Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C0L2

Protein Details
Accession A0A5M6C0L2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
374-401DGITPKSGKKGVKPRKERRSAAVPNNVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
378-392PKSGKKGVKPRKERR
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 7.5, cyto_nucl 6.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046896  Cup1-like_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF20263  LYRM2-like  
Amino Acid Sequences MSLLPPLGTIPHPAHLYRSFLQHLRLLPDPHVWSILQPRFRRLLETPGASPSFVQGAIELDSTAIAEEVDGDVPHAESSKAASIRKHRRLKAISEAQEHLNRLRAAVACHPHALTRLLEESYGQRGSVRWELIRAISLPYGSTTRTPLPPPLLPLRPPPPPPSEAQPRARKTLPDCRVRKIALRQTYKSWEDVKPPIVLPSSSASQLHLVNDMDGVVKGTGWERTGVIANLRHFAGLPPDSHSLPGLSDKTTPSSSSLPISSTAALPKHIRLIFPSKLNPTLREEPYPPPRPKATRANPRTWGVPRVLTNRLVRRTYRRLWDNLVWVRPVDVTGSPLGGLGEGEGEQKRVGEERWKRCTYDEMRAWERGESDRDGITPKSGKKGVKPRKERRSAAVPNNVEDHRWSEGTDDERRLLGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.31
3 0.36
4 0.34
5 0.37
6 0.38
7 0.38
8 0.41
9 0.4
10 0.4
11 0.38
12 0.41
13 0.38
14 0.35
15 0.39
16 0.38
17 0.35
18 0.34
19 0.29
20 0.27
21 0.35
22 0.39
23 0.41
24 0.4
25 0.44
26 0.49
27 0.49
28 0.52
29 0.44
30 0.47
31 0.46
32 0.48
33 0.44
34 0.43
35 0.43
36 0.37
37 0.35
38 0.27
39 0.21
40 0.17
41 0.15
42 0.09
43 0.1
44 0.11
45 0.11
46 0.1
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.07
51 0.06
52 0.04
53 0.03
54 0.04
55 0.05
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.07
64 0.06
65 0.09
66 0.14
67 0.18
68 0.2
69 0.26
70 0.35
71 0.46
72 0.57
73 0.64
74 0.63
75 0.7
76 0.73
77 0.73
78 0.73
79 0.72
80 0.69
81 0.64
82 0.61
83 0.56
84 0.54
85 0.5
86 0.4
87 0.36
88 0.3
89 0.25
90 0.26
91 0.22
92 0.21
93 0.26
94 0.29
95 0.25
96 0.26
97 0.26
98 0.23
99 0.24
100 0.23
101 0.17
102 0.15
103 0.16
104 0.15
105 0.14
106 0.15
107 0.15
108 0.17
109 0.17
110 0.14
111 0.13
112 0.13
113 0.18
114 0.21
115 0.21
116 0.17
117 0.18
118 0.19
119 0.19
120 0.2
121 0.16
122 0.14
123 0.12
124 0.12
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.13
131 0.15
132 0.18
133 0.19
134 0.22
135 0.25
136 0.25
137 0.28
138 0.32
139 0.32
140 0.31
141 0.35
142 0.36
143 0.38
144 0.4
145 0.4
146 0.38
147 0.37
148 0.37
149 0.38
150 0.44
151 0.46
152 0.52
153 0.56
154 0.55
155 0.57
156 0.57
157 0.53
158 0.49
159 0.53
160 0.52
161 0.52
162 0.52
163 0.52
164 0.55
165 0.53
166 0.53
167 0.51
168 0.51
169 0.51
170 0.54
171 0.52
172 0.51
173 0.56
174 0.51
175 0.45
176 0.41
177 0.35
178 0.33
179 0.34
180 0.32
181 0.27
182 0.26
183 0.24
184 0.21
185 0.18
186 0.15
187 0.14
188 0.13
189 0.12
190 0.12
191 0.11
192 0.12
193 0.13
194 0.12
195 0.11
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.06
211 0.07
212 0.09
213 0.09
214 0.11
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.14
219 0.13
220 0.12
221 0.12
222 0.14
223 0.12
224 0.12
225 0.14
226 0.16
227 0.17
228 0.17
229 0.17
230 0.13
231 0.12
232 0.15
233 0.12
234 0.11
235 0.12
236 0.13
237 0.16
238 0.16
239 0.16
240 0.16
241 0.17
242 0.17
243 0.17
244 0.17
245 0.15
246 0.15
247 0.16
248 0.13
249 0.12
250 0.14
251 0.13
252 0.15
253 0.15
254 0.15
255 0.21
256 0.21
257 0.2
258 0.21
259 0.28
260 0.29
261 0.32
262 0.35
263 0.31
264 0.37
265 0.39
266 0.38
267 0.38
268 0.42
269 0.41
270 0.41
271 0.41
272 0.42
273 0.5
274 0.57
275 0.52
276 0.49
277 0.53
278 0.54
279 0.58
280 0.61
281 0.62
282 0.64
283 0.68
284 0.71
285 0.7
286 0.67
287 0.67
288 0.59
289 0.53
290 0.44
291 0.42
292 0.39
293 0.38
294 0.4
295 0.39
296 0.43
297 0.47
298 0.5
299 0.5
300 0.5
301 0.54
302 0.59
303 0.6
304 0.62
305 0.6
306 0.59
307 0.62
308 0.61
309 0.62
310 0.6
311 0.56
312 0.47
313 0.41
314 0.37
315 0.3
316 0.26
317 0.18
318 0.12
319 0.12
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.1
324 0.1
325 0.08
326 0.07
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.13
337 0.15
338 0.22
339 0.32
340 0.41
341 0.5
342 0.53
343 0.53
344 0.53
345 0.61
346 0.57
347 0.57
348 0.54
349 0.53
350 0.55
351 0.57
352 0.56
353 0.47
354 0.44
355 0.37
356 0.35
357 0.3
358 0.28
359 0.25
360 0.25
361 0.27
362 0.25
363 0.27
364 0.3
365 0.3
366 0.35
367 0.4
368 0.43
369 0.5
370 0.6
371 0.65
372 0.69
373 0.77
374 0.8
375 0.86
376 0.92
377 0.88
378 0.84
379 0.85
380 0.84
381 0.82
382 0.82
383 0.73
384 0.66
385 0.66
386 0.59
387 0.49
388 0.41
389 0.35
390 0.3
391 0.27
392 0.25
393 0.21
394 0.26
395 0.3
396 0.35
397 0.35
398 0.31