Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VR83

Protein Details
Accession H1VR83    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-80RRNAREEAKKKQRLKPKPLAARERHRRGLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-79NARNARRNAREEAKKKQRLKPKPLAARERHRRG
Subcellular Location(s) mito 11, cyto_nucl 8, nucl 7.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016848  RNase_P/MRP_Rpp29-subunit  
IPR036980  RNase_P/MRP_Rpp29_sf  
IPR023534  Rof/RNase_P-like  
IPR002730  Rpp29/RNP1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0030677  C:ribonuclease P complex  
GO:0033204  F:ribonuclease P RNA binding  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:1905267  P:endonucleolytic cleavage involved in tRNA processing  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
KEGG chig:CH63R_05034  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01868  RNase_P-MRP_p29  
Amino Acid Sequences MAPSSQPVTQALLARAHSPESVNRIFSDKIQYRPLYLRPSSPPPPSNARNARRNAREEAKKKQRLKPKPLAARERHRRGLYDVPRRGQKYAIFEPLHRLWLGYVEEILGSELYHGGAAAAAKLSAAEFHGARVEVSRSSCPSRVGITGIVIKDGKFAFEIITPKNEIKVVPKEGTWFKFEIPVKEPVADPQATTEASPRRFVFEVLGDQFLTRGADRANKKFKHHYLKNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.25
4 0.23
5 0.21
6 0.22
7 0.25
8 0.27
9 0.26
10 0.26
11 0.29
12 0.28
13 0.29
14 0.35
15 0.33
16 0.35
17 0.42
18 0.41
19 0.41
20 0.45
21 0.49
22 0.47
23 0.43
24 0.44
25 0.42
26 0.49
27 0.52
28 0.54
29 0.51
30 0.48
31 0.54
32 0.52
33 0.57
34 0.59
35 0.6
36 0.61
37 0.66
38 0.7
39 0.69
40 0.7
41 0.67
42 0.67
43 0.69
44 0.67
45 0.7
46 0.72
47 0.75
48 0.78
49 0.78
50 0.79
51 0.8
52 0.84
53 0.83
54 0.82
55 0.83
56 0.84
57 0.86
58 0.84
59 0.84
60 0.85
61 0.82
62 0.79
63 0.71
64 0.64
65 0.59
66 0.6
67 0.59
68 0.59
69 0.56
70 0.53
71 0.58
72 0.58
73 0.54
74 0.47
75 0.41
76 0.38
77 0.37
78 0.41
79 0.35
80 0.33
81 0.39
82 0.36
83 0.34
84 0.26
85 0.22
86 0.14
87 0.16
88 0.16
89 0.1
90 0.09
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.04
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.03
106 0.03
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.03
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.06
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.08
121 0.08
122 0.1
123 0.12
124 0.14
125 0.17
126 0.19
127 0.19
128 0.19
129 0.19
130 0.18
131 0.18
132 0.16
133 0.15
134 0.17
135 0.15
136 0.16
137 0.14
138 0.13
139 0.14
140 0.14
141 0.12
142 0.09
143 0.1
144 0.09
145 0.12
146 0.15
147 0.14
148 0.17
149 0.18
150 0.18
151 0.19
152 0.19
153 0.17
154 0.2
155 0.26
156 0.29
157 0.28
158 0.28
159 0.32
160 0.37
161 0.39
162 0.35
163 0.3
164 0.25
165 0.32
166 0.34
167 0.33
168 0.31
169 0.34
170 0.33
171 0.33
172 0.32
173 0.28
174 0.3
175 0.26
176 0.22
177 0.19
178 0.2
179 0.19
180 0.19
181 0.22
182 0.24
183 0.26
184 0.31
185 0.29
186 0.31
187 0.32
188 0.32
189 0.29
190 0.26
191 0.31
192 0.28
193 0.29
194 0.25
195 0.24
196 0.23
197 0.2
198 0.18
199 0.12
200 0.11
201 0.12
202 0.2
203 0.28
204 0.38
205 0.47
206 0.5
207 0.57
208 0.66
209 0.73
210 0.77