Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C8K4

Protein Details
Accession A0A5M6C8K4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
115-136VRGPSPPPPVRRPPPHHQDLKPBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11.5, mito 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR002156  RNaseH_domain  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0004523  F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50879  RNASE_H_1  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSHFPPFPPSQSGRYSPNRAYGDRPPYPPQQVPPPREYMPYPPYPPAVPPPPPSSYRPYDNYPPYPYEQPRAPYEDHYDPYQPAAKAYNAPAPPVRMPPNPYPPPHITAPPPRPVRGPSPPPPVRRPPPHHQDLKPTFGPGDLSVMTAPTTINISGYTSAVHTLPPSHLPITKYVSINRDDAIDLHRHLCSSRSSVWYADGSSRAGEAWCAAVEWKMDSGRSGSKMRGVILEGDALEAELGGLYKAAEGFKELLQQSIKDAEPISHELTVFCDSQAAIIALDTSSRPEALKFDQLWREICSEFLHAHMTLVWIPKDGNIEGQVLADRIATVAASNSYLKRRKERTLPELYSRPGSGDPAPSASSEPGPWQRGDADPSRHKAHFERPKPRPISPILQDPQSSNGLKLDLAPASDPVDGEDEGIQPREGAVFVTHFPLEASAKDIGILFAQYGEIVAVDIFHISPAHPRFANVTFSDPASGLAAIQDLHRRPIRLDTPFAQENQADLEIWKNWAGQLTVVQHEPPRIVPSSVEADFPDLPDWARGNKDARKSEEEETMEVEGQIKEEPSATPESISRKRERERKPNAATPMNGGTGASTPVSSVNSPSPRKRLRTDITTDNVATHNVSPQDTQAANAANVADLVSHAQPEVSKEDVTQSAPISQDHRSDSVDATFLSRGTPPVALPPFPPTIKTDGAGKTTPQSLPAALPDAQGRQSTQSTTHTNVSALPPTPLTAERPAGVNAPPRSPPRQPSLEAGSQSSKPAITNSASEPQEYPIKISAKTLKAHINLTRNSLVKHDLSNWIAHTCLIAHDIDHARRALQADLYATDECFITGRDLERALASRGFTAPRVDAFISKVLKVLDGIAAAEEPEADQQASDEDVERLEKELEEVLQPYPDQTKEAMSSAAKVMEYLVRGKELQEKKRLEVERRVKVLEGMVKIGEVVGGVVRYLLTEAT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.6
3 0.56
4 0.61
5 0.61
6 0.56
7 0.58
8 0.59
9 0.6
10 0.59
11 0.61
12 0.57
13 0.6
14 0.65
15 0.64
16 0.6
17 0.61
18 0.65
19 0.66
20 0.65
21 0.63
22 0.58
23 0.57
24 0.55
25 0.53
26 0.51
27 0.52
28 0.51
29 0.48
30 0.48
31 0.46
32 0.46
33 0.46
34 0.46
35 0.45
36 0.46
37 0.48
38 0.5
39 0.53
40 0.54
41 0.53
42 0.52
43 0.53
44 0.52
45 0.53
46 0.58
47 0.63
48 0.64
49 0.62
50 0.6
51 0.58
52 0.62
53 0.59
54 0.56
55 0.53
56 0.51
57 0.51
58 0.52
59 0.49
60 0.45
61 0.48
62 0.49
63 0.46
64 0.45
65 0.43
66 0.38
67 0.4
68 0.41
69 0.33
70 0.28
71 0.29
72 0.27
73 0.28
74 0.31
75 0.35
76 0.29
77 0.33
78 0.33
79 0.35
80 0.35
81 0.38
82 0.41
83 0.38
84 0.44
85 0.49
86 0.57
87 0.59
88 0.59
89 0.6
90 0.58
91 0.58
92 0.56
93 0.52
94 0.49
95 0.52
96 0.56
97 0.58
98 0.58
99 0.55
100 0.55
101 0.55
102 0.56
103 0.56
104 0.57
105 0.57
106 0.63
107 0.69
108 0.72
109 0.76
110 0.77
111 0.77
112 0.79
113 0.79
114 0.78
115 0.8
116 0.83
117 0.84
118 0.78
119 0.79
120 0.75
121 0.74
122 0.65
123 0.56
124 0.47
125 0.38
126 0.36
127 0.25
128 0.23
129 0.16
130 0.15
131 0.14
132 0.14
133 0.13
134 0.11
135 0.11
136 0.07
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.09
146 0.11
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.1
151 0.12
152 0.15
153 0.18
154 0.18
155 0.22
156 0.23
157 0.27
158 0.31
159 0.34
160 0.34
161 0.36
162 0.38
163 0.37
164 0.37
165 0.33
166 0.28
167 0.23
168 0.21
169 0.2
170 0.19
171 0.18
172 0.19
173 0.19
174 0.18
175 0.18
176 0.19
177 0.19
178 0.2
179 0.24
180 0.25
181 0.27
182 0.27
183 0.29
184 0.28
185 0.27
186 0.24
187 0.21
188 0.18
189 0.16
190 0.15
191 0.13
192 0.12
193 0.1
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.11
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.14
207 0.17
208 0.21
209 0.22
210 0.21
211 0.25
212 0.27
213 0.27
214 0.25
215 0.23
216 0.2
217 0.19
218 0.19
219 0.14
220 0.12
221 0.11
222 0.09
223 0.08
224 0.05
225 0.04
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.07
236 0.09
237 0.09
238 0.16
239 0.16
240 0.18
241 0.19
242 0.19
243 0.19
244 0.21
245 0.21
246 0.16
247 0.16
248 0.14
249 0.16
250 0.2
251 0.2
252 0.17
253 0.17
254 0.16
255 0.18
256 0.2
257 0.16
258 0.13
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.11
263 0.09
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.11
276 0.14
277 0.21
278 0.21
279 0.26
280 0.3
281 0.32
282 0.33
283 0.32
284 0.32
285 0.25
286 0.24
287 0.2
288 0.17
289 0.15
290 0.15
291 0.15
292 0.12
293 0.12
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.14
298 0.13
299 0.11
300 0.11
301 0.13
302 0.15
303 0.14
304 0.13
305 0.12
306 0.13
307 0.13
308 0.13
309 0.12
310 0.09
311 0.09
312 0.08
313 0.06
314 0.05
315 0.05
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.06
321 0.07
322 0.09
323 0.17
324 0.24
325 0.27
326 0.36
327 0.41
328 0.47
329 0.55
330 0.61
331 0.63
332 0.67
333 0.67
334 0.65
335 0.63
336 0.58
337 0.51
338 0.42
339 0.35
340 0.25
341 0.23
342 0.19
343 0.16
344 0.15
345 0.15
346 0.16
347 0.15
348 0.15
349 0.14
350 0.13
351 0.11
352 0.14
353 0.17
354 0.19
355 0.18
356 0.18
357 0.19
358 0.2
359 0.23
360 0.24
361 0.27
362 0.3
363 0.34
364 0.38
365 0.37
366 0.38
367 0.37
368 0.42
369 0.45
370 0.49
371 0.55
372 0.56
373 0.66
374 0.68
375 0.66
376 0.61
377 0.55
378 0.53
379 0.46
380 0.5
381 0.42
382 0.4
383 0.39
384 0.34
385 0.33
386 0.29
387 0.26
388 0.17
389 0.16
390 0.14
391 0.14
392 0.13
393 0.12
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.07
402 0.09
403 0.09
404 0.09
405 0.09
406 0.08
407 0.08
408 0.09
409 0.08
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.08
419 0.08
420 0.07
421 0.07
422 0.08
423 0.08
424 0.07
425 0.09
426 0.08
427 0.08
428 0.09
429 0.09
430 0.08
431 0.07
432 0.07
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.02
442 0.02
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.09
450 0.1
451 0.13
452 0.12
453 0.13
454 0.16
455 0.18
456 0.21
457 0.17
458 0.19
459 0.17
460 0.17
461 0.17
462 0.14
463 0.13
464 0.1
465 0.09
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.09
472 0.09
473 0.13
474 0.14
475 0.15
476 0.15
477 0.21
478 0.25
479 0.24
480 0.27
481 0.26
482 0.3
483 0.31
484 0.31
485 0.26
486 0.21
487 0.19
488 0.17
489 0.14
490 0.09
491 0.08
492 0.08
493 0.07
494 0.08
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.08
499 0.08
500 0.07
501 0.1
502 0.11
503 0.12
504 0.12
505 0.13
506 0.12
507 0.13
508 0.13
509 0.11
510 0.12
511 0.11
512 0.11
513 0.11
514 0.12
515 0.16
516 0.16
517 0.16
518 0.13
519 0.15
520 0.14
521 0.15
522 0.13
523 0.09
524 0.08
525 0.1
526 0.1
527 0.09
528 0.1
529 0.12
530 0.17
531 0.21
532 0.29
533 0.32
534 0.36
535 0.4
536 0.42
537 0.42
538 0.43
539 0.4
540 0.33
541 0.3
542 0.26
543 0.21
544 0.17
545 0.16
546 0.1
547 0.09
548 0.09
549 0.07
550 0.06
551 0.07
552 0.07
553 0.08
554 0.11
555 0.1
556 0.1
557 0.13
558 0.2
559 0.26
560 0.31
561 0.34
562 0.39
563 0.46
564 0.56
565 0.63
566 0.67
567 0.7
568 0.75
569 0.77
570 0.76
571 0.75
572 0.69
573 0.6
574 0.52
575 0.45
576 0.34
577 0.28
578 0.21
579 0.15
580 0.11
581 0.12
582 0.08
583 0.06
584 0.06
585 0.07
586 0.08
587 0.08
588 0.09
589 0.14
590 0.21
591 0.26
592 0.3
593 0.38
594 0.43
595 0.48
596 0.51
597 0.54
598 0.53
599 0.55
600 0.57
601 0.55
602 0.52
603 0.5
604 0.46
605 0.37
606 0.32
607 0.25
608 0.21
609 0.14
610 0.14
611 0.12
612 0.13
613 0.12
614 0.12
615 0.16
616 0.14
617 0.15
618 0.14
619 0.14
620 0.13
621 0.13
622 0.13
623 0.08
624 0.08
625 0.08
626 0.05
627 0.04
628 0.06
629 0.05
630 0.06
631 0.06
632 0.06
633 0.06
634 0.09
635 0.12
636 0.11
637 0.11
638 0.11
639 0.14
640 0.16
641 0.16
642 0.16
643 0.13
644 0.14
645 0.15
646 0.16
647 0.16
648 0.16
649 0.19
650 0.2
651 0.21
652 0.2
653 0.2
654 0.2
655 0.19
656 0.17
657 0.14
658 0.14
659 0.12
660 0.11
661 0.11
662 0.1
663 0.1
664 0.11
665 0.11
666 0.09
667 0.16
668 0.18
669 0.18
670 0.18
671 0.22
672 0.25
673 0.24
674 0.26
675 0.21
676 0.24
677 0.24
678 0.24
679 0.26
680 0.24
681 0.28
682 0.27
683 0.26
684 0.23
685 0.26
686 0.25
687 0.21
688 0.19
689 0.16
690 0.16
691 0.17
692 0.18
693 0.15
694 0.16
695 0.15
696 0.16
697 0.17
698 0.17
699 0.16
700 0.16
701 0.17
702 0.18
703 0.19
704 0.22
705 0.24
706 0.27
707 0.29
708 0.26
709 0.25
710 0.26
711 0.26
712 0.24
713 0.21
714 0.18
715 0.16
716 0.16
717 0.17
718 0.16
719 0.18
720 0.18
721 0.19
722 0.18
723 0.2
724 0.2
725 0.2
726 0.21
727 0.26
728 0.24
729 0.26
730 0.3
731 0.33
732 0.38
733 0.42
734 0.44
735 0.44
736 0.48
737 0.47
738 0.48
739 0.5
740 0.49
741 0.45
742 0.43
743 0.39
744 0.34
745 0.33
746 0.28
747 0.21
748 0.17
749 0.17
750 0.17
751 0.15
752 0.17
753 0.2
754 0.27
755 0.27
756 0.28
757 0.27
758 0.26
759 0.31
760 0.28
761 0.27
762 0.25
763 0.27
764 0.26
765 0.31
766 0.36
767 0.35
768 0.37
769 0.39
770 0.4
771 0.4
772 0.45
773 0.46
774 0.46
775 0.43
776 0.47
777 0.48
778 0.42
779 0.4
780 0.37
781 0.35
782 0.29
783 0.3
784 0.27
785 0.28
786 0.28
787 0.29
788 0.28
789 0.25
790 0.23
791 0.21
792 0.18
793 0.12
794 0.11
795 0.11
796 0.09
797 0.08
798 0.15
799 0.2
800 0.21
801 0.24
802 0.23
803 0.22
804 0.24
805 0.25
806 0.21
807 0.17
808 0.17
809 0.16
810 0.17
811 0.19
812 0.18
813 0.16
814 0.15
815 0.13
816 0.11
817 0.1
818 0.1
819 0.09
820 0.1
821 0.12
822 0.14
823 0.15
824 0.15
825 0.17
826 0.19
827 0.19
828 0.2
829 0.19
830 0.19
831 0.2
832 0.21
833 0.2
834 0.21
835 0.2
836 0.19
837 0.23
838 0.22
839 0.21
840 0.22
841 0.27
842 0.26
843 0.24
844 0.26
845 0.22
846 0.21
847 0.2
848 0.18
849 0.13
850 0.11
851 0.11
852 0.1
853 0.09
854 0.09
855 0.08
856 0.07
857 0.06
858 0.07
859 0.08
860 0.07
861 0.07
862 0.07
863 0.08
864 0.09
865 0.1
866 0.1
867 0.09
868 0.1
869 0.12
870 0.13
871 0.13
872 0.14
873 0.13
874 0.13
875 0.14
876 0.14
877 0.15
878 0.16
879 0.15
880 0.16
881 0.16
882 0.17
883 0.19
884 0.18
885 0.18
886 0.18
887 0.21
888 0.21
889 0.23
890 0.25
891 0.21
892 0.23
893 0.23
894 0.24
895 0.2
896 0.17
897 0.18
898 0.17
899 0.18
900 0.2
901 0.19
902 0.2
903 0.2
904 0.22
905 0.31
906 0.37
907 0.43
908 0.49
909 0.52
910 0.54
911 0.63
912 0.68
913 0.66
914 0.68
915 0.7
916 0.7
917 0.7
918 0.68
919 0.6
920 0.54
921 0.53
922 0.48
923 0.4
924 0.33
925 0.28
926 0.26
927 0.25
928 0.22
929 0.16
930 0.09
931 0.07
932 0.06
933 0.06
934 0.06
935 0.06
936 0.06
937 0.06