Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5B1QHM9

Protein Details
Accession A0A5B1QHM9    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
177-197VSAPRTPEPLRPKKRKAAAMDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
183-192PEPLRPKKRK
299-307PKGRPPKKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MAYNLSRQNADLLKKHVDSPPSLSVQLHPDHWTLNSGSKFLYNSPAAALLDDIRAQRIPVDLLELFDAAKVPFYEGCMIVELKDLRDSPSVSEGSNTQSKRNAASDNTPAKITRVVLHPNGESFWADLCLLNQKTGKKWTDQEALEVEARIVAATAPPLCLDPDPRLGRIANKMLRVSAPRTPEPLRPKKRKAAAMDQPETDEESIARRAKLFQFMNPQRNRSATPTYRLLDTITKMKTQPALEPPAAQPAAPPNPQAQFQHLQQIAPQPQPPPQQTLVPPPRHTATPVAPIAPMTAAPKGRPPKKKGEGQTPSNATEGTVGTPTPAATPVASTPISATPQLPTQQLRHNLQPSPHPPSQSPHPTSVYASSPADPSRPTPSPALHHHPPSQSPHPPITQPAQPQHPQQPAQAHPQFQPHAGQPYPANMSSQTYNTLAQAAAFAQKNKLPQKNGVQQGTPTPTNVQMHPQFLALQYQRQQALAAQQRLTQTQAQNGHSATRSPMAQQQAAAVANGHNQPIAARSPMPNAQQQAQVQAQVQQQAQAQAARQQGQQPGQQQQAQHPALVHAGLNFAALTPQQQQQYIQYRVMQQGQAGGQTPMHPQHLAMLQHAHAQAQAQAQAQAGAQATASPVPNQQQQQQQQRRQGASPAQGTPQEQQAHAQQAQAQAHAHNQAHLMANYPQVYNYQQMGMNPAAAAAAGMRIPQGFAWQMPVGYGRGMPMNAQHPGQGPGQGQGPMPGAGASQPMPIGMNKAGQAGGQGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.47
3 0.46
4 0.44
5 0.42
6 0.43
7 0.44
8 0.41
9 0.41
10 0.37
11 0.36
12 0.37
13 0.37
14 0.33
15 0.3
16 0.27
17 0.27
18 0.27
19 0.27
20 0.23
21 0.28
22 0.27
23 0.25
24 0.24
25 0.25
26 0.26
27 0.24
28 0.3
29 0.23
30 0.22
31 0.22
32 0.24
33 0.22
34 0.2
35 0.2
36 0.14
37 0.14
38 0.17
39 0.16
40 0.15
41 0.15
42 0.15
43 0.15
44 0.16
45 0.16
46 0.13
47 0.18
48 0.16
49 0.16
50 0.17
51 0.16
52 0.14
53 0.13
54 0.14
55 0.09
56 0.11
57 0.1
58 0.11
59 0.11
60 0.14
61 0.16
62 0.16
63 0.17
64 0.17
65 0.17
66 0.15
67 0.2
68 0.19
69 0.17
70 0.2
71 0.2
72 0.21
73 0.24
74 0.25
75 0.22
76 0.27
77 0.26
78 0.23
79 0.24
80 0.22
81 0.23
82 0.3
83 0.28
84 0.26
85 0.3
86 0.32
87 0.35
88 0.37
89 0.37
90 0.34
91 0.38
92 0.45
93 0.46
94 0.45
95 0.43
96 0.39
97 0.36
98 0.35
99 0.31
100 0.25
101 0.25
102 0.3
103 0.32
104 0.36
105 0.35
106 0.33
107 0.32
108 0.29
109 0.24
110 0.18
111 0.15
112 0.12
113 0.12
114 0.11
115 0.11
116 0.18
117 0.18
118 0.21
119 0.24
120 0.26
121 0.3
122 0.38
123 0.4
124 0.38
125 0.42
126 0.46
127 0.51
128 0.48
129 0.48
130 0.41
131 0.41
132 0.37
133 0.32
134 0.24
135 0.16
136 0.15
137 0.11
138 0.09
139 0.05
140 0.05
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.08
146 0.1
147 0.11
148 0.13
149 0.14
150 0.23
151 0.25
152 0.26
153 0.28
154 0.28
155 0.31
156 0.35
157 0.41
158 0.36
159 0.37
160 0.37
161 0.36
162 0.38
163 0.38
164 0.35
165 0.31
166 0.33
167 0.31
168 0.36
169 0.38
170 0.42
171 0.49
172 0.56
173 0.62
174 0.66
175 0.72
176 0.76
177 0.81
178 0.81
179 0.78
180 0.78
181 0.76
182 0.76
183 0.72
184 0.63
185 0.56
186 0.49
187 0.43
188 0.33
189 0.23
190 0.14
191 0.13
192 0.17
193 0.18
194 0.18
195 0.17
196 0.2
197 0.23
198 0.31
199 0.3
200 0.29
201 0.38
202 0.46
203 0.55
204 0.56
205 0.56
206 0.5
207 0.52
208 0.49
209 0.44
210 0.45
211 0.39
212 0.4
213 0.44
214 0.42
215 0.4
216 0.38
217 0.35
218 0.29
219 0.27
220 0.28
221 0.24
222 0.25
223 0.24
224 0.26
225 0.29
226 0.27
227 0.3
228 0.29
229 0.33
230 0.31
231 0.33
232 0.31
233 0.33
234 0.32
235 0.26
236 0.21
237 0.21
238 0.26
239 0.25
240 0.25
241 0.21
242 0.23
243 0.26
244 0.26
245 0.25
246 0.24
247 0.24
248 0.32
249 0.29
250 0.28
251 0.27
252 0.33
253 0.31
254 0.3
255 0.31
256 0.24
257 0.29
258 0.35
259 0.35
260 0.33
261 0.31
262 0.33
263 0.33
264 0.42
265 0.46
266 0.45
267 0.45
268 0.42
269 0.43
270 0.39
271 0.39
272 0.32
273 0.26
274 0.27
275 0.26
276 0.24
277 0.22
278 0.22
279 0.2
280 0.16
281 0.13
282 0.08
283 0.1
284 0.1
285 0.11
286 0.18
287 0.26
288 0.34
289 0.42
290 0.46
291 0.54
292 0.61
293 0.68
294 0.68
295 0.7
296 0.7
297 0.66
298 0.68
299 0.61
300 0.55
301 0.47
302 0.41
303 0.3
304 0.23
305 0.18
306 0.12
307 0.09
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.12
324 0.12
325 0.12
326 0.09
327 0.12
328 0.14
329 0.15
330 0.15
331 0.17
332 0.23
333 0.28
334 0.3
335 0.33
336 0.35
337 0.35
338 0.34
339 0.39
340 0.37
341 0.39
342 0.38
343 0.34
344 0.31
345 0.33
346 0.39
347 0.41
348 0.4
349 0.35
350 0.36
351 0.35
352 0.35
353 0.34
354 0.27
355 0.21
356 0.18
357 0.15
358 0.15
359 0.14
360 0.14
361 0.12
362 0.13
363 0.16
364 0.17
365 0.18
366 0.19
367 0.2
368 0.24
369 0.29
370 0.34
371 0.32
372 0.34
373 0.36
374 0.36
375 0.37
376 0.38
377 0.38
378 0.36
379 0.36
380 0.35
381 0.32
382 0.31
383 0.32
384 0.29
385 0.28
386 0.27
387 0.27
388 0.3
389 0.31
390 0.34
391 0.38
392 0.4
393 0.37
394 0.36
395 0.38
396 0.35
397 0.42
398 0.41
399 0.36
400 0.33
401 0.36
402 0.34
403 0.29
404 0.29
405 0.21
406 0.23
407 0.21
408 0.2
409 0.16
410 0.18
411 0.2
412 0.18
413 0.17
414 0.13
415 0.15
416 0.14
417 0.15
418 0.14
419 0.13
420 0.13
421 0.12
422 0.13
423 0.1
424 0.09
425 0.09
426 0.07
427 0.1
428 0.1
429 0.11
430 0.11
431 0.13
432 0.2
433 0.27
434 0.32
435 0.31
436 0.36
437 0.44
438 0.51
439 0.56
440 0.52
441 0.45
442 0.41
443 0.42
444 0.41
445 0.33
446 0.25
447 0.2
448 0.21
449 0.23
450 0.22
451 0.24
452 0.22
453 0.24
454 0.23
455 0.22
456 0.19
457 0.18
458 0.23
459 0.17
460 0.19
461 0.21
462 0.23
463 0.23
464 0.23
465 0.23
466 0.18
467 0.25
468 0.29
469 0.28
470 0.26
471 0.28
472 0.29
473 0.3
474 0.31
475 0.28
476 0.21
477 0.24
478 0.29
479 0.28
480 0.29
481 0.29
482 0.28
483 0.24
484 0.24
485 0.19
486 0.16
487 0.15
488 0.14
489 0.18
490 0.19
491 0.2
492 0.19
493 0.18
494 0.19
495 0.18
496 0.17
497 0.12
498 0.09
499 0.12
500 0.13
501 0.12
502 0.09
503 0.09
504 0.09
505 0.11
506 0.12
507 0.1
508 0.11
509 0.12
510 0.16
511 0.21
512 0.23
513 0.25
514 0.26
515 0.27
516 0.3
517 0.3
518 0.31
519 0.27
520 0.26
521 0.23
522 0.26
523 0.25
524 0.24
525 0.24
526 0.22
527 0.22
528 0.22
529 0.23
530 0.19
531 0.18
532 0.19
533 0.22
534 0.22
535 0.22
536 0.25
537 0.29
538 0.31
539 0.34
540 0.34
541 0.36
542 0.38
543 0.39
544 0.36
545 0.36
546 0.42
547 0.39
548 0.35
549 0.3
550 0.26
551 0.24
552 0.24
553 0.19
554 0.09
555 0.09
556 0.08
557 0.08
558 0.07
559 0.06
560 0.06
561 0.05
562 0.07
563 0.1
564 0.14
565 0.15
566 0.16
567 0.18
568 0.25
569 0.34
570 0.35
571 0.34
572 0.34
573 0.36
574 0.39
575 0.41
576 0.34
577 0.26
578 0.26
579 0.24
580 0.23
581 0.2
582 0.17
583 0.14
584 0.15
585 0.18
586 0.17
587 0.18
588 0.17
589 0.15
590 0.19
591 0.24
592 0.23
593 0.22
594 0.22
595 0.2
596 0.25
597 0.25
598 0.21
599 0.16
600 0.16
601 0.17
602 0.16
603 0.19
604 0.15
605 0.15
606 0.15
607 0.16
608 0.15
609 0.14
610 0.12
611 0.1
612 0.09
613 0.08
614 0.09
615 0.1
616 0.11
617 0.1
618 0.12
619 0.16
620 0.23
621 0.25
622 0.31
623 0.38
624 0.46
625 0.56
626 0.64
627 0.68
628 0.71
629 0.76
630 0.74
631 0.66
632 0.64
633 0.6
634 0.57
635 0.54
636 0.47
637 0.42
638 0.41
639 0.42
640 0.36
641 0.37
642 0.32
643 0.27
644 0.28
645 0.3
646 0.35
647 0.33
648 0.32
649 0.28
650 0.32
651 0.33
652 0.32
653 0.28
654 0.22
655 0.25
656 0.3
657 0.28
658 0.22
659 0.22
660 0.23
661 0.26
662 0.24
663 0.24
664 0.2
665 0.24
666 0.24
667 0.23
668 0.21
669 0.2
670 0.22
671 0.22
672 0.22
673 0.2
674 0.2
675 0.2
676 0.24
677 0.22
678 0.21
679 0.17
680 0.15
681 0.12
682 0.1
683 0.1
684 0.05
685 0.05
686 0.05
687 0.05
688 0.06
689 0.06
690 0.07
691 0.07
692 0.11
693 0.11
694 0.11
695 0.16
696 0.16
697 0.16
698 0.17
699 0.19
700 0.16
701 0.15
702 0.15
703 0.12
704 0.14
705 0.14
706 0.14
707 0.17
708 0.21
709 0.23
710 0.23
711 0.24
712 0.24
713 0.27
714 0.27
715 0.27
716 0.23
717 0.23
718 0.25
719 0.25
720 0.23
721 0.23
722 0.23
723 0.19
724 0.18
725 0.16
726 0.13
727 0.12
728 0.14
729 0.12
730 0.11
731 0.11
732 0.11
733 0.12
734 0.13
735 0.16
736 0.15
737 0.18
738 0.18
739 0.19
740 0.19
741 0.18