Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6BUM3

Protein Details
Accession A0A5M6BUM3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
389-411RSSRYDDRDRRDRDRYRDRDGERBasic
415-440RDGHRDRERRYESKERSRSPPKRRVVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
346-439RRGSSERERERGSGYRERERESGRGDRDRERDGRHRSERDDRDRSSRYDDRDRRDRDRYRDRDGERERDRDGHRDRERRYESKERSRSPPKRRV
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004882  Luc7-rel  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006376  P:mRNA splice site selection  
Pfam View protein in Pfam  
PF03194  LUC7  
Amino Acid Sequences MGRMAEAQRRLLEQMMGPEAMGIQPVQLDWWNEKVCRNFLFGTCPHLIFGNTKMDLGPCPKVHSDRILTQFREHATLHPNEPRVMAYRQEHENNIYGIVDDVDRRIRASQRKLEKTPEENRKTVDLMREIGEIELSIQGGTEEIEALGEAGKIDESMEKLAAVDALKQLKTDKEKELTHLNENAGASGHQKLRVCETCGAMLSVLDSDKRLADHFGGKLHLGYHELRKLLAMFAEARMTGRPWPIVPPKGDEQAPPAVGAGGATPTPAAPTGPANPSPAPAPAIAPPSAPAGPRSTLAPPPPPPGGNVPHTPHHSKVPPADEMPLVGHGDKVKREAGELVDDLRERRGSSERERERGSGYRERERESGRGDRDRERDGRHRSERDDRDRSSRYDDRDRRDRDRYRDRDGERERDRDGHRDRERRYESKERSRSPPKRRVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.24
4 0.21
5 0.19
6 0.18
7 0.15
8 0.14
9 0.09
10 0.06
11 0.06
12 0.06
13 0.08
14 0.11
15 0.13
16 0.15
17 0.22
18 0.26
19 0.28
20 0.34
21 0.37
22 0.4
23 0.39
24 0.41
25 0.37
26 0.35
27 0.4
28 0.35
29 0.37
30 0.35
31 0.33
32 0.29
33 0.27
34 0.27
35 0.22
36 0.25
37 0.25
38 0.23
39 0.23
40 0.23
41 0.23
42 0.25
43 0.28
44 0.31
45 0.24
46 0.28
47 0.32
48 0.36
49 0.38
50 0.42
51 0.43
52 0.44
53 0.51
54 0.53
55 0.51
56 0.5
57 0.5
58 0.45
59 0.43
60 0.36
61 0.32
62 0.32
63 0.33
64 0.36
65 0.37
66 0.38
67 0.35
68 0.35
69 0.33
70 0.3
71 0.29
72 0.3
73 0.28
74 0.31
75 0.36
76 0.39
77 0.39
78 0.37
79 0.38
80 0.32
81 0.29
82 0.24
83 0.17
84 0.14
85 0.13
86 0.1
87 0.08
88 0.09
89 0.12
90 0.12
91 0.13
92 0.17
93 0.23
94 0.31
95 0.4
96 0.47
97 0.54
98 0.62
99 0.65
100 0.7
101 0.7
102 0.7
103 0.71
104 0.73
105 0.68
106 0.62
107 0.61
108 0.55
109 0.5
110 0.45
111 0.4
112 0.32
113 0.28
114 0.27
115 0.25
116 0.22
117 0.2
118 0.16
119 0.11
120 0.09
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.05
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.1
152 0.13
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.18
157 0.23
158 0.26
159 0.27
160 0.31
161 0.32
162 0.34
163 0.41
164 0.39
165 0.38
166 0.37
167 0.32
168 0.28
169 0.27
170 0.25
171 0.17
172 0.14
173 0.12
174 0.12
175 0.13
176 0.14
177 0.16
178 0.16
179 0.22
180 0.25
181 0.27
182 0.25
183 0.25
184 0.23
185 0.22
186 0.21
187 0.15
188 0.12
189 0.09
190 0.07
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.11
201 0.12
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.12
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.11
210 0.13
211 0.15
212 0.15
213 0.15
214 0.15
215 0.15
216 0.12
217 0.11
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.09
230 0.16
231 0.21
232 0.25
233 0.25
234 0.27
235 0.29
236 0.32
237 0.32
238 0.27
239 0.24
240 0.23
241 0.22
242 0.18
243 0.16
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.07
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.07
258 0.1
259 0.13
260 0.14
261 0.17
262 0.17
263 0.18
264 0.18
265 0.17
266 0.15
267 0.13
268 0.13
269 0.12
270 0.15
271 0.14
272 0.14
273 0.14
274 0.15
275 0.16
276 0.15
277 0.14
278 0.14
279 0.15
280 0.15
281 0.17
282 0.17
283 0.2
284 0.23
285 0.27
286 0.27
287 0.31
288 0.33
289 0.31
290 0.3
291 0.31
292 0.32
293 0.31
294 0.34
295 0.33
296 0.36
297 0.41
298 0.42
299 0.39
300 0.41
301 0.4
302 0.38
303 0.4
304 0.39
305 0.37
306 0.35
307 0.35
308 0.28
309 0.26
310 0.23
311 0.19
312 0.16
313 0.12
314 0.13
315 0.13
316 0.17
317 0.17
318 0.19
319 0.2
320 0.19
321 0.2
322 0.21
323 0.2
324 0.21
325 0.2
326 0.19
327 0.19
328 0.19
329 0.19
330 0.19
331 0.19
332 0.15
333 0.18
334 0.22
335 0.26
336 0.35
337 0.45
338 0.49
339 0.54
340 0.57
341 0.55
342 0.54
343 0.55
344 0.53
345 0.51
346 0.5
347 0.54
348 0.54
349 0.57
350 0.57
351 0.55
352 0.53
353 0.51
354 0.53
355 0.52
356 0.56
357 0.56
358 0.58
359 0.59
360 0.61
361 0.61
362 0.6
363 0.61
364 0.63
365 0.69
366 0.7
367 0.72
368 0.71
369 0.76
370 0.78
371 0.79
372 0.79
373 0.73
374 0.73
375 0.71
376 0.67
377 0.66
378 0.62
379 0.59
380 0.62
381 0.66
382 0.66
383 0.71
384 0.75
385 0.74
386 0.78
387 0.8
388 0.79
389 0.82
390 0.8
391 0.79
392 0.81
393 0.77
394 0.78
395 0.77
396 0.77
397 0.73
398 0.71
399 0.65
400 0.64
401 0.64
402 0.63
403 0.62
404 0.62
405 0.65
406 0.69
407 0.7
408 0.72
409 0.77
410 0.74
411 0.76
412 0.76
413 0.76
414 0.78
415 0.84
416 0.8
417 0.81
418 0.86
419 0.87
420 0.87