FuNGI

A0A5M6BPM5

Protein Details

Accession

A0A5M6BPM5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
81-101	GIQRLKFKPKVPIRRVKQEVD	Hydrophilic
218-238	AKGKAKEKAKNEKEKKGKSRA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
87-95	FKPKVPIRR
112-131	PVRGGIRGRGRGGPTRGRGR
216-237	GKAKGKAKEKAKNEKEKKGKSR

Subcellular Location(s)

cyto 4.5, cyto_mito 13.5, mito 21.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSKPPAPPTTRGKPSLIAAAQAQSTQPPNANRPVAPGPASIATLSDGSVSAASASRSGTPMTAGDGSGSVPPSGSVPPPGGIQRLKFKPKVPIRRVKQEVDVKPEIPVAAAPVRGGIRGRGRGGPTRGRGRGTVVGTSVAAGVFGGPRPVASSSSTKRFAAPAPSMRGLDYASDEVYSDHSDQEGGMGKPIDIDKVSQMSESAPTSLFRDRNLSQGKAKGKAKEKAKNEKEKKGKSRAGEEAMEVDSSSTPTVDPSLPRVKAEPVSPEKQPRQLQELREDDAMLSDDETQDRDERGRRVRSFAMTGGIEDPEDAEEEDEAVNEAQKVDLSDSEEEEEEETMEGDFVNTEGHDDPENKLFMFQFPHLFPKFASSGPVDLTDPTAGPDVKPDIKPTAAQLRANAKKAVNEPPPEGRVGTLVVMKSGKVKMVLGKDIVMNVHPGVEATFIRHLVHLDQKQKAAVVLGELHKNYVVTPDIDILLQDLYIEGGKTPGEKETEVRERRRREGGLVKIEDR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.56
3	0.48
4	0.4
5	0.34
6	0.32
7	0.29
8	0.26
9	0.24
10	0.18
11	0.21
12	0.21
13	0.24
14	0.27
15	0.32
16	0.39
17	0.43
18	0.4
19	0.43
20	0.45
21	0.44
22	0.41
23	0.36
24	0.31
25	0.28
26	0.29
27	0.22
28	0.18
29	0.15
30	0.13
31	0.13
32	0.1
33	0.09
34	0.08
35	0.08
36	0.08
37	0.07
38	0.08
39	0.08
40	0.09
41	0.1
42	0.11
43	0.12
44	0.13
45	0.12
46	0.12
47	0.12
48	0.15
49	0.14
50	0.13
51	0.12
52	0.12
53	0.12
54	0.13
55	0.14
56	0.1
57	0.09
58	0.09
59	0.11
60	0.12
61	0.13
62	0.13
63	0.14
64	0.15
65	0.17
66	0.19
67	0.23
68	0.24
69	0.27
70	0.34
71	0.41
72	0.49
73	0.51
74	0.53
75	0.58
76	0.65
77	0.72
78	0.73
79	0.75
80	0.75
81	0.81
82	0.83
83	0.77
84	0.76
85	0.75
86	0.7
87	0.68
88	0.64
89	0.53
90	0.48
91	0.45
92	0.35
93	0.26
94	0.2
95	0.15
96	0.13
97	0.13
98	0.11
99	0.13
100	0.13
101	0.14
102	0.15
103	0.16
104	0.21
105	0.25
106	0.27
107	0.29
108	0.33
109	0.39
110	0.45
111	0.47
112	0.48
113	0.53
114	0.54
115	0.51
116	0.48
117	0.46
118	0.46
119	0.41
120	0.35
121	0.27
122	0.24
123	0.22
124	0.21
125	0.16
126	0.1
127	0.07
128	0.05
129	0.05
130	0.05
131	0.05
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.07
136	0.08
137	0.1
138	0.12
139	0.19
140	0.23
141	0.3
142	0.33
143	0.32
144	0.32
145	0.33
146	0.32
147	0.32
148	0.33
149	0.33
150	0.35
151	0.37
152	0.36
153	0.34
154	0.32
155	0.26
156	0.21
157	0.17
158	0.12
159	0.1
160	0.1
161	0.09
162	0.09
163	0.1
164	0.11
165	0.1
166	0.09
167	0.09
168	0.09
169	0.08
170	0.1
171	0.13
172	0.1
173	0.12
174	0.12
175	0.11
176	0.13
177	0.13
178	0.13
179	0.09
180	0.1
181	0.09
182	0.11
183	0.12
184	0.1
185	0.1
186	0.1
187	0.11
188	0.11
189	0.1
190	0.09
191	0.09
192	0.12
193	0.16
194	0.16
195	0.15
196	0.21
197	0.2
198	0.28
199	0.32
200	0.32
201	0.3
202	0.36
203	0.39
204	0.41
205	0.44
206	0.42
207	0.46
208	0.5
209	0.56
210	0.57
211	0.62
212	0.66
213	0.71
214	0.75
215	0.75
216	0.78
217	0.79
218	0.8
219	0.8
220	0.79
221	0.75
222	0.67
223	0.66
224	0.61
225	0.55
226	0.47
227	0.38
228	0.3
229	0.26
230	0.22
231	0.16
232	0.11
233	0.07
234	0.07
235	0.06
236	0.05
237	0.04
238	0.04
239	0.06
240	0.07
241	0.07
242	0.12
243	0.18
244	0.19
245	0.19
246	0.2
247	0.21
248	0.21
249	0.22
250	0.24
251	0.24
252	0.26
253	0.28
254	0.34
255	0.35
256	0.41
257	0.43
258	0.38
259	0.4
260	0.43
261	0.43
262	0.44
263	0.44
264	0.38
265	0.35
266	0.33
267	0.25
268	0.2
269	0.18
270	0.1
271	0.08
272	0.06
273	0.06
274	0.06
275	0.07
276	0.08
277	0.08
278	0.09
279	0.11
280	0.14
281	0.2
282	0.27
283	0.35
284	0.35
285	0.38
286	0.41
287	0.4
288	0.39
289	0.34
290	0.3
291	0.21
292	0.21
293	0.17
294	0.14
295	0.12
296	0.09
297	0.09
298	0.06
299	0.06
300	0.05
301	0.05
302	0.04
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.06
314	0.06
315	0.07
316	0.09
317	0.1
318	0.11
319	0.12
320	0.12
321	0.11
322	0.11
323	0.1
324	0.08
325	0.07
326	0.06
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.04
334	0.04
335	0.05
336	0.06
337	0.08
338	0.1
339	0.11
340	0.13
341	0.16
342	0.17
343	0.15
344	0.16
345	0.15
346	0.15
347	0.17
348	0.17
349	0.18
350	0.18
351	0.25
352	0.25
353	0.25
354	0.24
355	0.25
356	0.25
357	0.21
358	0.23
359	0.17
360	0.17
361	0.18
362	0.19
363	0.15
364	0.14
365	0.15
366	0.13
367	0.11
368	0.11
369	0.13
370	0.11
371	0.11
372	0.13
373	0.16
374	0.2
375	0.21
376	0.23
377	0.24
378	0.25
379	0.26
380	0.28
381	0.33
382	0.32
383	0.33
384	0.35
385	0.42
386	0.47
387	0.49
388	0.49
389	0.4
390	0.41
391	0.44
392	0.48
393	0.45
394	0.43
395	0.44
396	0.46
397	0.46
398	0.42
399	0.39
400	0.3
401	0.24
402	0.21
403	0.18
404	0.15
405	0.14
406	0.15
407	0.15
408	0.14
409	0.18
410	0.18
411	0.18
412	0.16
413	0.18
414	0.21
415	0.26
416	0.29
417	0.26
418	0.26
419	0.25
420	0.25
421	0.24
422	0.19
423	0.16
424	0.12
425	0.12
426	0.1
427	0.1
428	0.09
429	0.1
430	0.1
431	0.11
432	0.14
433	0.14
434	0.15
435	0.16
436	0.16
437	0.18
438	0.27
439	0.31
440	0.36
441	0.39
442	0.4
443	0.41
444	0.4
445	0.37
446	0.29
447	0.22
448	0.18
449	0.19
450	0.21
451	0.25
452	0.24
453	0.25
454	0.24
455	0.23
456	0.21
457	0.19
458	0.18
459	0.14
460	0.15
461	0.16
462	0.16
463	0.16
464	0.16
465	0.13
466	0.11
467	0.09
468	0.08
469	0.06
470	0.06
471	0.07
472	0.07
473	0.06
474	0.07
475	0.08
476	0.09
477	0.11
478	0.14
479	0.16
480	0.18
481	0.21
482	0.29
483	0.39
484	0.46
485	0.55
486	0.61
487	0.65
488	0.71
489	0.77
490	0.7
491	0.69
492	0.7
493	0.69
494	0.7

A0A5M6BPM5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer