Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VGP4

Protein Details
Accession H1VGP4    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
705-724NTSPASNKRRRPSGVKMEEDHydrophilic
739-759VQNKGKPPTPRMAKRMKGNPAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
559-559K
744-755KPPTPRMAKRMK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029005  LIM-bd/SEUSS  
Pfam View protein in Pfam  
PF01803  LIM_bind  
Amino Acid Sequences MTSMGPSFAGHPAGMQQHPGVPGHPMAQGMPHNPGQQGPQGGGMPHQMHMAVSGPGGQVNPNQLMGGMPPGAGGPNAHALQHLNPAQNPMFQQNQFGNFNNPAAMAHATQLAQQRLFQQQQQARQALMAQQAFNANMAGVNGMPMGMQMNPMNAAQLAAMRQGMRPQGHNPQAQAMLAQQIALQQHQAVQNQQMQQGQQQGQPVQMNPQHMQLQQAQMAASMQAQQQQQQQQAQQQQQAQQQAQQQQAQQQQQQQAQQQAQHQQQQQQQGQPQGQPQQPQPQPQQTPHQTPQQQSAQPVNPQSAGQPTPSQTPGPAPNQQPQPPQAQAQPQGPPQMAPQPGPQQMNPAQQAAAQAAVANSMAMAQQRREGMKGHCLLKLMQFSEHLSGFPGSKGKDDLSYWNSFVSQFFSTKGVFRHSVHITDVEDQADKQYEITYPALPRYFHTHFDSGVKNMQLIMEKGTTDRPLPGDGHWIENTKSSLVYWFESGSHLVATGTVRAHFDAEQKIELFEFLTSNHEEYISRKAAIEAAKPVHNWVKEWHKVNSQDSKASPEMSKKGKARPMKSPQNPPPEALVDLPESAVKRGMGVTEAVFQFLEIAEVIGQMNPLFAFYHTHPNLGPYAALEQYVGQINAAPPNMNGQPMPQGPRTPSFGQFPMGASPAQPHMQLPGSPHVQGSPAQGHMQAPGMQMQQSQQGTSSSGPSANTSPASNKRRRPSGVKMEEDGSQAPTPGGPQVNGVQNKGKPPTPRMAKRMKGNPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.22
3 0.21
4 0.23
5 0.25
6 0.26
7 0.22
8 0.19
9 0.2
10 0.2
11 0.21
12 0.18
13 0.16
14 0.2
15 0.24
16 0.23
17 0.27
18 0.28
19 0.3
20 0.29
21 0.31
22 0.29
23 0.3
24 0.3
25 0.25
26 0.24
27 0.23
28 0.23
29 0.23
30 0.26
31 0.22
32 0.21
33 0.21
34 0.18
35 0.16
36 0.17
37 0.17
38 0.11
39 0.1
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.12
44 0.12
45 0.13
46 0.17
47 0.18
48 0.17
49 0.16
50 0.15
51 0.15
52 0.15
53 0.15
54 0.11
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.14
63 0.14
64 0.14
65 0.15
66 0.17
67 0.18
68 0.26
69 0.28
70 0.25
71 0.26
72 0.31
73 0.32
74 0.33
75 0.33
76 0.3
77 0.32
78 0.3
79 0.34
80 0.33
81 0.37
82 0.38
83 0.38
84 0.38
85 0.33
86 0.34
87 0.29
88 0.25
89 0.19
90 0.18
91 0.18
92 0.13
93 0.12
94 0.14
95 0.13
96 0.17
97 0.23
98 0.23
99 0.22
100 0.23
101 0.26
102 0.32
103 0.35
104 0.34
105 0.38
106 0.4
107 0.48
108 0.54
109 0.51
110 0.44
111 0.41
112 0.4
113 0.35
114 0.36
115 0.3
116 0.22
117 0.22
118 0.23
119 0.23
120 0.21
121 0.17
122 0.1
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.05
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.09
141 0.09
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.14
150 0.19
151 0.2
152 0.22
153 0.26
154 0.34
155 0.41
156 0.43
157 0.4
158 0.38
159 0.37
160 0.34
161 0.3
162 0.21
163 0.17
164 0.14
165 0.13
166 0.09
167 0.11
168 0.12
169 0.11
170 0.11
171 0.09
172 0.13
173 0.16
174 0.18
175 0.17
176 0.21
177 0.26
178 0.28
179 0.3
180 0.29
181 0.26
182 0.27
183 0.32
184 0.3
185 0.27
186 0.29
187 0.27
188 0.29
189 0.3
190 0.27
191 0.27
192 0.27
193 0.29
194 0.26
195 0.3
196 0.3
197 0.29
198 0.32
199 0.28
200 0.28
201 0.26
202 0.25
203 0.21
204 0.17
205 0.17
206 0.14
207 0.11
208 0.1
209 0.09
210 0.13
211 0.14
212 0.17
213 0.22
214 0.27
215 0.31
216 0.32
217 0.35
218 0.36
219 0.43
220 0.45
221 0.44
222 0.43
223 0.44
224 0.45
225 0.48
226 0.42
227 0.39
228 0.4
229 0.41
230 0.41
231 0.38
232 0.35
233 0.36
234 0.43
235 0.43
236 0.42
237 0.41
238 0.43
239 0.44
240 0.47
241 0.44
242 0.43
243 0.41
244 0.4
245 0.39
246 0.4
247 0.41
248 0.44
249 0.43
250 0.44
251 0.46
252 0.51
253 0.51
254 0.48
255 0.47
256 0.45
257 0.45
258 0.4
259 0.4
260 0.38
261 0.37
262 0.36
263 0.36
264 0.41
265 0.41
266 0.45
267 0.47
268 0.48
269 0.49
270 0.49
271 0.56
272 0.52
273 0.57
274 0.54
275 0.57
276 0.53
277 0.5
278 0.53
279 0.51
280 0.47
281 0.42
282 0.44
283 0.38
284 0.37
285 0.36
286 0.31
287 0.25
288 0.23
289 0.21
290 0.19
291 0.17
292 0.15
293 0.16
294 0.16
295 0.18
296 0.2
297 0.19
298 0.15
299 0.18
300 0.21
301 0.24
302 0.28
303 0.28
304 0.33
305 0.39
306 0.42
307 0.42
308 0.39
309 0.4
310 0.36
311 0.35
312 0.32
313 0.31
314 0.31
315 0.31
316 0.31
317 0.28
318 0.29
319 0.27
320 0.24
321 0.21
322 0.23
323 0.21
324 0.19
325 0.21
326 0.24
327 0.28
328 0.29
329 0.28
330 0.28
331 0.31
332 0.35
333 0.32
334 0.27
335 0.23
336 0.22
337 0.23
338 0.17
339 0.13
340 0.07
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.04
345 0.04
346 0.03
347 0.03
348 0.04
349 0.05
350 0.06
351 0.06
352 0.08
353 0.11
354 0.11
355 0.12
356 0.15
357 0.15
358 0.21
359 0.26
360 0.25
361 0.25
362 0.25
363 0.25
364 0.25
365 0.26
366 0.2
367 0.16
368 0.15
369 0.15
370 0.16
371 0.15
372 0.12
373 0.1
374 0.1
375 0.1
376 0.1
377 0.11
378 0.09
379 0.1
380 0.11
381 0.11
382 0.12
383 0.13
384 0.17
385 0.19
386 0.2
387 0.2
388 0.19
389 0.18
390 0.17
391 0.16
392 0.15
393 0.12
394 0.1
395 0.11
396 0.13
397 0.13
398 0.15
399 0.16
400 0.16
401 0.18
402 0.19
403 0.24
404 0.23
405 0.24
406 0.23
407 0.23
408 0.21
409 0.2
410 0.19
411 0.14
412 0.13
413 0.11
414 0.12
415 0.11
416 0.1
417 0.08
418 0.08
419 0.07
420 0.1
421 0.11
422 0.13
423 0.12
424 0.15
425 0.17
426 0.16
427 0.17
428 0.22
429 0.23
430 0.24
431 0.28
432 0.26
433 0.25
434 0.29
435 0.29
436 0.24
437 0.25
438 0.21
439 0.17
440 0.16
441 0.16
442 0.13
443 0.12
444 0.13
445 0.1
446 0.1
447 0.11
448 0.13
449 0.13
450 0.12
451 0.13
452 0.12
453 0.13
454 0.14
455 0.14
456 0.19
457 0.19
458 0.22
459 0.22
460 0.22
461 0.21
462 0.22
463 0.22
464 0.15
465 0.15
466 0.11
467 0.13
468 0.13
469 0.13
470 0.12
471 0.11
472 0.11
473 0.12
474 0.13
475 0.1
476 0.08
477 0.08
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.08
482 0.08
483 0.08
484 0.09
485 0.09
486 0.11
487 0.11
488 0.14
489 0.16
490 0.17
491 0.17
492 0.17
493 0.17
494 0.16
495 0.15
496 0.12
497 0.08
498 0.07
499 0.06
500 0.09
501 0.1
502 0.11
503 0.11
504 0.11
505 0.11
506 0.12
507 0.19
508 0.18
509 0.17
510 0.17
511 0.17
512 0.2
513 0.22
514 0.23
515 0.21
516 0.22
517 0.23
518 0.23
519 0.26
520 0.28
521 0.26
522 0.25
523 0.26
524 0.32
525 0.37
526 0.41
527 0.42
528 0.43
529 0.48
530 0.53
531 0.57
532 0.5
533 0.49
534 0.45
535 0.47
536 0.41
537 0.39
538 0.35
539 0.31
540 0.35
541 0.35
542 0.42
543 0.4
544 0.47
545 0.52
546 0.59
547 0.58
548 0.62
549 0.67
550 0.71
551 0.74
552 0.78
553 0.78
554 0.8
555 0.76
556 0.67
557 0.61
558 0.52
559 0.45
560 0.35
561 0.29
562 0.19
563 0.18
564 0.17
565 0.15
566 0.13
567 0.12
568 0.13
569 0.11
570 0.1
571 0.1
572 0.11
573 0.1
574 0.1
575 0.1
576 0.14
577 0.14
578 0.14
579 0.13
580 0.13
581 0.12
582 0.11
583 0.1
584 0.05
585 0.05
586 0.04
587 0.05
588 0.06
589 0.06
590 0.06
591 0.05
592 0.06
593 0.05
594 0.06
595 0.06
596 0.06
597 0.1
598 0.12
599 0.23
600 0.23
601 0.25
602 0.24
603 0.26
604 0.27
605 0.23
606 0.21
607 0.11
608 0.14
609 0.12
610 0.13
611 0.11
612 0.1
613 0.11
614 0.13
615 0.12
616 0.09
617 0.11
618 0.12
619 0.15
620 0.15
621 0.14
622 0.12
623 0.17
624 0.18
625 0.18
626 0.16
627 0.14
628 0.21
629 0.24
630 0.29
631 0.27
632 0.3
633 0.32
634 0.36
635 0.41
636 0.38
637 0.38
638 0.37
639 0.36
640 0.35
641 0.32
642 0.3
643 0.26
644 0.24
645 0.2
646 0.16
647 0.17
648 0.18
649 0.18
650 0.17
651 0.15
652 0.17
653 0.2
654 0.21
655 0.22
656 0.26
657 0.27
658 0.27
659 0.27
660 0.24
661 0.23
662 0.23
663 0.25
664 0.21
665 0.21
666 0.22
667 0.23
668 0.23
669 0.22
670 0.23
671 0.21
672 0.18
673 0.2
674 0.2
675 0.19
676 0.2
677 0.2
678 0.24
679 0.23
680 0.22
681 0.2
682 0.19
683 0.21
684 0.21
685 0.22
686 0.17
687 0.18
688 0.18
689 0.2
690 0.21
691 0.21
692 0.22
693 0.21
694 0.27
695 0.35
696 0.44
697 0.5
698 0.57
699 0.63
700 0.71
701 0.76
702 0.77
703 0.77
704 0.79
705 0.8
706 0.77
707 0.71
708 0.64
709 0.59
710 0.54
711 0.44
712 0.37
713 0.28
714 0.23
715 0.2
716 0.18
717 0.16
718 0.19
719 0.19
720 0.15
721 0.18
722 0.23
723 0.32
724 0.34
725 0.37
726 0.38
727 0.4
728 0.47
729 0.49
730 0.49
731 0.47
732 0.5
733 0.57
734 0.61
735 0.67
736 0.69
737 0.75
738 0.78
739 0.81