Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6BXB6

Protein Details
Accession A0A5M6BXB6    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
590-614DEDDKKKSAKSKGKKKAEKDDEDEDAcidic
728-754GRDKFGSMKGKKKKDAPSSSTNREKARBasic
762-785VHSNKVMQKKKASLRDKQIKLRASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
275-314RKLARNMEHRLEVGKSGKKREKMLTQMKKDANKKGKKKAA
594-606KKKSAKSKGKKKA
708-794RKKAKATWEERMESIQKGREGRDKFGSMKGKKKKDAPSSSTNREKARNKPIMMAVHSNKVMQKKKASLRDKQIKLRASIEKQKKLKH
Subcellular Location(s) mito 18.5, mito_nucl 12.999, cyto_mito 11.666, nucl 6, cyto_nucl 4.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027312  Sda1  
IPR007949  SDA1_C  
IPR012977  SDA1_N  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08158  NUC130_3NT  
PF05285  SDA1  
Amino Acid Sequences MGKSRASRGILLTSNLPQLQNLIKRDPEGYREEFLTQYNHYLSLLRLHQVSSAGATTSSSATDKSNELFGDLITFISQVAQCYPEDTKELPKQLRELLLGGEGGTTVKGDLRRTVVKNLVMLRNKEIIDSIELLQILLPLLPQVPQALRGVIRHTILTDIKTSNVKTKNHRLNRVVQSLLFGMVESGMGAEVVGDKGKGKAKEKGGEAMWAVMMVKELWKKSVWNDAKTVSIVALAAFHPNTKVQSAALHFFLGSENEDEDDSDEEDGGGVRAARKLARNMEHRLEVGKSGKKREKMLTQMKKDANKKGKKKAAGIGHTPNFPALELLHDPQTFGEKLYDNLHKHDKQYSLDHKILIMQLLSRVMGVHKLCVLGFYSYIIKYLTYHQLQVTLILVSLAQSVHDLTPPDVLTPVIRKLAQEFVHPGVGAEVIAAGLNAIREVCRRQPWCMEEDLLSDLIDYRKSKDKGVVTASRGLLQLFREVNPGLLKRRERGKAASMGLIGNQVLAYGHSRDAAEGIEGLELLDEHFANLRKEANGGISDDSDAEMEIDEDDDAGWENWDVESASSGSSGWEDVASDGDEDIVLSDSDDEDDKKKSAKSKGKKKAEKDDEDEDMDDAKSVVSMAPSAATEVSQTTKKLSLLAQQKILTPADFALLNELRLKAAKDLAESGGGSAAKRKLAALEASKRHVADDEADRFLTEAEILGPRKKAKATWEERMESIQKGREGRDKFGSMKGKKKKDAPSSSTNREKARNKPIMMAVHSNKVMQKKKASLRDKQIKLRASIEKQKKLKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.35
3 0.32
4 0.25
5 0.25
6 0.31
7 0.34
8 0.36
9 0.36
10 0.36
11 0.38
12 0.42
13 0.42
14 0.4
15 0.4
16 0.4
17 0.37
18 0.37
19 0.37
20 0.34
21 0.33
22 0.31
23 0.26
24 0.26
25 0.24
26 0.23
27 0.21
28 0.21
29 0.2
30 0.23
31 0.24
32 0.22
33 0.22
34 0.22
35 0.23
36 0.23
37 0.23
38 0.17
39 0.16
40 0.13
41 0.13
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.12
46 0.11
47 0.11
48 0.13
49 0.15
50 0.17
51 0.17
52 0.2
53 0.18
54 0.18
55 0.18
56 0.16
57 0.16
58 0.14
59 0.12
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.1
64 0.11
65 0.1
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.16
70 0.17
71 0.16
72 0.2
73 0.21
74 0.28
75 0.33
76 0.42
77 0.43
78 0.45
79 0.47
80 0.47
81 0.49
82 0.42
83 0.36
84 0.29
85 0.26
86 0.23
87 0.19
88 0.14
89 0.1
90 0.08
91 0.07
92 0.06
93 0.05
94 0.08
95 0.11
96 0.13
97 0.17
98 0.22
99 0.3
100 0.33
101 0.39
102 0.42
103 0.41
104 0.44
105 0.47
106 0.5
107 0.49
108 0.48
109 0.46
110 0.45
111 0.43
112 0.39
113 0.34
114 0.27
115 0.23
116 0.23
117 0.2
118 0.17
119 0.17
120 0.16
121 0.15
122 0.13
123 0.1
124 0.08
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.06
129 0.06
130 0.08
131 0.09
132 0.11
133 0.12
134 0.14
135 0.16
136 0.17
137 0.2
138 0.2
139 0.21
140 0.19
141 0.18
142 0.21
143 0.21
144 0.21
145 0.21
146 0.19
147 0.2
148 0.24
149 0.25
150 0.29
151 0.34
152 0.38
153 0.43
154 0.53
155 0.61
156 0.67
157 0.75
158 0.71
159 0.74
160 0.77
161 0.74
162 0.65
163 0.55
164 0.48
165 0.39
166 0.35
167 0.25
168 0.16
169 0.1
170 0.08
171 0.07
172 0.05
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.09
184 0.15
185 0.2
186 0.24
187 0.31
188 0.37
189 0.43
190 0.45
191 0.47
192 0.42
193 0.4
194 0.36
195 0.3
196 0.23
197 0.16
198 0.14
199 0.09
200 0.09
201 0.06
202 0.09
203 0.12
204 0.12
205 0.14
206 0.15
207 0.17
208 0.19
209 0.3
210 0.32
211 0.32
212 0.34
213 0.34
214 0.35
215 0.34
216 0.31
217 0.2
218 0.14
219 0.12
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.09
232 0.13
233 0.16
234 0.17
235 0.17
236 0.16
237 0.15
238 0.15
239 0.15
240 0.12
241 0.1
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.05
259 0.07
260 0.08
261 0.11
262 0.14
263 0.18
264 0.24
265 0.31
266 0.36
267 0.4
268 0.43
269 0.42
270 0.4
271 0.37
272 0.31
273 0.27
274 0.27
275 0.27
276 0.27
277 0.34
278 0.4
279 0.42
280 0.46
281 0.49
282 0.51
283 0.55
284 0.63
285 0.64
286 0.64
287 0.68
288 0.68
289 0.7
290 0.68
291 0.68
292 0.67
293 0.67
294 0.69
295 0.71
296 0.73
297 0.71
298 0.7
299 0.67
300 0.66
301 0.61
302 0.59
303 0.57
304 0.52
305 0.47
306 0.42
307 0.36
308 0.27
309 0.22
310 0.16
311 0.08
312 0.09
313 0.1
314 0.11
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.13
319 0.16
320 0.13
321 0.12
322 0.13
323 0.1
324 0.12
325 0.16
326 0.23
327 0.21
328 0.24
329 0.32
330 0.31
331 0.33
332 0.36
333 0.35
334 0.31
335 0.38
336 0.42
337 0.4
338 0.4
339 0.38
340 0.33
341 0.31
342 0.29
343 0.21
344 0.14
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.06
350 0.06
351 0.05
352 0.09
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.11
360 0.07
361 0.07
362 0.08
363 0.09
364 0.08
365 0.09
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.11
370 0.16
371 0.15
372 0.17
373 0.16
374 0.18
375 0.18
376 0.17
377 0.15
378 0.09
379 0.08
380 0.06
381 0.06
382 0.04
383 0.05
384 0.04
385 0.03
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.09
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.12
404 0.18
405 0.18
406 0.17
407 0.19
408 0.18
409 0.19
410 0.18
411 0.16
412 0.11
413 0.1
414 0.08
415 0.05
416 0.04
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.02
421 0.02
422 0.02
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.05
427 0.07
428 0.12
429 0.19
430 0.21
431 0.23
432 0.29
433 0.31
434 0.32
435 0.32
436 0.29
437 0.22
438 0.22
439 0.2
440 0.15
441 0.12
442 0.1
443 0.09
444 0.08
445 0.1
446 0.1
447 0.11
448 0.2
449 0.21
450 0.23
451 0.28
452 0.3
453 0.32
454 0.38
455 0.41
456 0.34
457 0.39
458 0.38
459 0.33
460 0.31
461 0.26
462 0.21
463 0.16
464 0.18
465 0.14
466 0.14
467 0.15
468 0.14
469 0.16
470 0.17
471 0.19
472 0.19
473 0.24
474 0.26
475 0.28
476 0.36
477 0.39
478 0.39
479 0.41
480 0.42
481 0.42
482 0.42
483 0.39
484 0.32
485 0.28
486 0.25
487 0.21
488 0.16
489 0.09
490 0.07
491 0.05
492 0.04
493 0.05
494 0.06
495 0.07
496 0.07
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.09
501 0.08
502 0.07
503 0.06
504 0.06
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.07
515 0.09
516 0.1
517 0.11
518 0.13
519 0.12
520 0.13
521 0.13
522 0.13
523 0.12
524 0.13
525 0.13
526 0.11
527 0.12
528 0.11
529 0.11
530 0.08
531 0.07
532 0.06
533 0.05
534 0.05
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.04
539 0.04
540 0.04
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.05
545 0.05
546 0.05
547 0.06
548 0.06
549 0.05
550 0.06
551 0.06
552 0.07
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.06
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.06
563 0.06
564 0.06
565 0.06
566 0.06
567 0.06
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.04
572 0.04
573 0.05
574 0.05
575 0.06
576 0.07
577 0.08
578 0.1
579 0.12
580 0.13
581 0.16
582 0.2
583 0.26
584 0.35
585 0.45
586 0.53
587 0.62
588 0.72
589 0.8
590 0.86
591 0.87
592 0.88
593 0.88
594 0.85
595 0.8
596 0.75
597 0.68
598 0.61
599 0.53
600 0.42
601 0.33
602 0.25
603 0.18
604 0.13
605 0.09
606 0.06
607 0.06
608 0.06
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.06
613 0.06
614 0.07
615 0.07
616 0.06
617 0.07
618 0.08
619 0.11
620 0.12
621 0.13
622 0.15
623 0.17
624 0.18
625 0.19
626 0.2
627 0.25
628 0.32
629 0.36
630 0.39
631 0.37
632 0.39
633 0.4
634 0.39
635 0.31
636 0.23
637 0.19
638 0.15
639 0.14
640 0.12
641 0.16
642 0.15
643 0.16
644 0.17
645 0.17
646 0.17
647 0.18
648 0.19
649 0.14
650 0.18
651 0.18
652 0.18
653 0.2
654 0.2
655 0.2
656 0.19
657 0.17
658 0.16
659 0.15
660 0.14
661 0.17
662 0.18
663 0.17
664 0.18
665 0.18
666 0.17
667 0.2
668 0.26
669 0.29
670 0.36
671 0.39
672 0.43
673 0.46
674 0.44
675 0.41
676 0.36
677 0.3
678 0.26
679 0.3
680 0.3
681 0.3
682 0.3
683 0.29
684 0.27
685 0.26
686 0.21
687 0.12
688 0.08
689 0.08
690 0.13
691 0.15
692 0.19
693 0.23
694 0.25
695 0.29
696 0.3
697 0.32
698 0.36
699 0.45
700 0.49
701 0.55
702 0.61
703 0.6
704 0.6
705 0.62
706 0.56
707 0.49
708 0.46
709 0.41
710 0.37
711 0.38
712 0.41
713 0.44
714 0.45
715 0.47
716 0.49
717 0.48
718 0.47
719 0.52
720 0.58
721 0.56
722 0.63
723 0.67
724 0.69
725 0.72
726 0.78
727 0.8
728 0.8
729 0.84
730 0.81
731 0.81
732 0.81
733 0.83
734 0.84
735 0.8
736 0.75
737 0.74
738 0.74
739 0.73
740 0.75
741 0.75
742 0.67
743 0.67
744 0.68
745 0.66
746 0.64
747 0.63
748 0.56
749 0.54
750 0.53
751 0.49
752 0.47
753 0.49
754 0.51
755 0.49
756 0.54
757 0.56
758 0.65
759 0.73
760 0.77
761 0.77
762 0.81
763 0.84
764 0.85
765 0.85
766 0.84
767 0.8
768 0.76
769 0.74
770 0.72
771 0.71
772 0.72
773 0.73
774 0.74