FuNGI

A0A5M6C2R1

Protein Details

Accession

A0A5M6C2R1

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
310-383	ALAVRKEKEKLKEKKRREKAKEKEKREKEKRKRKEEKKKKEKEKKKRKKEKEKEKEKEKKKKKRKGGDSDADDS	Basic
389-414	VSISDEGKKNKKKKRRHSISSVSSSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
306-375	ERRRALAVRKEKEKLKEKKRREKAKEKEKREKEKRKRKEEKKKKEKEKKKRKKEKEKEKEKEKKKKKRKG
396-405	KKNKKKKRRH

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, mito_nucl 13

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MSTMSNSDQQVWKKVLAAKNKSMTQQQIEASFPSMSKKAITGSIGTLLRLRLFSTTKAKDDDKTYFHASTPEEAKQKQTLTQEQKLVLSIIGNAGNRGIASVLIGRQIGNDVIPPAILRKTMKGLESGGLIKQFKPVNAPTTVYYCLGHLKPPEEISGGVWFDDNKEYDQSLVEAVCHVLLVKVRNATYVDEKKRSEKDRNLIPNALNISTKAQSQLTPHALRTYVNNLNVTSAKLSVKNVMECMRALELDGLVEVVKPLAGVYVPDDADERGSDDDDVGPSSSKRRKVSVADPDSDEDMDEEERERRRALAVRKEKEKLKEKKRREKAKEKEKREKEKRKRKEEKKKKEKEKKKRKKEKEKEKEKEKKKKKRKGGDSDADDSDDDRLVSISDEGKKNKKKKRRHSISSVSSSSSSSSSSSSDSDSDSDSDSDSDTDSVSSVSSSQLDTGLVPLKPSRGTLAPNVNTIFAGGISGGLTDLTDTAVVYRATNRLGVPLGQTQAPCGKCPVFSFCEEGGPVEPEGCKYYDDWLGDINGGWDDKALKVMKPELVEEEGVEGVNGDVNGNGVEEGLEPEDEMEVDDQGYDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.46
3	0.51
4	0.55
5	0.57
6	0.62
7	0.65
8	0.64
9	0.63
10	0.63
11	0.58
12	0.56
13	0.5
14	0.45
15	0.42
16	0.39
17	0.35
18	0.29
19	0.24
20	0.23
21	0.22
22	0.2
23	0.19
24	0.19
25	0.19
26	0.22
27	0.23
28	0.21
29	0.21
30	0.27
31	0.26
32	0.25
33	0.25
34	0.22
35	0.22
36	0.2
37	0.19
38	0.17
39	0.19
40	0.24
41	0.32
42	0.36
43	0.38
44	0.43
45	0.45
46	0.45
47	0.49
48	0.49
49	0.43
50	0.44
51	0.46
52	0.42
53	0.4
54	0.4
55	0.36
56	0.35
57	0.36
58	0.36
59	0.36
60	0.36
61	0.4
62	0.4
63	0.4
64	0.4
65	0.43
66	0.47
67	0.49
68	0.55
69	0.55
70	0.52
71	0.51
72	0.47
73	0.4
74	0.3
75	0.22
76	0.15
77	0.13
78	0.15
79	0.14
80	0.13
81	0.12
82	0.12
83	0.11
84	0.11
85	0.08
86	0.05
87	0.06
88	0.08
89	0.08
90	0.1
91	0.1
92	0.1
93	0.1
94	0.11
95	0.11
96	0.09
97	0.09
98	0.08
99	0.08
100	0.08
101	0.08
102	0.09
103	0.1
104	0.13
105	0.13
106	0.15
107	0.21
108	0.24
109	0.25
110	0.24
111	0.25
112	0.23
113	0.24
114	0.23
115	0.19
116	0.21
117	0.21
118	0.19
119	0.23
120	0.24
121	0.22
122	0.26
123	0.27
124	0.27
125	0.28
126	0.3
127	0.26
128	0.28
129	0.3
130	0.25
131	0.22
132	0.19
133	0.22
134	0.2
135	0.22
136	0.21
137	0.21
138	0.22
139	0.23
140	0.24
141	0.19
142	0.19
143	0.17
144	0.18
145	0.17
146	0.14
147	0.13
148	0.12
149	0.12
150	0.15
151	0.14
152	0.12
153	0.13
154	0.13
155	0.14
156	0.14
157	0.13
158	0.11
159	0.1
160	0.08
161	0.07
162	0.07
163	0.06
164	0.06
165	0.05
166	0.05
167	0.08
168	0.1
169	0.12
170	0.14
171	0.14
172	0.17
173	0.18
174	0.19
175	0.26
176	0.33
177	0.37
178	0.4
179	0.42
180	0.46
181	0.53
182	0.57
183	0.58
184	0.57
185	0.58
186	0.62
187	0.68
188	0.67
189	0.63
190	0.56
191	0.51
192	0.45
193	0.39
194	0.29
195	0.21
196	0.2
197	0.17
198	0.17
199	0.15
200	0.13
201	0.14
202	0.16
203	0.22
204	0.25
205	0.26
206	0.26
207	0.26
208	0.26
209	0.24
210	0.25
211	0.25
212	0.23
213	0.24
214	0.24
215	0.23
216	0.24
217	0.24
218	0.22
219	0.16
220	0.13
221	0.12
222	0.13
223	0.13
224	0.16
225	0.17
226	0.17
227	0.19
228	0.19
229	0.19
230	0.17
231	0.18
232	0.14
233	0.12
234	0.11
235	0.1
236	0.07
237	0.06
238	0.06
239	0.05
240	0.04
241	0.04
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.04
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.08
255	0.08
256	0.08
257	0.08
258	0.08
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.07
264	0.06
265	0.07
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.13
270	0.17
271	0.23
272	0.24
273	0.26
274	0.3
275	0.35
276	0.42
277	0.46
278	0.46
279	0.42
280	0.42
281	0.4
282	0.37
283	0.32
284	0.24
285	0.13
286	0.09
287	0.07
288	0.06
289	0.06
290	0.09
291	0.11
292	0.12
293	0.12
294	0.12
295	0.14
296	0.2
297	0.27
298	0.34
299	0.42
300	0.47
301	0.52
302	0.56
303	0.58
304	0.6
305	0.63
306	0.63
307	0.64
308	0.69
309	0.75
310	0.81
311	0.87
312	0.9
313	0.89
314	0.9
315	0.89
316	0.9
317	0.9
318	0.89
319	0.89
320	0.88
321	0.9
322	0.9
323	0.91
324	0.91
325	0.92
326	0.92
327	0.93
328	0.94
329	0.94
330	0.94
331	0.94
332	0.95
333	0.95
334	0.95
335	0.95
336	0.95
337	0.95
338	0.95
339	0.95
340	0.95
341	0.95
342	0.96
343	0.96
344	0.96
345	0.96
346	0.96
347	0.96
348	0.96
349	0.95
350	0.94
351	0.94
352	0.93
353	0.93
354	0.92
355	0.92
356	0.92
357	0.92
358	0.92
359	0.92
360	0.92
361	0.92
362	0.92
363	0.9
364	0.85
365	0.79
366	0.69
367	0.59
368	0.48
369	0.38
370	0.28
371	0.18
372	0.12
373	0.07
374	0.07
375	0.06
376	0.06
377	0.07
378	0.1
379	0.15
380	0.19
381	0.23
382	0.33
383	0.41
384	0.51
385	0.59
386	0.65
387	0.71
388	0.78
389	0.85
390	0.87
391	0.88
392	0.89
393	0.89
394	0.89
395	0.86
396	0.76
397	0.66
398	0.56
399	0.47
400	0.38
401	0.28
402	0.2
403	0.13
404	0.12
405	0.12
406	0.13
407	0.13
408	0.14
409	0.14
410	0.14
411	0.14
412	0.14
413	0.14
414	0.14
415	0.13
416	0.12
417	0.12
418	0.11
419	0.1
420	0.1
421	0.09
422	0.08
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.08
434	0.08
435	0.08
436	0.1
437	0.13
438	0.12
439	0.13
440	0.14
441	0.16
442	0.16
443	0.17
444	0.18
445	0.16
446	0.19
447	0.25
448	0.34
449	0.33
450	0.36
451	0.36
452	0.33
453	0.3
454	0.28
455	0.21
456	0.11
457	0.09
458	0.05
459	0.05
460	0.04
461	0.04
462	0.04
463	0.04
464	0.04
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.04
470	0.05
471	0.08
472	0.08
473	0.09
474	0.12
475	0.13
476	0.14
477	0.17
478	0.16
479	0.16
480	0.17
481	0.18
482	0.19
483	0.2
484	0.21
485	0.21
486	0.21
487	0.21
488	0.27
489	0.27
490	0.24
491	0.25
492	0.25
493	0.24
494	0.27
495	0.31
496	0.28
497	0.29
498	0.34
499	0.3
500	0.32
501	0.3
502	0.29
503	0.24
504	0.23
505	0.21
506	0.16
507	0.16
508	0.15
509	0.17
510	0.16
511	0.15
512	0.14
513	0.17
514	0.21
515	0.21
516	0.21
517	0.2
518	0.2
519	0.19
520	0.19
521	0.16
522	0.12
523	0.11
524	0.1
525	0.1
526	0.1
527	0.1
528	0.16
529	0.17
530	0.17
531	0.22
532	0.26
533	0.29
534	0.29
535	0.31
536	0.29
537	0.3
538	0.29
539	0.24
540	0.22
541	0.18
542	0.16
543	0.14
544	0.1
545	0.07
546	0.09
547	0.08
548	0.06
549	0.06
550	0.07
551	0.07
552	0.07
553	0.07
554	0.05
555	0.06
556	0.06
557	0.08
558	0.09
559	0.09
560	0.08
561	0.09
562	0.09
563	0.09
564	0.1
565	0.08
566	0.08
567	0.08

A0A5M6C2R1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer