Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6BUU4

Protein Details
Accession A0A5M6BUU4    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
341-367DDETGENKPKEKPKKKKKTAAAVAAAAHydrophilic
412-436TAGGGETKPKKKSEKKKKEEDAAGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
318-338KKKGSGGGGGGGGKKKRPPPP
345-359GENKPKEKPKKKKKT
391-430KKKKAAAAAAAAGGGAAGSGATAGGGETKPKKKSEKKKKE
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 6, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MASASGYNHHRFARAVLKKSRKWEPSLTVQLFQSHWRFENSPVNFQYDGPMKPFLLALRSQVIPTTLLPFLYDIQPPISFVDGCLVVELQDFRRSPGIGVPGGGGGGSVTGGQGQVGQGEVRSRVVMRPAAETLAQTIDVMLERKGQSWDETMALELESRIIAATSPPLYLGTSILATRNAVLALSLTSPASSNLSASGSIRSPSSLLESDSKSSLDKMRKLLRAGERPSSSTGSGGDSASGGGGGGGVGGPFQPNWTVLRAKEQWEMIKAQREREAREIRPPLGPDGQPLPGNGTGPEGENGTGATTTATTTTTITKKKGSGGGGGGGGKKKRPPPPTDDDETGENKPKEKPKKKKKTAAAVAAAAAAAAAEETKAETTEDVKTTTAPTKKKKAAAAAAAAGGGAAGSGATAGGGETKPKKKSEKKKKEEDAAGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.47
3 0.53
4 0.62
5 0.66
6 0.73
7 0.78
8 0.74
9 0.72
10 0.73
11 0.69
12 0.69
13 0.74
14 0.69
15 0.63
16 0.57
17 0.54
18 0.46
19 0.46
20 0.4
21 0.33
22 0.32
23 0.34
24 0.34
25 0.37
26 0.45
27 0.43
28 0.47
29 0.45
30 0.48
31 0.43
32 0.41
33 0.42
34 0.37
35 0.35
36 0.29
37 0.3
38 0.25
39 0.25
40 0.26
41 0.21
42 0.2
43 0.19
44 0.19
45 0.2
46 0.21
47 0.21
48 0.2
49 0.2
50 0.18
51 0.17
52 0.18
53 0.15
54 0.14
55 0.14
56 0.14
57 0.15
58 0.16
59 0.17
60 0.14
61 0.16
62 0.16
63 0.16
64 0.16
65 0.17
66 0.13
67 0.12
68 0.14
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.11
73 0.08
74 0.1
75 0.12
76 0.11
77 0.17
78 0.17
79 0.18
80 0.21
81 0.21
82 0.21
83 0.23
84 0.25
85 0.19
86 0.2
87 0.18
88 0.15
89 0.15
90 0.13
91 0.09
92 0.04
93 0.04
94 0.03
95 0.03
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.05
104 0.05
105 0.06
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.1
111 0.11
112 0.15
113 0.18
114 0.17
115 0.19
116 0.19
117 0.2
118 0.19
119 0.18
120 0.15
121 0.13
122 0.12
123 0.09
124 0.08
125 0.07
126 0.07
127 0.08
128 0.07
129 0.11
130 0.11
131 0.13
132 0.15
133 0.15
134 0.16
135 0.17
136 0.18
137 0.14
138 0.14
139 0.13
140 0.11
141 0.11
142 0.09
143 0.07
144 0.06
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.09
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.1
193 0.09
194 0.1
195 0.13
196 0.14
197 0.15
198 0.16
199 0.16
200 0.13
201 0.14
202 0.18
203 0.2
204 0.22
205 0.26
206 0.33
207 0.36
208 0.37
209 0.42
210 0.44
211 0.47
212 0.47
213 0.48
214 0.41
215 0.4
216 0.41
217 0.36
218 0.29
219 0.21
220 0.19
221 0.14
222 0.14
223 0.12
224 0.09
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.04
230 0.02
231 0.02
232 0.02
233 0.02
234 0.02
235 0.02
236 0.02
237 0.02
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.04
242 0.05
243 0.07
244 0.1
245 0.12
246 0.12
247 0.2
248 0.22
249 0.24
250 0.26
251 0.27
252 0.27
253 0.27
254 0.3
255 0.25
256 0.32
257 0.3
258 0.3
259 0.35
260 0.36
261 0.37
262 0.43
263 0.47
264 0.4
265 0.48
266 0.49
267 0.44
268 0.45
269 0.42
270 0.37
271 0.34
272 0.32
273 0.26
274 0.25
275 0.25
276 0.22
277 0.21
278 0.21
279 0.17
280 0.17
281 0.15
282 0.14
283 0.12
284 0.12
285 0.13
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.08
300 0.13
301 0.18
302 0.22
303 0.24
304 0.27
305 0.28
306 0.32
307 0.36
308 0.33
309 0.31
310 0.29
311 0.28
312 0.27
313 0.27
314 0.26
315 0.25
316 0.24
317 0.23
318 0.28
319 0.33
320 0.4
321 0.46
322 0.5
323 0.55
324 0.62
325 0.66
326 0.67
327 0.63
328 0.57
329 0.53
330 0.5
331 0.45
332 0.45
333 0.38
334 0.34
335 0.38
336 0.45
337 0.52
338 0.59
339 0.67
340 0.7
341 0.81
342 0.89
343 0.92
344 0.93
345 0.93
346 0.92
347 0.9
348 0.84
349 0.74
350 0.63
351 0.53
352 0.42
353 0.31
354 0.2
355 0.1
356 0.05
357 0.03
358 0.03
359 0.02
360 0.03
361 0.04
362 0.05
363 0.05
364 0.06
365 0.07
366 0.09
367 0.14
368 0.16
369 0.16
370 0.17
371 0.17
372 0.2
373 0.28
374 0.33
375 0.37
376 0.44
377 0.53
378 0.6
379 0.66
380 0.68
381 0.69
382 0.7
383 0.68
384 0.64
385 0.55
386 0.48
387 0.42
388 0.35
389 0.26
390 0.17
391 0.1
392 0.05
393 0.03
394 0.02
395 0.02
396 0.02
397 0.02
398 0.02
399 0.02
400 0.03
401 0.06
402 0.06
403 0.13
404 0.22
405 0.29
406 0.35
407 0.42
408 0.53
409 0.61
410 0.72
411 0.77
412 0.81
413 0.84
414 0.9
415 0.93
416 0.93