Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5M6BU78

Protein Details
Accession A0A5M6BU78    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-36EPSTKKSKSASTTPKPKSKGKSVHydrophilic
483-505DKSVQARLKKASRKKDEPKGTLFHydrophilic
587-642LWVGANKKFRKVPRARVEKMKHDKPRTDEEQVKADKKLKKKESQRKKNIKGQGIDYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-33TKKSKSASTTPKPKSKG
94-103KKKGKAAKGK
289-297KKQAGKKGK
310-392GKKQAGKKGKQLADKAGEVVEEGKKQAGKKGKEVAKKAEEVVEEGKKQAGKKGKQVVEEAKETGKRKAKDAVAAAEPSVKKAK
490-497LKKASRKK
593-636KKFRKVPRARVEKMKHDKPRTDEEQVKADKKLKKKESQRKKNIK
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 6, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MPAKKRSAPSSAAEPSTKKSKSASTTPKPKSKGKSVVESATDSPLQTVKQAATDLIQTVSDAVDVAGDLIFDDGNTPAPVSQVIEENVDVPALKKKGKAAKGKAVEAATDAAIAASDKVTEAAKPLKGKAAKAAKDAGAAVESTIEGKTGVDVKAAKGKATKAAKAAKENIDAATAVVQPEVEKAVEAAKPLKGKAAKAAAAAQAKVVEGASEVEKAAKDPKNRKKAEDFMTQAEETVKKVVGDVAGKVSEVMGEVVSKFGEASGLTADLGGDAKKVQDKAKAVVEDGKKQAGKKGKQVVEKAEQVVEDGKKQAGKKGKQLADKAGEVVEEGKKQAGKKGKEVAKKAEEVVEEGKKQAGKKGKQVVEEAKETGKRKAKDAVAAAEPSVKKAKSAIPELGATIESGKKAAAKTAGKATKAVVDTVEDVAGSDDDEDDASYIHGFSSSDGEGDSSDDESDAEDLAVAEAGRKIDMSTLPSVAKDDKSVQARLKKASRKKDEPKGTLFLGRIPHGFYEEQMKEYFSQFGDVSRVRLARNRKTGASKHYAYIEMPSVSVAEIVAETMNNYLLMGHLLKCQVVPLDQVHPQLWVGANKKFRKVPRARVEKMKHDKPRTDEEQVKADKKLKKKESQRKKNIKGQGIDYEFDGHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.47
3 0.52
4 0.48
5 0.41
6 0.39
7 0.43
8 0.46
9 0.54
10 0.59
11 0.6
12 0.7
13 0.77
14 0.82
15 0.81
16 0.82
17 0.8
18 0.8
19 0.79
20 0.75
21 0.76
22 0.73
23 0.73
24 0.68
25 0.64
26 0.55
27 0.49
28 0.43
29 0.33
30 0.28
31 0.24
32 0.21
33 0.18
34 0.19
35 0.15
36 0.16
37 0.17
38 0.16
39 0.15
40 0.17
41 0.17
42 0.15
43 0.14
44 0.11
45 0.11
46 0.1
47 0.09
48 0.07
49 0.06
50 0.05
51 0.05
52 0.05
53 0.04
54 0.04
55 0.04
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.05
60 0.05
61 0.07
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.13
70 0.14
71 0.15
72 0.15
73 0.15
74 0.14
75 0.13
76 0.12
77 0.1
78 0.16
79 0.17
80 0.2
81 0.22
82 0.29
83 0.38
84 0.47
85 0.56
86 0.57
87 0.64
88 0.68
89 0.69
90 0.66
91 0.58
92 0.49
93 0.4
94 0.33
95 0.23
96 0.17
97 0.13
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.06
102 0.04
103 0.04
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.07
108 0.1
109 0.15
110 0.19
111 0.22
112 0.23
113 0.3
114 0.33
115 0.34
116 0.39
117 0.44
118 0.43
119 0.44
120 0.47
121 0.4
122 0.38
123 0.37
124 0.29
125 0.19
126 0.16
127 0.12
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.07
136 0.1
137 0.1
138 0.12
139 0.13
140 0.14
141 0.22
142 0.22
143 0.23
144 0.22
145 0.24
146 0.3
147 0.34
148 0.35
149 0.35
150 0.42
151 0.45
152 0.48
153 0.53
154 0.49
155 0.47
156 0.45
157 0.39
158 0.32
159 0.27
160 0.21
161 0.17
162 0.13
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.08
168 0.09
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.09
173 0.1
174 0.11
175 0.13
176 0.15
177 0.16
178 0.17
179 0.23
180 0.23
181 0.23
182 0.28
183 0.31
184 0.29
185 0.29
186 0.32
187 0.31
188 0.3
189 0.29
190 0.23
191 0.18
192 0.16
193 0.15
194 0.12
195 0.07
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.16
205 0.2
206 0.27
207 0.37
208 0.47
209 0.57
210 0.6
211 0.64
212 0.64
213 0.68
214 0.66
215 0.64
216 0.58
217 0.5
218 0.52
219 0.46
220 0.39
221 0.33
222 0.27
223 0.18
224 0.17
225 0.14
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.1
236 0.09
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.08
263 0.1
264 0.12
265 0.17
266 0.18
267 0.21
268 0.26
269 0.26
270 0.24
271 0.29
272 0.29
273 0.29
274 0.29
275 0.3
276 0.26
277 0.26
278 0.31
279 0.33
280 0.34
281 0.37
282 0.45
283 0.46
284 0.5
285 0.53
286 0.54
287 0.5
288 0.49
289 0.42
290 0.33
291 0.28
292 0.22
293 0.23
294 0.18
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.14
299 0.15
300 0.19
301 0.25
302 0.27
303 0.34
304 0.42
305 0.47
306 0.5
307 0.52
308 0.51
309 0.46
310 0.43
311 0.36
312 0.27
313 0.21
314 0.16
315 0.15
316 0.11
317 0.08
318 0.08
319 0.09
320 0.11
321 0.11
322 0.16
323 0.23
324 0.23
325 0.28
326 0.37
327 0.42
328 0.47
329 0.5
330 0.52
331 0.48
332 0.47
333 0.42
334 0.37
335 0.3
336 0.25
337 0.26
338 0.21
339 0.18
340 0.17
341 0.18
342 0.17
343 0.17
344 0.2
345 0.25
346 0.26
347 0.33
348 0.42
349 0.44
350 0.45
351 0.5
352 0.51
353 0.46
354 0.44
355 0.37
356 0.31
357 0.32
358 0.31
359 0.34
360 0.35
361 0.32
362 0.33
363 0.39
364 0.38
365 0.38
366 0.39
367 0.35
368 0.3
369 0.29
370 0.27
371 0.25
372 0.23
373 0.2
374 0.21
375 0.17
376 0.15
377 0.17
378 0.21
379 0.21
380 0.25
381 0.25
382 0.24
383 0.24
384 0.24
385 0.22
386 0.18
387 0.14
388 0.11
389 0.1
390 0.08
391 0.07
392 0.07
393 0.09
394 0.09
395 0.11
396 0.16
397 0.17
398 0.19
399 0.28
400 0.32
401 0.3
402 0.31
403 0.29
404 0.28
405 0.27
406 0.25
407 0.16
408 0.14
409 0.15
410 0.14
411 0.14
412 0.08
413 0.08
414 0.08
415 0.07
416 0.06
417 0.05
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.05
430 0.05
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.08
435 0.08
436 0.08
437 0.09
438 0.09
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.07
445 0.06
446 0.05
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.05
451 0.04
452 0.05
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.08
459 0.1
460 0.12
461 0.13
462 0.15
463 0.16
464 0.16
465 0.18
466 0.18
467 0.17
468 0.17
469 0.18
470 0.22
471 0.26
472 0.31
473 0.35
474 0.4
475 0.43
476 0.48
477 0.54
478 0.57
479 0.62
480 0.68
481 0.72
482 0.75
483 0.81
484 0.84
485 0.86
486 0.83
487 0.79
488 0.73
489 0.65
490 0.59
491 0.5
492 0.43
493 0.36
494 0.31
495 0.26
496 0.23
497 0.22
498 0.2
499 0.2
500 0.17
501 0.23
502 0.22
503 0.23
504 0.22
505 0.23
506 0.21
507 0.22
508 0.24
509 0.15
510 0.17
511 0.15
512 0.16
513 0.2
514 0.2
515 0.2
516 0.22
517 0.24
518 0.23
519 0.29
520 0.37
521 0.4
522 0.49
523 0.51
524 0.53
525 0.59
526 0.64
527 0.66
528 0.66
529 0.58
530 0.52
531 0.51
532 0.47
533 0.39
534 0.36
535 0.31
536 0.23
537 0.2
538 0.17
539 0.14
540 0.13
541 0.12
542 0.09
543 0.05
544 0.05
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.06
550 0.06
551 0.06
552 0.06
553 0.05
554 0.05
555 0.08
556 0.09
557 0.09
558 0.12
559 0.13
560 0.14
561 0.14
562 0.15
563 0.14
564 0.14
565 0.16
566 0.16
567 0.2
568 0.23
569 0.26
570 0.25
571 0.25
572 0.24
573 0.23
574 0.23
575 0.25
576 0.26
577 0.3
578 0.39
579 0.42
580 0.49
581 0.54
582 0.58
583 0.62
584 0.68
585 0.73
586 0.74
587 0.8
588 0.8
589 0.84
590 0.85
591 0.85
592 0.85
593 0.84
594 0.84
595 0.83
596 0.84
597 0.79
598 0.81
599 0.77
600 0.76
601 0.74
602 0.67
603 0.68
604 0.68
605 0.65
606 0.62
607 0.62
608 0.6
609 0.62
610 0.68
611 0.68
612 0.71
613 0.78
614 0.84
615 0.87
616 0.91
617 0.93
618 0.94
619 0.94
620 0.93
621 0.92
622 0.9
623 0.85
624 0.8
625 0.79
626 0.71
627 0.62
628 0.54