Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C8H1

Protein Details
Accession A0A5M6C8H1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-89QAQRQQQQQQQQQQQQQQQQHydrophilic
1052-1074SEAKVAWRKEKEAKRKREEDGPEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1055-1068KVAWRKEKEAKRKR
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 7.5, cyto_mito 6.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR037794  TAF12  
IPR003228  TFIID_TAF12_dom  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0046695  C:SLIK (SAGA-like) complex  
GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03847  TFIID_20kDa  
CDD cd07981  TAF12  
Amino Acid Sequences MSTPASSSSSAPANNVSASLASLSPANLQQLQLKFPQLLTEAERQLPDDRRNELFRMKMITFMKSSARAQAQRQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQGGQNQIQGTPQMNAGGVAAGGMQGQAQVRQATASPMMGMQQPQQQQQQQQGQAGAGMVQNGQQGQQGQQQQQMNPQNQVNYQDQMRLQQQAQQQQHLATMLEKTQRLQQQAIQHQQQGQTPVLQQQQLQPQQQMTQQQLQLQQQQQQQQQQQQQAMIQPMQHATPSSIAAPSPQAHAMSSPQTVRQSPSNNTSRAMQMSISGIKTLVENFPKLYELKGAGKLGPDQEKLFDQFMNSPEGRNQVQQMQAHHARTLVQNGLTNPVSLPNGVQQPQQTPQMNAMQLPLSAQQQMNALQQQQQQQQQQQQQAGFMQGQHSVLSQQLQQQFPQANVMANSLAGTQQGQQMQSPQMNQQQLHQLQLQRLAAAQAQAQAQALQVAQAQGRILPQHQLPNANLTQAQLLARAQSQSQMLQQAGSPMTGQHLQDLQQQVQAQAQQQQQSIQQQQQQQQQQQQQQNFGSPRPPQQQQQMTMQQMQMNLQQATSRMAPEKAANLRNVLMRLAAMTDEQRETAFRSTPQYRPLWNQANGITQAAVVQQMAAQAQAQAQAAAQAQAQAQANMANGAPPPGVSSPHMGMQHPGTPNMQQQARPPAGVSTPNFPGANTVPNLHIPPNKQRNLSQSSQGAAASPQMRPAMPQQIPGQPQGQILQGQNLQQAQAIQRMINSGIPVNQAVQNVAAARQQQLAAAAGAAVAANAAGANGLPFPGQQGGQPQQPVQGGQPHPIGLPNQIHASNITPSMLIAQFSQHDMARPPVRMDQVRQSSDIAVPQLDKSASLLARARWDPTPESDAALREKLNSFQPPLKHSGRGTMGIVNRVMGEVILEKMPEGLRMIMDEAEGDLLGEDKDGEVSGMPGQKKRKVQELAEGIDKALVVDRDVETLMLQLADEHCDLVSQISCSLAAHRKSNTIDRKDVQLAYETIFGRTIPGFSSDLIRLDQARSSRVKPLNPQRATKVRLVSEAKVAWRKEKEAKRKREEDGPEEVVVEVDGTGDGGGEGLQQDVVKTEVDGVGGGMAAVQNAAGETNGVTTPSVNGVTTGMTLPLPTPTAVMA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.21
3 0.18
4 0.14
5 0.14
6 0.14
7 0.11
8 0.09
9 0.1
10 0.1
11 0.12
12 0.14
13 0.17
14 0.17
15 0.18
16 0.24
17 0.26
18 0.29
19 0.3
20 0.31
21 0.28
22 0.27
23 0.29
24 0.24
25 0.25
26 0.27
27 0.31
28 0.32
29 0.33
30 0.34
31 0.33
32 0.37
33 0.42
34 0.44
35 0.42
36 0.43
37 0.46
38 0.5
39 0.52
40 0.51
41 0.47
42 0.44
43 0.45
44 0.41
45 0.43
46 0.4
47 0.4
48 0.35
49 0.34
50 0.36
51 0.34
52 0.35
53 0.35
54 0.41
55 0.42
56 0.47
57 0.52
58 0.57
59 0.62
60 0.68
61 0.69
62 0.67
63 0.73
64 0.76
65 0.79
66 0.78
67 0.78
68 0.79
69 0.79
70 0.81
71 0.8
72 0.79
73 0.78
74 0.77
75 0.77
76 0.75
77 0.73
78 0.69
79 0.66
80 0.64
81 0.6
82 0.58
83 0.51
84 0.47
85 0.41
86 0.38
87 0.33
88 0.29
89 0.25
90 0.2
91 0.18
92 0.16
93 0.15
94 0.13
95 0.12
96 0.1
97 0.08
98 0.06
99 0.05
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.05
105 0.06
106 0.08
107 0.1
108 0.11
109 0.11
110 0.12
111 0.13
112 0.14
113 0.15
114 0.14
115 0.12
116 0.12
117 0.14
118 0.15
119 0.16
120 0.16
121 0.22
122 0.25
123 0.3
124 0.37
125 0.4
126 0.43
127 0.5
128 0.55
129 0.52
130 0.51
131 0.48
132 0.41
133 0.36
134 0.31
135 0.24
136 0.16
137 0.12
138 0.09
139 0.1
140 0.11
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.12
145 0.15
146 0.21
147 0.26
148 0.27
149 0.34
150 0.38
151 0.37
152 0.45
153 0.51
154 0.48
155 0.47
156 0.46
157 0.43
158 0.41
159 0.44
160 0.38
161 0.34
162 0.31
163 0.31
164 0.29
165 0.31
166 0.32
167 0.31
168 0.28
169 0.31
170 0.36
171 0.4
172 0.43
173 0.42
174 0.41
175 0.37
176 0.38
177 0.33
178 0.27
179 0.19
180 0.17
181 0.17
182 0.21
183 0.21
184 0.2
185 0.27
186 0.31
187 0.33
188 0.34
189 0.34
190 0.39
191 0.48
192 0.55
193 0.52
194 0.51
195 0.51
196 0.51
197 0.5
198 0.44
199 0.36
200 0.3
201 0.27
202 0.3
203 0.3
204 0.29
205 0.27
206 0.29
207 0.38
208 0.42
209 0.43
210 0.4
211 0.37
212 0.39
213 0.41
214 0.41
215 0.36
216 0.36
217 0.35
218 0.36
219 0.41
220 0.42
221 0.46
222 0.44
223 0.46
224 0.44
225 0.5
226 0.51
227 0.54
228 0.55
229 0.57
230 0.6
231 0.59
232 0.56
233 0.5
234 0.47
235 0.43
236 0.4
237 0.33
238 0.27
239 0.22
240 0.21
241 0.2
242 0.18
243 0.15
244 0.13
245 0.13
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.12
251 0.14
252 0.14
253 0.15
254 0.15
255 0.15
256 0.14
257 0.15
258 0.17
259 0.17
260 0.19
261 0.17
262 0.2
263 0.23
264 0.24
265 0.25
266 0.29
267 0.32
268 0.33
269 0.41
270 0.44
271 0.42
272 0.42
273 0.41
274 0.38
275 0.34
276 0.31
277 0.22
278 0.17
279 0.18
280 0.2
281 0.18
282 0.15
283 0.13
284 0.12
285 0.13
286 0.13
287 0.15
288 0.15
289 0.15
290 0.16
291 0.17
292 0.18
293 0.18
294 0.17
295 0.15
296 0.16
297 0.19
298 0.22
299 0.23
300 0.22
301 0.23
302 0.24
303 0.26
304 0.27
305 0.25
306 0.22
307 0.23
308 0.24
309 0.25
310 0.24
311 0.2
312 0.16
313 0.18
314 0.19
315 0.23
316 0.21
317 0.19
318 0.2
319 0.23
320 0.23
321 0.22
322 0.23
323 0.21
324 0.26
325 0.28
326 0.28
327 0.32
328 0.36
329 0.35
330 0.34
331 0.3
332 0.26
333 0.25
334 0.26
335 0.2
336 0.17
337 0.18
338 0.18
339 0.22
340 0.2
341 0.19
342 0.16
343 0.16
344 0.15
345 0.12
346 0.13
347 0.12
348 0.16
349 0.17
350 0.19
351 0.19
352 0.21
353 0.24
354 0.31
355 0.29
356 0.25
357 0.28
358 0.31
359 0.29
360 0.26
361 0.25
362 0.18
363 0.16
364 0.16
365 0.14
366 0.1
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.13
371 0.15
372 0.17
373 0.17
374 0.17
375 0.19
376 0.23
377 0.28
378 0.32
379 0.36
380 0.38
381 0.42
382 0.5
383 0.53
384 0.54
385 0.51
386 0.46
387 0.41
388 0.37
389 0.33
390 0.24
391 0.18
392 0.14
393 0.12
394 0.12
395 0.11
396 0.1
397 0.09
398 0.09
399 0.1
400 0.1
401 0.14
402 0.19
403 0.2
404 0.2
405 0.23
406 0.24
407 0.23
408 0.24
409 0.19
410 0.15
411 0.14
412 0.15
413 0.11
414 0.1
415 0.1
416 0.07
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.09
422 0.11
423 0.11
424 0.11
425 0.14
426 0.16
427 0.17
428 0.18
429 0.19
430 0.23
431 0.26
432 0.26
433 0.26
434 0.32
435 0.31
436 0.32
437 0.31
438 0.28
439 0.25
440 0.3
441 0.27
442 0.18
443 0.18
444 0.16
445 0.14
446 0.12
447 0.11
448 0.09
449 0.09
450 0.1
451 0.1
452 0.09
453 0.08
454 0.08
455 0.07
456 0.05
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.07
461 0.07
462 0.06
463 0.07
464 0.08
465 0.08
466 0.09
467 0.11
468 0.15
469 0.17
470 0.19
471 0.19
472 0.23
473 0.23
474 0.21
475 0.2
476 0.15
477 0.14
478 0.12
479 0.12
480 0.08
481 0.08
482 0.08
483 0.08
484 0.08
485 0.08
486 0.09
487 0.1
488 0.1
489 0.11
490 0.12
491 0.12
492 0.11
493 0.11
494 0.12
495 0.11
496 0.1
497 0.09
498 0.07
499 0.09
500 0.11
501 0.1
502 0.09
503 0.1
504 0.11
505 0.15
506 0.17
507 0.16
508 0.16
509 0.16
510 0.16
511 0.16
512 0.17
513 0.14
514 0.18
515 0.2
516 0.2
517 0.2
518 0.21
519 0.22
520 0.26
521 0.28
522 0.25
523 0.27
524 0.3
525 0.35
526 0.41
527 0.44
528 0.43
529 0.49
530 0.55
531 0.58
532 0.58
533 0.54
534 0.52
535 0.47
536 0.47
537 0.4
538 0.32
539 0.28
540 0.25
541 0.3
542 0.3
543 0.32
544 0.31
545 0.37
546 0.42
547 0.4
548 0.45
549 0.43
550 0.4
551 0.4
552 0.38
553 0.31
554 0.26
555 0.24
556 0.2
557 0.17
558 0.15
559 0.13
560 0.12
561 0.11
562 0.13
563 0.12
564 0.11
565 0.1
566 0.1
567 0.11
568 0.11
569 0.15
570 0.18
571 0.21
572 0.2
573 0.2
574 0.21
575 0.22
576 0.21
577 0.17
578 0.12
579 0.09
580 0.08
581 0.07
582 0.06
583 0.05
584 0.05
585 0.06
586 0.07
587 0.07
588 0.07
589 0.07
590 0.09
591 0.1
592 0.11
593 0.11
594 0.16
595 0.2
596 0.23
597 0.28
598 0.28
599 0.29
600 0.32
601 0.39
602 0.4
603 0.38
604 0.38
605 0.34
606 0.35
607 0.33
608 0.29
609 0.21
610 0.13
611 0.12
612 0.09
613 0.08
614 0.05
615 0.04
616 0.04
617 0.05
618 0.05
619 0.04
620 0.04
621 0.04
622 0.05
623 0.07
624 0.06
625 0.06
626 0.06
627 0.07
628 0.07
629 0.07
630 0.07
631 0.07
632 0.07
633 0.1
634 0.1
635 0.09
636 0.09
637 0.09
638 0.09
639 0.09
640 0.08
641 0.06
642 0.06
643 0.06
644 0.06
645 0.05
646 0.07
647 0.07
648 0.08
649 0.09
650 0.11
651 0.11
652 0.16
653 0.17
654 0.15
655 0.16
656 0.16
657 0.2
658 0.18
659 0.19
660 0.16
661 0.17
662 0.19
663 0.22
664 0.23
665 0.19
666 0.22
667 0.29
668 0.29
669 0.28
670 0.25
671 0.22
672 0.21
673 0.24
674 0.22
675 0.17
676 0.18
677 0.2
678 0.2
679 0.18
680 0.2
681 0.16
682 0.18
683 0.16
684 0.15
685 0.14
686 0.15
687 0.17
688 0.17
689 0.19
690 0.19
691 0.29
692 0.37
693 0.4
694 0.41
695 0.43
696 0.48
697 0.51
698 0.5
699 0.44
700 0.37
701 0.34
702 0.32
703 0.29
704 0.22
705 0.15
706 0.17
707 0.14
708 0.12
709 0.13
710 0.13
711 0.13
712 0.14
713 0.18
714 0.23
715 0.22
716 0.25
717 0.26
718 0.31
719 0.33
720 0.34
721 0.32
722 0.24
723 0.24
724 0.22
725 0.2
726 0.17
727 0.16
728 0.17
729 0.17
730 0.17
731 0.18
732 0.17
733 0.16
734 0.13
735 0.14
736 0.12
737 0.15
738 0.14
739 0.12
740 0.12
741 0.13
742 0.14
743 0.13
744 0.12
745 0.09
746 0.1
747 0.11
748 0.11
749 0.11
750 0.13
751 0.12
752 0.12
753 0.11
754 0.11
755 0.1
756 0.11
757 0.11
758 0.09
759 0.1
760 0.11
761 0.11
762 0.11
763 0.11
764 0.11
765 0.09
766 0.08
767 0.06
768 0.05
769 0.05
770 0.04
771 0.03
772 0.02
773 0.02
774 0.02
775 0.02
776 0.02
777 0.02
778 0.02
779 0.02
780 0.03
781 0.03
782 0.03
783 0.03
784 0.05
785 0.06
786 0.07
787 0.07
788 0.14
789 0.17
790 0.2
791 0.21
792 0.21
793 0.23
794 0.23
795 0.23
796 0.19
797 0.24
798 0.22
799 0.24
800 0.25
801 0.22
802 0.22
803 0.23
804 0.22
805 0.18
806 0.19
807 0.17
808 0.19
809 0.18
810 0.18
811 0.18
812 0.19
813 0.15
814 0.14
815 0.13
816 0.1
817 0.1
818 0.12
819 0.12
820 0.1
821 0.09
822 0.1
823 0.1
824 0.12
825 0.14
826 0.11
827 0.12
828 0.13
829 0.2
830 0.22
831 0.23
832 0.24
833 0.26
834 0.32
835 0.33
836 0.36
837 0.38
838 0.43
839 0.43
840 0.42
841 0.39
842 0.35
843 0.33
844 0.31
845 0.23
846 0.16
847 0.15
848 0.13
849 0.14
850 0.13
851 0.12
852 0.11
853 0.14
854 0.14
855 0.16
856 0.18
857 0.18
858 0.24
859 0.24
860 0.26
861 0.24
862 0.27
863 0.26
864 0.28
865 0.31
866 0.25
867 0.27
868 0.26
869 0.26
870 0.25
871 0.25
872 0.22
873 0.19
874 0.2
875 0.21
876 0.25
877 0.26
878 0.27
879 0.29
880 0.33
881 0.35
882 0.41
883 0.41
884 0.41
885 0.38
886 0.41
887 0.39
888 0.38
889 0.35
890 0.34
891 0.32
892 0.31
893 0.3
894 0.23
895 0.2
896 0.17
897 0.16
898 0.1
899 0.08
900 0.06
901 0.07
902 0.07
903 0.07
904 0.07
905 0.09
906 0.1
907 0.1
908 0.1
909 0.09
910 0.09
911 0.1
912 0.11
913 0.1
914 0.09
915 0.09
916 0.07
917 0.07
918 0.07
919 0.06
920 0.04
921 0.05
922 0.05
923 0.04
924 0.04
925 0.04
926 0.05
927 0.05
928 0.05
929 0.04
930 0.06
931 0.09
932 0.14
933 0.17
934 0.22
935 0.28
936 0.35
937 0.42
938 0.45
939 0.51
940 0.53
941 0.54
942 0.58
943 0.59
944 0.56
945 0.53
946 0.49
947 0.4
948 0.33
949 0.3
950 0.21
951 0.16
952 0.13
953 0.09
954 0.11
955 0.12
956 0.12
957 0.13
958 0.12
959 0.1
960 0.1
961 0.1
962 0.07
963 0.06
964 0.07
965 0.07
966 0.1
967 0.1
968 0.1
969 0.09
970 0.09
971 0.1
972 0.1
973 0.11
974 0.09
975 0.09
976 0.09
977 0.1
978 0.1
979 0.15
980 0.21
981 0.24
982 0.28
983 0.29
984 0.35
985 0.39
986 0.48
987 0.53
988 0.52
989 0.56
990 0.53
991 0.58
992 0.58
993 0.55
994 0.46
995 0.41
996 0.35
997 0.3
998 0.33
999 0.27
1000 0.22
1001 0.21
1002 0.2
1003 0.17
1004 0.17
1005 0.15
1006 0.11
1007 0.14
1008 0.14
1009 0.14
1010 0.18
1011 0.18
1012 0.19
1013 0.19
1014 0.2
1015 0.18
1016 0.19
1017 0.22
1018 0.2
1019 0.24
1020 0.27
1021 0.29
1022 0.37
1023 0.41
1024 0.46
1025 0.52
1026 0.61
1027 0.66
1028 0.68
1029 0.7
1030 0.7
1031 0.73
1032 0.72
1033 0.68
1034 0.64
1035 0.56
1036 0.58
1037 0.58
1038 0.51
1039 0.49
1040 0.47
1041 0.48
1042 0.48
1043 0.48
1044 0.47
1045 0.47
1046 0.52
1047 0.55
1048 0.62
1049 0.66
1050 0.69
1051 0.78
1052 0.8
1053 0.84
1054 0.82
1055 0.81
1056 0.79
1057 0.74
1058 0.72
1059 0.65
1060 0.55
1061 0.48
1062 0.43
1063 0.33
1064 0.25
1065 0.19
1066 0.1
1067 0.06
1068 0.05
1069 0.05
1070 0.04
1071 0.04
1072 0.04
1073 0.04
1074 0.04
1075 0.04
1076 0.05
1077 0.05
1078 0.06
1079 0.06
1080 0.06
1081 0.08
1082 0.09
1083 0.08
1084 0.08
1085 0.1
1086 0.1
1087 0.1
1088 0.1
1089 0.09
1090 0.08
1091 0.07
1092 0.07
1093 0.05
1094 0.05
1095 0.04
1096 0.04
1097 0.04
1098 0.04
1099 0.04
1100 0.04
1101 0.04
1102 0.04
1103 0.05
1104 0.07
1105 0.08
1106 0.08
1107 0.08
1108 0.09
1109 0.1
1110 0.13
1111 0.14
1112 0.12
1113 0.12
1114 0.12
1115 0.13
1116 0.13
1117 0.13
1118 0.11
1119 0.1
1120 0.1
1121 0.1
1122 0.12
1123 0.12
1124 0.11