Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C4P5

Protein Details
Accession A0A5M6C4P5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-56IAPLKSQSPAKRQRKLPSLPSTFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MALVDYDSSSSSSSCEDEKHSGATSSIVDAGKRIAPLKSQSPAKRQRKLPSLPSTFDTTAPKDDPSLHQGRKRSRPFVDGEYNAHVYLSLPIPASLRNTLTSLLSTLSTLSTLLPSHTIHPLLPSLHISLTHSLPLRRHQIAPFRDQLRAALTSPRSRAGPFKLSFVGGVKGYDNHIAGNGGRAFLALRVGAGAVELKEIVDKAIHPLLEVVHLPRYHDNPEFHTSFAWTLIDPDSTQEKNVGNKDQEVDVEDAEAEAIATGTAEGVARANTSAVSSDTITHRSKSSPFTKSILDQLNAKYEAQILACQPRGGWDVDNVHLKIGKDITVIKLTSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.2
4 0.24
5 0.26
6 0.27
7 0.27
8 0.26
9 0.25
10 0.24
11 0.2
12 0.17
13 0.19
14 0.17
15 0.16
16 0.15
17 0.17
18 0.18
19 0.19
20 0.19
21 0.17
22 0.2
23 0.26
24 0.31
25 0.36
26 0.43
27 0.48
28 0.57
29 0.66
30 0.72
31 0.75
32 0.78
33 0.8
34 0.8
35 0.82
36 0.81
37 0.81
38 0.77
39 0.71
40 0.66
41 0.63
42 0.54
43 0.49
44 0.44
45 0.36
46 0.35
47 0.33
48 0.31
49 0.25
50 0.27
51 0.27
52 0.3
53 0.37
54 0.37
55 0.41
56 0.48
57 0.56
58 0.64
59 0.68
60 0.68
61 0.62
62 0.62
63 0.62
64 0.62
65 0.61
66 0.53
67 0.49
68 0.45
69 0.43
70 0.38
71 0.33
72 0.25
73 0.17
74 0.16
75 0.14
76 0.1
77 0.09
78 0.1
79 0.11
80 0.12
81 0.14
82 0.14
83 0.15
84 0.14
85 0.15
86 0.15
87 0.15
88 0.14
89 0.12
90 0.11
91 0.1
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.09
103 0.11
104 0.13
105 0.13
106 0.12
107 0.13
108 0.15
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.12
113 0.11
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.14
119 0.15
120 0.15
121 0.17
122 0.22
123 0.26
124 0.26
125 0.28
126 0.29
127 0.37
128 0.38
129 0.41
130 0.43
131 0.39
132 0.38
133 0.35
134 0.32
135 0.26
136 0.24
137 0.2
138 0.18
139 0.19
140 0.21
141 0.22
142 0.23
143 0.21
144 0.2
145 0.23
146 0.22
147 0.28
148 0.25
149 0.27
150 0.26
151 0.25
152 0.25
153 0.22
154 0.19
155 0.11
156 0.11
157 0.09
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.1
167 0.1
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.08
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.03
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.07
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.11
197 0.11
198 0.1
199 0.12
200 0.12
201 0.14
202 0.16
203 0.19
204 0.21
205 0.26
206 0.26
207 0.28
208 0.33
209 0.32
210 0.3
211 0.27
212 0.25
213 0.2
214 0.19
215 0.14
216 0.09
217 0.09
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.11
222 0.15
223 0.15
224 0.15
225 0.17
226 0.18
227 0.23
228 0.27
229 0.31
230 0.28
231 0.29
232 0.31
233 0.28
234 0.26
235 0.24
236 0.21
237 0.15
238 0.14
239 0.12
240 0.1
241 0.08
242 0.08
243 0.05
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.08
262 0.09
263 0.1
264 0.12
265 0.15
266 0.2
267 0.22
268 0.23
269 0.23
270 0.25
271 0.28
272 0.34
273 0.39
274 0.39
275 0.41
276 0.42
277 0.44
278 0.44
279 0.48
280 0.46
281 0.39
282 0.39
283 0.37
284 0.41
285 0.39
286 0.37
287 0.29
288 0.24
289 0.24
290 0.21
291 0.21
292 0.18
293 0.23
294 0.24
295 0.24
296 0.22
297 0.24
298 0.26
299 0.25
300 0.23
301 0.22
302 0.25
303 0.29
304 0.37
305 0.33
306 0.33
307 0.34
308 0.33
309 0.31
310 0.29
311 0.26
312 0.21
313 0.23
314 0.26
315 0.28