Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C5Y4

Protein Details
Accession A0A5M6C5Y4    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-28AMARRNHKERAQPLNRAKFGHydrophilic
35-63DYVLRARDYKSKQDRIRKLREKAAFRNKDHydrophilic
213-234GWAAPTPSKKRKEKQPEPVVEIHydrophilic
299-321EDRNGEKKRYQAKMWKWKLERRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
49-54RIRKLR
162-171GRKGKGKGKA
305-321KKRYQAKMWKWKLERRR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 8, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MVNSSLRNAMARRNHKERAQPLNRAKFGLLEKHKDYVLRARDYKSKQDRIRKLREKAAFRNKDEFYWGMVKDKTKGGVAVADRGNESLSTDLVKILKTQDLGYVRVQIAKDEKKITKLRAELEITAPVAGPSSEWTAASELAEVEKLAEMGIVLQPRDVSGGRKGKGKGKAPAAGHVVFVDGRTEFESYGRSDDEEENEASGSGGQQEVVDLGWAAPTPSKKRKEKQPEPVVEIDQEAIEEEARAHRLELLTDLSAYLARLKLLRQAEAKLSTTKSLMGKGAATKARQAGFVEDENAPEDRNGEKKRYQAKMWKWKLERRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.66
3 0.75
4 0.75
5 0.76
6 0.75
7 0.77
8 0.79
9 0.82
10 0.78
11 0.7
12 0.61
13 0.56
14 0.52
15 0.51
16 0.49
17 0.46
18 0.47
19 0.47
20 0.48
21 0.44
22 0.43
23 0.42
24 0.42
25 0.43
26 0.44
27 0.46
28 0.54
29 0.58
30 0.65
31 0.66
32 0.68
33 0.69
34 0.75
35 0.81
36 0.82
37 0.88
38 0.87
39 0.84
40 0.83
41 0.83
42 0.81
43 0.81
44 0.82
45 0.8
46 0.75
47 0.76
48 0.68
49 0.6
50 0.56
51 0.46
52 0.39
53 0.36
54 0.31
55 0.28
56 0.3
57 0.3
58 0.29
59 0.3
60 0.28
61 0.23
62 0.23
63 0.19
64 0.21
65 0.2
66 0.24
67 0.23
68 0.22
69 0.21
70 0.21
71 0.2
72 0.15
73 0.14
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.12
83 0.13
84 0.13
85 0.13
86 0.17
87 0.19
88 0.21
89 0.2
90 0.23
91 0.21
92 0.23
93 0.23
94 0.2
95 0.25
96 0.26
97 0.29
98 0.31
99 0.32
100 0.37
101 0.42
102 0.43
103 0.43
104 0.42
105 0.41
106 0.41
107 0.41
108 0.35
109 0.32
110 0.3
111 0.23
112 0.2
113 0.17
114 0.11
115 0.09
116 0.07
117 0.05
118 0.05
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.14
148 0.21
149 0.22
150 0.27
151 0.29
152 0.34
153 0.41
154 0.44
155 0.43
156 0.42
157 0.46
158 0.42
159 0.44
160 0.42
161 0.35
162 0.3
163 0.24
164 0.2
165 0.14
166 0.13
167 0.1
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.09
175 0.09
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.12
180 0.13
181 0.14
182 0.15
183 0.14
184 0.13
185 0.13
186 0.12
187 0.1
188 0.09
189 0.06
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.03
199 0.03
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.06
204 0.1
205 0.18
206 0.27
207 0.36
208 0.45
209 0.53
210 0.64
211 0.73
212 0.79
213 0.83
214 0.85
215 0.83
216 0.79
217 0.75
218 0.66
219 0.55
220 0.45
221 0.34
222 0.23
223 0.16
224 0.11
225 0.08
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.11
234 0.11
235 0.12
236 0.13
237 0.13
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.08
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.17
250 0.19
251 0.24
252 0.24
253 0.26
254 0.31
255 0.34
256 0.36
257 0.34
258 0.33
259 0.3
260 0.28
261 0.3
262 0.26
263 0.25
264 0.24
265 0.21
266 0.22
267 0.23
268 0.3
269 0.3
270 0.3
271 0.31
272 0.34
273 0.34
274 0.34
275 0.32
276 0.29
277 0.28
278 0.29
279 0.28
280 0.24
281 0.23
282 0.23
283 0.22
284 0.19
285 0.15
286 0.15
287 0.15
288 0.23
289 0.27
290 0.32
291 0.36
292 0.44
293 0.54
294 0.59
295 0.64
296 0.66
297 0.72
298 0.77
299 0.82
300 0.84
301 0.83