Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C5W8

Protein Details
Accession A0A5M6C5W8    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
323-363KDKPAAEKPKKPRRPAKPKGDGEKKPRTKKPKEPKEKESGDBasic
584-619GDEAHRKKARPLKLPGEKRKPGPQKGWKLNRETNGLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
277-359TEKRSVSPVKEDKKAKAKDGARRSASPAKKGKEEKKEDVTKAESTDKDKPAAEKPKKPRRPAKPKGDGEKKPRTKKPKEPKEK
586-652EAHRKKARPLKLPGEKRKPGPQKGWKLNRETNGLQSRRPVIRDPNAPKRKYVRKVGAGAGAGGGAKK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
Amino Acid Sequences MSFNPNNVNQQGIYGQARPNNLPSNVVANGSPNPSTPSPMMGVRPPLSTYNSATAPGTPTPNRPHQFNPAQLAQLTDFHQRQQAALAAQVQRAQAQGIARPNIQAMQLAMQQRMQSQQTQQQQAAFQQILQASSTQSITPQQLQAMAQHVTPQQLQQLQAVKQFMTPQQMQSSSSGITPQQLQAPAQSITPQQLQQLASSSPQIRPSPSLNQQRPISQSALNPALLAATHVATSTVTPPPSNTVRPPVPVTQAFAPTPESIPRQVSPEKTETKPKVTEKRSVSPVKEDKKAKAKDGARRSASPAKKGKEEKKEDVTKAESTDKDKPAAEKPKKPRRPAKPKGDGEKKPRTKKPKEPKEKESGDTTPTVFFTAPETASKDAPTANDNGEPADKSVQSDAEKGSKVAEVKLADSVVKAAPAPPVTVPTSHPVESRRRKEELMRGTMRNEIARLMYGAGDVAEPDVDTVDYMEDMVVEFLADLCRPSPPIRPTPTSQRQPIPMSFDVLRHRLSSSPAMGKYLERFDRMVYMSEALKSAKNIANPTPHELIASVGADFLELDDDGKPTAGGGGGGGQRTKRSAGQDGGDEAHRKKARPLKLPGEKRKPGPQKGWKLNRETNGLQSRRPVIRDPNAPKRKYVRKVGAGAGAGGGAKKEM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.27
3 0.28
4 0.32
5 0.32
6 0.38
7 0.4
8 0.38
9 0.37
10 0.34
11 0.36
12 0.33
13 0.32
14 0.26
15 0.22
16 0.24
17 0.25
18 0.24
19 0.19
20 0.24
21 0.23
22 0.27
23 0.25
24 0.25
25 0.25
26 0.27
27 0.29
28 0.28
29 0.34
30 0.32
31 0.33
32 0.32
33 0.32
34 0.34
35 0.34
36 0.33
37 0.31
38 0.3
39 0.3
40 0.28
41 0.26
42 0.26
43 0.25
44 0.28
45 0.26
46 0.32
47 0.38
48 0.48
49 0.49
50 0.5
51 0.52
52 0.56
53 0.61
54 0.6
55 0.6
56 0.53
57 0.52
58 0.47
59 0.45
60 0.36
61 0.31
62 0.27
63 0.29
64 0.26
65 0.26
66 0.3
67 0.28
68 0.26
69 0.26
70 0.27
71 0.2
72 0.21
73 0.26
74 0.23
75 0.24
76 0.27
77 0.24
78 0.22
79 0.21
80 0.19
81 0.16
82 0.15
83 0.19
84 0.22
85 0.25
86 0.25
87 0.25
88 0.25
89 0.24
90 0.23
91 0.19
92 0.14
93 0.14
94 0.18
95 0.2
96 0.2
97 0.2
98 0.2
99 0.21
100 0.25
101 0.24
102 0.23
103 0.26
104 0.33
105 0.4
106 0.44
107 0.44
108 0.42
109 0.42
110 0.4
111 0.41
112 0.32
113 0.24
114 0.23
115 0.22
116 0.2
117 0.18
118 0.17
119 0.12
120 0.14
121 0.14
122 0.1
123 0.11
124 0.14
125 0.16
126 0.18
127 0.19
128 0.18
129 0.19
130 0.2
131 0.2
132 0.21
133 0.18
134 0.15
135 0.18
136 0.18
137 0.19
138 0.19
139 0.18
140 0.19
141 0.21
142 0.22
143 0.22
144 0.27
145 0.27
146 0.3
147 0.3
148 0.26
149 0.24
150 0.27
151 0.25
152 0.26
153 0.25
154 0.24
155 0.27
156 0.28
157 0.28
158 0.27
159 0.26
160 0.2
161 0.18
162 0.17
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.16
168 0.17
169 0.17
170 0.16
171 0.19
172 0.18
173 0.16
174 0.17
175 0.14
176 0.16
177 0.18
178 0.17
179 0.16
180 0.19
181 0.19
182 0.18
183 0.2
184 0.17
185 0.16
186 0.19
187 0.2
188 0.18
189 0.23
190 0.23
191 0.23
192 0.25
193 0.28
194 0.32
195 0.39
196 0.48
197 0.46
198 0.52
199 0.52
200 0.53
201 0.52
202 0.48
203 0.41
204 0.33
205 0.31
206 0.29
207 0.3
208 0.25
209 0.21
210 0.18
211 0.15
212 0.12
213 0.12
214 0.07
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.08
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.16
227 0.19
228 0.21
229 0.21
230 0.25
231 0.26
232 0.29
233 0.32
234 0.3
235 0.31
236 0.29
237 0.3
238 0.25
239 0.26
240 0.24
241 0.21
242 0.21
243 0.16
244 0.17
245 0.17
246 0.16
247 0.15
248 0.18
249 0.18
250 0.2
251 0.23
252 0.25
253 0.26
254 0.31
255 0.34
256 0.34
257 0.42
258 0.41
259 0.43
260 0.47
261 0.5
262 0.53
263 0.52
264 0.58
265 0.55
266 0.58
267 0.61
268 0.6
269 0.54
270 0.53
271 0.58
272 0.54
273 0.56
274 0.53
275 0.5
276 0.55
277 0.56
278 0.5
279 0.5
280 0.51
281 0.52
282 0.58
283 0.6
284 0.54
285 0.52
286 0.55
287 0.56
288 0.52
289 0.52
290 0.5
291 0.44
292 0.48
293 0.55
294 0.57
295 0.59
296 0.64
297 0.61
298 0.63
299 0.67
300 0.61
301 0.57
302 0.52
303 0.42
304 0.37
305 0.36
306 0.28
307 0.26
308 0.32
309 0.3
310 0.29
311 0.28
312 0.28
313 0.32
314 0.41
315 0.43
316 0.45
317 0.54
318 0.63
319 0.7
320 0.77
321 0.79
322 0.79
323 0.84
324 0.85
325 0.86
326 0.85
327 0.84
328 0.85
329 0.86
330 0.82
331 0.8
332 0.8
333 0.79
334 0.77
335 0.78
336 0.78
337 0.77
338 0.81
339 0.83
340 0.83
341 0.86
342 0.85
343 0.84
344 0.84
345 0.79
346 0.7
347 0.64
348 0.55
349 0.46
350 0.39
351 0.33
352 0.23
353 0.19
354 0.18
355 0.13
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.11
361 0.13
362 0.14
363 0.14
364 0.14
365 0.12
366 0.11
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.12
371 0.12
372 0.12
373 0.12
374 0.12
375 0.12
376 0.11
377 0.12
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.13
382 0.13
383 0.15
384 0.15
385 0.17
386 0.17
387 0.16
388 0.16
389 0.16
390 0.15
391 0.14
392 0.16
393 0.13
394 0.14
395 0.15
396 0.14
397 0.12
398 0.11
399 0.12
400 0.08
401 0.08
402 0.07
403 0.07
404 0.09
405 0.1
406 0.11
407 0.09
408 0.12
409 0.13
410 0.14
411 0.15
412 0.17
413 0.2
414 0.2
415 0.22
416 0.24
417 0.33
418 0.42
419 0.48
420 0.5
421 0.49
422 0.51
423 0.56
424 0.6
425 0.58
426 0.57
427 0.55
428 0.51
429 0.49
430 0.5
431 0.45
432 0.37
433 0.28
434 0.2
435 0.16
436 0.14
437 0.13
438 0.1
439 0.08
440 0.07
441 0.07
442 0.06
443 0.05
444 0.05
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.03
464 0.04
465 0.04
466 0.05
467 0.05
468 0.06
469 0.09
470 0.11
471 0.19
472 0.24
473 0.32
474 0.38
475 0.43
476 0.47
477 0.55
478 0.64
479 0.63
480 0.64
481 0.6
482 0.6
483 0.6
484 0.58
485 0.55
486 0.46
487 0.42
488 0.37
489 0.37
490 0.35
491 0.33
492 0.32
493 0.26
494 0.26
495 0.24
496 0.26
497 0.26
498 0.26
499 0.29
500 0.29
501 0.29
502 0.29
503 0.29
504 0.29
505 0.33
506 0.3
507 0.26
508 0.26
509 0.25
510 0.29
511 0.29
512 0.27
513 0.21
514 0.2
515 0.19
516 0.19
517 0.2
518 0.16
519 0.16
520 0.15
521 0.19
522 0.2
523 0.23
524 0.26
525 0.29
526 0.36
527 0.37
528 0.43
529 0.4
530 0.37
531 0.34
532 0.3
533 0.26
534 0.2
535 0.18
536 0.12
537 0.09
538 0.09
539 0.08
540 0.08
541 0.07
542 0.05
543 0.05
544 0.06
545 0.06
546 0.07
547 0.07
548 0.08
549 0.07
550 0.06
551 0.07
552 0.06
553 0.05
554 0.05
555 0.1
556 0.12
557 0.13
558 0.15
559 0.16
560 0.17
561 0.19
562 0.22
563 0.22
564 0.25
565 0.3
566 0.33
567 0.35
568 0.36
569 0.37
570 0.37
571 0.36
572 0.35
573 0.3
574 0.35
575 0.36
576 0.34
577 0.4
578 0.47
579 0.52
580 0.57
581 0.66
582 0.67
583 0.74
584 0.84
585 0.86
586 0.88
587 0.86
588 0.83
589 0.84
590 0.84
591 0.82
592 0.82
593 0.82
594 0.82
595 0.86
596 0.9
597 0.87
598 0.86
599 0.85
600 0.8
601 0.77
602 0.69
603 0.68
604 0.67
605 0.62
606 0.55
607 0.54
608 0.55
609 0.53
610 0.54
611 0.5
612 0.5
613 0.56
614 0.64
615 0.67
616 0.71
617 0.76
618 0.74
619 0.75
620 0.75
621 0.77
622 0.76
623 0.77
624 0.76
625 0.75
626 0.79
627 0.76
628 0.73
629 0.63
630 0.54
631 0.43
632 0.33
633 0.25
634 0.19