Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C8T8

Protein Details
Accession A0A5M6C8T8    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-56DEEGTNPPPTKKKRGRPRKTSGAEQGERBasic
131-155TTTPVLTVKPPKKRGRPSKADLVARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-48PTKKKRGRPRKT
140-148PPKKRGRPS
197-223KAKVLDKAKGKSKEKAVADLKKQRLAR
Subcellular Location(s) mito 20, nucl 4, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR007527  Znf_SWIM  
IPR039903  Zswim2  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04434  SWIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MSSFPKAPRRSARLSTISRSTVDPDDDHDEEGTNPPPTKKKRGRPRKTSGAEQGERTLMVKREPGIEVDNKPDISSLASYTPELPIAGSSSSALAQTRPATEVKAEPGVLADIKPIIPSSSTRPIASSSTTTTPVLTVKPPKKRGRPSKADLVARAAQPTASTSTPSVKTEIDPAPNIGPSEVKVEPIASGSRVEAKAKVLDKAKGKSKEKAVADLKKQRLARVRAKCPATILARYQRAISQRMFMLEREKTGPVDLAETFKVLGSTGNVYTVNIGTLPRCDCPDCKKGNMPCKHIIFVFIKVLKVPDDSAAWYQKCLTHDELEELFGNAPPTLSGSVAVSAQVQQAYYQATGKGKAVETAVAEVEREVTNGPGSKKLDAIGDDCPVCYEEMTQEDEDAKQLTYDVSLVGCGRPLHTQCFEMWAMTARRAQNPVTCVWCRADWPSANGNGKGKGKGKATNSWFSGGYINMADVAGMSRQRDVSTYHRGYRYIDEDYAY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.7
3 0.67
4 0.62
5 0.55
6 0.5
7 0.46
8 0.4
9 0.37
10 0.31
11 0.29
12 0.33
13 0.33
14 0.32
15 0.28
16 0.25
17 0.23
18 0.25
19 0.24
20 0.21
21 0.23
22 0.27
23 0.36
24 0.42
25 0.52
26 0.59
27 0.67
28 0.74
29 0.83
30 0.89
31 0.9
32 0.93
33 0.93
34 0.89
35 0.88
36 0.87
37 0.86
38 0.79
39 0.71
40 0.64
41 0.54
42 0.47
43 0.39
44 0.34
45 0.25
46 0.24
47 0.24
48 0.23
49 0.26
50 0.26
51 0.28
52 0.28
53 0.32
54 0.32
55 0.34
56 0.36
57 0.32
58 0.31
59 0.29
60 0.24
61 0.2
62 0.19
63 0.15
64 0.13
65 0.15
66 0.15
67 0.16
68 0.16
69 0.14
70 0.13
71 0.11
72 0.09
73 0.1
74 0.09
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.1
80 0.1
81 0.08
82 0.11
83 0.13
84 0.14
85 0.15
86 0.16
87 0.16
88 0.18
89 0.2
90 0.2
91 0.21
92 0.19
93 0.17
94 0.17
95 0.17
96 0.16
97 0.13
98 0.11
99 0.09
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.08
104 0.09
105 0.11
106 0.17
107 0.25
108 0.27
109 0.26
110 0.27
111 0.29
112 0.3
113 0.31
114 0.26
115 0.21
116 0.22
117 0.24
118 0.23
119 0.21
120 0.2
121 0.19
122 0.19
123 0.2
124 0.27
125 0.33
126 0.42
127 0.52
128 0.6
129 0.68
130 0.77
131 0.83
132 0.84
133 0.86
134 0.82
135 0.83
136 0.82
137 0.76
138 0.67
139 0.61
140 0.54
141 0.45
142 0.4
143 0.29
144 0.21
145 0.17
146 0.17
147 0.15
148 0.11
149 0.12
150 0.12
151 0.17
152 0.19
153 0.2
154 0.2
155 0.18
156 0.18
157 0.23
158 0.25
159 0.23
160 0.22
161 0.22
162 0.21
163 0.22
164 0.21
165 0.15
166 0.12
167 0.1
168 0.14
169 0.12
170 0.12
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.13
180 0.14
181 0.14
182 0.14
183 0.15
184 0.19
185 0.2
186 0.24
187 0.22
188 0.26
189 0.31
190 0.35
191 0.42
192 0.46
193 0.48
194 0.5
195 0.52
196 0.55
197 0.51
198 0.54
199 0.53
200 0.51
201 0.56
202 0.59
203 0.56
204 0.54
205 0.54
206 0.5
207 0.51
208 0.51
209 0.53
210 0.53
211 0.57
212 0.58
213 0.59
214 0.55
215 0.48
216 0.46
217 0.4
218 0.33
219 0.31
220 0.31
221 0.31
222 0.31
223 0.3
224 0.27
225 0.27
226 0.29
227 0.25
228 0.2
229 0.18
230 0.2
231 0.2
232 0.17
233 0.19
234 0.16
235 0.17
236 0.17
237 0.17
238 0.15
239 0.15
240 0.15
241 0.1
242 0.11
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.09
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.06
251 0.06
252 0.05
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.07
261 0.06
262 0.06
263 0.05
264 0.07
265 0.09
266 0.09
267 0.11
268 0.13
269 0.15
270 0.21
271 0.3
272 0.31
273 0.33
274 0.4
275 0.45
276 0.54
277 0.58
278 0.57
279 0.56
280 0.55
281 0.53
282 0.45
283 0.43
284 0.35
285 0.3
286 0.29
287 0.23
288 0.21
289 0.2
290 0.21
291 0.17
292 0.16
293 0.14
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.14
298 0.19
299 0.19
300 0.18
301 0.19
302 0.21
303 0.21
304 0.23
305 0.22
306 0.19
307 0.2
308 0.23
309 0.22
310 0.21
311 0.2
312 0.16
313 0.14
314 0.12
315 0.12
316 0.09
317 0.08
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.06
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.08
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.12
338 0.13
339 0.14
340 0.16
341 0.17
342 0.16
343 0.17
344 0.16
345 0.15
346 0.14
347 0.14
348 0.14
349 0.11
350 0.11
351 0.09
352 0.1
353 0.09
354 0.09
355 0.08
356 0.08
357 0.1
358 0.13
359 0.15
360 0.19
361 0.21
362 0.21
363 0.22
364 0.22
365 0.22
366 0.21
367 0.22
368 0.18
369 0.2
370 0.19
371 0.18
372 0.17
373 0.16
374 0.14
375 0.12
376 0.1
377 0.09
378 0.11
379 0.15
380 0.15
381 0.15
382 0.16
383 0.16
384 0.16
385 0.15
386 0.13
387 0.09
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.07
393 0.06
394 0.07
395 0.08
396 0.08
397 0.1
398 0.1
399 0.12
400 0.18
401 0.2
402 0.25
403 0.26
404 0.28
405 0.25
406 0.3
407 0.29
408 0.23
409 0.21
410 0.22
411 0.22
412 0.23
413 0.29
414 0.27
415 0.31
416 0.33
417 0.35
418 0.34
419 0.35
420 0.36
421 0.37
422 0.35
423 0.34
424 0.34
425 0.33
426 0.3
427 0.32
428 0.35
429 0.31
430 0.34
431 0.38
432 0.42
433 0.45
434 0.47
435 0.46
436 0.45
437 0.46
438 0.48
439 0.47
440 0.46
441 0.46
442 0.5
443 0.51
444 0.54
445 0.57
446 0.59
447 0.57
448 0.53
449 0.48
450 0.42
451 0.39
452 0.3
453 0.25
454 0.17
455 0.15
456 0.12
457 0.12
458 0.1
459 0.08
460 0.09
461 0.1
462 0.11
463 0.12
464 0.14
465 0.15
466 0.16
467 0.18
468 0.21
469 0.26
470 0.34
471 0.4
472 0.46
473 0.48
474 0.49
475 0.51
476 0.54
477 0.52
478 0.46