Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VHD3

Protein Details
Accession H1VHD3    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-48ETDPRFRLPSKKQTKTTIDKRFSRMLHydrophilic
58-80KVDRYGRKVKSDTKKKALQRLYEHydrophilic
471-500EETTIEKYKRKERERKEKKREAARARREGGBasic
592-618NEILKAEKLKKKKGKAAKRLAAKKAAAHydrophilic
683-707EAPAEREGKKAKKSKGERKAEDEELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
417-435KLSKKELARRKMREALGLG
439-442EKKK
477-497KYKRKERERKEKKREAARARR
552-553KR
597-616AEKLKKKKGKAAKRLAAKKA
670-727GRKKRKAGGGDDDEAPAEREGKKAKKSKGERKAEDEELSRLVASVKKKASSKAGKKQA
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039754  Esf1  
IPR012580  NUC153  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG chig:CH63R_13813  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08159  NUC153  
Amino Acid Sequences MSSKSSKNGKNGQIADSRFSNFETDPRFRLPSKKQTKTTIDKRFSRMLKDDSFTGTAKVDRYGRKVKSDTKKKALQRLYEPEDGEEEDEEEQDKGMEVEADDVVERELAKANAKYDPARGGGFSESESESESDDDDESDEETTAVADPKASMSRLHDEQADVEDGEVTNRIAIVNLDWDNIKSADLFALFASFLPSTGGRIEKVSVYPSEFGKERMGREELEGPPKEIFKKSDGSDEDSEDSEAEEEAIKKELLEEGDAEDFDHDALRKYQLDRLRYFYAVMTVSDKTTAQKLYEATDGTEYQSSSNFLDLRFIPDDVTFDDEPRDECDKMPEGYKPVEFTTDALQHSKVKLTWDINPDDAARKASINRAFTGSRSQLEENDLKAYLASDSEDDGDSFAGFEDEEKKEGEEAAAEPKLSKKELARRKMREALGLGAEEEKKKSKDGPVGEMEITFTPALTESKKDKKPEEEETTIEKYKRKERERKEKKREAARARREGGTATAEVAEPAEEEEVGDAGEDLGFDDPFFTTDEPVAASKTKTSVRKEERLAKRAAREAEEKEKAEQKAQLQLLMADENDNEQAAHLDHFDMNEILKAEKLKKKKGKAAKRLAAKKAAAGGDENVGLQQDFRMDVDDDRFKAVFESHEYAIDPSNPKFKGTEAMQKLLEEGRKKRKAGGGDDDEAPAEREGKKAKKSKGERKAEDEELSRLVASVKKKASSKAGKKQA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.57
3 0.51
4 0.45
5 0.36
6 0.34
7 0.32
8 0.25
9 0.28
10 0.32
11 0.33
12 0.35
13 0.39
14 0.43
15 0.42
16 0.51
17 0.55
18 0.58
19 0.64
20 0.7
21 0.72
22 0.77
23 0.84
24 0.85
25 0.86
26 0.85
27 0.84
28 0.82
29 0.8
30 0.8
31 0.74
32 0.71
33 0.68
34 0.65
35 0.61
36 0.57
37 0.53
38 0.48
39 0.47
40 0.4
41 0.34
42 0.29
43 0.25
44 0.24
45 0.26
46 0.29
47 0.31
48 0.38
49 0.46
50 0.48
51 0.54
52 0.6
53 0.65
54 0.7
55 0.75
56 0.78
57 0.77
58 0.82
59 0.81
60 0.85
61 0.82
62 0.79
63 0.78
64 0.78
65 0.75
66 0.72
67 0.65
68 0.56
69 0.5
70 0.43
71 0.34
72 0.25
73 0.19
74 0.14
75 0.14
76 0.13
77 0.11
78 0.1
79 0.09
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.06
85 0.08
86 0.08
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.07
94 0.1
95 0.11
96 0.16
97 0.18
98 0.2
99 0.23
100 0.26
101 0.27
102 0.26
103 0.29
104 0.27
105 0.25
106 0.24
107 0.22
108 0.2
109 0.19
110 0.17
111 0.16
112 0.14
113 0.14
114 0.15
115 0.14
116 0.13
117 0.12
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.1
136 0.12
137 0.12
138 0.13
139 0.16
140 0.23
141 0.24
142 0.26
143 0.25
144 0.23
145 0.24
146 0.24
147 0.22
148 0.15
149 0.13
150 0.12
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.08
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.09
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.11
185 0.12
186 0.11
187 0.12
188 0.13
189 0.13
190 0.14
191 0.15
192 0.15
193 0.16
194 0.17
195 0.17
196 0.19
197 0.18
198 0.19
199 0.23
200 0.25
201 0.25
202 0.27
203 0.29
204 0.26
205 0.28
206 0.32
207 0.29
208 0.33
209 0.32
210 0.29
211 0.29
212 0.3
213 0.3
214 0.27
215 0.26
216 0.21
217 0.26
218 0.25
219 0.32
220 0.32
221 0.36
222 0.34
223 0.34
224 0.33
225 0.28
226 0.27
227 0.19
228 0.17
229 0.11
230 0.09
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.09
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.07
253 0.08
254 0.1
255 0.13
256 0.14
257 0.19
258 0.23
259 0.29
260 0.3
261 0.35
262 0.35
263 0.33
264 0.33
265 0.27
266 0.25
267 0.2
268 0.18
269 0.15
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.12
274 0.11
275 0.13
276 0.13
277 0.11
278 0.13
279 0.13
280 0.15
281 0.17
282 0.16
283 0.14
284 0.15
285 0.15
286 0.14
287 0.14
288 0.12
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.09
293 0.11
294 0.1
295 0.09
296 0.12
297 0.12
298 0.15
299 0.15
300 0.15
301 0.14
302 0.13
303 0.14
304 0.12
305 0.17
306 0.12
307 0.12
308 0.12
309 0.12
310 0.12
311 0.16
312 0.18
313 0.14
314 0.14
315 0.17
316 0.19
317 0.19
318 0.2
319 0.18
320 0.17
321 0.18
322 0.19
323 0.17
324 0.15
325 0.15
326 0.14
327 0.13
328 0.14
329 0.16
330 0.16
331 0.16
332 0.17
333 0.17
334 0.17
335 0.18
336 0.15
337 0.14
338 0.17
339 0.18
340 0.22
341 0.24
342 0.25
343 0.24
344 0.24
345 0.23
346 0.2
347 0.19
348 0.15
349 0.11
350 0.11
351 0.11
352 0.17
353 0.2
354 0.2
355 0.2
356 0.22
357 0.22
358 0.22
359 0.26
360 0.22
361 0.19
362 0.2
363 0.2
364 0.18
365 0.21
366 0.22
367 0.18
368 0.17
369 0.16
370 0.13
371 0.12
372 0.11
373 0.08
374 0.06
375 0.06
376 0.05
377 0.05
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.04
386 0.04
387 0.03
388 0.04
389 0.08
390 0.09
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.1
395 0.11
396 0.1
397 0.07
398 0.07
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.12
404 0.14
405 0.14
406 0.16
407 0.17
408 0.26
409 0.35
410 0.45
411 0.52
412 0.56
413 0.62
414 0.68
415 0.64
416 0.58
417 0.5
418 0.43
419 0.35
420 0.29
421 0.23
422 0.17
423 0.17
424 0.14
425 0.14
426 0.15
427 0.15
428 0.16
429 0.19
430 0.22
431 0.27
432 0.29
433 0.34
434 0.33
435 0.35
436 0.34
437 0.31
438 0.27
439 0.2
440 0.19
441 0.12
442 0.09
443 0.06
444 0.07
445 0.08
446 0.08
447 0.12
448 0.17
449 0.26
450 0.31
451 0.36
452 0.39
453 0.46
454 0.51
455 0.57
456 0.59
457 0.53
458 0.5
459 0.51
460 0.52
461 0.48
462 0.44
463 0.38
464 0.35
465 0.4
466 0.48
467 0.52
468 0.57
469 0.65
470 0.74
471 0.82
472 0.89
473 0.92
474 0.92
475 0.9
476 0.9
477 0.9
478 0.89
479 0.89
480 0.87
481 0.85
482 0.79
483 0.72
484 0.62
485 0.53
486 0.44
487 0.36
488 0.26
489 0.18
490 0.14
491 0.13
492 0.12
493 0.11
494 0.08
495 0.05
496 0.06
497 0.05
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.03
505 0.03
506 0.03
507 0.03
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.05
513 0.05
514 0.06
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.08
519 0.08
520 0.09
521 0.1
522 0.11
523 0.11
524 0.11
525 0.11
526 0.15
527 0.21
528 0.27
529 0.32
530 0.41
531 0.47
532 0.55
533 0.61
534 0.68
535 0.71
536 0.71
537 0.71
538 0.66
539 0.63
540 0.62
541 0.58
542 0.52
543 0.48
544 0.47
545 0.5
546 0.51
547 0.47
548 0.44
549 0.48
550 0.44
551 0.43
552 0.41
553 0.34
554 0.37
555 0.36
556 0.34
557 0.27
558 0.27
559 0.25
560 0.21
561 0.18
562 0.11
563 0.1
564 0.1
565 0.1
566 0.09
567 0.07
568 0.07
569 0.08
570 0.08
571 0.08
572 0.08
573 0.09
574 0.09
575 0.1
576 0.11
577 0.1
578 0.1
579 0.11
580 0.11
581 0.1
582 0.11
583 0.15
584 0.22
585 0.29
586 0.37
587 0.45
588 0.54
589 0.63
590 0.71
591 0.78
592 0.81
593 0.85
594 0.88
595 0.86
596 0.87
597 0.87
598 0.84
599 0.82
600 0.71
601 0.63
602 0.58
603 0.51
604 0.41
605 0.33
606 0.28
607 0.21
608 0.21
609 0.18
610 0.12
611 0.11
612 0.1
613 0.08
614 0.08
615 0.07
616 0.07
617 0.08
618 0.1
619 0.11
620 0.14
621 0.2
622 0.24
623 0.24
624 0.27
625 0.27
626 0.24
627 0.24
628 0.23
629 0.2
630 0.21
631 0.25
632 0.22
633 0.23
634 0.24
635 0.24
636 0.25
637 0.27
638 0.25
639 0.23
640 0.3
641 0.29
642 0.29
643 0.29
644 0.28
645 0.31
646 0.33
647 0.4
648 0.38
649 0.42
650 0.42
651 0.42
652 0.42
653 0.39
654 0.4
655 0.37
656 0.41
657 0.47
658 0.54
659 0.55
660 0.6
661 0.61
662 0.63
663 0.64
664 0.65
665 0.61
666 0.58
667 0.58
668 0.52
669 0.46
670 0.39
671 0.32
672 0.23
673 0.18
674 0.15
675 0.19
676 0.27
677 0.34
678 0.43
679 0.5
680 0.58
681 0.66
682 0.76
683 0.82
684 0.84
685 0.87
686 0.85
687 0.84
688 0.84
689 0.79
690 0.73
691 0.66
692 0.58
693 0.49
694 0.42
695 0.33
696 0.26
697 0.22
698 0.21
699 0.22
700 0.28
701 0.31
702 0.37
703 0.4
704 0.46
705 0.54
706 0.61
707 0.67