.19
479 0.21
480 0.22
481 0.25
482 0.26
483 0.24
484 0.25
485 0.26
486 0.24
487 0.22
488 0.2
489 0.17
490 0.19
491 0.18
492 0.18
493 0.2
494 0.2
495 0.25
496 0.23
497 0.23
498 0.25
499 0.24
500 0.25
501 0.29
502 0.29
503 0.23
504 0.24
505 0.23
506 0.19
507 0.22
508 0.23
509 0.25
510 0.29
511 0.34
512 0.38
513 0.41
514 0.41
515 0.4
516 0.46
517 0.39
518 0.38
519 0.35
520 0.28
521 0.25
522 0.23
523 0.2
524 0.11
525 0.08
526 0.05
527 0.03
528 0.03
529 0.03
530 0.03
531 0.03
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.06
536 0.07
537 0.07
538 0.07
539 0.09
540 0.1
541 0.14
542 0.14
543 0.12
544 0.12
545 0.13
546 0.14
547 0.13
548 0.15
549 0.15
550 0.19
551 0.2
552 0.2
553 0.22
554 0.22
555 0.22
556 0.19
557 0.16
558 0.14
559 0.13
560 0.17
561 0.14
562 0.15
563 0.18
564 0.21
565 0.23
566 0.23
567 0.28
568 0.3
569 0.33
570 0.33
571 0.33
572 0.3
573 0.3
574 0.29
575 0.24
576 0.18
577 0.14
578 0.14
579 0.11
580 0.09
581 0.08
582 0.07
583 0.06
584 0.06
585 0.06
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.03
590 0.03
591 0.03
592 0.03
593 0.05
594 0.06
595 0.06
596 0.08
597 0.13
598 0.14
599 0.15
600 0.16
601 0.17
602 0.19
603 0.21
604 0.23
605 0.24
606 0.23
607 0.22
608 0.21
609 0.2
610 0.22
611 0.21
612 0.19
613 0.16
614 0.2
615 0.22
616 0.25
617 0.25
618 0.22
619 0.24
620 0.24
621 0.21
622 0.18
623 0.16
624 0.12
625 0.11
626 0.11
627 0.08
628 0.09
629 0.12
630 0.16
631 0.19
632 0.27
633 0.31
634 0.33
635 0.37
636 0.39
637 0.45
638 0.44
639 0.46
640 0.42
641 0.4
642 0.4
643 0.4
644 0.38
645 0.31
646 0.3
647 0.27
648 0.24
649 0.23
650 0.22
651 0.21
652 0.23
653 0.2
654 0.25
655 0.29
656 0.31
657 0.31
658 0.3
659 0.28
660 0.32
661 0.35
662 0.37
663 0.36
664 0.36
665 0.38
666 0.39
667 0.4
668 0.32
669 0.3
670 0.23
671 0.21
672 0.29
673 0.32
674 0.34
675 0.35
676 0.39
677 0.42
678 0.43
679 0.49
680 0.5
681 0.56
682 0.62
683 0.69
684 0.69
685 0.72
686 0.75
687 0.75
688 0.73
689 0.71
690 0.72
691 0.71
692 0.72
693 0.68
694 0.67
695 0.63
696 0.6
697 0.58
698 0.56
699 0.52
700 0.49
701 0.49
702 0.45
703 0.4
704 0.32
705 0.26
706 0.18
707 0.13
708 0.1
709 0.09
710 0.08
711 0.09
712 0.12
713 0.1
714 0.11
715 0.12
716 0.12
717 0.12
718 0.13
719 0.13
720 0.12
721 0.12
722 0.11
723 0.09
724 0.09
725 0.09
726 0.08
727 0.09
728 0.09
729 0.09
730 0.1
731 0.1
732 0.1
733 0.1
734 0.1
735 0.12
736 0.17
737 0.19
738 0.19
739 0.2
740 0.2
741 0.2
742 0.2
743 0.19
744 0.14
745 0.14
746 0.15
747 0.15