Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6C050

Protein Details
Accession A0A5M6C050    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-128GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQHydrophilic
613-633EIVSRPPSRKSKKRKVADVEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
427-430RRRA
434-434R
442-444RKK
618-627PPSRKSKKRK
978-991GGGRRGGGGGGGPR
Subcellular Location(s) mito 11.5cyto_mito 11.5, cyto 10.5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSKKYPKIVNRVVEDAPKRVRGPDGEIVEEPLRYENPNPNGFEVDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEEEMMVEIFNYTERVVNMTRPRKVLMMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQDAADKEEEKREAIKLFEVMGHKVSDETANKKSWDTNAITPGTPFMDLLSISLKYWVSYKLTNDPGWKDLKVILSDSSVPGEGEHKIMDWIRRQRSHPNWNANTSHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFRVLREDVFAQGSKGPQNCRNCGQPGHLSANCKGEKQVKDPNVVEVAKPVDPKPFIFLDVACLREYLAVELNVPNVPFKFDMELAIDDWIFMIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDALLKIWRAQLPFMGGYLTNHGKVDLARAQLILEGLAKNEDDIFQKRKEDEERQESNNKRRRADDHRRQDEASARKKANREAAPGSMQLNGTDYVAVQPALTARGGTLHPSLPTRPGFDIKPKVEAETGGAETDSIKKGIAAMSGSNSDIVKNRRAIRMANMSAAQALKAELEGGAGEEETETVTVERTEDEEKEQLTKEDAKAVLEAQAELAGVDEEILPSAIKTDEDEGEAVVGDEAMEEADAEIVSRPPSRKSKKRKVADVEDADEDAEEDDEGEEDEEDDDEEAPPNPEADQPVPKKKLKFNPDGTVEGYEDDVKLWEPGYRARYYEKKFGVELSDTEFIHNITRSYMEGLCWVLEYYYQGVPAWDWYYPYHYAPFAQDFKDVGKLDIQFEVSIPFKPFAQLLGVFPAASRIHLPEPLQTLMVDEDSPIIDFYPPDFEIDMNGKKMAWQGVALLPFIDQKRLLTALKSKEDELSDDEKRRNSWGDNVMFISSENPLYGAFCKHLYSLKAATKPILLQEQVDSAGRPLCEIAGAALGDPNWVPSSSFETPIPNIEECPDLDPNNSQSVRYYFPTQAHPHRSILLPRYTPGPTRLTESDKDWVRRGGQGGGRRGGGGGGGPRHSNGGGGGGPGMARGAYNTANSAAAGRSANGYPQASPQDLARHGAPSGGYAPQGGGGYGGYGGGGGGYSAPHPRPVAAYGGAGGGGGYGGYGGTPYSAPYAGAAYGAPTAYGAYNPQSRNPYVQAPPPNPYGGAIPPRPPAGGAYGGQGAYGGYGGAAGGGRGAGGAYNPYGGAGGGGGAYQPRNGGQPPRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.67
3 0.72
4 0.77
5 0.76
6 0.72
7 0.7
8 0.65
9 0.64
10 0.6
11 0.57
12 0.54
13 0.51
14 0.47
15 0.45
16 0.46
17 0.41
18 0.45
19 0.45
20 0.44
21 0.42
22 0.41
23 0.43
24 0.39
25 0.36
26 0.29
27 0.24
28 0.21
29 0.19
30 0.23
31 0.28
32 0.34
33 0.4
34 0.41
35 0.41
36 0.43
37 0.4
38 0.38
39 0.33
40 0.28
41 0.23
42 0.22
43 0.19
44 0.16
45 0.16
46 0.13
47 0.09
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.09
52 0.1
53 0.12
54 0.17
55 0.2
56 0.2
57 0.27
58 0.33
59 0.36
60 0.41
61 0.4
62 0.4
63 0.39
64 0.42
65 0.36
66 0.33
67 0.28
68 0.24
69 0.22
70 0.17
71 0.15
72 0.11
73 0.09
74 0.07
75 0.08
76 0.07
77 0.09
78 0.1
79 0.14
80 0.16
81 0.23
82 0.33
83 0.41
84 0.45
85 0.45
86 0.47
87 0.45
88 0.44
89 0.42
90 0.36
91 0.33
92 0.29
93 0.26
94 0.26
95 0.24
96 0.24
97 0.19
98 0.15
99 0.1
100 0.13
101 0.19
102 0.26
103 0.37
104 0.46
105 0.55
106 0.66
107 0.74
108 0.8
109 0.81
110 0.78
111 0.74
112 0.75
113 0.72
114 0.68
115 0.69
116 0.62
117 0.58
118 0.57
119 0.51
120 0.42
121 0.4
122 0.34
123 0.28
124 0.27
125 0.27
126 0.25
127 0.26
128 0.26
129 0.22
130 0.21
131 0.24
132 0.24
133 0.22
134 0.22
135 0.21
136 0.18
137 0.17
138 0.17
139 0.19
140 0.21
141 0.25
142 0.28
143 0.31
144 0.32
145 0.34
146 0.36
147 0.33
148 0.35
149 0.35
150 0.36
151 0.39
152 0.4
153 0.39
154 0.35
155 0.34
156 0.28
157 0.23
158 0.17
159 0.11
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.13
167 0.13
168 0.12
169 0.14
170 0.16
171 0.17
172 0.2
173 0.24
174 0.3
175 0.35
176 0.38
177 0.42
178 0.41
179 0.42
180 0.42
181 0.38
182 0.32
183 0.3
184 0.31
185 0.27
186 0.25
187 0.22
188 0.21
189 0.22
190 0.21
191 0.19
192 0.15
193 0.14
194 0.13
195 0.13
196 0.12
197 0.12
198 0.11
199 0.1
200 0.12
201 0.15
202 0.19
203 0.26
204 0.34
205 0.42
206 0.47
207 0.51
208 0.59
209 0.66
210 0.72
211 0.73
212 0.75
213 0.71
214 0.72
215 0.7
216 0.62
217 0.57
218 0.48
219 0.39
220 0.29
221 0.24
222 0.18
223 0.17
224 0.14
225 0.09
226 0.07
227 0.06
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.08
238 0.09
239 0.14
240 0.16
241 0.16
242 0.2
243 0.23
244 0.24
245 0.26
246 0.26
247 0.22
248 0.24
249 0.23
250 0.2
251 0.19
252 0.18
253 0.2
254 0.23
255 0.27
256 0.31
257 0.38
258 0.41
259 0.43
260 0.47
261 0.46
262 0.45
263 0.45
264 0.44
265 0.42
266 0.45
267 0.43
268 0.41
269 0.4
270 0.46
271 0.41
272 0.36
273 0.35
274 0.36
275 0.37
276 0.4
277 0.47
278 0.43
279 0.49
280 0.49
281 0.48
282 0.46
283 0.43
284 0.36
285 0.3
286 0.28
287 0.23
288 0.25
289 0.22
290 0.22
291 0.22
292 0.23
293 0.24
294 0.22
295 0.21
296 0.2
297 0.19
298 0.2
299 0.21
300 0.22
301 0.18
302 0.17
303 0.16
304 0.16
305 0.16
306 0.11
307 0.12
308 0.1
309 0.11
310 0.12
311 0.13
312 0.13
313 0.12
314 0.12
315 0.1
316 0.12
317 0.11
318 0.12
319 0.13
320 0.12
321 0.13
322 0.14
323 0.15
324 0.14
325 0.14
326 0.13
327 0.1
328 0.1
329 0.08
330 0.06
331 0.04
332 0.04
333 0.03
334 0.03
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.06
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.12
347 0.13
348 0.13
349 0.12
350 0.12
351 0.12
352 0.11
353 0.11
354 0.07
355 0.05
356 0.06
357 0.07
358 0.06
359 0.07
360 0.09
361 0.11
362 0.12
363 0.12
364 0.12
365 0.14
366 0.14
367 0.14
368 0.13
369 0.11
370 0.11
371 0.15
372 0.15
373 0.13
374 0.13
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.17
379 0.16
380 0.16
381 0.15
382 0.15
383 0.15
384 0.15
385 0.15
386 0.1
387 0.08
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.08
395 0.1
396 0.14
397 0.18
398 0.2
399 0.23
400 0.24
401 0.28
402 0.33
403 0.39
404 0.43
405 0.48
406 0.5
407 0.52
408 0.6
409 0.62
410 0.66
411 0.65
412 0.62
413 0.55
414 0.55
415 0.58
416 0.59
417 0.64
418 0.65
419 0.68
420 0.7
421 0.71
422 0.67
423 0.63
424 0.6
425 0.57
426 0.55
427 0.51
428 0.46
429 0.47
430 0.49
431 0.51
432 0.53
433 0.47
434 0.45
435 0.4
436 0.41
437 0.39
438 0.37
439 0.33
440 0.26
441 0.22
442 0.17
443 0.15
444 0.12
445 0.1
446 0.09
447 0.08
448 0.06
449 0.07
450 0.07
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.05
457 0.05
458 0.07
459 0.07
460 0.09
461 0.1
462 0.1
463 0.11
464 0.13
465 0.14
466 0.17
467 0.18
468 0.18
469 0.19
470 0.2
471 0.21
472 0.27
473 0.35
474 0.31
475 0.36
476 0.33
477 0.33
478 0.3
479 0.29
480 0.23
481 0.17
482 0.16
483 0.11
484 0.1
485 0.09
486 0.09
487 0.11
488 0.1
489 0.08
490 0.07
491 0.07
492 0.08
493 0.08
494 0.09
495 0.07
496 0.07
497 0.08
498 0.09
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.12
504 0.15
505 0.17
506 0.22
507 0.25
508 0.27
509 0.29
510 0.29
511 0.31
512 0.36
513 0.33
514 0.3
515 0.27
516 0.24
517 0.23
518 0.22
519 0.16
520 0.08
521 0.07
522 0.05
523 0.05
524 0.05
525 0.03
526 0.03
527 0.03
528 0.03
529 0.03
530 0.03
531 0.03
532 0.03
533 0.03
534 0.03
535 0.03
536 0.03
537 0.03
538 0.04
539 0.04
540 0.04
541 0.04
542 0.06
543 0.08
544 0.08
545 0.1
546 0.11
547 0.12
548 0.13
549 0.13
550 0.12
551 0.13
552 0.15
553 0.13
554 0.15
555 0.15
556 0.14
557 0.14
558 0.14
559 0.14
560 0.12
561 0.12
562 0.08
563 0.08
564 0.07
565 0.06
566 0.06
567 0.03
568 0.03
569 0.03
570 0.03
571 0.03
572 0.03
573 0.03
574 0.03
575 0.03
576 0.04
577 0.04
578 0.04
579 0.04
580 0.06
581 0.06
582 0.07
583 0.07
584 0.06
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.04
589 0.03
590 0.02
591 0.02
592 0.02
593 0.02
594 0.02
595 0.02
596 0.02
597 0.02
598 0.02
599 0.03
600 0.03
601 0.04
602 0.05
603 0.07
604 0.08
605 0.13
606 0.23
607 0.32
608 0.41
609 0.52
610 0.62
611 0.7
612 0.77
613 0.81
614 0.8
615 0.79
616 0.79
617 0.72
618 0.63
619 0.53
620 0.46
621 0.36
622 0.28
623 0.2
624 0.1
625 0.07
626 0.04
627 0.03
628 0.03
629 0.03
630 0.03
631 0.03
632 0.03
633 0.03
634 0.04
635 0.04
636 0.04
637 0.04
638 0.04
639 0.05
640 0.05
641 0.06
642 0.06
643 0.06
644 0.06
645 0.07
646 0.07
647 0.09
648 0.11
649 0.18
650 0.22
651 0.31
652 0.36
653 0.39
654 0.43
655 0.49
656 0.55
657 0.56
658 0.6
659 0.58
660 0.6
661 0.6
662 0.58
663 0.51
664 0.44
665 0.36
666 0.27
667 0.21
668 0.14
669 0.11
670 0.08
671 0.07
672 0.06
673 0.06
674 0.06
675 0.07
676 0.08
677 0.12
678 0.16
679 0.17
680 0.18
681 0.23
682 0.31
683 0.33
684 0.41
685 0.39
686 0.37
687 0.36
688 0.36
689 0.34
690 0.27
691 0.23
692 0.19
693 0.2
694 0.18
695 0.18
696 0.17
697 0.14
698 0.15
699 0.15
700 0.1
701 0.08
702 0.09
703 0.09
704 0.11
705 0.11
706 0.09
707 0.1
708 0.1
709 0.09
710 0.09
711 0.08
712 0.06
713 0.06
714 0.07
715 0.08
716 0.08
717 0.08
718 0.08
719 0.08
720 0.08
721 0.1
722 0.1
723 0.08
724 0.09
725 0.09
726 0.13
727 0.15
728 0.16
729 0.16
730 0.15
731 0.15
732 0.16
733 0.21
734 0.19
735 0.18
736 0.18
737 0.17
738 0.18
739 0.23
740 0.22
741 0.17
742 0.18
743 0.18
744 0.18
745 0.19
746 0.19
747 0.12
748 0.12
749 0.14
750 0.11
751 0.12
752 0.12
753 0.11
754 0.11
755 0.12
756 0.12
757 0.1
758 0.12
759 0.11
760 0.1
761 0.13
762 0.13
763 0.12
764 0.12
765 0.15
766 0.12
767 0.12
768 0.12
769 0.11
770 0.13
771 0.15
772 0.16
773 0.16
774 0.19
775 0.19
776 0.19
777 0.16
778 0.16
779 0.14
780 0.14
781 0.1
782 0.07
783 0.07
784 0.07
785 0.07
786 0.06
787 0.06
788 0.05
789 0.06
790 0.06
791 0.1
792 0.1
793 0.11
794 0.11
795 0.11
796 0.13
797 0.17
798 0.19
799 0.16
800 0.16
801 0.15
802 0.15
803 0.18
804 0.17
805 0.13
806 0.11
807 0.12
808 0.15
809 0.16
810 0.15
811 0.12
812 0.11
813 0.14
814 0.15
815 0.14
816 0.12
817 0.11
818 0.13
819 0.16
820 0.16
821 0.16
822 0.22
823 0.27
824 0.32
825 0.34
826 0.32
827 0.32
828 0.32
829 0.31
830 0.3
831 0.29
832 0.29
833 0.32
834 0.35
835 0.34
836 0.34
837 0.35
838 0.33
839 0.29
840 0.32
841 0.35
842 0.34
843 0.33
844 0.33
845 0.31
846 0.27
847 0.25
848 0.19
849 0.12
850 0.1
851 0.08
852 0.07
853 0.07
854 0.08
855 0.09
856 0.1
857 0.1
858 0.11
859 0.12
860 0.13
861 0.17
862 0.17
863 0.2
864 0.25
865 0.3
866 0.32
867 0.33
868 0.32
869 0.3
870 0.3
871 0.29
872 0.26
873 0.21
874 0.18
875 0.18
876 0.18
877 0.18
878 0.17
879 0.14
880 0.11
881 0.13
882 0.12
883 0.11
884 0.1
885 0.09
886 0.08
887 0.08
888 0.07
889 0.07
890 0.07
891 0.06
892 0.07
893 0.07
894 0.07
895 0.07
896 0.08
897 0.07
898 0.07
899 0.08
900 0.09
901 0.17
902 0.18
903 0.21
904 0.2
905 0.23
906 0.23
907 0.26
908 0.28
909 0.21
910 0.19
911 0.19
912 0.19
913 0.17
914 0.2
915 0.19
916 0.17
917 0.18
918 0.2
919 0.21
920 0.27
921 0.27
922 0.23
923 0.23
924 0.26
925 0.28
926 0.28
927 0.31
928 0.27
929 0.29
930 0.37
931 0.41
932 0.47
933 0.51
934 0.51
935 0.48
936 0.47
937 0.47
938 0.46
939 0.45
940 0.43
941 0.37
942 0.35
943 0.37
944 0.37
945 0.37
946 0.35
947 0.32
948 0.26
949 0.31
950 0.34
951 0.35
952 0.36
953 0.36
954 0.4
955 0.43
956 0.45
957 0.42
958 0.42
959 0.38
960 0.4
961 0.39
962 0.38
963 0.36
964 0.4
965 0.43
966 0.42
967 0.4
968 0.36
969 0.34
970 0.27
971 0.21
972 0.16
973 0.14
974 0.14
975 0.16
976 0.16
977 0.16
978 0.18
979 0.18
980 0.17
981 0.13
982 0.12
983 0.11
984 0.11
985 0.11
986 0.09
987 0.09
988 0.08
989 0.08
990 0.05
991 0.04
992 0.05
993 0.07
994 0.09
995 0.09
996 0.11
997 0.12
998 0.12
999 0.12
1000 0.13
1001 0.1
1002 0.11
1003 0.11
1004 0.1
1005 0.12
1006 0.12
1007 0.14
1008 0.17
1009 0.18
1010 0.16
1011 0.21
1012 0.24
1013 0.23
1014 0.23
1015 0.24
1016 0.27
1017 0.27
1018 0.29
1019 0.26
1020 0.23
1021 0.22
1022 0.23
1023 0.2
1024 0.16
1025 0.16
1026 0.15
1027 0.13
1028 0.12
1029 0.12
1030 0.12
1031 0.12
1032 0.1
1033 0.08
1034 0.07
1035 0.07
1036 0.07
1037 0.06
1038 0.04
1039 0.04
1040 0.04
1041 0.03
1042 0.03
1043 0.03
1044 0.03
1045 0.04
1046 0.05
1047 0.1
1048 0.12
1049 0.15
1050 0.16
1051 0.17
1052 0.19
1053 0.21
1054 0.24
1055 0.2
1056 0.2
1057 0.17
1058 0.17
1059 0.16
1060 0.13
1061 0.1
1062 0.06
1063 0.04
1064 0.04
1065 0.03
1066 0.02
1067 0.02
1068 0.02
1069 0.03
1070 0.03
1071 0.04
1072 0.04
1073 0.06
1074 0.08
1075 0.08
1076 0.09
1077 0.09
1078 0.11
1079 0.1
1080 0.1
1081 0.09
1082 0.08
1083 0.09
1084 0.09
1085 0.08
1086 0.07
1087 0.08
1088 0.08
1089 0.08
1090 0.1
1091 0.14
1092 0.21
1093 0.23
1094 0.29
1095 0.34
1096 0.36
1097 0.4
1098 0.42
1099 0.44
1100 0.42
1101 0.49
1102 0.53
1103 0.51
1104 0.54
1105 0.52
1106 0.49
1107 0.42
1108 0.38
1109 0.33
1110 0.3
1111 0.35
1112 0.34
1113 0.35
1114 0.36
1115 0.38
1116 0.37
1117 0.34
1118 0.29
1119 0.25
1120 0.25
1121 0.22
1122 0.21
1123 0.22
1124 0.22
1125 0.21
1126 0.19
1127 0.14
1128 0.1
1129 0.1
1130 0.06
1131 0.03
1132 0.03
1133 0.03
1134 0.04
1135 0.04
1136 0.04
1137 0.04
1138 0.04
1139 0.04
1140 0.04
1141 0.04
1142 0.04
1143 0.04
1144 0.07
1145 0.07
1146 0.08
1147 0.08
1148 0.08
1149 0.08
1150 0.08
1151 0.07
1152 0.05
1153 0.05
1154 0.04
1155 0.05
1156 0.05
1157 0.07
1158 0.08
1159 0.08
1160 0.1
1161 0.11
1162 0.15
1163 0.19
1164 0.29