Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C0B8

Protein Details
Accession A0A5M6C0B8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
193-217AQEGGKKKEKKEKKEKPAKAQAVKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
129-142RKAPAPKVKKDKKA
197-212GKKKEKKEKKEKPAKA
Subcellular Location(s) cyto 19.5, cyto_nucl 13.333, nucl 6, mito_nucl 4.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010987  Glutathione-S-Trfase_C-like  
IPR036282  Glutathione-S-Trfase_C_sf  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR002547  tRNA-bd_dom  
Gene Ontology GO:0016874  F:ligase activity  
GO:0000049  F:tRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF01588  tRNA_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50405  GST_CTER  
PS50886  TRBD  
CDD cd02799  tRNA_bind_EMAP-II_like  
Amino Acid Sequences MSAVSEFVAAAEKADPSLVGTEEKDKTEIAKLVKETEGYVKDLPALNEKLTPLTYLYSNSPTSADVSLYAHLHPSLITASPEQHPKQPSLLRYFLQIQSLPAVQSAQSSLPNSFPSLDIDLSSLAIPERKAPAPKVKKDKKAAAVPGAPAAAGAVETVTGAVSAAVGAVTNAAASAAQTVKDAVVGAAPATAAQEGGKKKEKKEKKEKPAKAQAVKEEPVGPLPSQIDMRVGKVLDVKRHPDADSLYVESIDVGEAEPRTVCSGLVKYMTEDEIRGATIIVICNLKPVTMRGVKSFAMLLCASSKDGKAEGGVEFVLPPAGSQPGERIYFEGEKYENATPEPLLNPKKKVFETIQPGFVTLDNLDAAWVDPETKSVHRIRTKDGVCKAKSFVGASLS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.09
4 0.11
5 0.11
6 0.12
7 0.14
8 0.2
9 0.23
10 0.25
11 0.24
12 0.23
13 0.24
14 0.27
15 0.31
16 0.27
17 0.31
18 0.31
19 0.34
20 0.35
21 0.34
22 0.3
23 0.32
24 0.31
25 0.29
26 0.28
27 0.25
28 0.26
29 0.29
30 0.28
31 0.28
32 0.28
33 0.25
34 0.27
35 0.27
36 0.26
37 0.23
38 0.23
39 0.17
40 0.16
41 0.16
42 0.16
43 0.19
44 0.21
45 0.21
46 0.21
47 0.21
48 0.19
49 0.21
50 0.19
51 0.16
52 0.13
53 0.13
54 0.15
55 0.15
56 0.14
57 0.13
58 0.12
59 0.12
60 0.11
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.14
67 0.18
68 0.25
69 0.26
70 0.31
71 0.32
72 0.32
73 0.39
74 0.41
75 0.43
76 0.43
77 0.45
78 0.39
79 0.41
80 0.44
81 0.38
82 0.37
83 0.31
84 0.25
85 0.24
86 0.24
87 0.2
88 0.15
89 0.14
90 0.1
91 0.1
92 0.11
93 0.1
94 0.12
95 0.13
96 0.13
97 0.15
98 0.15
99 0.16
100 0.15
101 0.14
102 0.14
103 0.15
104 0.15
105 0.13
106 0.13
107 0.12
108 0.12
109 0.11
110 0.09
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.1
115 0.13
116 0.16
117 0.19
118 0.23
119 0.33
120 0.41
121 0.5
122 0.59
123 0.64
124 0.7
125 0.75
126 0.79
127 0.76
128 0.74
129 0.7
130 0.65
131 0.58
132 0.5
133 0.43
134 0.35
135 0.27
136 0.19
137 0.14
138 0.07
139 0.05
140 0.04
141 0.02
142 0.02
143 0.02
144 0.03
145 0.02
146 0.02
147 0.02
148 0.02
149 0.02
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.02
155 0.02
156 0.02
157 0.02
158 0.02
159 0.02
160 0.02
161 0.02
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.06
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.08
182 0.09
183 0.14
184 0.22
185 0.25
186 0.29
187 0.39
188 0.48
189 0.54
190 0.64
191 0.71
192 0.74
193 0.82
194 0.85
195 0.86
196 0.88
197 0.86
198 0.81
199 0.74
200 0.68
201 0.63
202 0.56
203 0.47
204 0.38
205 0.3
206 0.25
207 0.23
208 0.16
209 0.13
210 0.12
211 0.12
212 0.11
213 0.11
214 0.13
215 0.12
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.13
220 0.18
221 0.2
222 0.22
223 0.25
224 0.28
225 0.29
226 0.31
227 0.31
228 0.27
229 0.27
230 0.24
231 0.22
232 0.2
233 0.18
234 0.16
235 0.15
236 0.12
237 0.1
238 0.07
239 0.05
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.09
250 0.1
251 0.11
252 0.13
253 0.13
254 0.12
255 0.13
256 0.15
257 0.13
258 0.12
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.08
264 0.07
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.12
275 0.17
276 0.22
277 0.24
278 0.24
279 0.28
280 0.28
281 0.28
282 0.28
283 0.21
284 0.19
285 0.17
286 0.15
287 0.13
288 0.14
289 0.14
290 0.14
291 0.15
292 0.13
293 0.13
294 0.13
295 0.12
296 0.13
297 0.12
298 0.11
299 0.11
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.08
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.12
311 0.16
312 0.18
313 0.18
314 0.18
315 0.21
316 0.24
317 0.24
318 0.25
319 0.21
320 0.2
321 0.24
322 0.26
323 0.22
324 0.2
325 0.21
326 0.18
327 0.19
328 0.21
329 0.25
330 0.31
331 0.35
332 0.41
333 0.44
334 0.51
335 0.5
336 0.54
337 0.51
338 0.52
339 0.56
340 0.54
341 0.55
342 0.48
343 0.48
344 0.42
345 0.38
346 0.3
347 0.21
348 0.18
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.09
353 0.09
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.07
358 0.1
359 0.14
360 0.15
361 0.22
362 0.26
363 0.36
364 0.42
365 0.46
366 0.51
367 0.58
368 0.62
369 0.64
370 0.68
371 0.68
372 0.63
373 0.63
374 0.6
375 0.55
376 0.53
377 0.46