Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C3H3

Protein Details
Accession A0A5M6C3H3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
210-232AVSKAFLLKKKKKAKATDVSAEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
218-225KKKKKAKA
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 11.833, mito 9, cyto_mito 6.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024974  Sde2_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF13019  Sde2_N_Ubi  
Amino Acid Sequences MSLQTVFLHLPTPLASVQLSLPSSTPLSALPLPSTLDPTTYYLRTTVSSPLSASTTLDSLRHVDSPSHPISLHLCPRLPGGKGGFGSQLRAAGGRMSTGKATNVDSCRDLSGRRLGTIKEAQRQAELLESEPALRAQAQAADKSKLEALERKLGITPADALIGSDDNGEGSSKRRVEDVDLEELARKKHKFEDNKFLEESREINENVRAAVSKAFLLKKKKKAKATDVSAEADKKVDQAKKAEKDKLAMPPPPAATVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.12
4 0.12
5 0.16
6 0.16
7 0.14
8 0.15
9 0.16
10 0.17
11 0.16
12 0.15
13 0.11
14 0.15
15 0.16
16 0.17
17 0.15
18 0.16
19 0.18
20 0.17
21 0.22
22 0.17
23 0.17
24 0.17
25 0.2
26 0.23
27 0.22
28 0.22
29 0.18
30 0.19
31 0.19
32 0.19
33 0.21
34 0.19
35 0.19
36 0.19
37 0.19
38 0.2
39 0.19
40 0.18
41 0.13
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.14
48 0.15
49 0.15
50 0.16
51 0.17
52 0.24
53 0.24
54 0.24
55 0.22
56 0.22
57 0.24
58 0.29
59 0.31
60 0.28
61 0.26
62 0.26
63 0.29
64 0.3
65 0.28
66 0.25
67 0.21
68 0.23
69 0.22
70 0.23
71 0.24
72 0.21
73 0.22
74 0.19
75 0.18
76 0.14
77 0.13
78 0.12
79 0.09
80 0.09
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.1
86 0.11
87 0.11
88 0.13
89 0.17
90 0.18
91 0.18
92 0.19
93 0.19
94 0.19
95 0.18
96 0.17
97 0.15
98 0.2
99 0.19
100 0.19
101 0.2
102 0.19
103 0.23
104 0.29
105 0.29
106 0.29
107 0.31
108 0.3
109 0.29
110 0.29
111 0.24
112 0.2
113 0.16
114 0.11
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.09
125 0.09
126 0.12
127 0.14
128 0.16
129 0.16
130 0.16
131 0.17
132 0.14
133 0.15
134 0.17
135 0.18
136 0.24
137 0.24
138 0.24
139 0.23
140 0.23
141 0.22
142 0.17
143 0.15
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.07
158 0.13
159 0.14
160 0.15
161 0.16
162 0.16
163 0.2
164 0.27
165 0.28
166 0.27
167 0.26
168 0.26
169 0.28
170 0.29
171 0.27
172 0.26
173 0.23
174 0.21
175 0.29
176 0.37
177 0.45
178 0.51
179 0.6
180 0.6
181 0.64
182 0.64
183 0.56
184 0.49
185 0.41
186 0.34
187 0.26
188 0.23
189 0.19
190 0.19
191 0.21
192 0.2
193 0.18
194 0.18
195 0.16
196 0.13
197 0.14
198 0.13
199 0.12
200 0.17
201 0.21
202 0.27
203 0.37
204 0.45
205 0.54
206 0.64
207 0.71
208 0.75
209 0.8
210 0.84
211 0.84
212 0.83
213 0.81
214 0.74
215 0.69
216 0.64
217 0.56
218 0.46
219 0.37
220 0.29
221 0.24
222 0.27
223 0.28
224 0.28
225 0.36
226 0.45
227 0.53
228 0.61
229 0.66
230 0.62
231 0.61
232 0.62
233 0.63
234 0.61
235 0.56
236 0.51
237 0.49
238 0.48